MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 63725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004603	CAG	2	6	198516	198521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896960
4002	NC_004603	AAG	2	6	198624	198629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896960
4003	NC_004603	AAT	2	6	198639	198644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896960
4004	NC_004603	A	6	6	198668	198673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_004603	T	6	6	198692	198697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_004603	ATT	2	6	198698	198703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_004603	AGTAA	2	10	198719	198728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_004603	ATTA	2	8	198766	198773	50 %	50 %	0 %	0 %	28896961
4009	NC_004603	TCTTA	2	10	198826	198835	20 %	60 %	0 %	20 %	28896961
4010	NC_004603	ATT	2	6	198959	198964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896961
4011	NC_004603	TCTG	2	8	199116	199123	0 %	50 %	25 %	25 %	28896961
4012	NC_004603	TAA	2	6	199183	199188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896961
4013	NC_004603	GCAT	2	8	199198	199205	25 %	25 %	25 %	25 %	28896961
4014	NC_004603	CT	3	6	199208	199213	0 %	50 %	0 %	50 %	28896961
4015	NC_004603	ACA	2	6	199263	199268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896961
4016	NC_004603	AATG	2	8	199519	199526	50 %	25 %	25 %	0 %	28896961
4017	NC_004603	TAA	2	6	199546	199551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896961
4018	NC_004603	TGC	2	6	199722	199727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896961
4019	NC_004603	TGA	2	6	199753	199758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896961
4020	NC_004603	GTG	2	6	199986	199991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896961
4021	NC_004603	TTTG	2	8	200038	200045	0 %	75 %	25 %	0 %	28896961
4022	NC_004603	AGT	2	6	200074	200079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896961
4023	NC_004603	TCT	2	6	200169	200174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896961
4024	NC_004603	AAT	2	6	200201	200206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896961
4025	NC_004603	GAT	2	6	200243	200248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896961
4026	NC_004603	AGC	3	9	200285	200293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_004603	GCT	3	9	200302	200310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_004603	CCGTCG	2	12	200350	200361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28896962
4029	NC_004603	CAT	2	6	200386	200391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896962
4030	NC_004603	ACCT	2	8	200432	200439	25 %	25 %	0 %	50 %	28896962
4031	NC_004603	GAACT	2	10	200615	200624	40 %	20 %	20 %	20 %	28896962
4032	NC_004603	CAG	2	6	200627	200632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896962
4033	NC_004603	AGCCT	2	10	200646	200655	20 %	20 %	20 %	40 %	28896962
4034	NC_004603	CAT	2	6	200794	200799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896962
4035	NC_004603	AGT	2	6	200809	200814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896962
4036	NC_004603	TCG	3	9	201067	201075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896963
4037	NC_004603	ATTG	2	8	201088	201095	25 %	50 %	25 %	0 %	28896963
4038	NC_004603	GCAAG	2	10	201352	201361	40 %	0 %	40 %	20 %	28896963
4039	NC_004603	TCA	2	6	201381	201386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896963
4040	NC_004603	ACA	2	6	201390	201395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896963
4041	NC_004603	GGT	2	6	201548	201553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896963
4042	NC_004603	CTT	2	6	201694	201699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896963
4043	NC_004603	AAT	2	6	201781	201786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_004603	TGA	2	6	201898	201903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896964
4045	NC_004603	GTTTG	2	10	202108	202117	0 %	60 %	40 %	0 %	28896964
4046	NC_004603	ACT	2	6	202135	202140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896964
4047	NC_004603	AGA	3	9	202171	202179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896964
4048	NC_004603	CGTG	2	8	202204	202211	0 %	25 %	50 %	25 %	28896964
4049	NC_004603	GGC	2	6	202226	202231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896964
4050	NC_004603	GTTC	2	8	202243	202250	0 %	50 %	25 %	25 %	28896964
4051	NC_004603	GAA	2	6	202276	202281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896964
