MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009457	T	6	6	154785	154790	0 %	100 %	0 %	0 %	147673733
3002	NC_009457	GCT	2	6	154848	154853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674509
3003	NC_009457	TGT	2	6	154879	154884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674509
3004	NC_009457	TGT	2	6	154897	154902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674509
3005	NC_009457	TAT	2	6	154975	154980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674509
3006	NC_009457	GTG	2	6	155033	155038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009457	GCTT	2	8	155147	155154	0 %	50 %	25 %	25 %	147674104
3008	NC_009457	GCA	2	6	155188	155193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674104
3009	NC_009457	GAA	2	6	155201	155206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674104
3010	NC_009457	AGA	2	6	155275	155280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674104
3011	NC_009457	GCC	2	6	155291	155296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674104
3012	NC_009457	GGC	2	6	155372	155377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674104
3013	NC_009457	CTT	2	6	155395	155400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674104
3014	NC_009457	ACC	2	6	155516	155521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674104
3015	NC_009457	GTC	2	6	155565	155570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674104
3016	NC_009457	TGT	2	6	155584	155589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674104
3017	NC_009457	GCC	2	6	155603	155608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674104
3018	NC_009457	TCA	2	6	155629	155634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674104
3019	NC_009457	CTT	2	6	155659	155664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674104
3020	NC_009457	TGG	2	6	155705	155710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674104
3021	NC_009457	CAG	2	6	155839	155844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674104
3022	NC_009457	TTGG	2	8	155860	155867	0 %	50 %	50 %	0 %	147674104
3023	NC_009457	TGA	2	6	155941	155946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674104
3024	NC_009457	TCG	2	6	155992	155997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674104
3025	NC_009457	GGTG	2	8	156083	156090	0 %	25 %	75 %	0 %	147674104
3026	NC_009457	TGC	2	6	156113	156118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674104
3027	NC_009457	GC	3	6	156223	156228	0 %	0 %	50 %	50 %	147674104
3028	NC_009457	ACC	2	6	156257	156262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674104
3029	NC_009457	ATG	2	6	156364	156369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675430
3030	NC_009457	CGC	2	6	156552	156557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_009457	CATTAT	2	12	156558	156569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3032	NC_009457	GCA	2	6	156577	156582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_009457	GTT	2	6	156599	156604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009457	GA	3	6	156620	156625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009457	GCA	2	6	156672	156677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673412
3036	NC_009457	AGA	3	9	156701	156709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673412
3037	NC_009457	TGG	3	9	156743	156751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673412
3038	NC_009457	GCG	2	6	156823	156828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673412
3039	NC_009457	TGG	2	6	156835	156840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673412
3040	NC_009457	CGG	2	6	156869	156874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673412
3041	NC_009457	TTC	2	6	156912	156917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673412
3042	NC_009457	AAC	2	6	156921	156926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147673412
3043	NC_009457	GCG	2	6	156952	156957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673412
3044	NC_009457	CAT	2	6	156958	156963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673412
3045	NC_009457	CTT	2	6	157088	157093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674168
3046	NC_009457	GC	3	6	157102	157107	0 %	0 %	50 %	50 %	147674168
3047	NC_009457	ACT	2	6	157109	157114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674168
3048	NC_009457	ATT	2	6	157150	157155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674168
3049	NC_009457	TTAGGC	2	12	157171	157182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147674168
3050	NC_009457	TTGA	2	8	157405	157412	25 %	50 %	25 %	0 %	147674168
3051	NC_009457	AGCG	2	8	157439	157446	25 %	0 %	50 %	25 %	147674168
3052	NC_009457	ACA	2	6	157467	157472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674168
3053	NC_009457	TGC	4	12	157536	157547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674168
3054	NC_009457	ATA	2	6	157595	157600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674168
3055	NC_009457	TTG	2	6	157661	157666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674168
3056	NC_009457	GCG	2	6	157765	157770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674168
3057	NC_009457	CAA	2	6	157882	157887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674168
3058	NC_009457	AGTTG	2	10	157914	157923	20 %	40 %	40 %	0 %	147674168
3059	NC_009457	ATT	2	6	158098	158103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674168
3060	NC_009457	ACTCA	2	10	158149	158158	40 %	20 %	0 %	40 %	147674168
3061	NC_009457	TGAT	2	8	158193	158200	25 %	50 %	25 %	0 %	147674212
3062	NC_009457	GCG	2	6	158201	158206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674212
3063	NC_009457	ATC	2	6	158315	158320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674212
3064	NC_009457	CCA	2	6	158335	158340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674212
3065	NC_009457	GATT	2	8	158367	158374	25 %	50 %	25 %	0 %	147674212
3066	NC_009457	TGT	2	6	158455	158460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674212
3067	NC_009457	CGG	2	6	158544	158549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674212
3068	NC_009457	TGA	2	6	158554	158559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674212
