MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012578	GCT	2	6	132066	132071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080373
2502	NC_012578	TCGGA	2	10	132091	132100	20 %	20 %	40 %	20 %	227080373
2503	NC_012578	GGACA	2	10	132145	132154	40 %	0 %	40 %	20 %	227080373
2504	NC_012578	TCC	2	6	132196	132201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227080373
2505	NC_012578	TGG	2	6	132359	132364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080373
2506	NC_012578	GAT	2	6	132382	132387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080373
2507	NC_012578	AGC	2	6	132479	132484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080373
2508	NC_012578	ATTG	2	8	132528	132535	25 %	50 %	25 %	0 %	227080373
2509	NC_012578	GCA	2	6	132622	132627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080374
2510	NC_012578	GA	3	6	132645	132650	50 %	0 %	50 %	0 %	227080374
2511	NC_012578	GAT	2	6	132681	132686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080374
2512	NC_012578	GACC	2	8	132694	132701	25 %	0 %	25 %	50 %	227080374
2513	NC_012578	TCA	2	6	132815	132820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080375
2514	NC_012578	GTT	2	6	132872	132877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080375
2515	NC_012578	CCA	2	6	132902	132907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080375
2516	NC_012578	TGC	2	6	132917	132922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080375
2517	NC_012578	GTT	2	6	133161	133166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080375
2518	NC_012578	TG	3	6	133192	133197	0 %	50 %	50 %	0 %	227080375
2519	NC_012578	T	6	6	133242	133247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012578	GAA	2	6	133293	133298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_012578	AATG	2	8	133479	133486	50 %	25 %	25 %	0 %	227080376
2522	NC_012578	GCTT	2	8	133586	133593	0 %	50 %	25 %	25 %	227080376
2523	NC_012578	GGC	2	6	133647	133652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080376
2524	NC_012578	A	6	6	133666	133671	100 %	0 %	0 %	0 %	227080376
2525	NC_012578	AAT	2	6	133684	133689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080376
2526	NC_012578	CCT	2	6	133731	133736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_012578	CGC	2	6	133747	133752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_012578	T	6	6	133825	133830	0 %	100 %	0 %	0 %	227080377
2529	NC_012578	GCT	2	6	133890	133895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_012578	AG	3	6	133905	133910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_012578	AGG	2	6	133918	133923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_012578	GTT	2	6	133948	133953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080378
2533	NC_012578	GAA	2	6	134038	134043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080378
2534	NC_012578	CGA	2	6	134084	134089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080378
2535	NC_012578	GTG	2	6	134101	134106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080378
2536	NC_012578	GAT	2	6	134113	134118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080378
2537	NC_012578	GAT	2	6	134128	134133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080378
2538	NC_012578	AAG	2	6	134184	134189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080378
2539	NC_012578	TG	3	6	134199	134204	0 %	50 %	50 %	0 %	227080378
2540	NC_012578	TGA	2	6	134222	134227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080378
2541	NC_012578	TGA	2	6	134231	134236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080378
2542	NC_012578	A	6	6	134316	134321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_012578	T	6	6	134337	134342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_012578	CAT	2	6	134366	134371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_012578	GAA	2	6	134430	134435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_012578	A	7	7	134474	134480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_012578	A	6	6	134529	134534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_012578	TATT	2	8	134635	134642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_012578	T	6	6	134660	134665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_012578	TTGT	2	8	134667	134674	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_012578	GTT	2	6	134681	134686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_012578	TTA	2	6	134704	134709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_012578	GTTT	2	8	134712	134719	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_012578	ATT	2	6	134762	134767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_012578	TGT	2	6	134772	134777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_012578	GTTG	2	8	134867	134874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_012578	T	6	6	134882	134887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_012578	T	7	7	134890	134896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_012578	GTT	3	9	134897	134905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_012578	GTTTTT	2	12	134914	134925	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_012578	TGG	2	6	134943	