MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 2223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	TTACG	2	10	4539	4548	20 %	40 %	20 %	20 %	197334034
2	NC_011184	AATGC	2	10	5412	5421	40 %	20 %	20 %	20 %	197334117
3	NC_011184	AAATC	2	10	6207	6216	60 %	20 %	0 %	20 %	197333922
4	NC_011184	ATTTG	2	10	6855	6864	20 %	60 %	20 %	0 %	197334002
5	NC_011184	TGCTT	2	10	8118	8127	0 %	60 %	20 %	20 %	197334133
6	NC_011184	TAATT	2	10	8805	8814	40 %	60 %	0 %	0 %	197334133
7	NC_011184	GAGTT	2	10	10498	10507	20 %	40 %	40 %	0 %	197334005
8	NC_011184	CAATA	2	10	12834	12843	60 %	20 %	0 %	20 %	197334084
9	NC_011184	TTAAA	2	10	13897	13906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011184	ATTAC	2	10	15216	15225	40 %	40 %	0 %	20 %	197333917
11	NC_011184	AATTA	2	10	16022	16031	60 %	40 %	0 %	0 %	197333992
12	NC_011184	TTCGT	2	10	16371	16380	0 %	60 %	20 %	20 %	197333992
13	NC_011184	ATTCA	2	10	17413	17422	40 %	40 %	0 %	20 %	197334221
14	NC_011184	AAGGA	2	10	20924	20933	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011184	ATGCA	2	10	22336	22345	40 %	20 %	20 %	20 %	197333985
16	NC_011184	AAGAG	2	10	23915	23924	60 %	0 %	40 %	0 %	197334120
17	NC_011184	GAAAA	2	10	24110	24119	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011184	TTTCA	2	10	24324	24333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011184	TAATG	2	10	24406	24415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011184	TTAAG	2	10	24595	24604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011184	AAATT	2	10	28245	28254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011184	TCACT	2	10	29824	29833	20 %	40 %	0 %	40 %	197334156
23	NC_011184	TTAAC	2	10	30814	30823	40 %	40 %	0 %	20 %	197334103
24	NC_011184	TATTT	2	10	32704	32713	20 %	80 %	0 %	0 %	197334035
25	NC_011184	TCTCT	2	10	34975	34984	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011184	CATTT	2	10	36647	36656	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011184	CAATT	2	10	39119	39128	40 %	40 %	0 %	20 %	197333936
28	NC_011184	AAAAC	2	10	40246	40255	80 %	0 %	0 %	20 %	197334226
29	NC_011184	TTAGA	2	10	42099	42108	40 %	40 %	20 %	0 %	197334211
30	NC_011184	TAACA	2	10	45175	45184	60 %	20 %	0 %	20 %	197334179
31	NC_011184	CAACC	2	10	47650	47659	40 %	0 %	0 %	60 %	197334131
32	NC_011184	TGAAG	2	10	49847	49856	40 %	20 %	40 %	0 %	197334099
33	NC_011184	AAAAG	2	10	50874	50883	80 %	0 %	20 %	0 %	197333938
34	NC_011184	TCTTT	2	10	50919	50928	0 %	80 %	0 %	20 %	197333938
35	NC_011184	ATCAC	2	10	51427	51436	40 %	20 %	0 %	40 %	197334207
36	NC_011184	AATGC	2	10	52029	52038	40 %	20 %	20 %	20 %	197334207
37	NC_011184	GTTTG	2	10	53825	53834	0 %	60 %	40 %	0 %	197334101
38	NC_011184	TGATT	2	10	56860	56869	20 %	60 %	20 %	0 %	197334052
39	NC_011184	TCGCT	2	10	57803	57812	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011184	TGCGC	2	10	57862	57871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011184	GAAGC	2	10	58023	58032	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011184	ATTGC	2	10	58788	58797	20 %	40 %	20 %	20 %	197334158
43	NC_011184	GTACC	2	10	58878	58887	20 %	20 %	20 %	40 %	197334158
44	NC_011184	GCCTG	2	10	60704	60713	0 %	20 %	40 %	40 %	197334079
45	NC_011184	TAAAT	2	10	61144	61153	60 %	40 %	0 %	0 %	197334006
46	NC_011184	GTTTT	2	10	61354	61363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011184	AGCTA	2	10	61369	61378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011184	ATTTC	2	10	61451	61460	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011184	CGATG	2	10	62718	62727	20 %	20 %	40 %	20 %	197334080
