MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 42183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	TTA	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011184	TAT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011184	TCG	2	6	62	67	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011184	GTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011184	TAG	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011184	TAA	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011184	TTA	2	6	310	315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334190
8	NC_011184	TGT	2	6	323	328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334190
9	NC_011184	CTG	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334190
10	NC_011184	TTC	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334190
11	NC_011184	CTG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334190
12	NC_011184	CAA	2	6	483	488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334190
13	NC_011184	ACA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334190
14	NC_011184	ATC	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334190
15	NC_011184	TCT	2	6	665	670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334190
16	NC_011184	CAC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334190
17	NC_011184	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334190
18	NC_011184	TTA	2	6	794	799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011184	ATC	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334085
20	NC_011184	TGT	3	9	888	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334085
21	NC_011184	TTC	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
22	NC_011184	CTT	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
23	NC_011184	GTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334085
24	NC_011184	TCA	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334085
25	NC_011184	CGG	2	6	1357	1362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334085
26	NC_011184	AAT	2	6	1367	1372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334085
27	NC_011184	AAG	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334085
28	NC_011184	AAC	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334085
29	NC_011184	ATG	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334085
30	NC_011184	CTT	2	6	1555	1560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
31	NC_011184	CAC	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334085
32	NC_011184	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
33	NC_011184	TGC	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334085
34	NC_011184	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
35	NC_011184	GAC	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334085
36	NC_011184	ACC	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334085
37	NC_011184	CGC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334085
38	NC_011184	CAA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334085
39	NC_011184	ATT	2	6	2178	2183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011184	GCC	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011184	AAG	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
42	NC_011184	TCT	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
43	NC_011184	TGT	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
44	NC_011184	TCT	2	6	2465	2470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
45	NC_011184	TAA	2	6	2496	2501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333980
46	NC_011184	GTA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
47	NC_011184	GAA	3	9	2621	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
48	NC_011184	ACC	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
49	NC_011184	CAT	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
50	NC_011184	CAC	2	6	2804	2809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
51	NC_011184	GTG	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333980
52	NC_011184	CTT	2	6	3005	3010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
53	NC_011184	CTG	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
54	NC_011184	CAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
55	NC_011184	AGT	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
56	NC_011184	GTC	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
57	NC_011184	TCT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
58	NC_011184	AGC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333980
59	NC_011184	ACC	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
60	NC_011184	ATC	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
61	NC_011184	CGT	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
62	NC_011184	AAG	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
63	NC_011184	CGT	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
64	NC_011184	TTA	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333980
65	NC_011184	ATG	2	6	3640	3645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
66	NC_011184	CAC	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
67	NC_011184	GAA	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
68	NC_011184	TGC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
69	NC_011184	TTG	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
70	NC_011184	TGC	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011184	CAT	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011184	TGA	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011184	TTG	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333937
74	NC_011184	TTG	2	6	4292	4297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333937
75	NC_011184	CAG	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333937
76	NC_011184	CTT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333937
77	NC_011184	TCA	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011184	AAT	2	6	4483	4488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011184	ACG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334034
80	NC_011184	TAG	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334034
81	NC_011184	TTA	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011184	AGT	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011184	CAA	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011184	CAA	2	6	4747	4752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011184	CGA	2	6	4898	4903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334117
86	NC_011184	AAC	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334117
87	NC_011184	TTC	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334117
88	NC_011184	TCA	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
89	NC_011184	GTT	3	9	5114	5122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334117
90	NC_011184	CCT	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197334117
91	NC_011184	GCT	2	6	5137	5142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334117
92	NC_011184	ATC	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
93	NC_011184	CGT	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334117
94	NC_011184	TTA	2	6	5234	5239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334117
95	NC_011184	CAT	2	6	5366	5371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
