MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012578	GAGT	2	8	157381	157388	25 %	25 %	50 %	0 %	227080394
3002	NC_012578	GT	3	6	157417	157422	0 %	50 %	50 %	0 %	227080394
3003	NC_012578	TTG	2	6	157575	157580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_012578	AT	3	6	157597	157602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_012578	TTA	2	6	157675	157680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_012578	ATT	2	6	157700	157705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080395
3007	NC_012578	GTG	2	6	157810	157815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080395
3008	NC_012578	TGA	2	6	157908	157913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080395
3009	NC_012578	GTCA	2	8	157919	157926	25 %	25 %	25 %	25 %	227080395
3010	NC_012578	AAT	2	6	157942	157947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080395
3011	NC_012578	AAC	2	6	157970	157975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080395
3012	NC_012578	AGC	2	6	158018	158023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080395
3013	NC_012578	TGA	2	6	158054	158059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080395
3014	NC_012578	TGC	2	6	158067	158072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080395
3015	NC_012578	TGG	2	6	158144	158149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080395
3016	NC_012578	CTT	3	9	158312	158320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080395
3017	NC_012578	TGC	2	6	158375	158380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080395
3018	NC_012578	TTGG	2	8	158459	158466	0 %	50 %	50 %	0 %	227080395
3019	NC_012578	ATG	2	6	158509	158514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080395
3020	NC_012578	ACA	2	6	158591	158596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080395
3021	NC_012578	CAT	2	6	158610	158615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080395
3022	NC_012578	ATG	2	6	158638	158643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080395
3023	NC_012578	ATG	2	6	158657	158662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080395
3024	NC_012578	CAA	2	6	158720	158725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080395
3025	NC_012578	TGA	2	6	158771	158776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080395
3026	NC_012578	GTGC	2	8	158785	158792	0 %	25 %	50 %	25 %	227080395
3027	NC_012578	CAT	2	6	158832	158837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080395
3028	NC_012578	ATGAA	2	10	158912	158921	60 %	20 %	20 %	0 %	227080395
3029	NC_012578	CTG	2	6	158939	158944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080395
3030	NC_012578	AACGC	2	10	159064	159073	40 %	0 %	20 %	40 %	227080395
3031	NC_012578	CAT	2	6	159090	159095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080395
3032	NC_012578	ACA	3	9	159204	159212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_012578	TAA	2	6	159218	159223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012578	AAG	2	6	159229	159234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_012578	CTTT	2	8	159255	159262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_012578	TTAT	2	8	159304	159311	25 %	75 %	0 %	0 %	227080396
3037	NC_012578	T	6	6	159538	159543	0 %	100 %	0 %	0 %	227080396
3038	NC_012578	ATA	2	6	159619	159624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_012578	A	6	6	159624	159629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_012578	TGA	2	6	159651	159656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_012578	TCA	2	6	159699	159704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080397
3042	NC_012578	CAA	2	6	159736	159741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080397
3043	NC_012578	CCAGA	2	10	159823	159832	40 %	0 %	20 %	40 %	227080397
3044	NC_012578	TGC	2	6	159914	159919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080397
3045	NC_012578	GCAT	2	8	159957	159964	25 %	25 %	25 %	25 %	227080397
3046	NC_012578	TGT	2	6	159988	159993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080397
3047	NC_012578	CTC	2	6	160001	160006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227080397
3048	NC_012578	CAC	2	6	160123	160128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080397
3049	NC_012578	GA	3	6	160172	160177	50 %	0 %	50 %	0 %	227080397
3050	NC_012578	AAG	2	6	160200	160205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080397
3051	NC_012578	GC	3	6	160240	160245	0 %	0 %	50 %	50 %	227080397
3052	NC_012578	TGC	2	6	160309	160314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080397
3053	NC_012578	GCACC	2	10	160369	160378	20 %	0 %	20 %	60 %	227080397
3054	NC_012578	AGCG	2	8	160413	160420	25 %	0 %	50 %	25 %	227080397
3055	NC_012578	CTG	2	6	160477	160482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080397
3056	NC_012578	GTA	2	6	160490	160495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080397
3057	NC_012578	CAT	2	6	160598	160603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080397
3058	NC_012578	CTTTAT	2	12	160654	160665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227080397
3059	NC_012578	CAGATC	2	12	160700	160711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227080397
3060	NC_012578	GTG	2	6	160794	160799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080397
3061	NC_012578	GGTT	2	8	160903	160910	0 %	50 %	50 %	0 %	227080397
3062	NC_012578	TGGCT	2	10	160915	160924	0 %	40 %	40 %	20 %	227080397
3063	NC_012578	GAACT	2	10	161006	161015	40 %	20 %	20 %	20 %	227080397
3064	NC_012578	CAGA	2	8	161026	161033	50 %	0 %	25 %	25 %	227080397
3065	NC_012578	CAT	2	6	161044	161049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080397
3066	NC_012578	CAT	2	6	161330	161335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080397
3067	NC_012578	CAA	2	6	161353	161358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080397
3068	NC_012578	CCAG	2	8	161379	161386	25 %	0 %	25 %	50 %	227080397
3069	NC_012578	GAT	2	6	161507	161512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080397
3070	NC_012578	CGC	2	6	161513	161518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080397
3071	NC_012578	CTT	2	6	161536	161541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080397
3072	NC_012578	ACG	2	6	161568	161573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080397
3073	NC_012578	CAG	2	6	161615	161620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080397
3074	NC_012578	CAT	2	6	161645	161650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080397
3075	NC_012578	TGA	2	6	161737	161742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080397
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3077	NC_012578	GCA	2	6	161872	161877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080397
