MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 8658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	ATCA	2	8	440	447	50 %	25 %	0 %	25 %	28896775
2	NC_004603	GTGG	2	8	641	648	0 %	25 %	75 %	0 %	28896775
3	NC_004603	GGTT	2	8	696	703	0 %	50 %	50 %	0 %	28896775
4	NC_004603	GTCG	2	8	1348	1355	0 %	25 %	50 %	25 %	28896776
5	NC_004603	ATCA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	0 %	25 %	28896776
6	NC_004603	TTGG	2	8	2182	2189	0 %	50 %	50 %	0 %	28896776
7	NC_004603	ATTA	2	8	2311	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004603	ACCA	2	8	2465	2472	50 %	0 %	0 %	50 %	28896777
9	NC_004603	AGCA	2	8	2986	2993	50 %	0 %	25 %	25 %	28896777
10	NC_004603	GTGA	2	8	2994	3001	25 %	25 %	50 %	0 %	28896777
11	NC_004603	AGCC	2	8	3023	3030	25 %	0 %	25 %	50 %	28896777
12	NC_004603	TACG	2	8	3153	3160	25 %	25 %	25 %	25 %	28896777
13	NC_004603	TCGA	2	8	3779	3786	25 %	25 %	25 %	25 %	28896777
14	NC_004603	TTGA	2	8	3894	3901	25 %	50 %	25 %	0 %	28896777
15	NC_004603	AAGA	2	8	3959	3966	75 %	0 %	25 %	0 %	28896777
16	NC_004603	GTTA	2	8	4013	4020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004603	TTCA	2	8	4065	4072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_004603	TTTG	2	8	4346	4353	0 %	75 %	25 %	0 %	28896778
19	NC_004603	CGAC	2	8	4410	4417	25 %	0 %	25 %	50 %	28896778
20	NC_004603	CCGG	2	8	4918	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004603	CACG	2	8	5394	5401	25 %	0 %	25 %	50 %	28896780
22	NC_004603	AAAC	2	8	5466	5473	75 %	0 %	0 %	25 %	28896780
23	NC_004603	GTAC	2	8	5723	5730	25 %	25 %	25 %	25 %	28896781
24	NC_004603	CCGA	2	8	6004	6011	25 %	0 %	25 %	50 %	28896781
25	NC_004603	CAAA	2	8	7029	7036	75 %	0 %	0 %	25 %	28896782
26	NC_004603	GTTA	2	8	7289	7296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004603	TAAA	2	8	7304	7311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004603	GAAA	2	8	7440	7447	75 %	0 %	25 %	0 %	28896783
29	NC_004603	ATCA	2	8	8058	8065	50 %	25 %	0 %	25 %	28896785
30	NC_004603	TTGG	2	8	8539	8546	0 %	50 %	50 %	0 %	28896785
31	NC_004603	TTCG	2	8	8754	8761	0 %	50 %	25 %	25 %	28896785
32	NC_004603	CTAA	2	8	8931	8938	50 %	25 %	0 %	25 %	28896785
33	NC_004603	TGCA	2	8	8995	9002	25 %	25 %	25 %	25 %	28896785
34	NC_004603	GTTC	2	8	9444	9451	0 %	50 %	25 %	25 %	28896786
35	NC_004603	ACGT	2	8	9598	9605	25 %	25 %	25 %	25 %	28896786
36	NC_004603	CGAC	2	8	9661	9668	25 %	0 %	25 %	50 %	28896786
37	NC_004603	GATG	2	8	9767	9774	25 %	25 %	50 %	0 %	28896786
38	NC_004603	CGTG	2	8	9815	9822	0 %	25 %	50 %	25 %	28896786
39	NC_004603	TTCT	2	8	9964	9971	0 %	75 %	0 %	25 %	28896786
40	NC_004603	ATTG	2	8	10190	10197	25 %	50 %	25 %	0 %	28896786
41	NC_004603	ATTT	2	8	10386	10393	25 %	75 %	0 %	0 %	28896787
42	NC_004603	TGTT	2	8	10462	10469	0 %	75 %	25 %	0 %	28896787
43	NC_004603	CCAT	2	8	11750	11757	25 %	25 %	0 %	50 %	28896788
44	NC_004603	CAAG	2	8	11985	11992	50 %	0 %	25 %	25 %	28896788
45	NC_004603	CGTT	2	8	12023	12030	0 %	50 %	25 %	25 %	28896788
46	NC_004603	GCCT	2	8	13334	13341	0 %	25 %	25 %	50 %	28896788
47	NC_004603	TGGT	2	8	13528	13535	0 %	50 %	50 %	0 %	28896788
48	NC_004603	ATCA	2	8	14192	14199	50 %	25 %	0 %	25 %	28896790
49	NC_004603	TCAT	2	8	14474	14481	25 %	50 %	0 %	25 %	28896790
