MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 1773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009456	GT	3	6	1378	1383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009456	CT	4	8	1455	1462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009456	AT	3	6	3846	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	147671999
4	NC_009456	AG	3	6	4303	4308	50 %	0 %	50 %	0 %	147671650
5	NC_009456	AC	3	6	4314	4319	50 %	0 %	0 %	50 %	147671650
6	NC_009456	TC	3	6	4938	4943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009456	CG	3	6	5905	5910	0 %	0 %	50 %	50 %	147671890
8	NC_009456	CA	3	6	6311	6316	50 %	0 %	0 %	50 %	147671538
9	NC_009456	GC	3	6	6384	6389	0 %	0 %	50 %	50 %	147671538
10	NC_009456	AC	3	6	6458	6463	50 %	0 %	0 %	50 %	147671538
11	NC_009456	CG	3	6	6842	6847	0 %	0 %	50 %	50 %	147671538
12	NC_009456	CA	3	6	8784	8789	50 %	0 %	0 %	50 %	147672299
13	NC_009456	GC	3	6	9500	9505	0 %	0 %	50 %	50 %	147671783
14	NC_009456	GC	3	6	9662	9667	0 %	0 %	50 %	50 %	147671783
15	NC_009456	CG	3	6	10661	10666	0 %	0 %	50 %	50 %	229259762
16	NC_009456	AG	3	6	10979	10984	50 %	0 %	50 %	0 %	229259762
17	NC_009456	TG	3	6	11547	11552	0 %	50 %	50 %	0 %	147672208
18	NC_009456	TA	3	6	11727	11732	50 %	50 %	0 %	0 %	147671565
19	NC_009456	TA	3	6	11817	11822	50 %	50 %	0 %	0 %	147671565
20	NC_009456	AC	3	6	11952	11957	50 %	0 %	0 %	50 %	147671565
21	NC_009456	AT	3	6	12534	12539	50 %	50 %	0 %	0 %	147671421
22	NC_009456	GT	3	6	14571	14576	0 %	50 %	50 %	0 %	147671421
23	NC_009456	CA	3	6	14663	14668	50 %	0 %	0 %	50 %	147671421
24	NC_009456	TG	3	6	15223	15228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009456	CG	3	6	17890	17895	0 %	0 %	50 %	50 %	147671876
26	NC_009456	CT	3	6	18314	18319	0 %	50 %	0 %	50 %	147671876
27	NC_009456	AC	3	6	18474	18479	50 %	0 %	0 %	50 %	147671876
28	NC_009456	CT	3	6	18712	18717	0 %	50 %	0 %	50 %	147671876
29	NC_009456	AG	3	6	18865	18870	50 %	0 %	50 %	0 %	147671876
30	NC_009456	CG	3	6	18985	18990	0 %	0 %	50 %	50 %	147671876
31	NC_009456	GA	5	10	21520	21529	50 %	0 %	50 %	0 %	147672276
32	NC_009456	CA	3	6	21623	21628	50 %	0 %	0 %	50 %	147672276
33	NC_009456	CG	3	6	22393	22398	0 %	0 %	50 %	50 %	147671674
34	NC_009456	GC	3	6	22641	22646	0 %	0 %	50 %	50 %	147671674
35	NC_009456	GT	3	6	22906	22911	0 %	50 %	50 %	0 %	147671674
36	NC_009456	CT	3	6	23972	23977	0 %	50 %	0 %	50 %	147672171
37	NC_009456	CT	3	6	24100	24105	0 %	50 %	0 %	50 %	147672171
38	NC_009456	GT	3	6	24562	24567	0 %	50 %	50 %	0 %	147672171
39	NC_009456	TG	3	6	25382	25387	0 %	50 %	50 %	0 %	147672171
40	NC_009456	AG	3	6	26367	26372	50 %	0 %	50 %	0 %	147672171
41	NC_009456	AG	4	8	26438	26445	50 %	0 %	50 %	0 %	147672171
42	NC_009456	AC	6	12	27846	27857	50 %	0 %	0 %	50 %	147671947
43	NC_009456	GA	3	6	27858	27863	50 %	0 %	50 %	0 %	147671947
44	NC_009456	TG	3	6	29294	29299	0 %	50 %	50 %	0 %	147671976
45	NC_009456	CA	3	6	29617	29622	50 %	0 %	0 %	50 %	147671976
46	NC_009456	TG	3	6	29755	29760	0 %	50 %	50 %	0 %	147671976
47	NC_009456	TG	3	6	31638	31643	0 %	50 %	50 %	0 %	147672162
48	NC_009456	CA	3	6	31940	31945	50 %	0 %	0 %	50 %	147672162
