MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	GAAC	2	8	298	305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011185	AGAC	2	8	458	465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011185	AGAC	2	8	492	499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011185	TAAC	2	8	1136	1143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011185	ATTG	2	8	1205	1212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011185	AGAA	2	8	1267	1274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011185	TTAC	2	8	1411	1418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011185	TTAT	2	8	1434	1441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011185	TGTT	2	8	1517	1524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011185	AAAT	2	8	2103	2110	75 %	25 %	0 %	0 %	197336538
11	NC_011185	AACT	2	8	2193	2200	50 %	25 %	0 %	25 %	197336538
12	NC_011185	CTCA	2	8	3440	3447	25 %	25 %	0 %	50 %	197336538
13	NC_011185	AGGT	2	8	4791	4798	25 %	25 %	50 %	0 %	197336485
14	NC_011185	ATTA	2	8	5028	5035	50 %	50 %	0 %	0 %	197336485
15	NC_011185	GTTT	2	8	5547	5554	0 %	75 %	25 %	0 %	197336485
16	NC_011185	ACTT	2	8	6069	6076	25 %	50 %	0 %	25 %	197336564
17	NC_011185	ATGA	2	8	6101	6108	50 %	25 %	25 %	0 %	197336564
18	NC_011185	GTTG	2	8	6147	6154	0 %	50 %	50 %	0 %	197336564
19	NC_011185	ATTT	2	8	6155	6162	25 %	75 %	0 %	0 %	197336564
20	NC_011185	AGTG	2	8	6506	6513	25 %	25 %	50 %	0 %	197336564
21	NC_011185	CATT	2	8	6561	6568	25 %	50 %	0 %	25 %	197336564
22	NC_011185	TAAA	2	8	6622	6629	75 %	25 %	0 %	0 %	197336564
23	NC_011185	TTTC	2	8	6844	6851	0 %	75 %	0 %	25 %	197336564
24	NC_011185	TTAA	2	8	6939	6946	50 %	50 %	0 %	0 %	197336564
25	NC_011185	ATGC	2	8	6988	6995	25 %	25 %	25 %	25 %	197336576
26	NC_011185	CTAA	2	8	7072	7079	50 %	25 %	0 %	25 %	197336576
27	NC_011185	TTCA	2	8	7188	7195	25 %	50 %	0 %	25 %	197336576
28	NC_011185	CAAG	2	8	7265	7272	50 %	0 %	25 %	25 %	197336576
29	NC_011185	CTAT	2	8	7878	7885	25 %	50 %	0 %	25 %	197336517
30	NC_011185	TATT	2	8	8256	8263	25 %	75 %	0 %	0 %	197336517
31	NC_011185	TGAT	2	8	8734	8741	25 %	50 %	25 %	0 %	197336573
32	NC_011185	GTAA	2	8	8808	8815	50 %	25 %	25 %	0 %	197336573
33	NC_011185	CTTT	2	8	9086	9093	0 %	75 %	0 %	25 %	197336573
34	NC_011185	TAAA	2	8	9415	9422	75 %	25 %	0 %	0 %	197336573
35	NC_011185	GAAA	2	8	9503	9510	75 %	0 %	25 %	0 %	197336573
36	NC_011185	ACCA	2	8	9700	9707	50 %	0 %	0 %	50 %	197336573
37	NC_011185	ATCT	2	8	9708	9715	25 %	50 %	0 %	25 %	197336573
38	NC_011185	GTTT	3	12	10296	10307	0 %	75 %	25 %	0 %	197336664
39	NC_011185	CTAA	2	8	10753	10760	50 %	25 %	0 %	25 %	197336664
40	NC_011185	AATT	2	8	11348	11355	50 %	50 %	0 %	0 %	197336569
41	NC_011185	GCTC	2	8	11361	11368	0 %	25 %	25 %	50 %	197336569
42	NC_011185	TGCT	2	8	11846	11853	0 %	50 %	25 %	25 %	197336569
43	NC_011185	TTAA	2	8	11967	11974	50 %	50 %	0 %	0 %	197336569
44	NC_011185	TTTA	2	8	12134	12141	25 %	75 %	0 %	0 %	197336569
45	NC_011185	TATT	2	8	12172	12179	25 %	75 %	0 %	0 %	197336569
46	NC_011185	TTTC	2	8	12487	12494	0 %	75 %	0 %	25 %	197336569
47	NC_011185	ATTT	2	8	12957	12964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011185	CAAT	2	8	13542	13549	50 %	25 %	0 %	25 %	197336490
