MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009456	CATCT	2	10	209352	209361	20 %	40 %	0 %	40 %	147671881
4002	NC_009456	GCT	2	6	209378	209383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_009456	ATT	2	6	209541	209546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672053
4004	NC_009456	ATT	2	6	209588	209593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_009456	ATTT	2	8	209620	209627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_009456	AAT	2	6	209654	209659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_009456	A	8	8	209682	209689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009456	GTG	2	6	209768	209773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671454
4009	NC_009456	GCG	2	6	209807	209812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671454
4010	NC_009456	CAT	2	6	209842	209847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671454
4011	NC_009456	AATG	2	8	209854	209861	50 %	25 %	25 %	0 %	147671454
4012	NC_009456	TG	3	6	209893	209898	0 %	50 %	50 %	0 %	147671454
4013	NC_009456	GAT	2	6	209918	209923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671454
4014	NC_009456	TG	3	6	209955	209960	0 %	50 %	50 %	0 %	147671454
4015	NC_009456	CGT	2	6	210005	210010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671454
4016	NC_009456	TTG	2	6	210023	210028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671454
4017	NC_009456	CTTT	2	8	210033	210040	0 %	75 %	0 %	25 %	147671454
4018	NC_009456	A	6	6	210050	210055	100 %	0 %	0 %	0 %	147671454
4019	NC_009456	TTGC	2	8	210081	210088	0 %	50 %	25 %	25 %	147671454
4020	NC_009456	GGT	2	6	210101	210106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671454
4021	NC_009456	TTC	2	6	210110	210115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671454
4022	NC_009456	T	6	6	210140	210145	0 %	100 %	0 %	0 %	147671454
4023	NC_009456	ACGT	2	8	210192	210199	25 %	25 %	25 %	25 %	147671454
4024	NC_009456	ATG	2	6	210234	210239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671454
4025	NC_009456	CGC	2	6	210250	210255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671454
4026	NC_009456	CAA	2	6	210310	210315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671454
4027	NC_009456	GTG	2	6	210317	210322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671454
4028	NC_009456	CTG	2	6	210332	210337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671454
4029	NC_009456	CAA	2	6	210367	210372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671454
4030	NC_009456	ACC	2	6	210384	210389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
4031	NC_009456	CG	3	6	210530	210535	0 %	0 %	50 %	50 %	147671454
4032	NC_009456	CAT	2	6	210562	210567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671454
4033	NC_009456	ACG	2	6	210582	210587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671454
4034	NC_009456	CG	3	6	210601	210606	0 %	0 %	50 %	50 %	147671454
4035	NC_009456	GGT	2	6	210610	210615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671454
4036	NC_009456	TG	3	6	210633	210638	0 %	50 %	50 %	0 %	147671454
4037	NC_009456	TGGG	2	8	210662	210669	0 %	25 %	75 %	0 %	147671454
4038	NC_009456	ATG	2	6	210689	210694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671454
4039	NC_009456	CAC	2	6	210705	210710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
4040	NC_009456	TTC	2	6	210711	210716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671454
4041	NC_009456	CAG	2	6	210770	210775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671454
4042	NC_009456	AAGA	2	8	210806	210813	75 %	0 %	25 %	0 %	147671454
4043	NC_009456	CAC	2	6	210815	210820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
4044	NC_009456	TGC	2	6	210873	210878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671454
4045	NC_009456	GCG	2	6	210911	210916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671454
4046	NC_009456	TGA	2	6	211008	211013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671454
4047	NC_009456	A	6	6	211013	211018	100 %	0 %	0 %	0 %	147671454
4048	NC_009456	CCA	2	6	211043	211048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
4049	NC_009456	GAT	2	6	211097	211102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671454
4050	NC_009456	TTTGAA	2	12	211112	211123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	147671454
4051	NC_009456	CAC	2	6	211198	211203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
4052	NC_009456	CCA	2	6	211254	211259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
4053	NC_009456	AAC	2	6	211283	211288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671454
4054	NC_009456	ATC	2	6	211289	211294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671454
4055	NC_009456	GCA	2	6	211360	211365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671454
4056	NC_009456	TTGA	2	8	211397	211404	25 %	50 %	25 %	0 %	147671454
4057	NC_009456	AGA	2	6	211405	211410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671454
4058	NC_009456	CAC	2	6	211413	211418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
4059	NC_009456	ATG	2	6	211521	211526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671454
4060	NC_009456	CG	4	8	211553	211560	0 %	0 %	50 %	50 %	147671454
4061	NC_009456	AAG	2	6	211590	211595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671454
4062	NC_009456	CGC	2	6	211660	211665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671454
4063	NC_009456	GT	3	6	211692	211697	0 %	50 %	50 %	0 %	147671454
4064	NC_009456	TG	4	8	211698	211705	0 %	50 %	50 %	0 %	147671454
4065	NC_009456	AGA	2	6	211756	211761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671454
4066	NC_009456	TGC	2	6	211773	211778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671454
4067	NC_009456	ACA	2	6	211902	211907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_009456	ATG	2	6	211995	212000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672015
4069	NC_009456	CAT	2	6	212009	212014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672015
4070	NC_009456	TATCT	2	10	212054	212063	20 %	60 %	0 %	20 %	147672015
4071	NC_009456	A	6	6	212130	212135	100 %	0 %	0 %	0 %	147672015
4072	NC_009456	CGG	2	6	212138	212143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672015