50	NC_004603	GAAA	2	8	14589	14596	75 %	0 %	25 %	0 %	28896791
51	NC_004603	TTAA	2	8	15053	15060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004603	CAAT	2	8	15750	15757	50 %	25 %	0 %	25 %	28896793
53	NC_004603	GTCA	2	8	16255	16262	25 %	25 %	25 %	25 %	28896793
54	NC_004603	CAAA	2	8	16497	16504	75 %	0 %	0 %	25 %	28896793
55	NC_004603	GCGT	2	8	16761	16768	0 %	25 %	50 %	25 %	28896793
56	NC_004603	GGTA	2	8	17907	17914	25 %	25 %	50 %	0 %	28896794
57	NC_004603	GTCA	2	8	18530	18537	25 %	25 %	25 %	25 %	28896794
58	NC_004603	AGGT	2	8	18837	18844	25 %	25 %	50 %	0 %	28896794
59	NC_004603	GTTT	2	8	18960	18967	0 %	75 %	25 %	0 %	28896794
60	NC_004603	TAGG	2	8	21008	21015	25 %	25 %	50 %	0 %	28896795
61	NC_004603	TTCT	2	8	21457	21464	0 %	75 %	0 %	25 %	28896796
62	NC_004603	TGCG	2	8	21579	21586	0 %	25 %	50 %	25 %	28896796
63	NC_004603	GCAG	2	8	21632	21639	25 %	0 %	50 %	25 %	28896796
64	NC_004603	AAGT	2	8	21923	21930	50 %	25 %	25 %	0 %	28896796
65	NC_004603	GTTC	2	8	22691	22698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004603	CTAT	2	8	23029	23036	25 %	50 %	0 %	25 %	28896797
67	NC_004603	CATT	2	8	23145	23152	25 %	50 %	0 %	25 %	28896797
68	NC_004603	TTAT	2	8	23649	23656	25 %	75 %	0 %	0 %	28896798
69	NC_004603	ACTG	2	8	23694	23701	25 %	25 %	25 %	25 %	28896798
70	NC_004603	TACG	2	8	23801	23808	25 %	25 %	25 %	25 %	28896798
71	NC_004603	AAAC	2	8	23867	23874	75 %	0 %	0 %	25 %	28896798
72	NC_004603	TAAC	2	8	24175	24182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_004603	CGTT	2	8	24199	24206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_004603	AGAC	2	8	24308	24315	50 %	0 %	25 %	25 %	28896800
75	NC_004603	TCAA	2	8	24488	24495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_004603	TTGA	2	8	25269	25276	25 %	50 %	25 %	0 %	28896801
77	NC_004603	AACC	2	8	26321	26328	50 %	0 %	0 %	50 %	28896802
78	NC_004603	CCAG	2	8	26387	26394	25 %	0 %	25 %	50 %	28896802
79	NC_004603	AGCA	2	8	27828	27835	50 %	0 %	25 %	25 %	28896803
80	NC_004603	TAGA	2	8	28084	28091	50 %	25 %	25 %	0 %	28896804
81	NC_004603	ATCA	2	8	28137	28144	50 %	25 %	0 %	25 %	28896804
82	NC_004603	CAAG	2	8	28628	28635	50 %	0 %	25 %	25 %	28896804
83	NC_004603	GCCA	2	8	28652	28659	25 %	0 %	25 %	50 %	28896804
84	NC_004603	TGCT	2	8	29321	29328	0 %	50 %	25 %	25 %	28896804
85	NC_004603	ACCA	2	8	29382	29389	50 %	0 %	0 %	50 %	28896804
86	NC_004603	AGTT	2	8	30371	30378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004603	ATGA	2	8	30512	30519	50 %	25 %	25 %	0 %	28896805
88	NC_004603	TACC	2	8	30586	30593	25 %	25 %	0 %	50 %	28896805
89	NC_004603	TCAA	2	8	31171	31178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_004603	TGAC	2	8	31474	31481	25 %	25 %	25 %	25 %	28896806
91	NC_004603	CTTA	2	8	32600	32607	25 %	50 %	0 %	25 %	28896806
92	NC_004603	CTCA	2	8	32865	32872	25 %	25 %	0 %	50 %	28896807
93	NC_004603	GAAG	2	8	32949	32956	50 %	0 %	50 %	0 %	28896807
94	NC_004603	GGTT	2	8	33045	33052	0 %	50 %	50 %	0 %	28896807
