MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005128	AAAC	2	8	81	88	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005128	GATT	2	8	227	234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005128	CATT	2	8	1315	1322	25 %	50 %	0 %	25 %	37595822
4	NC_005128	AAAG	2	8	1444	1451	75 %	0 %	25 %	0 %	37595822
5	NC_005128	ATGT	2	8	1546	1553	25 %	50 %	25 %	0 %	37595822
6	NC_005128	ACCA	2	8	1699	1706	50 %	0 %	0 %	50 %	37595823
7	NC_005128	CTCA	2	8	1780	1787	25 %	25 %	0 %	50 %	37595823
8	NC_005128	ATTT	2	8	1867	1874	25 %	75 %	0 %	0 %	37595824
9	NC_005128	ATCA	2	8	2153	2160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005128	CAGC	2	8	2259	2266	25 %	0 %	25 %	50 %	37595825
11	NC_005128	AAGC	2	8	2295	2302	50 %	0 %	25 %	25 %	37595825
12	NC_005128	CTTT	2	8	2740	2747	0 %	75 %	0 %	25 %	37595826
13	NC_005128	CACT	2	8	3832	3839	25 %	25 %	0 %	50 %	37595828
14	NC_005128	ATCA	2	8	4435	4442	50 %	25 %	0 %	25 %	37595829
15	NC_005128	GCTC	2	8	4472	4479	0 %	25 %	25 %	50 %	37595829
16	NC_005128	TCAA	2	8	4982	4989	50 %	25 %	0 %	25 %	37595829
17	NC_005128	ACGA	2	8	5082	5089	50 %	0 %	25 %	25 %	37595829
18	NC_005128	CTTA	2	8	5698	5705	25 %	50 %	0 %	25 %	37595830
19	NC_005128	CCAG	2	8	5854	5861	25 %	0 %	25 %	50 %	37595830
20	NC_005128	TCAG	2	8	6385	6392	25 %	25 %	25 %	25 %	37595831
21	NC_005128	ACCA	2	8	6783	6790	50 %	0 %	0 %	50 %	37595831
22	NC_005128	ACGC	2	8	7602	7609	25 %	0 %	25 %	50 %	37595831
23	NC_005128	TTGA	2	8	7860	7867	25 %	50 %	25 %	0 %	37595831
24	NC_005128	ATCA	2	8	8064	8071	50 %	25 %	0 %	25 %	37595831
25	NC_005128	ACAA	2	8	8530	8537	75 %	0 %	0 %	25 %	37595831
26	NC_005128	CGAG	2	8	8811	8818	25 %	0 %	50 %	25 %	37595832
27	NC_005128	GCCA	2	8	9088	9095	25 %	0 %	25 %	50 %	37595832
28	NC_005128	TCAC	2	8	9218	9225	25 %	25 %	0 %	50 %	37595832
29	NC_005128	CCAC	2	8	9366	9373	25 %	0 %	0 %	75 %	37595833
30	NC_005128	GTGG	2	8	9666	9673	0 %	25 %	75 %	0 %	37595833
31	NC_005128	CCGT	2	8	11896	11903	0 %	25 %	25 %	50 %	37595836
32	NC_005128	CTCA	2	8	12201	12208	25 %	25 %	0 %	50 %	37595836
33	NC_005128	CTCA	2	8	12381	12388	25 %	25 %	0 %	50 %	37595836
34	NC_005128	ATCC	2	8	13148	13155	25 %	25 %	0 %	50 %	37595837
35	NC_005128	CCAT	2	8	13344	13351	25 %	25 %	0 %	50 %	37595837
36	NC_005128	CCGA	2	8	13484	13491	25 %	0 %	25 %	50 %	37595837
37	NC_005128	CCAT	2	8	13625	13632	25 %	25 %	0 %	50 %	37595837
38	NC_005128	GCCC	2	8	14175	14182	0 %	0 %	25 %	75 %	37595839
39	NC_005128	CACT	2	8	14313	14320	25 %	25 %	0 %	50 %	37595840
40	NC_005128	TTGT	2	8	14514	14521	0 %	75 %	25 %	0 %	37595840
41	NC_005128	CAAA	2	8	14720	14727	75 %	0 %	0 %	25 %	37595840
42	NC_005128	CGAC	2	8	15316	15323	25 %	0 %	25 %	50 %	37595840
43	NC_005128	GCCA	2	8	15492	15499	25 %	0 %	25 %	50 %	37595840
44	NC_005128	TTAC	2	8	15812	15819	25 %	50 %	0 %	25 %	37595841
45	NC_005128	ATGG	2	8	15896	15903	25 %	25 %	50 %	0 %	37595841
46	NC_005128	ACTT	2	8	16026	16033	25 %	50 %	0 %	25 %	37595841
