MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012578	CGA	2	6	286756	286761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080507
5502	NC_012578	TGAC	2	8	286837	286844	25 %	25 %	25 %	25 %	227080507
5503	NC_012578	TTC	2	6	286856	286861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080507
5504	NC_012578	CAAAA	2	10	287025	287034	80 %	0 %	0 %	20 %	227080508
5505	NC_012578	AGT	2	6	287085	287090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_012578	TGAT	2	8	287098	287105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_012578	CGG	2	6	287132	287137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_012578	T	6	6	287154	287159	0 %	100 %	0 %	0 %	227080509
5509	NC_012578	TTG	2	6	287217	287222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080509
5510	NC_012578	ATC	2	6	287254	287259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080509
5511	NC_012578	TGA	2	6	287315	287320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080509
5512	NC_012578	ATC	2	6	287329	287334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080509
5513	NC_012578	TG	3	6	287372	287377	0 %	50 %	50 %	0 %	227080509
5514	NC_012578	GCC	2	6	287397	287402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080509
5515	NC_012578	TCT	2	6	287503	287508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080509
5516	NC_012578	GCT	2	6	287546	287551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080509
5517	NC_012578	TTC	2	6	287730	287735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080509
5518	NC_012578	CTT	2	6	287756	287761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080509
5519	NC_012578	CCA	2	6	287762	287767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080509
5520	NC_012578	ATTGC	2	10	287815	287824	20 %	40 %	20 %	20 %	227080509
5521	NC_012578	ACGTG	2	10	287854	287863	20 %	20 %	40 %	20 %	227080509
5522	NC_012578	GTT	2	6	287898	287903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080509
5523	NC_012578	GGC	2	6	287907	287912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080509
5524	NC_012578	TACG	2	8	287963	287970	25 %	25 %	25 %	25 %	227080509
5525	NC_012578	ACC	2	6	287985	287990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080509
5526	NC_012578	GCC	3	9	287991	287999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080509
5527	NC_012578	ATA	2	6	288010	288015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080509
5528	NC_012578	TCG	2	6	288058	288063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080509
5529	NC_012578	T	6	6	288108	288113	0 %	100 %	0 %	0 %	227080509
5530	NC_012578	CCG	2	6	288272	288277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080509
5531	NC_012578	CAG	2	6	288351	288356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080509
5532	NC_012578	ATT	2	6	288496	288501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080510
5533	NC_012578	AAC	2	6	288506	288511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080510
5534	NC_012578	CAA	2	6	288547	288552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080510
5535	NC_012578	TCA	2	6	288595	288600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080510
5536	NC_012578	CTG	2	6	288730	288735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080510
5537	NC_012578	GCT	2	6	288747	288752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080510
5538	NC_012578	GCT	2	6	288771	288776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080510
5539	NC_012578	AACT	2	8	288920	288927	50 %	25 %	0 %	25 %	227080510
5540	NC_012578	CTT	2	6	288935	288940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080510
5541	NC_012578	TTTC	2	8	288960	288967	0 %	75 %	0 %	25 %	227080510
5542	NC_012578	GCA	2	6	289043	289048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080510
5543	NC_012578	TGA	2	6	289121	289126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080511
5544	NC_012578	GCC	2	6	289229	289234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080511
5545	NC_012578	ATG	2	6	289244	289249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080511
5546	NC_012578	TCAA	2	8	289283	289290	50 %	25 %	0 %	25 %	227080511
5547	NC_012578	TAA	2	6	289414	289419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080511
5548	NC_012578	TG	3	6	289489	289494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_012578	TTA	2	6	289561	289566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_012578	GCA	2	6	289602	289607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_012578	AGA	2	6	289730	289735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_012578	GA	3	6	289741	289746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_012578	GCAA	2	8	289789	289796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_012578	CTT	2	6	290062	290067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080512
5555	NC_012578	CAT	2	6	290095	290100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080512
5556	NC_012578	CGG	2	6	290158	290163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080512
5557	NC_012578	CCA	2	6	290185	290190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080512
5558	NC_012578	AGT	2	6	290266	290271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080512
5559	NC_012578	AGC	2	6	290397	290402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080512
5560	NC_012578	GCTG	2	8	290457	290464	0 %	25 %	50 %	25 %	227080512
5561	NC_012578	AAG	2	6	290472	290477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080512
5562	NC_012578	GTG	2	6	290521	290526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080512
5563	NC_012578	CCG	2	6	290538	290543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080512
5564	NC_012578	CCA	2	6	290555	290560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080512
5565	NC_012578	TTC	2	6	290579	290584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080512