96	NC_011184	ATC	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
97	NC_011184	TTC	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333922
98	NC_011184	AAC	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333922
99	NC_011184	TGA	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333922
100	NC_011184	TCA	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333922
101	NC_011184	AAG	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333922
102	NC_011184	AAT	2	6	5801	5806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
103	NC_011184	GTC	2	6	5826	5831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333922
104	NC_011184	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
105	NC_011184	AGC	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333922
106	NC_011184	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
107	NC_011184	AGG	2	6	6000	6005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197333922
108	NC_011184	TAA	2	6	6017	6022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
109	NC_011184	GAA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333922
110	NC_011184	GTA	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333922
111	NC_011184	ATT	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011184	AGA	2	6	6243	6248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011184	CTT	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334002
114	NC_011184	CAT	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334002
115	NC_011184	AAT	2	6	6690	6695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334002
116	NC_011184	TAA	2	6	6890	6895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334002
117	NC_011184	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334002
118	NC_011184	TAT	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011184	GAT	2	6	7159	7164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011184	TAA	2	6	7207	7212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011184	TTG	2	6	7246	7251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011184	ATC	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011184	AAG	2	6	7463	7468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011184	ATT	2	6	7605	7610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334133
125	NC_011184	GCT	2	6	7699	7704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334133
126	NC_011184	TGC	2	6	7794	7799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334133
127	NC_011184	ATC	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334133
128	NC_011184	TTG	2	6	7850	7855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334133
129	NC_011184	GGC	3	9	7881	7889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334133
130	NC_011184	TGG	2	6	7941	7946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334133
131	NC_011184	TTA	2	6	7969	7974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334133
132	NC_011184	GAA	2	6	8086	8091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334133
133	NC_011184	TTA	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334133
134	NC_011184	GAT	2	6	8131	8136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334133
135	NC_011184	TAA	2	6	8151	8156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334133
136	NC_011184	AAG	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334133
137	NC_011184	CAA	2	6	8212	8217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334133
138	NC_011184	TGA	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334133
139	NC_011184	AGA	2	6	8358	8363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334133
140	NC_011184	CTT	2	6	8394	8399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334133
141	NC_011184	TTA	2	6	8524	8529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334133
142	NC_011184	ATA	2	6	8558	8563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334133
143	NC_011184	TAT	2	6	8609	8614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334133
144	NC_011184	CGT	2	6	8620	8625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334133
145	NC_011184	TGG	2	6	8715	8720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334133
146	NC_011184	GAA	2	6	8773	8778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334133
147	NC_011184	AGA	2	6	8793	8798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334133
148	NC_011184	TAT	2	6	8861	8866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334198
149	NC_011184	TTA	2	6	8892	8897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334198
150	NC_011184	CAA	2	6	8907	8912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334198
151	NC_011184	TGG	2	6	8927	8932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334198
152	NC_011184	ATG	2	6	9336	9341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334198
153	NC_011184	AAC	2	6	9433	9438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334198
154	NC_011184	TTG	2	6	9571	9576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334198
155	NC_011184	AGT	2	6	9615	9620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334198
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157	NC_011184	GTG	2	6	9700	9705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334198
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159	NC_011184	GAA	2	6	9771	9776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334198
160	NC_011184	GAT	2	6	9801	9806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334198
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162	NC_011184	TGT	2	6	9941	9946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334198
163	NC_011184	AAC	2	6	10020	10025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334005
164	NC_011184	ATT	2	6	10156	10161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334005
165	NC_011184	CAC	2	6	10200	10205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334005
166	NC_011184	ATG	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334005
167	NC_011184	AAC	2	6	10457	10462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334005
168	NC_011184	ATT	2	6	10470	10475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334005
169	NC_011184	CAA	2	6	10591	10596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334005
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187	NC_011184	GTA	2	6	11439	11444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334084
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243	NC_011184	TTA	2	6	14416	14421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_011184	TGA	2	6	14482	14487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_011184	TCA	2	6	15270	15275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333917
255	NC_011184	TAA	2	6	15323	15328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333917
256	NC_011184	AGT	2	6	15655	15660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333917
257	NC_011184	CAG	2	6	15679	15684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333917
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259	NC_011184	ATG	2	6	15702	15707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333917
260	NC_011184	CAT	2	6	15727	15732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333917
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