4073	NC_009456	GGT	2	6	212148	212153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672015
4074	NC_009456	TGG	2	6	212351	212356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672015
4075	NC_009456	CAT	3	9	212399	212407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672015
4076	NC_009456	CAT	2	6	212426	212431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672015
4077	NC_009456	GGC	2	6	212508	212513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672015
4078	NC_009456	GGC	2	6	212616	212621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672015
4079	NC_009456	CAT	2	6	212645	212650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672015
4080	NC_009456	TGGC	2	8	212801	212808	0 %	25 %	50 %	25 %	147672015
4081	NC_009456	TTC	2	6	212853	212858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672015
4082	NC_009456	TGA	2	6	212944	212949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672015
4083	NC_009456	CTCA	2	8	212960	212967	25 %	25 %	0 %	50 %	147672015
4084	NC_009456	CAT	2	6	213011	213016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672015
4085	NC_009456	CT	3	6	213027	213032	0 %	50 %	0 %	50 %	147672015
4086	NC_009456	AGC	2	6	213058	213063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672015
4087	NC_009456	CTT	2	6	213185	213190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672015
4088	NC_009456	TC	3	6	213214	213219	0 %	50 %	0 %	50 %	147672015
4089	NC_009456	CAGCG	2	10	213285	213294	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4090	NC_009456	GCG	2	6	213420	213425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_009456	ACA	2	6	213445	213450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_009456	GGGCG	2	10	213460	213469	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4093	NC_009456	GGT	2	6	213482	213487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_009456	TCG	2	6	213519	213524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_009456	CAG	2	6	213529	213534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_009456	GA	4	8	213574	213581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_009456	AC	3	6	213589	213594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_009456	T	6	6	213685	213690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_009456	GTG	2	6	213784	213789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671705
4100	NC_009456	CTG	2	6	213792	213797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671705
4101	NC_009456	GAT	2	6	213801	213806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671705
4102	NC_009456	TAC	2	6	213854	213859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671705
4103	NC_009456	TGA	2	6	213874	213879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671705
4104	NC_009456	CTGA	2	8	213912	213919	25 %	25 %	25 %	25 %	147671705
4105	NC_009456	TGG	2	6	213952	213957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671705
4106	NC_009456	AAC	2	6	213963	213968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671705
4107	NC_009456	CAC	2	6	214049	214054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671705
4108	NC_009456	CCG	2	6	214063	214068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671705
4109	NC_009456	AGA	2	6	214088	214093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671705
4110	NC_009456	CGT	2	6	214152	214157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671705
4111	NC_009456	CAGC	2	8	214203	214210	25 %	0 %	25 %	50 %	147671705
4112	NC_009456	GT	3	6	214213	214218	0 %	50 %	50 %	0 %	147671705
4113	NC_009456	GCA	2	6	214243	214248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671705
4114	NC_009456	ATC	2	6	214266	214271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671705
4115	NC_009456	GAA	2	6	214361	214366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_009456	TCA	2	6	214388	214393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_009456	TGA	2	6	214408	214413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009456	ACC	2	6	214425	214430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672209
4119	NC_009456	CTT	2	6	214434	214439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672209
4120	NC_009456	T	6	6	214509	214514	0 %	100 %	0 %	0 %	147672209
4121	NC_009456	GGTC	2	8	214566	214573	0 %	25 %	50 %	25 %	147672209
4122	NC_009456	T	6	6	214624	214629	0 %	100 %	0 %	0 %	147672209
4123	NC_009456	CAT	2	6	214633	214638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672209
4124	NC_009456	ATG	2	6	214648	214653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672209
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4134	NC_009456	TGC	2	6	215100	215105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4240	NC_009456	CAT	2	6	220585	220590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_009456	TCGC	2	8	220604	220611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4242	NC_009456	AC	3	6	220642	220647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_009456	A	6	6	220675	220680	100 %	0 %	0 %	0 %	147672322
4244	NC_009456	TCGT	2	8	220768	220775	0 %	50 %	25 %	25 %	147672322
4245	NC_009456	AG	3	6	220835	220840	50 %	0 %	50 %	0 %	147672322
4246	NC_009456	CTCA	2	8	220841	220848	25 %	25 %	0 %	50 %	147672322
4247	NC_009456	CGG	2	6	220889	220894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672322
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4249	NC_009456	AGA	2	6	221051	221056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672322
4250	NC_009456	GCAA	2	8	221106	221113	50 %	0 %	25 %	25 %	147672322
4251	NC_009456	CAAG	2	8	221168	221175	50 %	0 %	25 %	25 %	147672322
4252	NC_009456	GCG	2	6	221191	221196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672322
4253	NC_009456	CTG	2	6	221202	221207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672322
4254	NC_009456	TGAT	2	8	221260	221267	25 %	50 %	25 %	0 %	147672322
4255	NC_009456	CA	3	6	221321	221326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4256	NC_009456	GTGC	2	8	221357	221364	0 %	25 %	50 %	25 %	147671731
4257	NC_009456	GTT	2	6	221510	221515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671731
4258	NC_009456	TTG	2	6	221531	221536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671731
4259	NC_009456	CAC	2	6	221544	221549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671731