134948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_012578	T	7	7	134957	134963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_012578	TTTTG	2	10	134965	134974	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_012578	TTTG	2	8	134986	134993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_012578	TGT	2	6	135003	135008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_012578	TTGGT	2	10	135010	135019	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_012578	TGG	2	6	135020	135025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_012578	TA	3	6	135068	135073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_012578	GGC	2	6	135153	135158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_012578	AAGC	2	8	135250	135257	50 %	0 %	25 %	25 %	227080379
2571	NC_012578	CCT	2	6	135279	135284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227080379
2572	NC_012578	ATT	2	6	135295	135300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080379
2573	NC_012578	AGC	2	6	135308	135313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080379
2574	NC_012578	TC	3	6	135344	135349	0 %	50 %	0 %	50 %	227080379
2575	NC_012578	ATC	2	6	135392	135397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080379
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2577	NC_012578	TGGTG	2	10	135482	135491	0 %	40 %	60 %	0 %	227080379
2578	NC_012578	TGG	2	6	135506	135511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080379
2579	NC_012578	T	8	8	135529	135536	0 %	100 %	0 %	0 %	227080379
2580	NC_012578	TTA	2	6	135697	135702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080379
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2582	NC_012578	A	7	7	135827	135833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_012578	CGG	2	6	135842	135847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_012578	T	7	7	135848	135854	0 %	100 %	0 %	0 %	227080380
2585	NC_012578	CAT	2	6	135856	135861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080380
2586	NC_012578	CATG	2	8	135981	135988	25 %	25 %	25 %	25 %	227080380
2587	NC_012578	ATG	2	6	136007	136012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080380
2588	NC_012578	GGC	2	6	136024	136029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080380
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2590	NC_012578	AGT	2	6	136106	136111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080380
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2592	NC_012578	GAG	2	6	136187	136192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080381
2593	NC_012578	ATC	2	6	136234	136239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080381
2594	NC_012578	TAA	2	6	136290	136295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080381
2595	NC_012578	TTGG	2	8	136464	136471	0 %	50 %	50 %	0 %	227080381
2596	NC_012578	CTT	2	6	136544	136549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080381
2597	NC_012578	TTTC	2	8	136571	136578	0 %	75 %	0 %	25 %	227080381
2598	NC_012578	GTC	2	6	136588	136593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080381
2599	NC_012578	CAT	2	6	136610	136615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080381
2600	NC_012578	T	7	7	136678	136684	0 %	100 %	0 %	0 %	227080381
2601	NC_012578	TGGC	2	8	136695	136702	0 %	25 %	50 %	25 %	227080381
2602	NC_012578	T	6	6	136719	136724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_012578	A	6	6	136791	136796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_012578	T	6	6	136845	136850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_012578	AAT	2	6	136865	136870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_012578	A	7	7	136926	136932	100 %	0 %	0 %	0 %	227080382
2607	NC_012578	TTG	2	6	136943	136948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080382
2608	NC_012578	AAGCC	2	10	137023	137032	40 %	0 %	20 %	40 %	227080382
2609	NC_012578	AACAGA	10	60	137071	137130	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	227080382
2610	NC_012578	TTG	2	6	137157	137162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080382
2611	NC_012578	ACCG	2	8	137173	137180	25 %	0 %	25 %	50 %	227080382
2612	NC_012578	GC	3	6	137192	137197	0 %	0 %	50 %	50 %	227080382
2613	NC_012578	CTT	2	6	137242	137247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080382
2614	NC_012578	TGA	3	9	137272	137280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080382
2615	NC_012578	GAA	2	6	137297	137302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080382
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2620	NC_012578	TC	4	8	137437	137444	0 %	50 %	0 %	50 %	227080382
2621	NC_012578	AGC	2	6	137451	137456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080382
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2623	NC_012578	TGG	2	6	137499	137504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080382
2624	NC_012578	GGGT	2	8	137514	137521	0 %	25 %	75 %	0 %	227080382
2625	NC_012578	GCAAG	2	10	137563	137572	40 %	0 %	40 %	20 %	227080382
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2627	NC_012578	ATG	2	6	137700	137705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080382
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