MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012578	GTG	2	6	236714	236719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080463
4502	NC_012578	ATAA	2	8	236788	236795	75 %	25 %	0 %	0 %	227080463
4503	NC_012578	AT	3	6	236824	236829	50 %	50 %	0 %	0 %	227080463
4504	NC_012578	TG	3	6	236864	236869	0 %	50 %	50 %	0 %	227080463
4505	NC_012578	CTG	2	6	236918	236923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080463
4506	NC_012578	A	6	6	236932	236937	100 %	0 %	0 %	0 %	227080463
4507	NC_012578	GGT	2	6	237004	237009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080463
4508	NC_012578	A	6	6	237057	237062	100 %	0 %	0 %	0 %	227080463
4509	NC_012578	TGC	2	6	237135	237140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080463
4510	NC_012578	TAT	2	6	237288	237293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080463
4511	NC_012578	TGA	2	6	237329	237334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080463
4512	NC_012578	CTT	2	6	237336	237341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080463
4513	NC_012578	AAT	2	6	237346	237351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080463
4514	NC_012578	GAT	2	6	237490	237495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080463
4515	NC_012578	ATT	2	6	237527	237532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080463
4516	NC_012578	A	7	7	237559	237565	100 %	0 %	0 %	0 %	227080464
4517	NC_012578	TAG	2	6	237571	237576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080464
4518	NC_012578	CCT	2	6	237591	237596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227080464
4519	NC_012578	AAATTG	2	12	237670	237681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227080464
4520	NC_012578	A	6	6	237721	237726	100 %	0 %	0 %	0 %	227080464
4521	NC_012578	AT	3	6	237736	237741	50 %	50 %	0 %	0 %	227080464
4522	NC_012578	CTA	2	6	237772	237777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080464
4523	NC_012578	A	7	7	237777	237783	100 %	0 %	0 %	0 %	227080464
4524	NC_012578	ATGT	2	8	237885	237892	25 %	50 %	25 %	0 %	227080464
4525	NC_012578	TAT	2	6	237910	237915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080464
4526	NC_012578	TA	3	6	237919	237924	50 %	50 %	0 %	0 %	227080464
4527	NC_012578	AAG	2	6	237941	237946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080464
4528	NC_012578	CTAC	2	8	237981	237988	25 %	25 %	0 %	50 %	227080464
4529	NC_012578	ATC	2	6	237993	237998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080464
4530	NC_012578	GTG	2	6	238018	238023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080464
4531	NC_012578	GTTT	2	8	238049	238056	0 %	75 %	25 %	0 %	227080464
4532	NC_012578	CTG	2	6	238084	238089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080464
4533	NC_012578	ATT	2	6	238137	238142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080464
4534	NC_012578	TCAA	2	8	238145	238152	50 %	25 %	0 %	25 %	227080464
4535	NC_012578	ATT	2	6	238231	238236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080464
4536	NC_012578	CAA	2	6	238251	238256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080464
4537	NC_012578	AAG	2	6	238311	238316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080464
4538	NC_012578	ATC	2	6	238339	238344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080464
4539	NC_012578	TAT	2	6	238360	238365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080464
4540	NC_012578	ATTTT	2	10	238498	238507	20 %	80 %	0 %	0 %	227080464
4541	NC_012578	GA	3	6	238557	238562	50 %	0 %	50 %	0 %	227080464
4542	NC_012578	ATT	2	6	238588	238593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080464
4543	NC_012578	CT	4	8	238601	238608	0 %	50 %	0 %	50 %	227080464
4544	NC_012578	GGT	2	6	238650	238655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080464
4545	NC_012578	GAA	2	6	238740	238745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080464
4546	NC_012578	GAAA	2	8	238787	238794	75 %	0 %	25 %	0 %	227080464
4547	NC_012578	AT	3	6	238832	238837	50 %	50 %	0 %	0 %	227080464
4548	NC_012578	T	6	6	238911	238916	0 %	100 %	0 %	0 %	227080464
4549	NC_012578	T	6	6	238949	238954	0 %	100 %	0 %	0 %	227080465
4550	NC_012578	GAT	2	6	239107	239112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080465
4551	NC_012578	AT	3	6	239254	239259	50 %	50 %	0 %	0 %	227080465
4552	NC_012578	TTC	3	9	239273	239281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080465
4553	NC_012578	ATA	2	6	239282	239287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080465
4554	NC_012578	ACCA	2	8	239289	239296	50 %	0 %	0 %	50 %	227080465
4555	NC_012578	GCTA	2	8	239392	239399	25 %	25 %	25 %	25 %	227080465
4556	NC_012578	CTTT	2	8	239468	239475	0 %	75 %	0 %	25 %	227080465
4557	NC_012578	AATT	2	8	239561	239568	50 %	50 %	0 %	0 %	227080465
4558	NC_012578	ATA	2	6	239578	239583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080465
4559	NC_012578	TAG	2	6	239618	239623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080465
4560	NC_012578	A	6	6	239677	239682	100 %	0 %	0 %	0 %	227080465
4561	NC_012578	T	6	6	239687	239692	0 %	100 %	0 %	0 %	227080465
4562	NC_012578	GTA	2	6	239697	239702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080465
4563	NC_012578	ACA	2	6	239768	239773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080466
