MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009457	AAGA	2	8	283653	283660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_009457	TGC	2	6	283746	283751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675363
5503	NC_009457	TGG	2	6	283776	283781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675363
5504	NC_009457	CTG	2	6	283826	283831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675363
5505	NC_009457	AAC	2	6	283838	283843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675363
5506	NC_009457	CGTT	2	8	283945	283952	0 %	50 %	25 %	25 %	147675363
5507	NC_009457	TTTA	2	8	283983	283990	25 %	75 %	0 %	0 %	147675363
5508	NC_009457	GTT	2	6	284038	284043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675363
5509	NC_009457	TCAA	2	8	284085	284092	50 %	25 %	0 %	25 %	147675363
5510	NC_009457	TGA	2	6	284131	284136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675363
5511	NC_009457	CGG	2	6	284202	284207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675363
5512	NC_009457	GCT	2	6	284227	284232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675363
5513	NC_009457	ATGC	2	8	284336	284343	25 %	25 %	25 %	25 %	147675363
5514	NC_009457	AAG	2	6	284364	284369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675363
5515	NC_009457	TGG	2	6	284370	284375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675363
5516	NC_009457	GCG	2	6	284384	284389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675363
5517	NC_009457	GTG	2	6	284400	284405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675363
5518	NC_009457	ACC	2	6	284426	284431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675363
5519	NC_009457	GCG	2	6	284453	284458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675363
5520	NC_009457	T	6	6	284495	284500	0 %	100 %	0 %	0 %	147675363
5521	NC_009457	ATCTTC	2	12	284513	284524	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	147675363
5522	NC_009457	TGG	2	6	284544	284549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675363
5523	NC_009457	CTT	2	6	284668	284673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675363
5524	NC_009457	GCGAT	2	10	284682	284691	20 %	20 %	40 %	20 %	147675363
5525	NC_009457	GAC	2	6	284707	284712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675363
5526	NC_009457	ATC	2	6	284722	284727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675363
5527	NC_009457	TTG	2	6	284846	284851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_009457	CTG	2	6	284878	284883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_009457	GAAAAA	2	12	284971	284982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	147674126
5530	NC_009457	CGT	2	6	284993	284998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674126
5531	NC_009457	GAA	2	6	285086	285091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674126
5532	NC_009457	AAG	2	6	285156	285161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674126
5533	NC_009457	TGA	2	6	285162	285167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674126
5534	NC_009457	CTGA	2	8	285215	285222	25 %	25 %	25 %	25 %	147674126
5535	NC_009457	TGG	2	6	285226	285231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674126
5536	NC_009457	GAA	2	6	285272	285277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674126
5537	NC_009457	TGA	2	6	285372	285377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674126
5538	NC_009457	A	6	6	285422	285427	100 %	0 %	0 %	0 %	147674126
5539	NC_009457	AAC	2	6	285494	285499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674126
5540	NC_009457	GTG	2	6	285519	285524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674126
5541	NC_009457	GGT	2	6	285593	285598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674126
5542	NC_009457	GGTG	2	8	285604	285611	0 %	25 %	75 %	0 %	147674126
5543	NC_009457	AGA	2	6	285619	285624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674126
5544	NC_009457	TGG	2	6	285711	285716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674126
5545	NC_009457	CGT	2	6	285725	285730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674126
5546	NC_009457	TG	3	6	285749	285754	0 %	50 %	50 %	0 %	147674126
5547	NC_009457	GTG	2	6	285798	285803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674126
5548	NC_009457	GCA	2	6	285821	285826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674126
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5551	NC_009457	CAT	2	6	285902	285907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674126
5552	NC_009457	CCAT	2	8	285948	285955	25 %	25 %	0 %	50 %	147674126
5553	NC_009457	TAC	2	6	285965	285970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674126
5554	NC_009457	TGA	2	6	286003	286008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674126
5555	NC_009457	CG	3	6	286042	286047	0 %	0 %	50 %	50 %	147674126
5556	NC_009457	CCA	2	6	286064	286069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674126
5557	NC_009457	ACA	2	6	286167	286172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_009457	ATC	2	6	286261	286266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673510
5559	NC_009457	TCT	2	6	286289	286294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673510
5560	NC_009457	TGG	2	6	286386	286391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673510
5561	NC_009457	CAA	2	6	286455	286460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147673510
5562	NC_009457	AAG	2	6	286474	286479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673510
5563	NC_009457	TGC	2	6	286496	286501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673510
5564	NC_009457	GATACG	2	12	286786	286797	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	147675510
5565	NC_009457	ATC	2	6	286816	286821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675510
5566	NC_009457	TCG	2	6	286847	286852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675510
5567	NC_009457	TGC	2	6	286899	286904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675510
5568	NC_009457	GTG	3	9	286931	286939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675510
5569	NC_009457	CAA	2	6	286993	286998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675510
5570	NC_009457	GAA	2	6	286999	287004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675510
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5572	NC_009457	AGC	2	6	287096	287101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675510
5573	NC_009457	GCT	2	6	287115	287120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675510
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5575	NC_009457	CG	3	6	287352	287357	0 %	0 %	50 %	50 %	147675510
5576	NC_009457	GCA	2	6	287434	287439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675510
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5583	NC_009457	GATT	2	8	287784	287791	25 %	50 %	25 %	0 %	147675510
5584	NC_009457	TCG	2	6	287858	287863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675510
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5587	NC_009457	TAC	2	6	287965	287970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675510
5588	NC_009457	GAT	2	6	288039	288044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675510
5589	NC_009457	CGGT	2	8	288092	288099	0 %	25 %	50 %	25 %	147675510
5590	NC_009457	A	6	6	288159	288164	100 %	0 %	0 %	0 %	147675510
5591	NC_009457	GCA	2	6	288168	288173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675510
5592	NC_009457	TCA	2	6	288180	288185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675510
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5594	NC_009457	TTTG	2	8	288252	288259	0 %	75 %	25 %	0 %	147675510
5595	NC_009457	CTG	2	6	288361	288366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675510
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5601	NC_009457	AGC	2	6	288586	288591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673073
5602	NC_009457	TACGTC	2	12	288685	288696	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147673073
5603	NC_009457	TGA	2	6	288701	288706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673073
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5605	NC_009457	CGG	2	6	288761	288766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673073
5606	NC_009457	TGA	2	6	288812	288817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673073
5607	NC_009457	GCGG	2	8	288828	288835	0 %	0 %	75 %	25 %	147673073
5608	NC_009457	GGTGC	2	10	288909	288918	0 %	20 %	60 %	20 %	147673073
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5617	NC_009457	TTG	2	6	289224	289229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673073
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5619	NC_009457	AGAA	2	8	289330	289337	75 %	0 %	25 %	0 %	147673073
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