MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012578	GAA	2	6	208734	208739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080435
4002	NC_012578	CGG	2	6	208843	208848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080435
4003	NC_012578	CTG	2	6	208893	208898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080435
4004	NC_012578	TGGC	2	8	208904	208911	0 %	25 %	50 %	25 %	227080435
4005	NC_012578	TGG	2	6	208931	208936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080435
4006	NC_012578	GTG	2	6	208948	208953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080435
4007	NC_012578	GC	3	6	208983	208988	0 %	0 %	50 %	50 %	227080435
4008	NC_012578	CAG	2	6	209013	209018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080435
4009	NC_012578	CAAG	2	8	209078	209085	50 %	0 %	25 %	25 %	227080435
4010	NC_012578	GGC	2	6	209145	209150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080435
4011	NC_012578	TCA	2	6	209156	209161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080435
4012	NC_012578	CCA	2	6	209186	209191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080435
4013	NC_012578	CGA	2	6	209194	209199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080435
4014	NC_012578	TGCC	2	8	209258	209265	0 %	25 %	25 %	50 %	227080435
4015	NC_012578	A	6	6	209289	209294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012578	GC	3	6	209298	209303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_012578	CCG	2	6	209342	209347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_012578	AAT	2	6	209440	209445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080436
4019	NC_012578	TCT	2	6	209465	209470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080436
4020	NC_012578	TGAT	2	8	209604	209611	25 %	50 %	25 %	0 %	227080436
4021	NC_012578	A	6	6	209618	209623	100 %	0 %	0 %	0 %	227080436
4022	NC_012578	ATG	2	6	209642	209647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080436
4023	NC_012578	CGG	2	6	209655	209660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080436
4024	NC_012578	CAAA	2	8	209710	209717	75 %	0 %	0 %	25 %	227080436
4025	NC_012578	CGA	2	6	209922	209927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080436
4026	NC_012578	TGA	2	6	210007	210012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080436
4027	NC_012578	CG	3	6	210038	210043	0 %	0 %	50 %	50 %	227080436
4028	NC_012578	TAT	2	6	210115	210120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080436
4029	NC_012578	CAC	2	6	210153	210158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080436
4030	NC_012578	GGC	2	6	210200	210205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080436
4031	NC_012578	CG	3	6	210214	210219	0 %	0 %	50 %	50 %	227080436
4032	NC_012578	CAA	2	6	210356	210361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080436
4033	NC_012578	AGCC	2	8	210370	210377	25 %	0 %	25 %	50 %	227080436
4034	NC_012578	GC	3	6	210446	210451	0 %	0 %	50 %	50 %	227080436
4035	NC_012578	CTG	2	6	210585	210590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080436
4036	NC_012578	GGC	2	6	210613	210618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080436
4037	NC_012578	GCG	2	6	210686	210691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080436
4038	NC_012578	GCG	2	6	210698	210703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080436
4039	NC_012578	TGG	2	6	210735	210740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080436
4040	NC_012578	GTG	2	6	210864	210869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080436
4041	NC_012578	AG	3	6	210901	210906	50 %	0 %	50 %	0 %	227080436
4042	NC_012578	AGC	2	6	210975	210980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080436
4043	NC_012578	AGA	2	6	210994	210999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080436
4044	NC_012578	CAG	2	6	211025	211030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080436
4045	NC_012578	ACA	2	6	211099	211104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080436
4046	NC_012578	TTGG	2	8	211115	211122	0 %	50 %	50 %	0 %	227080436
4047	NC_012578	ATTGC	2	10	211150	211159	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4048	NC_012578	TTA	2	6	211181	211186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012578	CG	3	6	211284	211289	0 %	0 %	50 %	50 %	227080437
4050	NC_012578	TGC	2	6	211296	211301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080437
4051	NC_012578	CTG	3	9	211394	211402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080437
4052	NC_012578	GC	3	6	211420	211425	0 %	0 %	50 %	50 %	227080437
4053	NC_012578	GCA	2	6	211567	211572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080437
4054	NC_012578	TTTA	2	8	211581	211588	25 %	75 %	0 %	0 %	227080437
4055	NC_012578	TGC	2	6	211596	211601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080437
4056	NC_012578	TA	3	6	211625	211630	50 %	50 %	0 %	0 %	227080437
4057	NC_012578	TGA	2	6	211663	211668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080437