50	NC_011184	CATTT	2	10	66051	66060	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011184	AAAGT	2	10	66494	66503	60 %	20 %	20 %	0 %	197333973
52	NC_011184	TTCTT	2	10	69872	69881	0 %	80 %	0 %	20 %	197334036
53	NC_011184	TGGGT	2	10	70079	70088	0 %	40 %	60 %	0 %	197334036
54	NC_011184	GGTGA	2	10	71386	71395	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011184	GTGAT	2	10	74199	74208	20 %	40 %	40 %	0 %	197334239
56	NC_011184	TTTCT	2	10	74214	74223	0 %	80 %	0 %	20 %	197334239
57	NC_011184	TGTGA	2	10	74927	74936	20 %	40 %	40 %	0 %	197334239
58	NC_011184	TACCG	2	10	75321	75330	20 %	20 %	20 %	40 %	197334239
59	NC_011184	GAGCA	2	10	79996	80005	40 %	0 %	40 %	20 %	197334053
60	NC_011184	TCTTT	2	10	80168	80177	0 %	80 %	0 %	20 %	197334141
61	NC_011184	TTCTT	2	10	81048	81057	0 %	80 %	0 %	20 %	197334141
62	NC_011184	CCATC	2	10	81093	81102	20 %	20 %	0 %	60 %	197334141
63	NC_011184	CAAAA	2	10	81176	81185	80 %	0 %	0 %	20 %	197334141
64	NC_011184	TAAGG	2	10	81341	81350	40 %	20 %	40 %	0 %	197334141
65	NC_011184	TTATT	2	10	81517	81526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011184	AGCAA	2	10	83131	83140	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011184	CATTT	2	10	84640	84649	20 %	60 %	0 %	20 %	197334225
68	NC_011184	GTTAC	2	10	86062	86071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011184	TTAAT	2	10	88290	88299	40 %	60 %	0 %	0 %	197334047
70	NC_011184	AGTGG	2	10	88432	88441	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011184	GCAAA	2	10	89323	89332	60 %	0 %	20 %	20 %	197334137
72	NC_011184	TGATC	2	10	90121	90130	20 %	40 %	20 %	20 %	197333989
73	NC_011184	CGCTT	2	10	91744	91753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011184	TTGGT	2	10	91811	91820	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011184	TAGCG	2	10	92090	92099	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011184	TAAGA	2	10	92615	92624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011184	AAAAG	2	10	93270	93279	80 %	0 %	20 %	0 %	197334213
78	NC_011184	GGATA	2	10	93675	93684	40 %	20 %	40 %	0 %	197334135
79	NC_011184	GTGTT	2	10	93739	93748	0 %	60 %	40 %	0 %	197334135
80	NC_011184	ATCTA	2	10	94160	94169	40 %	40 %	0 %	20 %	197334107
81	NC_011184	GAATT	2	10	95390	95399	40 %	40 %	20 %	0 %	197334240
82	NC_011184	ATTTT	2	10	96394	96403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011184	TTCTC	2	10	96522	96531	0 %	60 %	0 %	40 %	197334154
84	NC_011184	ATTCA	2	10	97588	97597	40 %	40 %	0 %	20 %	197334154
85	NC_011184	ATTGG	2	10	98198	98207	20 %	40 %	40 %	0 %	197334154
86	NC_011184	TTTAT	2	10	99284	99293	20 %	80 %	0 %	0 %	197333987
87	NC_011184	AAAAG	2	10	102358	102367	80 %	0 %	20 %	0 %	197333927
88	NC_011184	AATGG	2	10	103821	103830	40 %	20 %	40 %	0 %	197333927
89	NC_011184	AGCGC	2	10	104093	104102	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_011184	TTGTG	2	10	105687	105696	0 %	60 %	40 %	0 %	197334048
91	NC_011184	AAACC	2	10	106173	106182	60 %	0 %	0 %	40 %	197334048
92	NC_011184	GTCAT	2	10	106595	106604	20 %	40 %	20 %	20 %	197334048
93	NC_011184	AATTC	2	10	109807	109816	40 %	40 %	0 %	20 %	197334242
94	NC_011184	TTGAG	2	10	110423	110432	20 %	40 %	40 %	0 %	197334242
95	NC_011184	ATAAG	2	10	111035	111044	60 %	20 %	20 %	0 %	197333972
96	NC_011184	CTTTA	2	10	111287	111296	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011184	GCACT	2	10	112499	112508	20 %	20 %	20 %	40 %	197334234
98	NC_011184	TATAA	2	10	112747	112756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011184	ATTAA	2	10	113127	113136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011184	TCGTT	2	10	113603	113612	0 %	60 %	20 %	20 %	197334122
