MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_012578	TCG	2	6	2873891	2873896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082870
55003	NC_012578	GGC	3	9	2874040	2874048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082870
55004	NC_012578	CCA	3	9	2874089	2874097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082870
55005	NC_012578	CAT	2	6	2874126	2874131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082870
55006	NC_012578	GGC	2	6	2874142	2874147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082870
55007	NC_012578	ATC	2	6	2874193	2874198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082870
55008	NC_012578	CG	3	6	2874217	2874222	0 %	0 %	50 %	50 %	227082870
55009	NC_012578	GAA	2	6	2874223	2874228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082870
55010	NC_012578	CAC	2	6	2874291	2874296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082870
55011	NC_012578	GAA	2	6	2874313	2874318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082870
55012	NC_012578	CAG	2	6	2874343	2874348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082870
55013	NC_012578	AAGC	2	8	2874369	2874376	50 %	0 %	25 %	25 %	227082870
55014	NC_012578	ATG	2	6	2874385	2874390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082870
55015	NC_012578	TGG	2	6	2874413	2874418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082870
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55017	NC_012578	GAA	2	6	2874472	2874477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082870
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55019	NC_012578	TGC	2	6	2874498	2874503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082870
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55024	NC_012578	TGA	2	6	2874719	2874724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082870
55025	NC_012578	CGCAC	2	10	2874732	2874741	20 %	0 %	20 %	60 %	227082870
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55041	NC_012578	A	6	6	2875501	2875506	100 %	0 %	0 %	0 %	227082870
55042	NC_012578	GCG	2	6	2875547	2875552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082870
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55059	NC_012578	TG	3	6	2876063	2876068	0 %	50 %	50 %	0 %	227082871
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55062	NC_012578	ATG	2	6	2876190	2876195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082871
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55235	NC_012578	AGAC	2	8	2884067	2884074	50 %	0 %	25 %	25 %	227082878
55236	NC_012578	TCA	2	6	2884097	2884102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082878
55237	NC_012578	CGC	2	6	2884176	2884181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082878
55238	NC_012578	AGC	2	6	2884194	2884199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082878
55239	NC_012578	ACC	2	6	2884215	2884220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082878
55240	NC_012578	AG	3	6	2884221	2884226	50 %	0 %	50 %	0 %	227082878
55241	NC_012578	CTT	2	6	2884227	2884232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082878
55242	NC_012578	CAC	2	6	2884253	2884258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082878
55243	NC_012578	CAGTT	2	10	2884314	2884323	20 %	40 %	20 %	20 %	227082878
55244	NC_012578	GAT	2	6	2884401	2884406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082878
55245	NC_012578	TTCAC	2	10	2884438	2884447	20 %	40 %	0 %	40 %	227082878
55246	NC_012578	TAG	2	6	2884497	2884502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082878
55247	NC_012578	TGG	2	6	2884548	2884553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082878
55248	NC_012578	ACG	2	6	2884554	2884559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082878
55249	NC_012578	TGCAG	2	10	2884687	2884696	20 %	20 %	40 %	20 %	227082878
55250	NC_012578	CCA	2	6	2884715	2884720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082878
55251	NC_012578	CAA	2	6	2884721	2884726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082878
55252	NC_012578	ATAG	2	8	2884806	2884813	50 %	25 %	25 %	0 %	227082878
55253	NC_012578	TGA	2	6	2884838	2884843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082878
55254	NC_012578	GAT	2	6	2884887	2884892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082878
55255	NC_012578	ATC	2	6	2884921	2884926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082878
55256	NC_012578	CGAT	2	8	2884975	2884982	25 %	25 %	25 %	25 %	227082878
55257	NC_012578	GTTT	2	8	2885014	2885021	0 %	75 %	25 %	0 %	227082878
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55259	NC_012578	TAC	2	6	2885166	2885171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082878
55260	NC_012578	CAGTGC	2	12	2885199	2885210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227082878
55261	NC_012578	CGATA	2	10	2885292	2885301	40 %	20 %	20 %	20 %	227082878
55262	NC_012578	AAC	2	6	2885325	2885330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082878
55263	NC_012578	GTT	2	6	2885348	2885353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082878
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55265	NC_012578	GCT	2	6	2885544	2885549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082879
55266	NC_012578	TGC	2	6	2885556	2885561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082879
55267	NC_012578	TGT	2	6	2885576	2885581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082879
55268	NC_012578	TCT	2	6	2885622	2885627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082879
55269	NC_012578	GAC	2	6	2885682	2885687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082879
55270	NC_012578	T	6	6	2885816	2885821	0 %	100 %	0 %	0 %	227082879
55271	NC_012578	AGCA	2	8	2885839	2885846	50 %	0 %	25 %	25 %	227082879
55272	NC_012578	GCT	2	6	2885894	2885899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082879
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55277	NC_012578	TCT	2	6	2886308	2886313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082880
55278	NC_012578	CGG	2	6	2886339	2886344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082880
55279	NC_012578	CA	3	6	2886346	2886351	50 %	0 %	0 %	50 %	227082880
55280	NC_012578	CA	3	6	2886367	2886372	50 %	0 %	0 %	50 %	227082880
55281	NC_012578	AGCT	2	8	2886502	2886509	25 %	25 %	25 %	25 %	227082881
55282	NC_012578	CAG	2	6	2886577	2886582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082881
