MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 2367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009783	TCCGA	2	10	67	76	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009783	ACTAC	2	10	912	921	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009783	CTTTG	2	10	1733	1742	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009783	CAACC	2	10	3459	3468	40 %	0 %	0 %	60 %	156972384
5	NC_009783	CACCT	2	10	4477	4486	20 %	20 %	0 %	60 %	156972384
6	NC_009783	CTTCA	2	10	5016	5025	20 %	40 %	0 %	40 %	156972385
7	NC_009783	TTGAA	2	10	6672	6681	40 %	40 %	20 %	0 %	156972386
8	NC_009783	TCCAA	2	10	8976	8985	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009783	AGACG	2	10	9645	9654	40 %	0 %	40 %	20 %	156972390
10	NC_009783	TTGAA	2	10	9848	9857	40 %	40 %	20 %	0 %	156972391
11	NC_009783	CTTTT	2	10	10322	10331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009783	TGATT	2	10	11607	11616	20 %	60 %	20 %	0 %	156972392
13	NC_009783	ATCAT	2	10	12227	12236	40 %	40 %	0 %	20 %	156972393
14	NC_009783	CCAAA	2	10	12274	12283	60 %	0 %	0 %	40 %	156972394
15	NC_009783	GCACC	2	10	12868	12877	20 %	0 %	20 %	60 %	156972395
16	NC_009783	TCGTG	2	10	13343	13352	0 %	40 %	40 %	20 %	156972395
17	NC_009783	ATCTT	2	10	14814	14823	20 %	60 %	0 %	20 %	156972396
18	NC_009783	CGAAC	2	10	16576	16585	40 %	0 %	20 %	40 %	156972398
19	NC_009783	TTTCT	2	10	18977	18986	0 %	80 %	0 %	20 %	156972399
20	NC_009783	GTTCA	2	10	21630	21639	20 %	40 %	20 %	20 %	156972405
21	NC_009783	TTCCG	2	10	22575	22584	0 %	40 %	20 %	40 %	156972406
22	NC_009783	CTTAC	2	10	22606	22615	20 %	40 %	0 %	40 %	156972406
23	NC_009783	TTGGC	2	10	28054	28063	0 %	40 %	40 %	20 %	156972410
24	NC_009783	GTGCT	2	10	31784	31793	0 %	40 %	40 %	20 %	156972414
25	NC_009783	CTGCC	2	10	37657	37666	0 %	20 %	20 %	60 %	156972420
26	NC_009783	TCTTA	2	10	39517	39526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009783	CAAGC	2	10	39829	39838	40 %	0 %	20 %	40 %	156972421
28	NC_009783	CCCTA	2	10	43506	43515	20 %	20 %	0 %	60 %	156972424
29	NC_009783	GCTTG	2	10	48044	48053	0 %	40 %	40 %	20 %	156972427
30	NC_009783	TCAGA	2	10	49080	49089	40 %	20 %	20 %	20 %	156972428
31	NC_009783	CATCA	2	10	49496	49505	40 %	20 %	0 %	40 %	156972428
32	NC_009783	TCATC	2	10	53555	53564	20 %	40 %	0 %	40 %	156972431
33	NC_009783	GCCGT	2	10	54355	54364	0 %	20 %	40 %	40 %	156972431
34	NC_009783	TTCAT	2	10	55137	55146	20 %	60 %	0 %	20 %	156972432
35	NC_009783	ACCAC	2	10	57718	57727	40 %	0 %	0 %	60 %	156972435
36	NC_009783	TTGGA	2	10	58824	58833	20 %	40 %	40 %	0 %	156972435
37	NC_009783	AGCCA	2	10	60968	60977	40 %	0 %	20 %	40 %	156972439
38	NC_009783	TCGCT	2	10	63919	63928	0 %	40 %	20 %	40 %	156972443
39	NC_009783	AGCAT	2	10	66774	66783	40 %	20 %	20 %	20 %	156972448
40	NC_009783	CAAGC	2	10	67619	67628	40 %	0 %	20 %	40 %	156972448
41	NC_009783	ATGGA	2	10	71046	71055	40 %	20 %	40 %	0 %	156972450
42	NC_009783	TGTCA	2	10	73093	73102	20 %	40 %	20 %	20 %	156972454
43	NC_009783	CTGCT	2	10	77436	77445	0 %	40 %	20 %	40 %	156972457
44	NC_009783	TTGCC	2	10	77455	77464	0 %	40 %	20 %	40 %	156972457
45	NC_009783	GGATT	2	10	89944	89953	20 %	40 %	40 %	0 %	156972465
46	NC_009783	CTTTT	2	10	90233	90242	0 %	80 %	0 %	20 %	156972466
47	NC_009783	TTCTT	2	10	90585	90594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009783	AACCA	2	10	90674	90683	60 %	0 %	0 %	40 %	156972467
