MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009457	AAG	2	6	51974	51979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673364
1002	NC_009457	A	6	6	52031	52036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009457	TC	4	8	52061	52068	0 %	50 %	0 %	50 %	147673999
1004	NC_009457	CG	3	6	52263	52268	0 %	0 %	50 %	50 %	147673999
1005	NC_009457	GTC	2	6	52452	52457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673999
1006	NC_009457	GC	3	6	52581	52586	0 %	0 %	50 %	50 %	147673999
1007	NC_009457	AATCAG	2	12	52617	52628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	147673999
1008	NC_009457	TCTG	2	8	52640	52647	0 %	50 %	25 %	25 %	147673999
1009	NC_009457	TCGT	2	8	52652	52659	0 %	50 %	25 %	25 %	147673999
1010	NC_009457	AGC	2	6	52741	52746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673999
1011	NC_009457	GGCG	2	8	52826	52833	0 %	0 %	75 %	25 %	147673999
1012	NC_009457	AAG	2	6	52987	52992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673999
1013	NC_009457	GTG	2	6	53073	53078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673999
1014	NC_009457	AG	3	6	53105	53110	50 %	0 %	50 %	0 %	147673999
1015	NC_009457	AG	3	6	53120	53125	50 %	0 %	50 %	0 %	147673999
1016	NC_009457	GAT	2	6	53158	53163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674427
1017	NC_009457	GATTGT	2	12	53220	53231	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	147674427
1018	NC_009457	GTG	2	6	53252	53257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674427
1019	NC_009457	TGA	2	6	53369	53374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674427
1020	NC_009457	AATC	2	8	53406	53413	50 %	25 %	0 %	25 %	147674427
1021	NC_009457	TGA	2	6	53430	53435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674427
1022	NC_009457	GGC	3	9	53457	53465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674427
1023	NC_009457	ACT	2	6	53518	53523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674427
1024	NC_009457	TGC	2	6	53535	53540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674427
1025	NC_009457	CTTA	2	8	53598	53605	25 %	50 %	0 %	25 %	147674427
1026	NC_009457	TCC	2	6	53736	53741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147674427
1027	NC_009457	TCAC	2	8	53803	53810	25 %	25 %	0 %	50 %	147674427
1028	NC_009457	CAC	2	6	53940	53945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675360
1029	NC_009457	GGC	2	6	53953	53958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675360
1030	NC_009457	TCG	2	6	53985	53990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675360
1031	NC_009457	ATG	2	6	53999	54004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675360
1032	NC_009457	AAT	2	6	54020	54025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675360
1033	NC_009457	CGA	2	6	54258	54263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675360
1034	NC_009457	TGGC	2	8	54274	54281	0 %	25 %	50 %	25 %	147675360
1035	NC_009457	GCT	2	6	54326	54331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675360
1036	NC_009457	GGT	2	6	54374	54379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675360
1037	NC_009457	TGA	2	6	54506	54511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675360
1038	NC_009457	TTA	2	6	54535	54540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673872
1039	NC_009457	TTA	2	6	54553	54558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673872
1040	NC_009457	ACA	2	6	54611	54616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147673872
1041	NC_009457	A	6	6	54658	54663	100 %	0 %	0 %	0 %	147673872
1042	NC_009457	TGATC	2	10	54711	54720	20 %	40 %	20 %	20 %	147673872
1043	NC_009457	A	6	6	54764	54769	100 %	0 %	0 %	0 %	147673872
1044	NC_009457	CTC	2	6	54794	54799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147673872
1045	NC_009457	TGG	2	6	54807	54812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673872
1046	NC_009457	GTGGCT	2	12	54832	54843	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	147673872
1047	NC_009457	CAAGTG	2	12	54851	54862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	147673872
1048	NC_009457	GCG	2	6	54871	54876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673872
1049	NC_009457	ACG	2	6	54877	54882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673872
1050	NC_009457	A	6	6	54964	54969	100 %	0 %	0 %	0 %	147673872
1051	NC_009457	CAAA	2	8	54991	54998	75 %	0 %	0 %	25 %	147673872
1052	NC_009457	ATGTTA	2	12	55034	55045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	147673872
1053	NC_009457	CAA	2	6	55143	55148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147673872
1054	NC_009457	ATC	2	6	55249	55254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673872
1055	NC_009457	GCT	2	6	55302	55307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673872
1056	NC_009457	AGGA	2	8	55313	55320	50 %	0 %	50 %	0 %	147673872
1057	NC_009457	AGA	2	6	55340	55345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673872
1058	NC_009457	CCA	2	6	55349	55354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673872
1059	NC_009457	AGA	2	6	55546	55551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674644
1060	NC_009457	TGA	2	6	55609	55614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674644
1061	NC_009457	GAA	3	9	55739	55747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674644
