MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_012578	TCG	2	6	261739	261744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080486
5003	NC_012578	TGC	2	6	261802	261807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080486
5004	NC_012578	TCT	2	6	261868	261873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080486
5005	NC_012578	CAT	2	6	261939	261944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080486
5006	NC_012578	CAC	2	6	261981	261986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080486
5007	NC_012578	CATCA	2	10	261999	262008	40 %	20 %	0 %	40 %	227080486
5008	NC_012578	TGC	2	6	262036	262041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080486
5009	NC_012578	AAC	2	6	262048	262053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080486
5010	NC_012578	TGT	2	6	262079	262084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080486
5011	NC_012578	TGC	2	6	262132	262137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080486
5012	NC_012578	TCA	2	6	262147	262152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080486
5013	NC_012578	GCG	2	6	262190	262195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080486
5014	NC_012578	GTT	2	6	262236	262241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080486
5015	NC_012578	CATCGC	2	12	262290	262301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227080486
5016	NC_012578	GC	3	6	262338	262343	0 %	0 %	50 %	50 %	227080486
5017	NC_012578	GCA	2	6	262406	262411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080486
5018	NC_012578	GA	3	6	262413	262418	50 %	0 %	50 %	0 %	227080486
5019	NC_012578	CAG	2	6	262505	262510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080486
5020	NC_012578	ACC	2	6	262540	262545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080486
5021	NC_012578	GCA	2	6	262567	262572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080486
5022	NC_012578	TTG	2	6	262671	262676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080486
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5024	NC_012578	TCT	2	6	262826	262831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_012578	GAA	2	6	262874	262879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_012578	T	6	6	262911	262916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012578	TC	3	6	262979	262984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_012578	GTT	2	6	263031	263036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012578	TCGAT	2	10	263125	263134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5032	NC_012578	TAC	2	6	263440	263445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080488
5033	NC_012578	AGC	2	6	263481	263486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080488
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5036	NC_012578	ATCA	2	8	263561	263568	50 %	25 %	0 %	25 %	227080488
5037	NC_012578	TGG	2	6	263575	263580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080488
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5039	NC_012578	AAG	2	6	263793	263798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080488
5040	NC_012578	CAG	2	6	263813	263818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080488
5041	NC_012578	ATGA	2	8	263846	263853	50 %	25 %	25 %	0 %	227080488
5042	NC_012578	ACAA	2	8	263916	263923	75 %	0 %	0 %	25 %	227080488
5043	NC_012578	CGA	2	6	264100	264105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080488
5044	NC_012578	GCT	2	6	264106	264111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080488
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5048	NC_012578	A	6	6	264213	264218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_012578	T	6	6	264234	264239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012578	AAG	2	6	264248	264253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_012578	CG	3	6	264290	264295	0 %	0 %	50 %	50 %	227080489
5052	NC_012578	CGG	2	6	264309	264314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080489
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5054	NC_012578	CA	3	6	264400	264405	50 %	0 %	0 %	50 %	227080489
5055	NC_012578	CAC	2	6	264425	264430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080489
5056	NC_012578	TCACC	2	10	264505	264514	20 %	20 %	0 %	60 %	227080489
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5059	NC_012578	GCT	2	6	264615	264620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080489
5060	NC_012578	CAT	2	6	264653	264658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080489
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5062	NC_012578	CAC	2	6	264839	264844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080489
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5071	NC_012578	TGCGC	2	10	265257	265266	0 %	20 %	40 %	40 %	227080489
5072	NC_012578	TTGGG	2	10	265268	265277	0 %	40 %	60 %	0 %	227080489
5073	NC_012578	CCA	2	6	265312	265317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080489
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5080	NC_012578	GCA	2	6	265741	265746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080490
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5088	NC_012578	TCAAA	2	10	266066	266075	60 %	20 %	0 %	20 %	227080490
5089	NC_012578	CAC	2	6	266099	266104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080490
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5096	NC_012578	GGCT	2	8	266358	266365	0 %	25 %	50 %	25 %	227080490
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5103	NC_012578	CTT	2	6	266588	266593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080490
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5112	NC_012578	CAC	3	9	266898	266906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080490
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5121	NC_012578	A	6	6	267291	267296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5123	NC_012578	TTA	2	6	267361	267366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_012578	AAT	2	6	267401	267406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_012578	A	6	6	267411	267416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5248	NC_012578	ACC	2	6	273206	273211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080495
5249	NC_012578	TGA	2	6	273262	273267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080495
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5251	NC_012578	TGA	2	6	273379	273384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080495
5252	NC_012578	CTG	2	6	273422	273427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080495
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5262	NC_012578	CT	4	8	274030	274037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5263	NC_012578	T	6	6	274037	274042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_012578	CGT	2	6	274066	274071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5370	NC_012578	GC	3	6	279941	279946	0 %	0 %	50 %	50 %	227080500
5371	NC_012578	GCC	2	6	279964	279969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080500
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5375	NC_012578	CAG	2	6	280198	280203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080500
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5402	NC_012578	CAGT	2	8	281484	281491	25 %	25 %	25 %	25 %	227080501
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5463	NC_012578	TG	4	8	284547	284554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5464	NC_012578	TAA	2	6	284567	284572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5465	NC_012578	A	6	6	284571	284576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5474	NC_012578	CTCTT	2	10	284923	284932	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5475	NC_012578	ATG	2	6	284937	284942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080505
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5481	NC_012578	GCA	2	6	285558	285563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080505
5482	NC_012578	T	6	6	285592	285597	0 %	100 %	0 %	0 %	227080505
5483	NC_012578	GAT	2	6	285622	285627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080505
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5487	NC_012578	TGA	2	6	285884	285889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080505
5488	NC_012578	GC	3	6	285933	285938	0 %	0 %	50 %	50 %	227080506
5489	NC_012578	T	7	7	285949	285955	0 %	100 %	0 %	0 %	227080506
5490	NC_012578	CTAGC	2	10	286043	286052	20 %	20 %	20 %	40 %	227080507
5491	NC_012578	TGA	2	6	286198	286203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080507
5492	NC_012578	GCCA	2	8	286226	286233	25 %	0 %	25 %	50 %	227080507
5493	NC_012578	ACC	2	6	286245	286250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080507
5494	NC_012578	CCA	2	6	286258	286263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080507
5495	NC_012578	GGC	2	6	286400	286405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080507
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5497	NC_012578	GTGC	2	8	286502	286509	0 %	25 %	50 %	25 %	227080507
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5500	NC_012578	CAGC	2	8	286687	286694	25 %	0 %	25 %	50 %	227080507

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