5566	NC_012578	GTA	2	6	290600	290605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080512
5567	NC_012578	TCA	2	6	290688	290693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080512
5568	NC_012578	ACC	2	6	290760	290765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080512
5569	NC_012578	TGCG	2	8	290773	290780	0 %	25 %	50 %	25 %	227080512
5570	NC_012578	GTG	2	6	290781	290786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080512
5571	NC_012578	GTG	2	6	290964	290969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080512
5572	NC_012578	TCT	2	6	291042	291047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080512
5573	NC_012578	CCA	2	6	291086	291091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080512
5574	NC_012578	GCC	2	6	291122	291127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080512
5575	NC_012578	GCC	2	6	291218	291223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080512
5576	NC_012578	TCG	2	6	291234	291239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080512
5577	NC_012578	CCAG	2	8	291279	291286	25 %	0 %	25 %	50 %	227080512
5578	NC_012578	CCA	2	6	291303	291308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080512
5579	NC_012578	CCG	2	6	291358	291363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080512
5580	NC_012578	ACA	2	6	291393	291398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080512
5581	NC_012578	CTT	2	6	291448	291453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080512
5582	NC_012578	GTC	2	6	291494	291499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080512
5583	NC_012578	GT	3	6	291624	291629	0 %	50 %	50 %	0 %	227080512
5584	NC_012578	CGA	2	6	291658	291663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080512
5585	NC_012578	GAG	2	6	291854	291859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_012578	TTCGT	2	10	291864	291873	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5587	NC_012578	TCAG	2	8	291883	291890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_012578	TG	3	6	291939	291944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_012578	GA	3	6	291972	291977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_012578	CGC	2	6	291981	291986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_012578	AC	3	6	292001	292006	50 %	0 %	0 %	50 %	227080513
5592	NC_012578	GCG	2	6	292060	292065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080513
5593	NC_012578	CAT	2	6	292085	292090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080513
5594	NC_012578	GGC	2	6	292118	292123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080513
5595	NC_012578	TGG	2	6	292363	292368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080513
5596	NC_012578	GC	3	6	292412	292417	0 %	0 %	50 %	50 %	227080513
5597	NC_012578	GCG	2	6	292474	292479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080513
5598	NC_012578	TGG	2	6	292514	292519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080513
5599	NC_012578	CGAG	2	8	292529	292536	25 %	0 %	50 %	25 %	227080513
5600	NC_012578	GC	3	6	292551	292556	0 %	0 %	50 %	50 %	227080513
5601	NC_012578	TAA	2	6	292614	292619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080513
5602	NC_012578	TCA	2	6	292625	292630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080513
5603	NC_012578	T	6	6	292679	292684	0 %	100 %	0 %	0 %	227080514
5604	NC_012578	CAC	2	6	292685	292690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080514
5605	NC_012578	GTT	2	6	292732	292737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080514
5606	NC_012578	GTTG	2	8	292747	292754	0 %	50 %	50 %	0 %	227080514
5607	NC_012578	GTGCT	2	10	292755	292764	0 %	40 %	40 %	20 %	227080514
5608	NC_012578	GCT	2	6	292774	292779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080514
5609	NC_012578	T	6	6	292853	292858	0 %	100 %	0 %	0 %	227080514
5610	NC_012578	GC	3	6	292920	292925	0 %	0 %	50 %	50 %	227080514
5611	NC_012578	CTTG	2	8	292972	292979	0 %	50 %	25 %	25 %	227080514
5612	NC_012578	TGC	2	6	293076	293081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080514
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5615	NC_012578	GCA	2	6	293281	293286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080514
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5617	NC_012578	ATG	2	6	293346	293351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080514
5618	NC_012578	CCGAG	2	10	293398	293407	20 %	0 %	40 %	40 %	227080514
5619	NC_012578	ACT	2	6	293409	293414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080514
5620	NC_012578	GCA	2	6	293417	293422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080514
5621	NC_012578	GGA	2	6	293439	293444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080514
5622	NC_012578	GAT	2	6	293468	293473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080514
5623	NC_012578	TGTT	2	8	293556	293563	0 %	75 %	25 %	0 %	227080514
5624	NC_012578	GGC	2	6	293564	293569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080514
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5645	NC_012578	TGC	2	6	294402	294407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080514
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5749	NC_012578	T	6	6	299938	299943	0 %	100 %	0 %	0 %	227080518
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5751	NC_012578	GC	3	6	300124	300129	0 %	0 %	50 %	50 %	227080518
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5756	NC_012578	GTACC	2	10	300411	300420	20 %	20 %	20 %	40 %	227080518
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5763	NC_012578	CAC	2	6	300633	300638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080518
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5866	NC_012578	CAA	2	6	305374	305379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5867	NC_012578	AGT	2	6	305442	305447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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