95	NC_004603	GAAA	2	8	33311	33318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004603	GTAG	2	8	35076	35083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004603	TGAC	2	8	36277	36284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004603	GTAC	2	8	36360	36367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004603	AGTA	2	8	36763	36770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004603	CGTC	2	8	36800	36807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_004603	AAAG	2	8	36922	36929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004603	ACCC	2	8	39234	39241	25 %	0 %	0 %	75 %	28896808
103	NC_004603	GACA	2	8	39447	39454	50 %	0 %	25 %	25 %	28896808
104	NC_004603	TTTG	2	8	39486	39493	0 %	75 %	25 %	0 %	28896808
105	NC_004603	AACA	2	8	39804	39811	75 %	0 %	0 %	25 %	28896808
106	NC_004603	ATGA	2	8	39918	39925	50 %	25 %	25 %	0 %	28896808
107	NC_004603	CGAT	2	8	40305	40312	25 %	25 %	25 %	25 %	28896809
108	NC_004603	TCAC	2	8	40902	40909	25 %	25 %	0 %	50 %	28896809
109	NC_004603	TCTA	2	8	40921	40928	25 %	50 %	0 %	25 %	28896809
110	NC_004603	CAGA	2	8	41619	41626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_004603	TTAT	2	8	41762	41769	25 %	75 %	0 %	0 %	28896810
112	NC_004603	AGCT	2	8	41771	41778	25 %	25 %	25 %	25 %	28896810
113	NC_004603	GACC	2	8	42534	42541	25 %	0 %	25 %	50 %	28896812
114	NC_004603	GACC	2	8	42552	42559	25 %	0 %	25 %	50 %	28896812
115	NC_004603	GGCA	2	8	42784	42791	25 %	0 %	50 %	25 %	28896812
116	NC_004603	TCCA	2	8	42958	42965	25 %	25 %	0 %	50 %	28896812
117	NC_004603	GAAC	2	8	42968	42975	50 %	0 %	25 %	25 %	28896812
118	NC_004603	TGGC	2	8	43406	43413	0 %	25 %	50 %	25 %	28896812
119	NC_004603	CTTG	2	8	43777	43784	0 %	50 %	25 %	25 %	28896812
120	NC_004603	CAAT	2	8	44157	44164	50 %	25 %	0 %	25 %	28896812
121	NC_004603	TGCT	2	8	45058	45065	0 %	50 %	25 %	25 %	28896812
122	NC_004603	TAAA	2	8	46310	46317	75 %	25 %	0 %	0 %	28896813
123	NC_004603	AAAG	2	8	46365	46372	75 %	0 %	25 %	0 %	28896813
124	NC_004603	GCTT	2	8	46506	46513	0 %	50 %	25 %	25 %	28896814
125	NC_004603	TGAA	2	8	47000	47007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004603	TTCA	2	8	47010	47017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004603	CTAT	2	8	47781	47788	25 %	50 %	0 %	25 %	28896815
128	NC_004603	ATTG	2	8	47838	47845	25 %	50 %	25 %	0 %	28896815
129	NC_004603	TTGA	2	8	48223	48230	25 %	50 %	25 %	0 %	28896815
130	NC_004603	AAGC	2	8	48455	48462	50 %	0 %	25 %	25 %	28896815
131	NC_004603	TGGT	2	8	48529	48536	0 %	50 %	50 %	0 %	28896815
132	NC_004603	CATT	2	8	48600	48607	25 %	50 %	0 %	25 %	28896815
133	NC_004603	CAGC	2	8	48632	48639	25 %	0 %	25 %	50 %	28896815
134	NC_004603	CAAA	2	8	49204	49211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004603	ATCA	2	8	49272	49279	50 %	25 %	0 %	25 %	28896816
136	NC_004603	GGTT	2	8	49506	49513	0 %	50 %	50 %	0 %	28896816
137	NC_004603	CTTC	2	8	49514	49521	0 %	50 %	0 %	50 %	28896816
138	NC_004603	TTCT	2	8	50473	50480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_004603	CCAC	2	8	51071	51078	25 %	0 %	0 %	75 %	28896818
140	NC_004603	TGCT	2	8	51256	51263	0 %	50 %	25 %	25 %	28896818
141	NC_004603	ATTC	2	8	52141	52148	25 %	50 %	0 %	25 %	28896820
142	NC_004603	ATCC	2	8	52253	52260	25 %	25 %	0 %	50 %	28896821
143	NC_004603	GTTG	2	8	52828	52835	0 %	50 %	50 %	0 %	28896821
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145	NC_004603	CTGG	2	8	53076	53083	0 %	25 %	50 %	25 %	28896821
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