49	NC_009456	CA	3	6	32099	32104	50 %	0 %	0 %	50 %	147672162
50	NC_009456	CT	3	6	32247	32252	0 %	50 %	0 %	50 %	147672162
51	NC_009456	AG	3	6	32839	32844	50 %	0 %	50 %	0 %	147672162
52	NC_009456	GT	3	6	32959	32964	0 %	50 %	50 %	0 %	147672162
53	NC_009456	CG	3	6	33222	33227	0 %	0 %	50 %	50 %	147672162
54	NC_009456	GA	3	6	33581	33586	50 %	0 %	50 %	0 %	147671801
55	NC_009456	CT	3	6	33788	33793	0 %	50 %	0 %	50 %	147671801
56	NC_009456	GC	3	6	33942	33947	0 %	0 %	50 %	50 %	147672284
57	NC_009456	GC	3	6	34593	34598	0 %	0 %	50 %	50 %	147672284
58	NC_009456	TC	3	6	35390	35395	0 %	50 %	0 %	50 %	147671915
59	NC_009456	AT	3	6	36045	36050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009456	AT	3	6	36233	36238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009456	AT	3	6	37640	37645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009456	AC	3	6	38875	38880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009456	TC	3	6	39439	39444	0 %	50 %	0 %	50 %	147672092
64	NC_009456	TG	3	6	39690	39695	0 %	50 %	50 %	0 %	147672092
65	NC_009456	CA	3	6	40354	40359	50 %	0 %	0 %	50 %	147671884
66	NC_009456	GA	3	6	41408	41413	50 %	0 %	50 %	0 %	147671884
67	NC_009456	AC	3	6	41627	41632	50 %	0 %	0 %	50 %	147671884
68	NC_009456	CT	3	6	41874	41879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009456	TC	3	6	42129	42134	0 %	50 %	0 %	50 %	147672516
70	NC_009456	CA	3	6	42701	42706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009456	CT	4	8	43218	43225	0 %	50 %	0 %	50 %	147671764
72	NC_009456	TC	3	6	43582	43587	0 %	50 %	0 %	50 %	147671764
73	NC_009456	GC	3	6	44478	44483	0 %	0 %	50 %	50 %	147671576
74	NC_009456	AG	3	6	44799	44804	50 %	0 %	50 %	0 %	147671842
75	NC_009456	TG	3	6	44927	44932	0 %	50 %	50 %	0 %	147671842
76	NC_009456	CA	3	6	45990	45995	50 %	0 %	0 %	50 %	147672331
77	NC_009456	CA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	0 %	50 %	147672331
78	NC_009456	CG	3	6	47756	47761	0 %	0 %	50 %	50 %	147671694
79	NC_009456	GC	3	6	48029	48034	0 %	0 %	50 %	50 %	147671694
80	NC_009456	TG	3	6	49288	49293	0 %	50 %	50 %	0 %	147672107
81	NC_009456	CT	3	6	49819	49824	0 %	50 %	0 %	50 %	147672338
82	NC_009456	TG	3	6	50328	50333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009456	TC	3	6	50824	50829	0 %	50 %	0 %	50 %	147672104
84	NC_009456	AT	3	6	50995	51000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009456	TG	3	6	51856	51861	0 %	50 %	50 %	0 %	147671916
86	NC_009456	AC	3	6	52131	52136	50 %	0 %	0 %	50 %	147671777
87	NC_009456	TC	3	6	53066	53071	0 %	50 %	0 %	50 %	147671653
88	NC_009456	AT	3	6	53993	53998	50 %	50 %	0 %	0 %	147672327
89	NC_009456	TC	3	6	54110	54115	0 %	50 %	0 %	50 %	147672327
90	NC_009456	CA	3	6	55219	55224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009456	TA	3	6	55942	55947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009456	GA	4	8	55982	55989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009456	CT	3	6	56609	56614	0 %	50 %	0 %	50 %	147671678
94	NC_009456	AG	3	6	57064	57069	50 %	0 %	50 %	0 %	147671678
95	NC_009456	AC	3	6	57952	57957	50 %	0 %	0 %	50 %	147672367
96	NC_009456	AC	3	6	57988	57993	50 %	0 %	0 %	50 %	147672367