4058	NC_012578	GCG	2	6	211694	211699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080437
4059	NC_012578	CA	3	6	211764	211769	50 %	0 %	0 %	50 %	227080437
4060	NC_012578	ACC	2	6	211770	211775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080437
4061	NC_012578	GTC	2	6	211874	211879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080437
4062	NC_012578	T	6	6	211993	211998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012578	AG	4	8	212160	212167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012578	CCA	2	6	212174	212179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_012578	AAC	2	6	212264	212269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080438
4066	NC_012578	A	6	6	212281	212286	100 %	0 %	0 %	0 %	227080438
4067	NC_012578	CTA	2	6	212289	212294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080438
4068	NC_012578	CGT	2	6	212297	212302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080438
4069	NC_012578	AG	3	6	212338	212343	50 %	0 %	50 %	0 %	227080438
4070	NC_012578	ATC	2	6	212390	212395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080438
4071	NC_012578	A	6	6	212488	212493	100 %	0 %	0 %	0 %	227080439
4072	NC_012578	ATC	2	6	212504	212509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080439
4073	NC_012578	AAG	2	6	212617	212622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080439
4074	NC_012578	A	7	7	212665	212671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_012578	T	7	7	212689	212695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012578	CTC	2	6	212749	212754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_012578	ACT	2	6	212765	212770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_012578	AAC	2	6	212896	212901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080440
4079	NC_012578	TATT	2	8	212965	212972	25 %	75 %	0 %	0 %	227080440
4080	NC_012578	A	6	6	213056	213061	100 %	0 %	0 %	0 %	227080440
4081	NC_012578	TGAGT	2	10	213087	213096	20 %	40 %	40 %	0 %	227080440
4082	NC_012578	CACT	2	8	213131	213138	25 %	25 %	0 %	50 %	227080440
4083	NC_012578	CAAC	2	8	213175	213182	50 %	0 %	0 %	50 %	227080440
4084	NC_012578	A	6	6	213276	213281	100 %	0 %	0 %	0 %	227080440
4085	NC_012578	TGAAGT	2	12	213369	213380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080441
4086	NC_012578	TACG	2	8	213437	213444	25 %	25 %	25 %	25 %	227080441
4087	NC_012578	TCG	2	6	213513	213518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080441
4088	NC_012578	ATT	2	6	213532	213537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080441
4089	NC_012578	CCG	2	6	213542	213547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080441
4090	NC_012578	TGA	2	6	213641	213646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080441
4091	NC_012578	TGA	2	6	213711	213716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080441
4092	NC_012578	AT	3	6	213777	213782	50 %	50 %	0 %	0 %	227080441
4093	NC_012578	GC	3	6	213793	213798	0 %	0 %	50 %	50 %	227080441
4094	NC_012578	TCCA	2	8	213896	213903	25 %	25 %	0 %	50 %	227080441
4095	NC_012578	TGC	2	6	213968	213973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080441
4096	NC_012578	GGC	2	6	213991	213996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080441
4097	NC_012578	T	7	7	214266	214272	0 %	100 %	0 %	0 %	227080442
4098	NC_012578	CCG	2	6	214325	214330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080442
4099	NC_012578	CGA	2	6	214357	214362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080442
4100	NC_012578	CGG	2	6	214380	214385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080442
4101	NC_012578	AC	3	6	214395	214400	50 %	0 %	0 %	50 %	227080442
4102	NC_012578	GC	3	6	214576	214581	0 %	0 %	50 %	50 %	227080442
4103	NC_012578	GGC	2	6	214630	214635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080442
4104	NC_012578	GAT	2	6	214642	214647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080442
4105	NC_012578	TCA	2	6	214652	214657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080442
4106	NC_012578	GCGCG	2	10	214665	214674	0 %	0 %	60 %	40 %	227080442
4107	NC_012578	TCAA	2	8	214676	214683	50 %	25 %	0 %	25 %	227080442
4108	NC_012578	TCA	2	6	214766	214771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_012578	ATG	2	6	214828	214833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_012578	CCG	2	6	214990	214995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080443
4111	NC_012578	ATC	2	6	215031	215036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080443
4112	NC_012578	GCA	2	6	215063	215068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080443
4113	NC_012578	CAG	2	6	215097	215102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080443
4114	NC_012578	GC	3	6	215160	215165	0 %	0 %	50 %	50 %	227080443
4115	NC_012578	T	6	6	215288	215293	0 %	100 %	0 %	0 %	227080443
4116	NC_012578	ATT	2	6	215313	215318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080443
