MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012578	GCGCT	2	10	77440	77449	0 %	20 %	40 %	40 %	227080315
1502	NC_012578	CAT	2	6	77460	77465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080315
1503	NC_012578	CAA	2	6	77491	77496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080315
1504	NC_012578	CAC	2	6	77517	77522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080315
1505	NC_012578	CAC	2	6	77581	77586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080315
1506	NC_012578	CAT	2	6	77587	77592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080315
1507	NC_012578	CAC	2	6	77664	77669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080315
1508	NC_012578	GTC	2	6	77671	77676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080315
1509	NC_012578	GCC	2	6	77769	77774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_012578	T	7	7	77807	77813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012578	TGA	2	6	77831	77836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080316
1512	NC_012578	ATT	2	6	77857	77862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080316
1513	NC_012578	GCG	2	6	77872	77877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080316
1514	NC_012578	GCA	2	6	77890	77895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080316
1515	NC_012578	GGC	2	6	77898	77903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080316
1516	NC_012578	TGC	2	6	77924	77929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080316
1517	NC_012578	A	6	6	77941	77946	100 %	0 %	0 %	0 %	227080316
1518	NC_012578	GGT	2	6	77971	77976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080316
1519	NC_012578	CGG	2	6	78008	78013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080316
1520	NC_012578	ACT	2	6	78017	78022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080316
1521	NC_012578	AGC	2	6	78206	78211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080316
1522	NC_012578	ACC	2	6	78268	78273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080316
1523	NC_012578	TGG	2	6	78299	78304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080316
1524	NC_012578	CGG	2	6	78312	78317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080316
1525	NC_012578	GC	3	6	78483	78488	0 %	0 %	50 %	50 %	227080316
1526	NC_012578	AAG	2	6	78509	78514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080316
1527	NC_012578	TGC	2	6	78554	78559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080316
1528	NC_012578	ACC	2	6	78595	78600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080316
1529	NC_012578	GTT	2	6	78630	78635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080316
1530	NC_012578	AGT	2	6	78637	78642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080316
1531	NC_012578	AAG	2	6	78647	78652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080316
1532	NC_012578	TGG	2	6	78858	78863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080316
1533	NC_012578	GATG	2	8	78939	78946	25 %	25 %	50 %	0 %	227080316
1534	NC_012578	CTGG	2	8	78950	78957	0 %	25 %	50 %	25 %	227080316
1535	NC_012578	CGG	2	6	78960	78965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080316
1536	NC_012578	CTG	2	6	79065	79070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080317
1537	NC_012578	AAT	2	6	79086	79091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080317
1538	NC_012578	ATG	2	6	79135	79140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080317
1539	NC_012578	TGCG	2	8	79193	79200	0 %	25 %	50 %	25 %	227080317
1540	NC_012578	AACC	2	8	79282	79289	50 %	0 %	0 %	50 %	227080317
1541	NC_012578	GTG	2	6	79294	79299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080317
1542	NC_012578	CAG	2	6	79356	79361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080317
1543	NC_012578	CAG	2	6	79431	79436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080317
1544	NC_012578	CAG	2	6	79443	79448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080317
1545	NC_012578	CAC	3	9	79512	79520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080317
1546	NC_012578	GCC	2	6	79585	79590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080317
1547	NC_012578	AGC	2	6	79648	79653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080317
1548	NC_012578	AATC	2	8	79695	79702	50 %	25 %	0 %	25 %	227080317
1549	NC_012578	GTA	2	6	79713	79718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080317
1550	NC_012578	GCA	2	6	79768	79773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080317
1551	NC_012578	AAGCC	2	10	79892	79901	40 %	0 %	20 %	40 %	227080317
1552	NC_012578	CG	3	6	79911	79916	0 %	0 %	50 %	50 %	227080317
1553	NC_012578	TCAT	2	8	79921	79928	25 %	50 %	0 %	25 %	227080317
1554	NC_012578	CT	3	6	79936	79941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_012578	CAA	2	6	79981	79986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_012578	AGTG	2	8	80095	80102	25 %	25 %	50 %	0 %	227080318
1557	NC_012578	TGG	2	6	80129	80134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080318
1558	NC_012578	AGC	2	6	80139	80144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1559	NC_012578	CAA	2	6	80174	80179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080318
1560	NC_012578	AGC	2	6	80184	80189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1561	NC_012578	GCA	2	6	80206	80211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1562	NC_012578	CAG	2	6	80216	80221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1563	NC_012578	AGC	2	6	80229	80234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1564	NC_012578	GCA	2	6	80245	80250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1565	NC_012578	CAG	2	6	80372	80377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1566	NC_012578	GC	3	6	80401	80406	0 %	0 %	50 %	50 %	227080318