49	NC_011185	TGAT	2	8	13705	13712	25 %	50 %	25 %	0 %	197336490
50	NC_011185	TCCT	2	8	13744	13751	0 %	50 %	0 %	50 %	197336490
51	NC_011185	TAAA	2	8	14900	14907	75 %	25 %	0 %	0 %	197336574
52	NC_011185	ATGG	2	8	15675	15682	25 %	25 %	50 %	0 %	197336575
53	NC_011185	GCTT	2	8	15698	15705	0 %	50 %	25 %	25 %	197336575
54	NC_011185	CTTG	2	8	15960	15967	0 %	50 %	25 %	25 %	197336575
55	NC_011185	GAAC	2	8	16084	16091	50 %	0 %	25 %	25 %	197336575
56	NC_011185	GAAC	2	8	16209	16216	50 %	0 %	25 %	25 %	197336575
57	NC_011185	TCGT	2	8	16419	16426	0 %	50 %	25 %	25 %	197336626
58	NC_011185	ATTT	2	8	16552	16559	25 %	75 %	0 %	0 %	197336520
59	NC_011185	ATTC	2	8	16613	16620	25 %	50 %	0 %	25 %	197336520
60	NC_011185	AAAG	2	8	16725	16732	75 %	0 %	25 %	0 %	197336520
61	NC_011185	AAAG	2	8	16806	16813	75 %	0 %	25 %	0 %	197336610
62	NC_011185	CATC	2	8	17204	17211	25 %	25 %	0 %	50 %	197336643
63	NC_011185	GTCC	2	8	19209	19216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011185	TTTA	2	8	19651	19658	25 %	75 %	0 %	0 %	197336509
65	NC_011185	CTTT	2	8	19913	19920	0 %	75 %	0 %	25 %	197336509
66	NC_011185	ATCA	3	12	20467	20478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011185	ATCA	2	8	21173	21180	50 %	25 %	0 %	25 %	197336637
68	NC_011185	ATTA	2	8	21258	21265	50 %	50 %	0 %	0 %	197336637
69	NC_011185	GATG	2	8	21395	21402	25 %	25 %	50 %	0 %	197336637
70	NC_011185	TAAT	2	8	22177	22184	50 %	50 %	0 %	0 %	197336637
71	NC_011185	TCGT	2	8	22414	22421	0 %	50 %	25 %	25 %	197336637
72	NC_011185	TCAT	2	8	23097	23104	25 %	50 %	0 %	25 %	197336637
73	NC_011185	ATCA	2	8	23258	23265	50 %	25 %	0 %	25 %	197336637
74	NC_011185	AGCA	2	8	23892	23899	50 %	0 %	25 %	25 %	197336637
75	NC_011185	GAAA	2	8	23934	23941	75 %	0 %	25 %	0 %	197336637
76	NC_011185	TTTA	2	8	24572	24579	25 %	75 %	0 %	0 %	197336600
77	NC_011185	TAGT	2	8	24717	24724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011185	TACT	2	8	24852	24859	25 %	50 %	0 %	25 %	197336513
79	NC_011185	TGTT	2	8	25694	25701	0 %	75 %	25 %	0 %	197336513
80	NC_011185	GAAG	2	8	25828	25835	50 %	0 %	50 %	0 %	197336539
81	NC_011185	AATT	2	8	25854	25861	50 %	50 %	0 %	0 %	197336539
82	NC_011185	TTTG	2	8	26123	26130	0 %	75 %	25 %	0 %	197336539
83	NC_011185	TGTT	2	8	26550	26557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011185	CATT	2	8	26801	26808	25 %	50 %	0 %	25 %	197336647
85	NC_011185	TTTG	2	8	26958	26965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011185	TTTA	2	8	27218	27225	25 %	75 %	0 %	0 %	197336518
87	NC_011185	TTAA	2	8	27264	27271	50 %	50 %	0 %	0 %	197336585
88	NC_011185	AATG	2	8	27420	27427	50 %	25 %	25 %	0 %	197336585
89	NC_011185	AAAT	2	8	27684	27691	75 %	25 %	0 %	0 %	197336501
90	NC_011185	AGAA	2	8	27810	27817	75 %	0 %	25 %	0 %	197336505
91	NC_011185	ACTC	2	8	28073	28080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011185	AATC	2	8	28261	28268	50 %	25 %	0 %	25 %	197336656
93	NC_011185	TTTG	2	8	28900	28907	0 %	75 %	25 %	0 %	197336656
94	NC_011185	TTAT	2	8	29462	29469	25 %	75 %	0 %	0 %	197336554
95	NC_011185	AACT	2	8	30086	30093	50 %	25 %	0 %	25 %	197336554
96	NC_011185	GCGA	2	8	31640	31647	25 %	0 %	50 %	25 %	197336487
97	NC_011185	AAAT	2	8	31660	31667	75 %	25 %	0 %	0 %	197336487
