MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009457	TCCGC	2	10	258723	258732	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5002	NC_009457	TTA	2	6	258736	258741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_009457	T	9	9	258764	258772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_009457	CT	3	6	258815	258820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_009457	CTT	2	6	258828	258833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_009457	T	6	6	258863	258868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_009457	GCTG	2	8	258890	258897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_009457	ATG	2	6	258900	258905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_009457	A	6	6	258908	258913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_009457	CT	3	6	259005	259010	0 %	50 %	0 %	50 %	147673086
5011	NC_009457	AGG	2	6	259071	259076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147673086
5012	NC_009457	TGG	2	6	259088	259093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673086
5013	NC_009457	CAG	2	6	259117	259122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673086
5014	NC_009457	TTA	2	6	259224	259229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673086
5015	NC_009457	ACA	2	6	259239	259244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147673086
5016	NC_009457	GAG	2	6	259250	259255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147673086
5017	NC_009457	GCAAC	2	10	259330	259339	40 %	0 %	20 %	40 %	147675451
5018	NC_009457	TGTT	2	8	259603	259610	0 %	75 %	25 %	0 %	147675451
5019	NC_009457	GGT	2	6	259633	259638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675451
5020	NC_009457	TGG	2	6	259647	259652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675451
5021	NC_009457	TGCTT	2	10	259680	259689	0 %	60 %	20 %	20 %	147675451
5022	NC_009457	GCC	2	6	259695	259700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675451
5023	NC_009457	CAG	2	6	259885	259890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675451
5024	NC_009457	TAA	2	6	259981	259986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675451
5025	NC_009457	AGT	2	6	260052	260057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673050
5026	NC_009457	TGA	2	6	260089	260094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673050
5027	NC_009457	CA	3	6	260227	260232	50 %	0 %	0 %	50 %	147673050
5028	NC_009457	CAG	2	6	260326	260331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674148
5029	NC_009457	CAT	2	6	260394	260399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5030	NC_009457	TCA	2	6	260463	260468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5031	NC_009457	CGTAGT	2	12	260583	260594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147674148
5032	NC_009457	TCA	2	6	260670	260675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5033	NC_009457	ATC	2	6	260680	260685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5034	NC_009457	CAT	2	6	260706	260711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5035	NC_009457	AGT	2	6	260748	260753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674148
5036	NC_009457	AGTG	2	8	260783	260790	25 %	25 %	50 %	0 %	147674148
5037	NC_009457	ATG	2	6	260849	260854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674148
5038	NC_009457	GGC	2	6	260878	260883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674148
5039	NC_009457	TCA	2	6	260891	260896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5040	NC_009457	CAT	2	6	260925	260930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5041	NC_009457	TGG	2	6	260952	260957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674148
5042	NC_009457	TGC	2	6	260992	260997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674148
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5044	NC_009457	TGC	2	6	261043	261048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674148
5045	NC_009457	TTG	2	6	261107	261112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674148
5046	NC_009457	AGCA	2	8	261125	261132	50 %	0 %	25 %	25 %	147674148
5047	NC_009457	CATA	2	8	261148	261155	50 %	25 %	0 %	25 %	147674148
5048	NC_009457	TCT	2	6	261218	261223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674148
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5050	NC_009457	TTC	2	6	261340	261345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674148
5051	NC_009457	CAT	2	6	261352	261357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674148
5052	NC_009457	ATG	2	6	261377	261382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674148
5053	NC_009457	ATCA	2	8	261400	261407	50 %	25 %	0 %	25 %	147674148
5054	NC_009457	AC	3	6	261463	261468	50 %	0 %	0 %	50 %	147674148
5055	NC_009457	T	6	6	261478	261483	0 %	100 %	0 %	0 %	147674148
5056	NC_009457	TACG	2	8	261543	261550	25 %	25 %	25 %	25 %	147674148
5057	NC_009457	TTC	2	6	261617	261622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674148
5058	NC_009457	TTGC	2	8	261675	261682	0 %	50 %	25 %	25 %	147674148
5059	NC_009457	ACC	2	6	261716	261721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_009457	CAC	2	6	261784	261789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_009457	GGT	2	6	261804	261809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_009457	AGGC	2	8	261841	261848	25 %	0 %	50 %	25 %	147673880
5063	NC_009457	TCA	2	6	261950	261955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673880
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5070	NC_009457	CGT	2	6	262219	262224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673880
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5073	NC_009457	CTGC	2	8	262316	262323	0 %	25 %	25 %	50 %	147673880