55283	NC_012578	GAT	2	6	2886589	2886594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082881
55284	NC_012578	GCA	2	6	2886609	2886614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082881
55285	NC_012578	CAA	2	6	2886705	2886710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082881
55286	NC_012578	TTA	2	6	2886794	2886799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082882
55287	NC_012578	CAT	2	6	2886845	2886850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082882
55288	NC_012578	CCAT	2	8	2886910	2886917	25 %	25 %	0 %	50 %	227082882
55289	NC_012578	GCA	2	6	2886931	2886936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082882
55290	NC_012578	ACT	2	6	2886957	2886962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082882
55291	NC_012578	CAG	2	6	2887016	2887021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082882
55292	NC_012578	TCAA	2	8	2887032	2887039	50 %	25 %	0 %	25 %	227082882
55293	NC_012578	GTA	2	6	2887127	2887132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082882
55294	NC_012578	ATC	2	6	2887134	2887139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082882
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55296	NC_012578	CAC	2	6	2887193	2887198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082882
55297	NC_012578	TGCTG	2	10	2887224	2887233	0 %	40 %	40 %	20 %	227082882
55298	NC_012578	GGTAA	2	10	2887234	2887243	40 %	20 %	40 %	0 %	227082882
55299	NC_012578	CAA	2	6	2887287	2887292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082882
55300	NC_012578	AGTG	2	8	2887298	2887305	25 %	25 %	50 %	0 %	227082882
55301	NC_012578	ACC	2	6	2887371	2887376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082882
55302	NC_012578	AGA	2	6	2887474	2887479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082882
55303	NC_012578	GGT	2	6	2887558	2887563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082882
55304	NC_012578	T	6	6	2887621	2887626	0 %	100 %	0 %	0 %	227082883
55305	NC_012578	GTT	2	6	2887627	2887632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082883
55306	NC_012578	TGA	2	6	2887746	2887751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082883
55307	NC_012578	CG	4	8	2887801	2887808	0 %	0 %	50 %	50 %	227082883
55308	NC_012578	CCA	2	6	2887865	2887870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082883
55309	NC_012578	CAC	2	6	2888028	2888033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55310	NC_012578	TCA	2	6	2888240	2888245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082884
55311	NC_012578	TGC	2	6	2888299	2888304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082884
55312	NC_012578	TTG	2	6	2888332	2888337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082884
55313	NC_012578	TCT	2	6	2888348	2888353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082884
55314	NC_012578	T	6	6	2888360	2888365	0 %	100 %	0 %	0 %	227082884
55315	NC_012578	T	7	7	2888389	2888395	0 %	100 %	0 %	0 %	227082884
55316	NC_012578	CTT	2	6	2888428	2888433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082884
55317	NC_012578	TGC	2	6	2888441	2888446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082884
55318	NC_012578	AGA	2	6	2888480	2888485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082884
55319	NC_012578	GCA	2	6	2888559	2888564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082884
55320	NC_012578	CGTG	2	8	2888578	2888585	0 %	25 %	50 %	25 %	227082884
55321	NC_012578	CTG	2	6	2888608	2888613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082884
55322	NC_012578	CAC	2	6	2888718	2888723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082884
55323	NC_012578	CTTG	2	8	2888733	2888740	0 %	50 %	25 %	25 %	227082884
55324	NC_012578	GGC	2	6	2888776	2888781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082884
55325	NC_012578	ACG	2	6	2888788	2888793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082884
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55327	NC_012578	ATA	2	6	2888852	2888857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082884
55328	NC_012578	GCC	2	6	2888876	2888881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082884
55329	NC_012578	CCG	2	6	2888973	2888978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082884
55330	NC_012578	GACT	2	8	2888984	2888991	25 %	25 %	25 %	25 %	227082884
55331	NC_012578	TGC	2	6	2889005	2889010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082884
55332	NC_012578	AGT	2	6	2889038	2889043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082884
55333	NC_012578	GTT	3	9	2889096	2889104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55334	NC_012578	TAC	2	6	2889260	2889265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082885
55335	NC_012578	CGG	2	6	2889368	2889373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082885
55336	NC_012578	CGG	2	6	2889455	2889460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082885
55337	NC_012578	AAG	2	6	2889480	2889485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082885
55338	NC_012578	AAG	2	6	2889491	2889496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082885
55339	NC_012578	CAAT	2	8	2889502	2889509	50 %	25 %	0 %	25 %	227082885
55340	NC_012578	GGC	2	6	2889618	2889623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082885
55341	NC_012578	ACC	2	6	2889769	2889774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082885
55342	NC_012578	GGC	2	6	2889804	2889809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082885
55343	NC_012578	GTT	3	9	2889823	2889831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082885
55344	NC_012578	TCA	3	9	2889999	2890007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082886
55345	NC_012578	TTG	2	6	2890170	2890175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082886
55346	NC_012578	ACC	2	6	2890338	2890343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082886
55347	NC_012578	AGC	2	6	2890425	2890430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082886
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55349	NC_012578	TGC	2	6	2890458	2890463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082886
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55388	NC_012578	T	6	6	2892509	2892514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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