101	NC_011184	AAACC	2	10	113970	113979	60 %	0 %	0 %	40 %	197334122
102	NC_011184	ATAAA	2	10	115237	115246	80 %	20 %	0 %	0 %	197333895
103	NC_011184	TAGCG	2	10	116709	116718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011184	TTGGT	2	10	118256	118265	0 %	60 %	40 %	0 %	197334204
105	NC_011184	TAGCG	2	10	118788	118797	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011184	CAGCT	2	10	119414	119423	20 %	20 %	20 %	40 %	197333966
107	NC_011184	CTATC	2	10	122494	122503	20 %	40 %	0 %	40 %	197333893
108	NC_011184	TTACA	2	10	122530	122539	40 %	40 %	0 %	20 %	197333893
109	NC_011184	GAAAG	2	10	123679	123688	60 %	0 %	40 %	0 %	197334026
110	NC_011184	GTTTG	2	10	124271	124280	0 %	60 %	40 %	0 %	197334026
111	NC_011184	ACGCT	2	10	126309	126318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_011184	GCGTA	2	10	128120	128129	20 %	20 %	40 %	20 %	197334071
113	NC_011184	CGCTT	2	10	128770	128779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_011184	TAGCG	2	10	129145	129154	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011184	AGCAA	2	10	130053	130062	60 %	0 %	20 %	20 %	197334116
116	NC_011184	CGCTT	2	10	130529	130538	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_011184	AAGCG	2	10	130865	130874	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011184	AGCGA	2	10	131033	131042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011184	AAGCG	2	10	133001	133010	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011184	TAGCA	2	10	136865	136874	40 %	20 %	20 %	20 %	197334228
121	NC_011184	ATTTA	2	10	137547	137556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011184	TTTTA	2	10	137673	137682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011184	TCGCT	2	10	139848	139857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011184	AGTTC	2	10	139893	139902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011184	ATCAG	2	10	140972	140981	40 %	20 %	20 %	20 %	197333918
126	NC_011184	CGCTT	2	10	142913	142922	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011184	CGCTT	2	10	143105	143114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_011184	AAAAG	2	10	143608	143617	80 %	0 %	20 %	0 %	197334073
129	NC_011184	TTTGA	2	10	143983	143992	20 %	60 %	20 %	0 %	197334049
130	NC_011184	TTTGA	2	10	144228	144237	20 %	60 %	20 %	0 %	197334049
131	NC_011184	AAGCG	2	10	151067	151076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011184	AACGA	2	10	152503	152512	60 %	0 %	20 %	20 %	197334029
133	NC_011184	GCAAA	2	10	152741	152750	60 %	0 %	20 %	20 %	197334029
134	NC_011184	CTTGT	2	10	153724	153733	0 %	60 %	20 %	20 %	197333956
135	NC_011184	CATTA	2	10	154572	154581	40 %	40 %	0 %	20 %	197334205
136	NC_011184	TATAC	2	10	155749	155758	40 %	40 %	0 %	20 %	197334045
137	NC_011184	TAAGT	2	10	156188	156197	40 %	40 %	20 %	0 %	197334045
138	NC_011184	ATGCA	2	10	156367	156376	40 %	20 %	20 %	20 %	197334045
139	NC_011184	CTTTT	2	10	156636	156645	0 %	80 %	0 %	20 %	197334030
140	NC_011184	ACTTT	2	10	156843	156852	20 %	60 %	0 %	20 %	197334030
141	NC_011184	ATCAC	2	10	157977	157986	40 %	20 %	0 %	40 %	197333968
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263	NC_011184	TTGTT	2	10	329518	329527	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_011184	GCTTG	2	10	506244	506253	0 %	40 %	40 %	20 %	197334555
405	NC_011184	GGCTG	2	10	506501	506510	0 %	20 %	60 %	20 %	197335564
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408	NC_011184	AAGCT	2	10	512642	512651	40 %	20 %	20 %	20 %	197334274
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