49	NC_009783	TAGTT	2	10	93124	93133	20 %	60 %	20 %	0 %	156972469
50	NC_009783	AGTAC	2	10	93325	93334	40 %	20 %	20 %	20 %	156972469
51	NC_009783	ATCAC	2	10	95066	95075	40 %	20 %	0 %	40 %	156972471
52	NC_009783	ATTTT	2	10	98436	98445	20 %	80 %	0 %	0 %	156972474
53	NC_009783	GCTAA	2	10	99383	99392	40 %	20 %	20 %	20 %	156972475
54	NC_009783	TGCCG	2	10	99412	99421	0 %	20 %	40 %	40 %	156972475
55	NC_009783	CCTCT	2	10	99764	99773	0 %	40 %	0 %	60 %	156972476
56	NC_009783	CAATG	2	10	101067	101076	40 %	20 %	20 %	20 %	156972476
57	NC_009783	CTGAA	2	10	102415	102424	40 %	20 %	20 %	20 %	156972477
58	NC_009783	CATCA	2	10	104696	104705	40 %	20 %	0 %	40 %	156972479
59	NC_009783	AAAGA	2	10	105508	105517	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009783	ATTCA	2	10	107802	107811	40 %	40 %	0 %	20 %	156972480
61	NC_009783	AGGTG	2	10	108224	108233	20 %	20 %	60 %	0 %	156972481
62	NC_009783	ACTTA	2	10	110831	110840	40 %	40 %	0 %	20 %	156972483
63	NC_009783	AACTT	2	10	111954	111963	40 %	40 %	0 %	20 %	156972484
64	NC_009783	TCTCC	2	10	114398	114407	0 %	40 %	0 %	60 %	156972486
65	NC_009783	CTTCC	2	10	114846	114855	0 %	40 %	0 %	60 %	156972486
66	NC_009783	CAAGG	2	10	116253	116262	40 %	0 %	40 %	20 %	156972487
67	NC_009783	GAAGT	2	10	120636	120645	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009783	AATTG	2	10	120656	120665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009783	TTTGG	2	10	120879	120888	0 %	60 %	40 %	0 %	156972490
70	NC_009783	TTTGG	2	10	122951	122960	0 %	60 %	40 %	0 %	156972492
71	NC_009783	GAAGA	2	10	124405	124414	60 %	0 %	40 %	0 %	156972494
72	NC_009783	CAACG	2	10	124789	124798	40 %	0 %	20 %	40 %	156972494
73	NC_009783	TCGAG	2	10	126878	126887	20 %	20 %	40 %	20 %	156972496
74	NC_009783	ATCGA	2	10	127154	127163	40 %	20 %	20 %	20 %	156972497
75	NC_009783	ATGCA	2	10	132181	132190	40 %	20 %	20 %	20 %	156972502
76	NC_009783	AATGC	2	10	132922	132931	40 %	20 %	20 %	20 %	156972503
77	NC_009783	GAATG	2	10	132972	132981	40 %	20 %	40 %	0 %	156972503
78	NC_009783	CTGCA	2	10	134412	134421	20 %	20 %	20 %	40 %	156972504
79	NC_009783	TTTCA	2	10	140721	140730	20 %	60 %	0 %	20 %	156972510
80	NC_009783	CGCTT	2	10	140926	140935	0 %	40 %	20 %	40 %	156972510
81	NC_009783	TTGGT	2	10	143129	143138	0 %	60 %	40 %	0 %	156972512
82	NC_009783	GCCGC	2	10	143187	143196	0 %	0 %	40 %	60 %	156972512
83	NC_009783	GGCGC	2	10	143340	143349	0 %	0 %	60 %	40 %	156972512
84	NC_009783	CTAAC	2	10	143875	143884	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009783	TCGCT	2	10	145505	145514	0 %	40 %	20 %	40 %	156972514
86	NC_009783	CTGCA	2	10	146820	146829	20 %	20 %	20 %	40 %	156972515
87	NC_009783	AATGG	2	10	148444	148453	40 %	20 %	40 %	0 %	156972517
88	NC_009783	TCTGG	2	10	156786	156795	0 %	40 %	40 %	20 %	156972524
89	NC_009783	GCGGT	2	10	161376	161385	0 %	20 %	60 %	20 %	156972528
90	NC_009783	GATGC	2	10	163142	163151	20 %	20 %	40 %	20 %	156972531
91	NC_009783	CTTCT	2	10	164617	164626	0 %	60 %	0 %	40 %	156972532
92	NC_009783	GTACA	2	10	167318	167327	40 %	20 %	20 %	20 %	156972532
93	NC_009783	ATTGG	2	10	168246	168255	20 %	40 %	40 %	0 %	156972534
94	NC_009783	CACAA	2	10	168466	168475	60 %	0 %	0 %	40 %	156972534
95	NC_009783	GTAAA	2	10	170502	170511	60 %	20 %	20 %	0 %	156972535
96	NC_009783	GAAGA	2	10	170600	170609	60 %	0 %	40 %	0 %	156972535
97	NC_009783	AGCTG	2	10	173465	173474	20 %	20 %	40 %	20 %	156972537