3069	NC_009457	TGAA	2	8	158568	158575	50 %	25 %	25 %	0 %	147674212
3070	NC_009457	GGC	2	6	158584	158589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674212
3071	NC_009457	TGT	2	6	158608	158613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674212
3072	NC_009457	ATC	2	6	158738	158743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674212
3073	NC_009457	CGC	2	6	158824	158829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674212
3074	NC_009457	TCGC	2	8	158994	159001	0 %	25 %	25 %	50 %	147674212
3075	NC_009457	A	6	6	159035	159040	100 %	0 %	0 %	0 %	147674212
3076	NC_009457	ATT	2	6	159056	159061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674212
3077	NC_009457	AAGCTC	2	12	159096	159107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147674212
3078	NC_009457	TGA	2	6	159109	159114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674212
3079	NC_009457	TAA	2	6	159121	159126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674212
3080	NC_009457	CAT	2	6	159208	159213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674212
3081	NC_009457	GTG	2	6	159221	159226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674212
3082	NC_009457	TTGG	2	8	159263	159270	0 %	50 %	50 %	0 %	147674212
3083	NC_009457	T	6	6	159289	159294	0 %	100 %	0 %	0 %	147674212
3084	NC_009457	TGG	2	6	159378	159383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674212
3085	NC_009457	GTG	2	6	159395	159400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674212
3086	NC_009457	GCG	2	6	159461	159466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674212
3087	NC_009457	CTG	2	6	159527	159532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3088	NC_009457	GTTT	2	8	159642	159649	0 %	75 %	25 %	0 %	147674212
3089	NC_009457	GTC	2	6	159651	159656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3090	NC_009457	TGG	2	6	159690	159695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674212
3091	NC_009457	GCT	2	6	159799	159804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3092	NC_009457	GCG	2	6	159812	159817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674212
3093	NC_009457	T	6	6	159857	159862	0 %	100 %	0 %	0 %	147674212
3094	NC_009457	TGAA	2	8	159921	159928	50 %	25 %	25 %	0 %	147674212
3095	NC_009457	G	6	6	160003	160008	0 %	0 %	100 %	0 %	147674212
3096	NC_009457	GAT	2	6	160010	160015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674212
3097	NC_009457	CGT	2	6	160024	160029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3098	NC_009457	TCG	2	6	160057	160062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3099	NC_009457	ATT	2	6	160076	160081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674212
3100	NC_009457	GCA	2	6	160278	160283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3101	NC_009457	GATT	2	8	160291	160298	25 %	50 %	25 %	0 %	147674212
3102	NC_009457	TGA	2	6	160318	160323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674212
3103	NC_009457	TGG	2	6	160353	160358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674212
3104	NC_009457	GAA	2	6	160424	160429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674212
3105	NC_009457	CACT	2	8	160518	160525	25 %	25 %	0 %	50 %	147674212
3106	NC_009457	ATT	2	6	160538	160543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674212
3107	NC_009457	AAGG	2	8	160613	160620	50 %	0 %	50 %	0 %	147674212
3108	NC_009457	AGT	2	6	160682	160687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674212
3109	NC_009457	GAG	2	6	160715	160720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147674212
3110	NC_009457	GGCGAT	2	12	160771	160782	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147674212
3111	NC_009457	CAT	3	9	160897	160905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674212
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3113	NC_009457	ATTG	2	8	160960	160967	25 %	50 %	25 %	0 %	147674212
3114	NC_009457	GAA	2	6	161006	161011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674212
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3117	NC_009457	GAC	2	6	161065	161070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3118	NC_009457	TGC	2	6	161082	161087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674212
3119	NC_009457	CAT	2	6	161113	161118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674212
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3121	NC_009457	CGG	2	6	161175	161180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674212
3122	NC_009457	GGA	2	6	161186	161191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147674212
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3239	NC_009457	T	6	6	167725	167730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_009457	ATT	2	6	167744	167749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673609
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3242	NC_009457	TG	3	6	167993	167998	0 %	50 %	50 %	0 %	147673609
3243	NC_009457	TGC	2	6	168013	168018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673609
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3490	NC_009457	TGA	2	6	179811	179816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675140
3491	NC_009457	GAT	2	6	179869	179874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675140
3492	NC_009457	TGC	2	6	179912	179917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675140
3493	NC_009457	TGA	2	6	180095	180100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675140
3494	NC_009457	GGC	2	6	180169	180174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675140
3495	NC_009457	TTGGCG	2	12	180191	180202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	147675140
3496	NC_009457	TGG	2	6	180239	180244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675140
3497	NC_009457	GA	3	6	180391	180396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_009457	AGC	2	6	180423	180428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675292
3499	NC_009457	ACTG	2	8	180492	180499	25 %	25 %	25 %	25 %	147675292
3500	NC_009457	ACC	2	6	180509	180514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675292

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