MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009456	CTT	2	6	24188	24193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672171
502	NC_009456	GGTA	2	8	24202	24209	25 %	25 %	50 %	0 %	147672171
503	NC_009456	CAG	2	6	24231	24236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672171
504	NC_009456	AAAG	2	8	24246	24253	75 %	0 %	25 %	0 %	147672171
505	NC_009456	TCA	2	6	24277	24282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672171
506	NC_009456	GAA	2	6	24342	24347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672171
507	NC_009456	AGA	2	6	24416	24421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672171
508	NC_009456	TCA	2	6	24454	24459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672171
509	NC_009456	ACC	2	6	24466	24471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672171
510	NC_009456	GT	3	6	24562	24567	0 %	50 %	50 %	0 %	147672171
511	NC_009456	TGG	2	6	24593	24598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672171
512	NC_009456	ACC	2	6	24612	24617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672171
513	NC_009456	GCT	2	6	24623	24628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672171
514	NC_009456	CAG	2	6	24678	24683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672171
515	NC_009456	GAC	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672171
516	NC_009456	CAC	2	6	24969	24974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672171
517	NC_009456	TCTTGC	2	12	24991	25002	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	147672171
518	NC_009456	TCAGC	2	10	25019	25028	20 %	20 %	20 %	40 %	147672171
519	NC_009456	GAT	2	6	25038	25043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672171
520	NC_009456	CCA	2	6	25049	25054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672171
521	NC_009456	T	6	6	25058	25063	0 %	100 %	0 %	0 %	147672171
522	NC_009456	GCT	2	6	25064	25069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672171
523	NC_009456	GAC	2	6	25313	25318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672171
524	NC_009456	CAT	2	6	25361	25366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672171
525	NC_009456	TG	3	6	25382	25387	0 %	50 %	50 %	0 %	147672171
526	NC_009456	GATC	2	8	25433	25440	25 %	25 %	25 %	25 %	147672171
527	NC_009456	CGT	2	6	25521	25526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672171
528	NC_009456	CGC	2	6	25527	25532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672171
529	NC_009456	CAC	2	6	25547	25552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672171
530	NC_009456	CTT	2	6	25595	25600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672171
531	NC_009456	ATCA	2	8	25674	25681	50 %	25 %	0 %	25 %	147672171
532	NC_009456	TGGG	2	8	25774	25781	0 %	25 %	75 %	0 %	147672171
533	NC_009456	GCCA	2	8	25788	25795	25 %	0 %	25 %	50 %	147672171
534	NC_009456	CACC	2	8	25847	25854	25 %	0 %	0 %	75 %	147672171
535	NC_009456	GTT	2	6	25863	25868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672171
536	NC_009456	GCG	2	6	25872	25877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672171
537	NC_009456	CCA	2	6	25892	25897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672171
538	NC_009456	CAGGA	2	10	25923	25932	40 %	0 %	40 %	20 %	147672171
539	NC_009456	GTG	2	6	25985	25990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672171
540	NC_009456	GCG	2	6	25996	26001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672171
541	NC_009456	ATC	2	6	26068	26073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672171
542	NC_009456	T	6	6	26082	26087	0 %	100 %	0 %	0 %	147672171
543	NC_009456	CAAA	2	8	26111	26118	75 %	0 %	0 %	25 %	147672171
544	NC_009456	AGC	2	6	26218	26223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672171
545	NC_009456	CTT	2	6	26228	26233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672171
546	NC_009456	CAG	2	6	26247	26252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672171
547	NC_009456	GCTT	2	8	26341	26348	0 %	50 %	25 %	25 %	147672171
548	NC_009456	AG	3	6	26367	26372	50 %	0 %	50 %	0 %	147672171
549	NC_009456	ATA	2	6	26397	26402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672171
550	NC_009456	AG	4	8	26438	26445	50 %	0 %	50 %	0 %	147672171
551	NC_009456	ACC	2	6	26525	26530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_009456	TTGA	2	8	26563	26570	25 %	50 %	25 %	0 %	147671772
553	NC_009456	TCTG	2	8	26667	26674	0 %	50 %	25 %	25 %	147671772
554	NC_009456	CGCA	2	8	26689	26696	25 %	0 %	25 %	50 %	147671772
555	NC_009456	TCGG	2	8	26705	26712	0 %	25 %	50 %	25 %	147671772
556	NC_009456	GCTC	2	8	26730	26737	0 %	25 %	25 %	50 %	147671772
557	NC_009456	GCT	2	6	26746	26751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671772
558	NC_009456	CAG	2	6	26752	26757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671772
559	NC_009456	GGC	2	6	26766	26771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671772
560	NC_009456	ATAA	2	8	26848	26855	75 %	25 %	0 %	0 %	147671772
561	NC_009456	TGT	2	6	27135	27140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671772
562	NC_009456	ATCA	2	8	27196	27203	50 %	25 %	0 %	25 %	147671772
563	NC_009456	AGT	2	6	27237	27242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671772
564	NC_009456	T	6	6	27258	27263	0 %	100 %	0 %	0 %	147671772
565	NC_009456	TCG	2	6	27269	27274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671772
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567	NC_009456	T	6	6	27301	27306	0 %	100 %	0 %	0 %	147671772
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572	NC_009456	GAC	2	6	27812	27817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671947
573	NC_009456	CAC	2	6	27842	27847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671947
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580	NC_009456	CAC	2	6	28115	28120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671947
581	NC_009456	TCG	2	6	28228	28233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671947
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583	NC_009456	GAT	2	6	28411	28416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671947
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585	NC_009456	GGT	2	6	28436	28441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671947
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587	NC_009456	CTG	2	6	28586	28591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671947
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594	NC_009456	GTA	2	6	29248	29253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671976
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599	NC_009456	ACG	2	6	29465	29470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671976
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602	NC_009456	CA	3	6	29617	29622	50 %	0 %	0 %	50 %	147671976
603	NC_009456	TCA	2	6	29681	29686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671976
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610	NC_009456	TTGG	2	8	30176	30183	0 %	50 %	50 %	0 %	147671976
611	NC_009456	TTC	2	6	30277	30282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671976
612	NC_009456	CACT	2	8	30330	30337	25 %	25 %	0 %	50 %	147671976
613	NC_009456	TGC	2	6	30405	30410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671976
614	NC_009456	CAT	2	6	30445	30450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671976
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621	NC_009456	AAT	2	6	31047	31052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671686
622	NC_009456	CCA	2	6	31163	31168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671686
623	NC_009456	ACGT	2	8	31215	31222	25 %	25 %	25 %	25 %	147671686
624	NC_009456	AATC	2	8	31260	31267	50 %	25 %	0 %	25 %	147671686
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629	NC_009456	ATC	2	6	31401	31406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671686
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