MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 36097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004605	GAT	2	6	24828	24833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899883
502	NC_004605	GCC	2	6	24900	24905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899883
503	NC_004605	TTG	2	6	25161	25166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004605	GGAA	2	8	25291	25298	50 %	0 %	50 %	0 %	28899884
505	NC_004605	TAAG	2	8	25330	25337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004605	GGC	2	6	25470	25475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899885
507	NC_004605	TGAA	2	8	25584	25591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004605	GGA	2	6	25617	25622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004605	AAT	2	6	25633	25638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004605	CTT	2	6	25684	25689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899886
511	NC_004605	TTA	2	6	25722	25727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899886
512	NC_004605	AAG	2	6	25748	25753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899886
513	NC_004605	CAT	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899886
514	NC_004605	GGTT	2	8	25885	25892	0 %	50 %	50 %	0 %	28899886
515	NC_004605	TGA	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899886
516	NC_004605	AGG	2	6	25921	25926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28899886
517	NC_004605	TCT	2	6	25941	25946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899886
518	NC_004605	ATC	2	6	25967	25972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899886
519	NC_004605	GCG	2	6	26000	26005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899886
520	NC_004605	TGG	2	6	26059	26064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899886
521	NC_004605	CACGG	2	10	26066	26075	20 %	0 %	40 %	40 %	28899886
522	NC_004605	GCG	2	6	26078	26083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899886
523	NC_004605	ATC	2	6	26162	26167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899886
524	NC_004605	GTG	2	6	26238	26243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899886
525	NC_004605	GAA	2	6	26300	26305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899886
526	NC_004605	CTT	3	9	26341	26349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899886
527	NC_004605	TG	3	6	26357	26362	0 %	50 %	50 %	0 %	28899886
528	NC_004605	TGA	2	6	26415	26420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899886
529	NC_004605	ATT	2	6	26456	26461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899886
530	NC_004605	CTT	2	6	26467	26472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899886
531	NC_004605	GCA	2	6	26676	26681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899886
532	NC_004605	GCG	2	6	26690	26695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899886
533	NC_004605	GGT	2	6	26705	26710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899886
534	NC_004605	TGGTTT	2	12	26716	26727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899886
535	NC_004605	TGA	2	6	26748	26753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899886
536	NC_004605	TGG	2	6	26802	26807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899886
537	NC_004605	TTG	2	6	26814	26819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899886
538	NC_004605	ATC	2	6	26849	26854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899886
539	NC_004605	TTTC	2	8	26868	26875	0 %	75 %	0 %	25 %	28899886
540	NC_004605	TAAAAA	2	12	26912	26923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004605	T	7	7	26948	26954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004605	GTT	2	6	26978	26983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899887
543	NC_004605	GAT	2	6	27100	27105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899887
544	NC_004605	CTG	2	6	27129	27134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899887
545	NC_004605	AGA	2	6	27135	27140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899887
546	NC_004605	GTA	2	6	27154	27159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899887
547	NC_004605	GCA	2	6	27267	27272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899887
548	NC_004605	GCA	3	9	27318	27326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899887
549	NC_004605	GTT	2	6	27363	27368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899887
550	NC_004605	GGTC	2	8	27369	27376	0 %	25 %	50 %	25 %	28899887
551	NC_004605	GCC	2	6	27407	27412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899887
552	NC_004605	AC	3	6	27427	27432	50 %	0 %	0 %	50 %	28899887
553	NC_004605	CAA	2	6	27445	27450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899887
554	NC_004605	TGC	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899887
555	NC_004605	CCA	2	6	27593	27598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899887
556	NC_004605	TCAC	2	8	27641	27648	25 %	25 %	0 %	50 %	28899887
557	NC_004605	TGT	2	6	27678	27683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899887
558	NC_004605	GTG	2	6	27692	27697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899887
559	NC_004605	TCA	2	6	27702	27707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899887
560	NC_004605	TAA	2	6	27711	27716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28899887
561	NC_004605	CGA	2	6	27798	27803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899887
562	NC_004605	CAT	2	6	27811	27816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899887
563	NC_004605	CCT	2	6	27821	27826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28899888
564	NC_004605	AG	3	6	27945	27950	50 %	0 %	50 %	0 %	28899888
565	NC_004605	AGT	2	6	28004	28009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899888
566	NC_004605	GCA	2	6	28037	28042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899888
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570	NC_004605	GA	3	6	28385	28390	50 %	0 %	50 %	0 %	28899888
571	NC_004605	CAT	2	6	28461	28466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899888
572	NC_004605	TAA	2	6	28526	28531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28899888
573	NC_004605	CAT	2	6	28601	28606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899888
574	NC_004605	TTG	2	6	28620	28625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899888
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578	NC_004605	T	6	6	28841	28846	0 %	100 %	0 %	0 %	28899889
579	NC_004605	CCA	2	6	28849	28854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899889
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586	NC_004605	AGAA	2	8	29099	29106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_004605	T	6	6	29193	29198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_004605	TC	3	6	29421	29426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_004605	A	6	6	29459	29464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_004605	A	7	7	29571	29577	100 %	0 %	0 %	0 %	28899890
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597	NC_004605	GTTA	2	8	29607	29614	25 %	50 %	25 %	0 %	28899890
598	NC_004605	T	6	6	29698	29703	0 %	100 %	0 %	0 %	28899890
599	NC_004605	GGT	2	6	29746	29751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899890
600	NC_004605	GT	3	6	29813	29818	0 %	50 %	50 %	0 %	28899890
601	NC_004605	TGG	2	6	29883	29888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899890
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609	NC_004605	TG	4	8	30170	30177	0 %	50 %	50 %	0 %	28899890
610	NC_004605	AGC	2	6	30208	30213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899890
611	NC_004605	TGA	2	6	30230	30235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899890
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613	NC_004605	TGGTG	2	10	30264	30273	0 %	40 %	60 %	0 %	28899890
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622	NC_004605	AAT	2	6	30695	30700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28899890
623	NC_004605	AAAGCC	2	12	30739	30750	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_004605	T	6	6	30768	30773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004605	CAG	3	9	30856	30864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_004605	CA	3	6	30872	30877	50 %	0 %	0 %	50 %	28899891
627	NC_004605	A	6	6	30884	30889	100 %	0 %	0 %	0 %	28899891
628	NC_004605	GCT	2	6	30933	30938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899891
629	NC_004605	CGG	2	6	31017	31022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899891
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631	NC_004605	CA	3	6	31119	31124	50 %	0 %	0 %	50 %	28899891
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