4117	NC_012578	CAG	2	6	215347	215352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080443
4118	NC_012578	GCAGC	3	15	215361	215375	20 %	0 %	40 %	40 %	227080443
4119	NC_012578	GTG	2	6	215437	215442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080443
4120	NC_012578	AAT	2	6	215451	215456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080443
4121	NC_012578	GATG	2	8	215495	215502	25 %	25 %	50 %	0 %	227080443
4122	NC_012578	GTG	2	6	215514	215519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080443
4123	NC_012578	GAA	2	6	215538	215543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080443
4124	NC_012578	GCG	2	6	215550	215555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080443
4125	NC_012578	GTTG	2	8	215618	215625	0 %	50 %	50 %	0 %	227080443
4126	NC_012578	GC	3	6	215647	215652	0 %	0 %	50 %	50 %	227080443
4127	NC_012578	TTC	2	6	215721	215726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080443
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4372	NC_012578	GTT	2	6	229480	229485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_012578	ACC	2	6	229529	229534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4374	NC_012578	CTA	2	6	229540	229545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4375	NC_012578	TCAC	2	8	229609	229616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4376	NC_012578	CAC	2	6	229650	229655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4377	NC_012578	CAT	2	6	229724	229729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4378	NC_012578	AG	3	6	229788	229793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_012578	GCT	2	6	229853	229858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4380	NC_012578	TCA	2	6	229897	229902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4381	NC_012578	GGT	2	6	229913	229918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4382	NC_012578	ATG	3	9	229921	229929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4383	NC_012578	TTG	2	6	229948	229953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_012578	AGTGC	2	10	230040	230049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4385	NC_012578	TCAA	2	8	230068	230075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4386	NC_012578	GCTT	2	8	230181	230188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4387	NC_012578	GGC	2	6	230207	230212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4388	NC_012578	ATT	2	6	230469	230474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_012578	TGC	2	6	230478	230483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_012578	T	6	6	230619	230624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_012578	GAC	2	6	230645	230650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4393	NC_012578	GTGA	2	8	230720	230727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_012578	TGC	2	6	230801	230806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_012578	TTA	2	6	230809	230814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_012578	A	6	6	230826	230831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_012578	ATA	2	6	230996	231001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4398	NC_012578	TCC	2	6	231086	231091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4399	NC_012578	AGG	2	6	231110	231115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4403	NC_012578	GAATG	2	10	231269	231278	40 %	20 %	40 %	0 %	227080459
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4464	NC_012578	ATTGA	2	10	234505	234514	40 %	40 %	20 %	0 %	227080461
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4484	NC_012578	A	6	6	235317	235322	100 %	0 %	0 %	0 %	227080462
4485	NC_012578	ATC	2	6	235447	235452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080462
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4487	NC_012578	CTA	2	6	235650	235655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080462
4488	NC_012578	A	7	7	235683	235689	100 %	0 %	0 %	0 %	227080462
4489	NC_012578	AGAA	2	8	235747	235754	75 %	0 %	25 %	0 %	227080462
4490	NC_012578	AATT	2	8	235817	235824	50 %	50 %	0 %	0 %	227080462
4491	NC_012578	GAG	2	6	235888	235893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080462
4492	NC_012578	GAT	2	6	236027	236032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080462
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4494	NC_012578	ATT	2	6	236220	236225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080462
4495	NC_012578	CCTAG	2	10	236283	236292	20 %	20 %	20 %	40 %	227080462
4496	NC_012578	AAG	2	6	236295	236300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080462
4497	NC_012578	ACA	2	6	236330	236335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080462
4498	NC_012578	A	6	6	236394	236399	100 %	0 %	0 %	0 %	227080462
4499	NC_012578	TGGA	2	8	236468	236475	25 %	25 %	50 %	0 %	227080463
4500	NC_012578	AT	3	6	236535	236540	50 %	50 %	0 %	0 %	227080463

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