98	NC_009783	AATCG	2	10	174164	174173	40 %	20 %	20 %	20 %	156972538
99	NC_009783	TTTTG	2	10	176394	176403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009783	TCAAA	2	10	176493	176502	60 %	20 %	0 %	20 %	156972541
101	NC_009783	TCAAA	2	10	176697	176706	60 %	20 %	0 %	20 %	156972541
102	NC_009783	AGCTG	2	10	178423	178432	20 %	20 %	40 %	20 %	156972542
103	NC_009783	AAGAG	2	10	178480	178489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009783	CAAGC	2	10	185204	185213	40 %	0 %	20 %	40 %	156972551
105	NC_009783	TCGGT	2	10	193222	193231	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009783	TTCGC	2	10	193769	193778	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009783	GGGAA	2	10	194354	194363	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009783	ACTAC	2	10	195624	195633	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_009783	TCGGT	2	10	198843	198852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009783	TTCGC	2	10	199390	199399	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009783	GGGAA	2	10	199975	199984	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009783	ACTAC	2	10	201245	201254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009783	CTGAT	2	10	202278	202287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009783	TTTCA	2	10	202856	202865	20 %	60 %	0 %	20 %	156972565
115	NC_009783	ATTGC	2	10	203062	203071	20 %	40 %	20 %	20 %	156972565
116	NC_009783	CAAGA	2	10	206493	206502	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009783	TTAAA	2	10	208638	208647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009783	CAAGC	2	10	208886	208895	40 %	0 %	20 %	40 %	156972568
119	NC_009783	CTGTT	2	10	210584	210593	0 %	60 %	20 %	20 %	156972570
120	NC_009783	GTCGT	2	10	211586	211595	0 %	40 %	40 %	20 %	156972571
121	NC_009783	AGTGA	2	10	213089	213098	40 %	20 %	40 %	0 %	156972572
122	NC_009783	GTACA	2	10	214569	214578	40 %	20 %	20 %	20 %	156972574
123	NC_009783	CAAAA	2	10	215932	215941	80 %	0 %	0 %	20 %	156972576
124	NC_009783	GTGAT	2	10	216215	216224	20 %	40 %	40 %	0 %	156972576
125	NC_009783	CATGC	2	10	219231	219240	20 %	20 %	20 %	40 %	156972580
126	NC_009783	CTTTG	2	10	220933	220942	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009783	GATCA	2	10	220967	220976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009783	AAGCG	2	10	221908	221917	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009783	CTTTT	2	10	221985	221994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009783	TACGT	2	10	228222	228231	20 %	40 %	20 %	20 %	156972585
131	NC_009783	TGCTC	2	10	234147	234156	0 %	40 %	20 %	40 %	156972592
132	NC_009783	TTTGC	2	10	236142	236151	0 %	60 %	20 %	20 %	156972595
133	NC_009783	GCAAA	2	10	236998	237007	60 %	0 %	20 %	20 %	156972594
134	NC_009783	ATCTT	2	10	237071	237080	20 %	60 %	0 %	20 %	156972594
135	NC_009783	TGCTG	2	10	238392	238401	0 %	40 %	40 %	20 %	156972597
136	NC_009783	ACGAG	2	10	239324	239333	40 %	0 %	40 %	20 %	156972598
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259	NC_009783	CGATA	2	10	408865	408874	40 %	20 %	20 %	20 %	156972758
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265	NC_009783	GCAAT	2	10	428223	428232	40 %	20 %	20 %	20 %	156972780
266	NC_009783	GAAGT	2	10	428490	428499	40 %	20 %	40 %	0 %	156972780
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