4564	NC_012578	TGG	2	6	239788	239793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080466
4565	NC_012578	AGA	2	6	239869	239874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080466
4566	NC_012578	TAT	2	6	239890	239895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080466
4567	NC_012578	CCA	2	6	239951	239956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080466
4568	NC_012578	TGAC	2	8	239997	240004	25 %	25 %	25 %	25 %	227080466
4569	NC_012578	CAA	2	6	240092	240097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080466
4570	NC_012578	GAA	2	6	240104	240109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080466
4571	NC_012578	AT	3	6	240219	240224	50 %	50 %	0 %	0 %	227080466
4572	NC_012578	TGA	2	6	240253	240258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080466
4573	NC_012578	AAG	2	6	240302	240307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080466
4574	NC_012578	GTT	2	6	240317	240322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080466
4575	NC_012578	TCT	2	6	240326	240331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080466
4576	NC_012578	ACT	2	6	240426	240431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080466
4577	NC_012578	A	6	6	240446	240451	100 %	0 %	0 %	0 %	227080466
4578	NC_012578	A	6	6	240465	240470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_012578	GAA	2	6	240514	240519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080467
4580	NC_012578	A	6	6	240518	240523	100 %	0 %	0 %	0 %	227080467
4581	NC_012578	TAT	2	6	240564	240569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080467
4582	NC_012578	TAA	2	6	240570	240575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080467
4583	NC_012578	AAT	2	6	240627	240632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080467
4584	NC_012578	AGT	2	6	240657	240662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080467
4585	NC_012578	AGA	2	6	240690	240695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080467
4586	NC_012578	TAAT	2	8	240719	240726	50 %	50 %	0 %	0 %	227080467
4587	NC_012578	GA	3	6	240753	240758	50 %	0 %	50 %	0 %	227080468
4588	NC_012578	A	8	8	240848	240855	100 %	0 %	0 %	0 %	227080468
4589	NC_012578	TAA	2	6	240914	240919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080468
4590	NC_012578	TATT	2	8	241042	241049	25 %	75 %	0 %	0 %	227080468
4591	NC_012578	A	6	6	241051	241056	100 %	0 %	0 %	0 %	227080468
4592	NC_012578	TTA	2	6	241066	241071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080468
4593	NC_012578	ATAG	2	8	241077	241084	50 %	25 %	25 %	0 %	227080468
4594	NC_012578	ATA	2	6	241096	241101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080468
4595	NC_012578	TAC	2	6	241151	241156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080468
4596	NC_012578	A	6	6	241229	241234	100 %	0 %	0 %	0 %	227080468
4597	NC_012578	GGT	2	6	241317	241322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080468
4598	NC_012578	GCT	2	6	241336	241341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080468
4599	NC_012578	AT	3	6	241424	241429	50 %	50 %	0 %	0 %	227080468
4600	NC_012578	ATG	2	6	241612	241617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080468
4601	NC_012578	ATC	2	6	241662	241667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080468
4602	NC_012578	ATA	2	6	241669	241674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080468
4603	NC_012578	GTT	2	6	241815	241820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080468
4604	NC_012578	AAT	2	6	241856	241861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080468
4605	NC_012578	GGC	2	6	241869	241874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080468
4606	NC_012578	A	6	6	241875	241880	100 %	0 %	0 %	0 %	227080468
4607	NC_012578	TAT	2	6	241906	241911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080468
4608	NC_012578	GCT	2	6	241944	241949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080468
4609	NC_012578	TTG	2	6	241990	241995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080468
4610	NC_012578	A	6	6	242079	242084	100 %	0 %	0 %	0 %	227080468
4611	NC_012578	TATAG	2	10	242085	242094	40 %	40 %	20 %	0 %	227080468
4612	NC_012578	TCT	2	6	242145	242150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080468
4613	NC_012578	TAG	2	6	242253	242258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080469
4614	NC_012578	TTA	3	9	242274	242282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080469
4615	NC_012578	CCTT	2	8	242285	242292	0 %	50 %	0 %	50 %	227080469
4616	NC_012578	TTA	2	6	242328	242333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080469
4617	NC_012578	GGC	2	6	242450	242455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080469
4618	NC_012578	TGC	2	6	242572	242577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080469
4619	NC_012578	CAA	2	6	242583	242588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080469
4620	NC_012578	GGCT	2	8	242596	242603	0 %	25 %	50 %	25 %	227080469
4621	NC_012578	GCT	2	6	242618	242623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080469
4622	NC_012578	T	6	6	242674	242679	0 %	100 %	0 %	0 %	227080469
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4624	NC_012578	CT	4	8	242757	242764	0 %	50 %	0 %	50 %	227080469
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