47	NC_005128	CAAA	2	8	16301	16308	75 %	0 %	0 %	25 %	37595841
48	NC_005128	CGAA	2	8	16411	16418	50 %	0 %	25 %	25 %	37595841
49	NC_005128	CCCA	2	8	16599	16606	25 %	0 %	0 %	75 %	37595841
50	NC_005128	AGCG	2	8	17090	17097	25 %	0 %	50 %	25 %	37595841
51	NC_005128	GTAA	2	8	17448	17455	50 %	25 %	25 %	0 %	37595841
52	NC_005128	ACCA	2	8	18049	18056	50 %	0 %	0 %	50 %	37595841
53	NC_005128	GAAT	2	8	18236	18243	50 %	25 %	25 %	0 %	37595841
54	NC_005128	CTCA	2	8	18679	18686	25 %	25 %	0 %	50 %	37595842
55	NC_005128	TGGC	2	8	19052	19059	0 %	25 %	50 %	25 %	37595842
56	NC_005128	TTTA	2	8	19440	19447	25 %	75 %	0 %	0 %	37595844
57	NC_005128	CAAC	2	8	19657	19664	50 %	0 %	0 %	50 %	37595845
58	NC_005128	ACTC	2	8	19936	19943	25 %	25 %	0 %	50 %	37595845
59	NC_005128	GGAC	2	8	20563	20570	25 %	0 %	50 %	25 %	37595845
60	NC_005128	TGGC	2	8	20714	20721	0 %	25 %	50 %	25 %	37595845
61	NC_005128	CTGG	2	8	21882	21889	0 %	25 %	50 %	25 %	37595847
62	NC_005128	CAAA	2	8	22292	22299	75 %	0 %	0 %	25 %	37595847
63	NC_005128	CTCG	2	8	22694	22701	0 %	25 %	25 %	50 %	37595847
64	NC_005128	GCCA	2	8	24126	24133	25 %	0 %	25 %	50 %	37595847
65	NC_005128	GTCA	2	8	24375	24382	25 %	25 %	25 %	25 %	37595847
66	NC_005128	TTCT	2	8	25041	25048	0 %	75 %	0 %	25 %	37595847
67	NC_005128	CAGT	2	8	25109	25116	25 %	25 %	25 %	25 %	37595847
68	NC_005128	AGAC	2	8	25379	25386	50 %	0 %	25 %	25 %	37595847
69	NC_005128	CGAG	2	8	25948	25955	25 %	0 %	50 %	25 %	37595847
70	NC_005128	AAAG	2	8	26160	26167	75 %	0 %	25 %	0 %	37595847
71	NC_005128	CTCA	2	8	26489	26496	25 %	25 %	0 %	50 %	37595847
72	NC_005128	ATGA	2	8	26541	26548	50 %	25 %	25 %	0 %	37595847
73	NC_005128	AGCC	2	8	26679	26686	25 %	0 %	25 %	50 %	37595847
74	NC_005128	TAAC	2	8	26812	26819	50 %	25 %	0 %	25 %	37595847
75	NC_005128	AGAA	2	8	27421	27428	75 %	0 %	25 %	0 %	37595847
76	NC_005128	AATT	2	8	27881	27888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005128	ATTC	2	8	28032	28039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_005128	TTAG	2	8	28077	28084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005128	TTGA	2	8	29373	29380	25 %	50 %	25 %	0 %	37595851
80	NC_005128	GATA	2	8	29923	29930	50 %	25 %	25 %	0 %	37595851
81	NC_005128	GCTC	2	8	30665	30672	0 %	25 %	25 %	50 %	37595852
82	NC_005128	CTTT	2	8	30886	30893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_005128	TGTT	2	8	31015	31022	0 %	75 %	25 %	0 %	37595853
84	NC_005128	AGTG	2	8	31721	31728	25 %	25 %	50 %	0 %	37595856
85	NC_005128	CAAT	2	8	31795	31802	50 %	25 %	0 %	25 %	37595856
86	NC_005128	CCTC	2	8	32519	32526	0 %	25 %	0 %	75 %	37595860
87	NC_005128	CTTT	2	8	32547	32554	0 %	75 %	0 %	25 %	37595860
88	NC_005128	GCTC	2	8	33588	33595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005128	CGAT	2	8	33814	33821	25 %	25 %	25 %	25 %	37595862
90	NC_005128	CATT	2	8	34050	34057	25 %	50 %	0 %	25 %	37595862