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5081	NC_009457	A	7	7	262811	262817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_009457	GTT	2	6	262833	262838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_009457	CTTTG	2	10	262840	262849	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5084	NC_009457	AT	3	6	262864	262869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_009457	TTTG	2	8	262897	262904	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_009457	TGG	2	6	263147	263152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674650
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5091	NC_009457	TGT	2	6	263210	263215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674650
5092	NC_009457	GTG	2	6	263230	263235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674650
5093	NC_009457	AAG	3	9	263236	263244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674650
5094	NC_009457	GAT	2	6	263274	263279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674650
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5096	NC_009457	CCG	2	6	263336	263341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674650
5097	NC_009457	GGA	2	6	263360	263365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147674650
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5099	NC_009457	CTT	2	6	263468	263473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674650
5100	NC_009457	AC	3	6	263478	263483	50 %	0 %	0 %	50 %	147674650
5101	NC_009457	GT	3	6	263491	263496	0 %	50 %	50 %	0 %	147674650
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5104	NC_009457	TCG	2	6	263573	263578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674650
5105	NC_009457	AGA	2	6	263594	263599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674650
5106	NC_009457	GCGCG	2	10	263630	263639	0 %	0 %	60 %	40 %	147674650
5107	NC_009457	T	8	8	263732	263739	0 %	100 %	0 %	0 %	147675436
5108	NC_009457	TGG	2	6	263755	263760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675436
5109	NC_009457	GCT	2	6	263786	263791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675436
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5111	NC_009457	A	6	6	263949	263954	100 %	0 %	0 %	0 %	147675436
5112	NC_009457	GGT	3	9	264017	264025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675436
5113	NC_009457	GTG	2	6	264050	264055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675436
5114	NC_009457	GCA	2	6	264068	264073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675436
5115	NC_009457	CTG	2	6	264123	264128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675436
5116	NC_009457	A	6	6	264156	264161	100 %	0 %	0 %	0 %	147675436
5117	NC_009457	GAT	2	6	264162	264167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675436
5118	NC_009457	CGC	2	6	264193	264198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675436
5119	NC_009457	TGG	2	6	264259	264264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675436
5120	NC_009457	TGC	2	6	264355	264360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675436
5121	NC_009457	AGA	2	6	264380	264385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675436
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5123	NC_009457	AGC	2	6	264439	264444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675436
5124	NC_009457	CTG	2	6	264474	264479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675436
5125	NC_009457	GCCA	2	8	264536	264543	25 %	0 %	25 %	50 %	147675436
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5132	NC_009457	TTGGTT	2	12	265025	265036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673708
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5141	NC_009457	GGGT	2	8	265665	265672	0 %	25 %	75 %	0 %	147673708
5142	NC_009457	GCT	2	6	265693	265698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673708
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5145	NC_009457	CAT	2	6	265951	265956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673708
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5153	NC_009457	GTTGC	2	10	266190	266199	0 %	40 %	40 %	20 %	147673098
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5164	NC_009457	CGCC	2	8	266717	266724	0 %	0 %	25 %	75 %	147673098
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5218	NC_009457	GTA	2	6	269553	269558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674904
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5220	NC_009457	GTT	2	6	269722	269727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_009457	CG	4	8	269854	269861	0 %	0 %	50 %	50 %	147675548
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5225	NC_009457	GTG	2	6	269990	269995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675548
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5235	NC_009457	CAA	2	6	270436	270441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675548
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5241	NC_009457	TGG	2	6	270896	270901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675548
5242	NC_009457	GTTT	2	8	271041	271048	0 %	75 %	25 %	0 %	147675548
5243	NC_009457	GCA	2	6	271060	271065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675548
5244	NC_009457	AGTTT	2	10	271085	271094	20 %	60 %	20 %	0 %	147675548
5245	NC_009457	TGT	2	6	271139	271144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675548
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5492	NC_009457	CAG	2	6	283237	283242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673820
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5495	NC_009457	TTG	2	6	283505	283510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_009457	CAC	2	6	283567	283572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5497	NC_009457	GCA	2	6	283573	283578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5499	NC_009457	GC	3	6	283613	283618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5500	NC_009457	CGA	2	6	283631	283636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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