1062	NC_009457	TCG	2	6	55759	55764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674644
1063	NC_009457	GTG	2	6	55773	55778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674644
1064	NC_009457	TGG	2	6	55821	55826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674644
1065	NC_009457	GAA	2	6	55880	55885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674644
1066	NC_009457	CTAC	2	8	55947	55954	25 %	25 %	0 %	50 %	147674644
1067	NC_009457	TGG	2	6	55961	55966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674644
1068	NC_009457	TGA	2	6	55992	55997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674644
1069	NC_009457	GTC	2	6	56030	56035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674644
1070	NC_009457	ATTT	2	8	56048	56055	25 %	75 %	0 %	0 %	147674644
1071	NC_009457	AGA	2	6	56104	56109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674644
1072	NC_009457	GACC	2	8	56126	56133	25 %	0 %	25 %	50 %	147674644
1073	NC_009457	GAT	2	6	56138	56143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674644
1074	NC_009457	TGC	2	6	56154	56159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674644
1075	NC_009457	AACG	2	8	56165	56172	50 %	0 %	25 %	25 %	147674644
1076	NC_009457	TGG	2	6	56197	56202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674644
1077	NC_009457	CTG	2	6	56219	56224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674644
1078	NC_009457	GAT	2	6	56273	56278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674644
1079	NC_009457	GCT	2	6	56293	56298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674644
1080	NC_009457	AAG	2	6	56331	56336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674644
1081	NC_009457	CTT	2	6	56357	56362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674644
1082	NC_009457	GAA	2	6	56384	56389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674644
1083	NC_009457	CGT	2	6	56450	56455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674644
1084	NC_009457	TTG	2	6	56568	56573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009457	AGC	2	6	56621	56626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675773
1086	NC_009457	GAG	2	6	56661	56666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147675773
1087	NC_009457	GGCTT	2	10	56754	56763	0 %	40 %	40 %	20 %	147675773
1088	NC_009457	GTT	2	6	56799	56804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675773
1089	NC_009457	GC	4	8	56813	56820	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
1090	NC_009457	GCCA	2	8	56845	56852	25 %	0 %	25 %	50 %	147675773
1091	NC_009457	AGCG	2	8	57061	57068	25 %	0 %	50 %	25 %	147675773
1092	NC_009457	CATC	2	8	57105	57112	25 %	25 %	0 %	50 %	147675773
1093	NC_009457	CCA	2	6	57168	57173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675773
1094	NC_009457	ATC	2	6	57199	57204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675773
1095	NC_009457	TCAT	2	8	57404	57411	25 %	50 %	0 %	25 %	147675773
1096	NC_009457	ACC	2	6	57436	57441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675773
1097	NC_009457	CTT	2	6	57459	57464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675773
1098	NC_009457	GC	3	6	57500	57505	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
1099	NC_009457	GCA	2	6	57519	57524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675773
1100	NC_009457	GCC	2	6	57545	57550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675773
1101	NC_009457	GTT	2	6	57552	57557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675773
1102	NC_009457	GCT	2	6	57561	57566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675773
1103	NC_009457	AAC	2	6	57590	57595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675773
1104	NC_009457	TTC	2	6	57670	57675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675773
1105	NC_009457	GAT	2	6	57676	57681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675773
1106	NC_009457	T	6	6	57695	57700	0 %	100 %	0 %	0 %	147675773
1107	NC_009457	CCA	2	6	57917	57922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675773
1108	NC_009457	CAC	2	6	57931	57936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675773
1109	NC_009457	GGGT	2	8	57937	57944	0 %	25 %	75 %	0 %	147675773
1110	NC_009457	GCT	2	6	58023	58028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675773
1111	NC_009457	GCTC	2	8	58032	58039	0 %	25 %	25 %	50 %	147675773
1112	NC_009457	CTG	2	6	58063	58068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675773
1113	NC_009457	CATGG	2	10	58069	58078	20 %	20 %	40 %	20 %	147675773
1114	NC_009457	CG	3	6	58095	58100	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
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1117	NC_009457	TG	3	6	58428	58433	0 %	50 %	50 %	0 %	147675773
1118	NC_009457	AGC	2	6	58473	58478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675773
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1121	NC_009457	CG	3	6	58530	58535	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
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1126	NC_009457	TCT	2	6	58697	58702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675773
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1373	NC_009457	ATA	2	6	71326	71331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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