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4261	NC_009456	GCG	2	6	221742	221747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671731
4262	NC_009456	GAA	2	6	221777	221782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671731
4263	NC_009456	GGTT	2	8	221802	221809	0 %	50 %	50 %	0 %	147671731
4264	NC_009456	GCTT	2	8	221840	221847	0 %	50 %	25 %	25 %	147671731
4265	NC_009456	C	12	12	221850	221861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4266	NC_009456	GTGA	2	8	221909	221916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_009456	CGC	2	6	222123	222128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672533
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4269	NC_009456	TGC	2	6	222288	222293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672533
4270	NC_009456	GGCGCT	2	12	222313	222324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	147672533
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4272	NC_009456	TGC	2	6	222366	222371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672533
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4278	NC_009456	ATC	2	6	222539	222544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672533
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4280	NC_009456	GGCTA	2	10	222624	222633	20 %	20 %	40 %	20 %	147672533
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4282	NC_009456	A	6	6	222672	222677	100 %	0 %	0 %	0 %	147672533
4283	NC_009456	GCG	2	6	222686	222691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672533
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4286	NC_009456	CGC	2	6	222768	222773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4287	NC_009456	CAA	2	6	222801	222806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4288	NC_009456	AGGTA	2	10	222811	222820	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4289	NC_009456	ATT	2	6	222842	222847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672390
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4294	NC_009456	CAT	2	6	223132	223137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672390
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4301	NC_009456	GCA	2	6	223583	223588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672061
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4309	NC_009456	GTCA	2	8	224174	224181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4310	NC_009456	CAC	2	6	224312	224317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672194
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4317	NC_009456	TGCG	2	8	225102	225109	0 %	25 %	50 %	25 %	147672194
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4321	NC_009456	TGG	2	6	225255	225260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4322	NC_009456	TGG	2	6	225270	225275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4323	NC_009456	CTG	2	6	225312	225317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672234
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4332	NC_009456	GC	3	6	225926	225931	0 %	0 %	50 %	50 %	147672234
4333	NC_009456	A	6	6	225978	225983	100 %	0 %	0 %	0 %	147672234
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4341	NC_009456	GGT	2	6	226429	226434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671432
4342	NC_009456	TCG	2	6	226452	226457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671432
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4344	NC_009456	T	7	7	226492	226498	0 %	100 %	0 %	0 %	147671432
4345	NC_009456	CAT	2	6	226561	226566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671432
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4347	NC_009456	GAA	2	6	226793	226798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671432
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4349	NC_009456	TGT	2	6	226874	226879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671432
4350	NC_009456	T	6	6	226938	226943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4351	NC_009456	AG	3	6	226981	226986	50 %	0 %	50 %	0 %	147671712
4352	NC_009456	TGT	2	6	226995	227000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671712
4353	NC_009456	CGG	2	6	227014	227019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671712
4354	NC_009456	CTT	2	6	227056	227061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671712
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4356	NC_009456	GAC	2	6	227227	227232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671712
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4359	NC_009456	CGC	2	6	227344	227349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671712
4360	NC_009456	CA	3	6	227447	227452	50 %	0 %	0 %	50 %	147671712
4361	NC_009456	CTG	2	6	227549	227554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671712
4362	NC_009456	TCG	2	6	227604	227609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671712
4363	NC_009456	GCT	2	6	227613	227618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671712
4364	NC_009456	TTG	3	9	227678	227686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671712
4365	NC_009456	CTG	2	6	227714	227719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671712
4366	NC_009456	GAT	2	6	227759	227764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671712
4367	NC_009456	AGCG	2	8	227794	227801	25 %	0 %	50 %	25 %	147671712
4368	NC_009456	CCG	2	6	227854	227859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671712
4369	NC_009456	CGG	2	6	227917	227922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671712
4370	NC_009456	ACTTTG	2	12	227964	227975	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	147671712
4371	NC_009456	TTG	2	6	227981	227986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671712
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4373	NC_009456	TC	3	6	228145	228150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4497	NC_009456	TGA	2	6	234069	234074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672361
4498	NC_009456	CAGC	2	8	234090	234097	25 %	0 %	25 %	50 %	147672361
4499	NC_009456	CAAGC	2	10	234160	234169	40 %	0 %	20 %	40 %	147672361
4500	NC_009456	AGA	2	6	234241	234246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672361

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