MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012580	AGAC	2	8	286809	286816	50 %	0 %	25 %	25 %	227811890
5502	NC_012580	TAG	2	6	286867	286872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811890
5503	NC_012580	TTAA	2	8	286889	286896	50 %	50 %	0 %	0 %	227811890
5504	NC_012580	T	7	7	287001	287007	0 %	100 %	0 %	0 %	227811891
5505	NC_012580	TCGT	2	8	287036	287043	0 %	50 %	25 %	25 %	227811891
5506	NC_012580	ATC	3	9	287092	287100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811891
5507	NC_012580	ACT	2	6	287115	287120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811891
5508	NC_012580	TGA	2	6	287165	287170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811891
5509	NC_012580	CTCG	2	8	287215	287222	0 %	25 %	25 %	50 %	227811891
5510	NC_012580	GAT	2	6	287279	287284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811891
5511	NC_012580	GGC	2	6	287324	287329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811891
5512	NC_012580	TGG	2	6	287344	287349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811891
5513	NC_012580	G	6	6	287412	287417	0 %	0 %	100 %	0 %	227811891
5514	NC_012580	ACT	2	6	287530	287535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811891
5515	NC_012580	GCT	2	6	287555	287560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811891
5516	NC_012580	TTGA	2	8	287622	287629	25 %	50 %	25 %	0 %	227811891
5517	NC_012580	GCT	2	6	287650	287655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811891
5518	NC_012580	CAT	2	6	287681	287686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811891
5519	NC_012580	GAT	2	6	287721	287726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811891
5520	NC_012580	CGT	2	6	287778	287783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811891
5521	NC_012580	TGC	2	6	287873	287878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811891
5522	NC_012580	TGA	2	6	287992	287997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811891
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5524	NC_012580	CAA	2	6	288069	288074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811891
5525	NC_012580	GCAGT	2	10	288109	288118	20 %	20 %	40 %	20 %	227811891
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5529	NC_012580	C	6	6	288293	288298	0 %	0 %	0 %	100 %	227811891
5530	NC_012580	ATC	2	6	288391	288396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811891
5531	NC_012580	TGA	2	6	288517	288522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811891
5532	NC_012580	TTC	2	6	288585	288590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_012580	TGAC	2	8	288592	288599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_012580	GTG	2	6	288609	288614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_012580	TGCT	2	8	288714	288721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_012580	CGT	2	6	288826	288831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811892
5537	NC_012580	GCC	2	6	288838	288843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811892
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5539	NC_012580	ATG	2	6	289131	289136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811892
5540	NC_012580	GCA	2	6	289207	289212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811892
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5542	NC_012580	TTAC	2	8	289359	289366	25 %	50 %	0 %	25 %	227811892
5543	NC_012580	CTG	2	6	289397	289402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811892
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5545	NC_012580	CCA	2	6	289479	289484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811892
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5548	NC_012580	A	6	6	289712	289717	100 %	0 %	0 %	0 %	227811892
5549	NC_012580	GTA	2	6	289775	289780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811892
5550	NC_012580	CTA	2	6	289792	289797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811892
5551	NC_012580	TGA	2	6	289801	289806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811892
5552	NC_012580	GCT	2	6	289891	289896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811892
5553	NC_012580	TGGT	2	8	289903	289910	0 %	50 %	50 %	0 %	227811892
5554	NC_012580	GAT	2	6	289992	289997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_012580	AC	3	6	290000	290005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_012580	CAA	2	6	290069	290074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_012580	CGA	2	6	290075	290080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_012580	AAG	2	6	290106	290111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811893
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5561	NC_012580	ATC	2	6	290411	290416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811893
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5563	NC_012580	CT	3	6	290486	290491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5569	NC_012580	AGG	2	6	290996	291001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_012580	TGAG	2	8	291021	291028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_012580	TGA	2	6	291074	291079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_012580	CAT	2	6	291135	291140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_012580	TCAA	2	8	291160	291167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_012580	GCT	2	6	291404	291409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811896
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5588	NC_012580	AAATT	2	10	291964	291973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_012580	GAT	2	6	292014	292019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_012580	TGC	2	6	292095	292100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_012580	A	6	6	292118	292123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_012580	CTT	2	6	292139	292144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_012580	ACG	2	6	292183	292188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_012580	TC	3	6	292196	292201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_012580	CTG	2	6	292213	292218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_012580	T	6	6	292234	292239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_012580	TTC	2	6	292270	292275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_012580	ACC	2	6	292473	292478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811897
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5607	NC_012580	ATTA	2	8	293169	293176	50 %	50 %	0 %	0 %	227811897
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5611	NC_012580	T	7	7	293318	293324	0 %	100 %	0 %	0 %	227811898
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5619	NC_012580	GATAT	2	10	293837	293846	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_012580	TGA	2	6	293867	293872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_012580	CTTA	2	8	293905	293912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_012580	TCT	2	6	293930	293935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_012580	CAC	2	6	293976	293981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5625	NC_012580	GT	3	6	294173	294178	0 %	50 %	50 %	0 %	227811899
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5867	NC_012580	ATTG	2	8	307502	307509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5999	NC_012580	TGT	2	6	314373	314378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811920
6000	NC_012580	CTGT	2	8	314389	314396	0 %	50 %	25 %	25 %	227811920

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