MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012578	GCGA	2	8	49404	49411	25 %	0 %	50 %	25 %	227080288
1002	NC_012578	CAT	2	6	49412	49417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080288
1003	NC_012578	GC	3	6	49418	49423	0 %	0 %	50 %	50 %	227080288
1004	NC_012578	AC	3	6	49447	49452	50 %	0 %	0 %	50 %	227080288
1005	NC_012578	CTC	2	6	49463	49468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227080289
1006	NC_012578	TCA	2	6	49531	49536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080289
1007	NC_012578	GAT	2	6	49556	49561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080289
1008	NC_012578	CAGA	2	8	49669	49676	50 %	0 %	25 %	25 %	227080289
1009	NC_012578	GCG	2	6	49722	49727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080289
1010	NC_012578	GCC	2	6	49751	49756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080289
1011	NC_012578	GAT	2	6	49766	49771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080289
1012	NC_012578	GAG	2	6	49822	49827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080289
1013	NC_012578	CTG	2	6	49885	49890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080289
1014	NC_012578	ATA	2	6	49929	49934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080289
1015	NC_012578	TTAT	2	8	49963	49970	25 %	75 %	0 %	0 %	227080290
1016	NC_012578	CAAG	2	8	49975	49982	50 %	0 %	25 %	25 %	227080290
1017	NC_012578	GCG	2	6	49990	49995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080290
1018	NC_012578	T	7	7	50009	50015	0 %	100 %	0 %	0 %	227080290
1019	NC_012578	TGA	2	6	50043	50048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080290
1020	NC_012578	GAA	2	6	50049	50054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080290
1021	NC_012578	ACA	2	6	50123	50128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080291
1022	NC_012578	GTTTG	2	10	50183	50192	0 %	60 %	40 %	0 %	227080291
1023	NC_012578	AGC	2	6	50242	50247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080291
1024	NC_012578	GCTA	2	8	50280	50287	25 %	25 %	25 %	25 %	227080291
1025	NC_012578	GCCA	2	8	50384	50391	25 %	0 %	25 %	50 %	227080291
1026	NC_012578	CGTG	2	8	50438	50445	0 %	25 %	50 %	25 %	227080291
1027	NC_012578	ATC	2	6	50452	50457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080291
1028	NC_012578	CAA	2	6	50544	50549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080291
1029	NC_012578	TGT	2	6	50582	50587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080291
1030	NC_012578	AAGC	2	8	50706	50713	50 %	0 %	25 %	25 %	227080292
1031	NC_012578	GAA	2	6	50717	50722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080292
1032	NC_012578	TGC	2	6	50728	50733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080292
1033	NC_012578	GCG	2	6	50766	50771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080292
1034	NC_012578	GTG	3	9	50830	50838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080292
1035	NC_012578	GTC	2	6	50956	50961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080292
1036	NC_012578	TGG	2	6	51075	51080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080292
1037	NC_012578	TGG	3	9	51083	51091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080292
1038	NC_012578	TTG	2	6	51118	51123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080292
1039	NC_012578	CGG	2	6	51254	51259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080292
1040	NC_012578	ATT	2	6	51260	51265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080292
1041	NC_012578	T	6	6	51264	51269	0 %	100 %	0 %	0 %	227080292
1042	NC_012578	GAT	2	6	51270	51275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080292
1043	NC_012578	AATG	2	8	51279	51286	50 %	25 %	25 %	0 %	227080292
1044	NC_012578	CGGT	2	8	51319	51326	0 %	25 %	50 %	25 %	227080292
1045	NC_012578	TCG	2	6	51413	51418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080292
1046	NC_012578	AATTT	2	10	51433	51442	40 %	60 %	0 %	0 %	227080292
1047	NC_012578	GGT	2	6	51480	51485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080292
1048	NC_012578	GCC	2	6	51512	51517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080292
1049	NC_012578	CAG	2	6	51760	51765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080293
1050	NC_012578	GTGC	2	8	51786	51793	0 %	25 %	50 %	25 %	227080293
1051	NC_012578	GGC	2	6	51813	51818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080293
1052	NC_012578	T	7	7	51825	51831	0 %	100 %	0 %	0 %	227080293
1053	NC_012578	AGG	2	6	51875	51880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080293
1054	NC_012578	GC	4	8	51909	51916	0 %	0 %	50 %	50 %	227080293
1055	NC_012578	A	6	6	51942	51947	100 %	0 %	0 %	0 %	227080293
1056	NC_012578	GAT	2	6	51952	51957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080293
1057	NC_012578	ACA	2	6	51974	51979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080293
1058	NC_012578	GCA	2	6	52014	52019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080293
1059	NC_012578	CGA	2	6	52037	52042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080293
1060	NC_012578	TTG	2	6	52045	52050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080293
1061	NC_012578	GGT	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080293
1062	NC_012578	GCG	2	6	52066	52071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080293
1063	NC_012578	TTA	2	6	52090	52095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080293
1064	NC_012578	CAG	2	6	52099	52104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080293
1065	NC_012578	ATG	2	6	52220	52225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080293
1066	NC_012578	ATC	2	6	52228	52233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080293