97	NC_009456	GA	3	6	58680	58685	50 %	0 %	50 %	0 %	147672367
98	NC_009456	GA	3	6	58689	58694	50 %	0 %	50 %	0 %	147672367
99	NC_009456	AC	3	6	58732	58737	50 %	0 %	0 %	50 %	147672367
100	NC_009456	AG	3	6	59111	59116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009456	AG	3	6	60338	60343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009456	CA	3	6	60444	60449	50 %	0 %	0 %	50 %	147672425
103	NC_009456	CA	3	6	60518	60523	50 %	0 %	0 %	50 %	147672425
104	NC_009456	CA	3	6	60630	60635	50 %	0 %	0 %	50 %	147672425
105	NC_009456	CT	3	6	61798	61803	0 %	50 %	0 %	50 %	147672425
106	NC_009456	GA	4	8	63043	63050	50 %	0 %	50 %	0 %	147671781
107	NC_009456	TG	3	6	63708	63713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009456	TC	3	6	64150	64155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009456	CG	3	6	65327	65332	0 %	0 %	50 %	50 %	147671888
110	NC_009456	GC	3	6	65522	65527	0 %	0 %	50 %	50 %	147671888
111	NC_009456	CA	3	6	66234	66239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009456	GT	3	6	66470	66475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009456	GC	3	6	68998	69003	0 %	0 %	50 %	50 %	147672035
114	NC_009456	TG	3	6	69211	69216	0 %	50 %	50 %	0 %	147672035
115	NC_009456	TC	4	8	69350	69357	0 %	50 %	0 %	50 %	147672035
116	NC_009456	GC	3	6	69911	69916	0 %	0 %	50 %	50 %	147671521
117	NC_009456	GC	3	6	70061	70066	0 %	0 %	50 %	50 %	147671521
118	NC_009456	CG	3	6	71706	71711	0 %	0 %	50 %	50 %	147672465
119	NC_009456	CG	3	6	71792	71797	0 %	0 %	50 %	50 %	147672465
120	NC_009456	AG	3	6	74434	74439	50 %	0 %	50 %	0 %	147671767
121	NC_009456	CA	3	6	74601	74606	50 %	0 %	0 %	50 %	147671767
122	NC_009456	AG	3	6	74668	74673	50 %	0 %	50 %	0 %	147671767
123	NC_009456	CG	3	6	74837	74842	0 %	0 %	50 %	50 %	147671767
124	NC_009456	CG	3	6	74896	74901	0 %	0 %	50 %	50 %	147671767
125	NC_009456	TC	3	6	75038	75043	0 %	50 %	0 %	50 %	147671767
126	NC_009456	TG	3	6	75822	75827	0 %	50 %	50 %	0 %	147672139
127	NC_009456	GC	3	6	77111	77116	0 %	0 %	50 %	50 %	147671952
128	NC_009456	GC	3	6	77287	77292	0 %	0 %	50 %	50 %	147671952
129	NC_009456	GA	3	6	77473	77478	50 %	0 %	50 %	0 %	147672272
130	NC_009456	GA	3	6	78792	78797	50 %	0 %	50 %	0 %	147672272
131	NC_009456	CT	3	6	80011	80016	0 %	50 %	0 %	50 %	147671724
132	NC_009456	TG	3	6	80921	80926	0 %	50 %	50 %	0 %	147671724
133	NC_009456	GC	3	6	82330	82335	0 %	0 %	50 %	50 %	147672486
134	NC_009456	GA	3	6	82799	82804	50 %	0 %	50 %	0 %	147672486
135	NC_009456	GT	3	6	82990	82995	0 %	50 %	50 %	0 %	147672486
136	NC_009456	CG	3	6	83512	83517	0 %	0 %	50 %	50 %	147672486
137	NC_009456	CA	3	6	84733	84738	50 %	0 %	0 %	50 %	147671861
138	NC_009456	CG	3	6	86362	86367	0 %	0 %	50 %	50 %	147671464
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140	NC_009456	CG	3	6	87716	87721	0 %	0 %	50 %	50 %	147672153
141	NC_009456	CA	3	6	87868	87873	50 %	0 %	0 %	50 %	147672153
142	NC_009456	GC	3	6	87998	88003	0 %	0 %	50 %	50 %	147672153
143	NC_009456	GC	3	6	88163	88168	0 %	0 %	50 %	50 %	147672153
144	NC_009456	AC	3	6	88673	88678	50 %	0 %	0 %	50 %	147671661
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