1567	NC_012578	AAG	2	6	80442	80447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080318
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1569	NC_012578	GCA	2	6	80458	80463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1570	NC_012578	TGG	2	6	80466	80471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080318
1571	NC_012578	GCT	2	6	80491	80496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1572	NC_012578	AGC	2	6	80520	80525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1573	NC_012578	CAC	2	6	80613	80618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080318
1574	NC_012578	AGC	2	6	80625	80630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1575	NC_012578	A	6	6	80642	80647	100 %	0 %	0 %	0 %	227080318
1576	NC_012578	AAG	2	6	80742	80747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080318
1577	NC_012578	AGC	2	6	80784	80789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1578	NC_012578	GTG	2	6	80807	80812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080318
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1580	NC_012578	ACTT	2	8	81033	81040	25 %	50 %	0 %	25 %	227080318
1581	NC_012578	ACG	2	6	81183	81188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080318
1582	NC_012578	ATT	2	6	81203	81208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080318
1583	NC_012578	CAC	2	6	81220	81225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080318
1584	NC_012578	TGG	2	6	81231	81236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080318
1585	NC_012578	AGA	2	6	81343	81348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080318
1586	NC_012578	GGC	2	6	81362	81367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080318
1587	NC_012578	GC	3	6	81366	81371	0 %	0 %	50 %	50 %	227080318
1588	NC_012578	ATTG	2	8	81499	81506	25 %	50 %	25 %	0 %	227080318
1589	NC_012578	CAA	2	6	81515	81520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080318
1590	NC_012578	TAG	2	6	81546	81551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080318
1591	NC_012578	CGC	2	6	81595	81600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_012578	AAT	2	6	81624	81629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080319
1593	NC_012578	CGTA	2	8	81699	81706	25 %	25 %	25 %	25 %	227080319
1594	NC_012578	CAT	2	6	81765	81770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080319
1595	NC_012578	GCG	2	6	81866	81871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080319
1596	NC_012578	GCG	2	6	81986	81991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080319
1597	NC_012578	GAA	2	6	82027	82032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080319
1598	NC_012578	TCTG	2	8	82076	82083	0 %	50 %	25 %	25 %	227080319
1599	NC_012578	CGG	2	6	82140	82145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080319
1600	NC_012578	ATG	2	6	82253	82258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080319
1601	NC_012578	GCTATC	2	12	82265	82276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227080319
1602	NC_012578	GCAT	2	8	82292	82299	25 %	25 %	25 %	25 %	227080319
1603	NC_012578	ATG	2	6	82324	82329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080319
1604	NC_012578	TTA	2	6	82356	82361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080319
1605	NC_012578	CGG	2	6	82371	82376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080319
1606	NC_012578	GCT	2	6	82413	82418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_012578	TTGC	2	8	82425	82432	0 %	50 %	25 %	25 %	227080320
1608	NC_012578	TCA	2	6	82489	82494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080320
1609	NC_012578	GAT	2	6	82497	82502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080320
1610	NC_012578	CTG	2	6	82521	82526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080320
1611	NC_012578	AATC	2	8	82569	82576	50 %	25 %	0 %	25 %	227080320
1612	NC_012578	TCAG	2	8	82591	82598	25 %	25 %	25 %	25 %	227080320
1613	NC_012578	TGA	2	6	82609	82614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080320
1614	NC_012578	TTC	2	6	82663	82668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080320
1615	NC_012578	CAAG	2	8	82706	82713	50 %	0 %	25 %	25 %	227080320
1616	NC_012578	TGA	2	6	82765	82770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080320
1617	NC_012578	TGG	2	6	82822	82827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080320
1618	NC_012578	CA	3	6	82828	82833	50 %	0 %	0 %	50 %	227080320
1619	NC_012578	TCG	2	6	82858	82863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080320
1620	NC_012578	GC	3	6	82864	82869	0 %	0 %	50 %	50 %	227080320
1621	NC_012578	GCC	2	6	82937	82942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080320
1622	NC_012578	CAT	2	6	83120	83125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080321
1623	NC_012578	T	6	6	83160	83165	0 %	100 %	0 %	0 %	227080321
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1625	NC_012578	CCG	2	6	83285	83290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080321
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1996	NC_012578	ACAGC	2	10	104475	104484	40 %	0 %	20 %	40 %	227080344
1997	NC_012578	GGTAAG	2	12	104509	104520	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227080344
1998	NC_012578	AGA	2	6	104550	104555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080344
1999	NC_012578	AGA	2	6	104574	104579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080344
2000	NC_012578	TTGA	2	8	104620	104627	25 %	50 %	25 %	0 %	227080344

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