91	NC_005128	AAAT	2	8	34846	34853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005128	GTAA	2	8	34914	34921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005128	AGGT	2	8	35200	35207	25 %	25 %	50 %	0 %	37595864
94	NC_005128	TTGA	2	8	35218	35225	25 %	50 %	25 %	0 %	37595864
95	NC_005128	AACA	2	8	35680	35687	75 %	0 %	0 %	25 %	37595865
96	NC_005128	CGTT	2	8	35916	35923	0 %	50 %	25 %	25 %	37595867
97	NC_005128	GTAA	2	8	36163	36170	50 %	25 %	25 %	0 %	37595867
98	NC_005128	ACCA	2	8	36568	36575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_005128	GCAA	2	8	37085	37092	50 %	0 %	25 %	25 %	37595868
100	NC_005128	GAAG	2	8	37338	37345	50 %	0 %	50 %	0 %	37595870
101	NC_005128	ATCT	2	8	37420	37427	25 %	50 %	0 %	25 %	37595870
102	NC_005128	CCTT	2	8	37873	37880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_005128	TGAA	2	8	38135	38142	50 %	25 %	25 %	0 %	37595872
104	NC_005128	CTGT	2	8	38361	38368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_005128	CAAA	2	8	38419	38426	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_005128	ACCA	2	8	38771	38778	50 %	0 %	0 %	50 %	37595873
107	NC_005128	CAAG	2	8	38933	38940	50 %	0 %	25 %	25 %	37595874
108	NC_005128	GCTT	2	8	39328	39335	0 %	50 %	25 %	25 %	37595875
109	NC_005128	TAAT	2	8	40367	40374	50 %	50 %	0 %	0 %	37595878
110	NC_005128	AGAT	2	8	40454	40461	50 %	25 %	25 %	0 %	37595878
111	NC_005128	AGTA	2	8	40597	40604	50 %	25 %	25 %	0 %	37595878
112	NC_005128	ATGA	2	8	41024	41031	50 %	25 %	25 %	0 %	37595879
113	NC_005128	GAAA	2	8	41491	41498	75 %	0 %	25 %	0 %	37595879
114	NC_005128	GATA	2	8	42403	42410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005128	CCCA	2	8	42434	42441	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_005128	GTAA	2	8	42614	42621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005128	CAGC	2	8	43453	43460	25 %	0 %	25 %	50 %	37595881
118	NC_005128	TTAT	2	8	43513	43520	25 %	75 %	0 %	0 %	37595881
119	NC_005128	AAGA	2	8	43600	43607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005128	TTCT	2	8	43626	43633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_005128	TTGA	2	8	44557	44564	25 %	50 %	25 %	0 %	37595884
122	NC_005128	ACTA	2	8	45036	45043	50 %	25 %	0 %	25 %	37595885
123	NC_005128	AAAT	2	8	45589	45596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005128	ATCG	2	8	46221	46228	25 %	25 %	25 %	25 %	37595887
125	NC_005128	AAAG	2	8	46632	46639	75 %	0 %	25 %	0 %	37595888
126	NC_005128	CAGC	2	8	46648	46655	25 %	0 %	25 %	50 %	37595888
127	NC_005128	GCTG	2	8	46692	46699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_005128	ATTT	2	8	46743	46750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005128	TCGG	2	8	47470	47477	0 %	25 %	50 %	25 %	37595889
130	NC_005128	TATT	2	8	48283	48290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005128	TCCA	2	8	48330	48337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005128	AGCA	2	8	48469	48476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.