98	NC_011185	TTTA	2	8	31878	31885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011185	TAAT	2	8	32180	32187	50 %	50 %	0 %	0 %	197336541
100	NC_011185	TTTC	2	8	32359	32366	0 %	75 %	0 %	25 %	197336541
101	NC_011185	AAAT	2	8	32375	32382	75 %	25 %	0 %	0 %	197336541
102	NC_011185	TGAT	2	8	32520	32527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011185	TTAG	2	8	32849	32856	25 %	50 %	25 %	0 %	197336484
104	NC_011185	TATT	2	8	33038	33045	25 %	75 %	0 %	0 %	197336484
105	NC_011185	TATG	2	8	33392	33399	25 %	50 %	25 %	0 %	197336563
106	NC_011185	CATT	2	8	33565	33572	25 %	50 %	0 %	25 %	197336563
107	NC_011185	CTTT	2	8	33860	33867	0 %	75 %	0 %	25 %	197336616
108	NC_011185	TGAT	2	8	33888	33895	25 %	50 %	25 %	0 %	197336616
109	NC_011185	TTAT	2	8	34074	34081	25 %	75 %	0 %	0 %	197336616
110	NC_011185	ACTT	2	8	34533	34540	25 %	50 %	0 %	25 %	197336616
111	NC_011185	TAAA	2	8	34883	34890	75 %	25 %	0 %	0 %	197336581
112	NC_011185	TATC	2	8	35245	35252	25 %	50 %	0 %	25 %	197336482
113	NC_011185	TGCT	2	8	35503	35510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011185	TTGT	2	8	35529	35536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011185	TTTA	2	8	36116	36123	25 %	75 %	0 %	0 %	197336523
116	NC_011185	TTAA	2	8	36495	36502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011185	TTAA	2	8	36809	36816	50 %	50 %	0 %	0 %	197336628
118	NC_011185	ATGG	2	8	36905	36912	25 %	25 %	50 %	0 %	197336514
119	NC_011185	TTGG	2	8	37853	37860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011185	ATTA	2	8	37862	37869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011185	ATGT	2	8	37918	37925	25 %	50 %	25 %	0 %	197336577
122	NC_011185	CTTA	2	8	38179	38186	25 %	50 %	0 %	25 %	197336577
123	NC_011185	CATC	2	8	41317	41324	25 %	25 %	0 %	50 %	197336497
124	NC_011185	GATT	2	8	41391	41398	25 %	50 %	25 %	0 %	197336497
125	NC_011185	GTAA	2	8	42080	42087	50 %	25 %	25 %	0 %	197336506
126	NC_011185	TTAT	2	8	42496	42503	25 %	75 %	0 %	0 %	197336540
127	NC_011185	TTTA	2	8	42630	42637	25 %	75 %	0 %	0 %	197336540
128	NC_011185	TATT	2	8	42653	42660	25 %	75 %	0 %	0 %	197336540
129	NC_011185	CATT	2	8	42943	42950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011185	TTCG	2	8	43034	43041	0 %	50 %	25 %	25 %	197336607
131	NC_011185	ATTT	2	8	43816	43823	25 %	75 %	0 %	0 %	197336632
132	NC_011185	ATTA	2	8	43854	43861	50 %	50 %	0 %	0 %	197336632
133	NC_011185	TTAT	2	8	44076	44083	25 %	75 %	0 %	0 %	197336632
134	NC_011185	GATT	2	8	44176	44183	25 %	50 %	25 %	0 %	197336632
135	NC_011185	GATT	2	8	44345	44352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011185	TTTA	2	8	44588	44595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011185	AAAC	2	8	45294	45301	75 %	0 %	0 %	25 %	197336572
138	NC_011185	GGAG	2	8	45527	45534	25 %	0 %	75 %	0 %	197336572
139	NC_011185	CATG	2	8	46275	46282	25 %	25 %	25 %	25 %	197336572
140	NC_011185	GGTT	2	8	46532	46539	0 %	50 %	50 %	0 %	197336572
141	NC_011185	GGAA	2	8	46914	46921	50 %	0 %	50 %	0 %	197336491
142	NC_011185	TTGA	2	8	47728	47735	25 %	50 %	25 %	0 %	197336491
143	NC_011185	ACCT	2	8	48077	48084	25 %	25 %	0 %	50 %	197336588
144	NC_011185	TGAT	2	8	48170	48177	25 %	50 %	25 %	0 %	197336588
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