3078	NC_012578	CG	3	6	161966	161971	0 %	0 %	50 %	50 %	227080397
3079	NC_012578	CAC	2	6	162047	162052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080397
3080	NC_012578	CTGA	2	8	162139	162146	25 %	25 %	25 %	25 %	227080397
3081	NC_012578	GTT	2	6	162149	162154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080397
3082	NC_012578	TCA	2	6	162169	162174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080397
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3085	NC_012578	TCT	2	6	162408	162413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080397
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3087	NC_012578	GCGA	2	8	162430	162437	25 %	0 %	50 %	25 %	227080397
3088	NC_012578	TAA	2	6	162592	162597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080397
3089	NC_012578	ATG	2	6	162780	162785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080397
3090	NC_012578	CTG	2	6	162810	162815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080398
3091	NC_012578	GTG	2	6	162816	162821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080398
3092	NC_012578	CGA	2	6	162837	162842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080398
3093	NC_012578	TTC	2	6	162988	162993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080398
3094	NC_012578	ATG	2	6	163079	163084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080398
3095	NC_012578	CAG	2	6	163173	163178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080398
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3097	NC_012578	TGG	2	6	163419	163424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080398
3098	NC_012578	TAG	2	6	163457	163462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080398
3099	NC_012578	TCA	2	6	163475	163480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080398
3100	NC_012578	GCAG	2	8	163547	163554	25 %	0 %	50 %	25 %	227080398
3101	NC_012578	GC	3	6	163555	163560	0 %	0 %	50 %	50 %	227080398
3102	NC_012578	TGT	2	6	163817	163822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080398
3103	NC_012578	CAG	2	6	163855	163860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080398
3104	NC_012578	A	6	6	163879	163884	100 %	0 %	0 %	0 %	227080398
3105	NC_012578	ATC	2	6	163972	163977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080399
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3107	NC_012578	AGAA	2	8	164041	164048	75 %	0 %	25 %	0 %	227080399
3108	NC_012578	CTG	2	6	164077	164082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080399
3109	NC_012578	AAC	2	6	164096	164101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080399
3110	NC_012578	T	6	6	164121	164126	0 %	100 %	0 %	0 %	227080399
3111	NC_012578	CAA	2	6	164147	164152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080399
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3113	NC_012578	TAA	2	6	164190	164195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080399
3114	NC_012578	AGCC	2	8	164208	164215	25 %	0 %	25 %	50 %	227080399
3115	NC_012578	T	6	6	164301	164306	0 %	100 %	0 %	0 %	227080399
3116	NC_012578	TCAA	2	8	164327	164334	50 %	25 %	0 %	25 %	227080399
3117	NC_012578	GAT	2	6	164337	164342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080399
3118	NC_012578	GCT	2	6	164387	164392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080399
3119	NC_012578	GTT	2	6	164522	164527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012578	TTG	2	6	164597	164602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_012578	ATT	3	9	164621	164629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012578	GGC	2	6	164630	164635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_012578	TAAA	2	8	164636	164643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_012578	CAAGA	2	10	164673	164682	60 %	0 %	20 %	20 %	227080400
3125	NC_012578	GGCGGG	2	12	164722	164733	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	227080400
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3155	NC_012578	GC	3	6	166087	166092	0 %	0 %	50 %	50 %	227080400
3156	NC_012578	GGT	2	6	166252	166257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080400
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3164	NC_012578	CTT	2	6	166703	166708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3234	NC_012578	CGCGA	2	10	170190	170199	20 %	0 %	40 %	40 %	227080403
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3240	NC_012578	AAAC	2	8	170605	170612	75 %	0 %	0 %	25 %	227080404
3241	NC_012578	GGCT	2	8	170632	170639	0 %	25 %	50 %	25 %	227080404
3242	NC_012578	ACG	2	6	170679	170684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080404
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3245	NC_012578	CGG	2	6	170931	170936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080404
3246	NC_012578	GAT	2	6	170981	170986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080404
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3372	NC_012578	CCG	2	6	177509	177514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080409
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3481	NC_012578	AAT	2	6	182980	182985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3482	NC_012578	TTTA	2	8	183000	183007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3483	NC_012578	ATT	2	6	183014	183019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3484	NC_012578	GTT	2	6	183023	183028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3485	NC_012578	T	6	6	183039	183044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3486	NC_012578	GCTT	2	8	183147	183154	0 %	50 %	25 %	25 %	227080413
3487	NC_012578	GTT	2	6	183233	183238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080413
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3491	NC_012578	GGC	2	6	183309	183314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080413
3492	NC_012578	CAGACA	2	12	183326	183337	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227080413
3493	NC_012578	GCTG	2	8	183339	183346	0 %	25 %	50 %	25 %	227080413
3494	NC_012578	A	6	6	183372	183377	100 %	0 %	0 %	0 %	227080413
3495	NC_012578	TCA	2	6	183407	183412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080413
3496	NC_012578	CGG	2	6	183433	183438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080413
3497	NC_012578	T	8	8	183484	183491	0 %	100 %	0 %	0 %	227080413
3498	NC_012578	CCA	2	6	183494	183499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080413
3499	NC_012578	GCC	2	6	183540	183545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080413
3500	NC_012578	GCT	2	6	183575	183580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080413

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