1067	NC_012578	ATG	2	6	52315	52320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080293
1068	NC_012578	ACA	2	6	52359	52364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080293
1069	NC_012578	GC	3	6	52370	52375	0 %	0 %	50 %	50 %	227080293
1070	NC_012578	CGAT	2	8	52379	52386	25 %	25 %	25 %	25 %	227080293
1071	NC_012578	T	6	6	52563	52568	0 %	100 %	0 %	0 %	227080294
1072	NC_012578	TGA	2	6	52660	52665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080294
1073	NC_012578	AGTG	2	8	52674	52681	25 %	25 %	50 %	0 %	227080294
1074	NC_012578	AAATG	2	10	52721	52730	60 %	20 %	20 %	0 %	227080294
1075	NC_012578	TGCT	2	8	52861	52868	0 %	50 %	25 %	25 %	227080295
1076	NC_012578	CAT	2	6	52947	52952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080295
1077	NC_012578	CGA	2	6	52992	52997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080295
1078	NC_012578	GCA	2	6	53025	53030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080295
1079	NC_012578	CAT	2	6	53052	53057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080295
1080	NC_012578	TGC	2	6	53176	53181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080295
1081	NC_012578	TCG	2	6	53204	53209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080295
1082	NC_012578	AGCAC	2	10	53231	53240	40 %	0 %	20 %	40 %	227080295
1083	NC_012578	TCA	2	6	53304	53309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080295
1084	NC_012578	GGTA	2	8	53332	53339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012578	TAG	2	6	53340	53345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012578	A	6	6	53409	53414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012578	A	6	6	53547	53552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012578	ACA	2	6	53562	53567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012578	GCC	2	6	53586	53591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_012578	TCT	2	6	53592	53597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_012578	AGA	2	6	53613	53618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012578	CAAT	2	8	53640	53647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_012578	TG	3	6	53649	53654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012578	TGA	2	6	53664	53669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012578	A	6	6	53770	53775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012578	GGC	2	6	53817	53822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_012578	GCA	2	6	53848	53853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_012578	GCG	2	6	53881	53886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_012578	CGA	2	6	54056	54061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012578	GAT	2	6	54081	54086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012578	GCA	2	6	54130	54135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_012578	GAA	2	6	54189	54194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012578	GGT	2	6	54232	54237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012578	AGA	2	6	54272	54277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012578	CAG	2	6	54298	54303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_012578	GGT	2	6	54363	54368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012578	G	6	6	54445	54450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012578	GGC	2	6	54509	54514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_012578	GAA	2	6	54752	54757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012578	TGC	2	6	54828	54833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_012578	GTC	2	6	54840	54845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_012578	TGG	2	6	54918	54923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012578	GGA	2	6	54954	54959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012578	GAC	2	6	54967	54972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_012578	TCA	2	6	54979	54984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_012578	AC	3	6	55005	55010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_012578	CGT	2	6	55073	55078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012578	AC	3	6	55174	55179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_012578	AAG	2	6	55210	55215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012578	GGA	2	6	55234	55239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012578	CCT	2	6	55315	55320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_012578	GAT	2	6	55326	55331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012578	TGA	2	6	55337	55342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012578	CA	3	6	55348	55353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_012578	GATT	2	8	55354	55361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012578	GCATG	2	10	55414	55423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1127	NC_012578	CCA	2	6	55455	55460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_012578	TCA	2	6	55500	55505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1130	NC_012578	TTG	2	6	55555	55560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1374	NC_012578	TCT	2	6	71263	71268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080307
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1376	NC_012578	ACC	2	6	71451	71456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1377	NC_012578	ACA	2	6	71511	71516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080308
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1384	NC_012578	ACCA	2	8	71744	71751	50 %	0 %	0 %	50 %	227080308
1385	NC_012578	CA	3	6	71782	71787	50 %	0 %	0 %	50 %	227080308
1386	NC_012578	ATT	2	6	71819	71824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080308
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