4052	NC_004603	TTA	2	6	202307	202312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896965
4053	NC_004603	CTGA	2	8	202386	202393	25 %	25 %	25 %	25 %	28896965
4054	NC_004603	TAC	2	6	202428	202433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896965
4055	NC_004603	A	7	7	202500	202506	100 %	0 %	0 %	0 %	28896965
4056	NC_004603	T	6	6	202523	202528	0 %	100 %	0 %	0 %	28896965
4057	NC_004603	TTA	2	6	202621	202626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896965
4058	NC_004603	AAGA	2	8	202728	202735	75 %	0 %	25 %	0 %	28896965
4059	NC_004603	AAG	2	6	202837	202842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896965
4060	NC_004603	GAG	2	6	202875	202880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28896965
4061	NC_004603	ATG	2	6	202918	202923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896965
4062	NC_004603	CAAC	2	8	202927	202934	50 %	0 %	0 %	50 %	28896965
4063	NC_004603	TTA	2	6	202966	202971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896965
4064	NC_004603	GAT	2	6	203046	203051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896965
4065	NC_004603	AAG	2	6	203098	203103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896965
4066	NC_004603	TCA	2	6	203210	203215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896965
4067	NC_004603	A	6	6	203221	203226	100 %	0 %	0 %	0 %	28896965
4068	NC_004603	T	6	6	203242	203247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_004603	CG	3	6	203364	203369	0 %	0 %	50 %	50 %	28896966
4070	NC_004603	CAA	2	6	203483	203488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896966
4071	NC_004603	GTT	2	6	203565	203570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896966
4072	NC_004603	TTGCGG	2	12	203620	203631	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28896966
4073	NC_004603	CGTC	2	8	203693	203700	0 %	25 %	25 %	50 %	28896966
4074	NC_004603	ACA	2	6	203771	203776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896966
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4076	NC_004603	CAT	2	6	203945	203950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896966
4077	NC_004603	CAA	2	6	203954	203959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896966
4078	NC_004603	CTT	2	6	204017	204022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896966
4079	NC_004603	GTG	2	6	204034	204039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896966
4080	NC_004603	ATT	2	6	204040	204045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896966
4081	NC_004603	GTAA	2	8	204079	204086	50 %	25 %	25 %	0 %	28896967
4082	NC_004603	CT	3	6	204163	204168	0 %	50 %	0 %	50 %	28896967
4083	NC_004603	A	6	6	204186	204191	100 %	0 %	0 %	0 %	28896967
4084	NC_004603	ATG	2	6	204293	204298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896967
4085	NC_004603	CAATC	2	10	204424	204433	40 %	20 %	0 %	40 %	28896967
4086	NC_004603	CCAG	2	8	204440	204447	25 %	0 %	25 %	50 %	28896967
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4089	NC_004603	TGC	2	6	204606	204611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896967
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4092	NC_004603	CGGT	2	8	204696	204703	0 %	25 %	50 %	25 %	28896967
4093	NC_004603	TCA	2	6	204729	204734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896967
4094	NC_004603	CTTC	2	8	204829	204836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_004603	TCT	2	6	204881	204886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896968
4096	NC_004603	TTGA	2	8	204892	204899	25 %	50 %	25 %	0 %	28896968
4097	NC_004603	CTTG	3	12	204912	204923	0 %	50 %	25 %	25 %	28896968
4098	NC_004603	GTT	2	6	204972	204977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896968
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4101	NC_004603	GCCA	2	8	205273	205280	25 %	0 %	25 %	50 %	28896968
4102	NC_004603	TGG	2	6	205310	205315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896968
4103	NC_004603	CT	3	6	205409	205414	0 %	50 %	0 %	50 %	28896968
4104	NC_004603	TG	3	6	205430	205435	0 %	50 %	50 %	0 %	28896968
4105	NC_004603	TGA	2	6	205481	205486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896968
4106	NC_004603	CGCT	2	8	205626	205633	0 %	25 %	25 %	50 %	28896968
4107	NC_004603	T	6	6	205720	205725	0 %	100 %	0 %	0 %	28896968
4108	NC_004603	TTGC	2	8	205827	205834	0 %	50 %	25 %	25 %	28896968
4109	NC_004603	AC	3	6	205852	205857	50 %	0 %	0 %	50 %	28896968
4110	NC_004603	GAC	2	6	205892	205897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896968
4111	NC_004603	ATT	2	6	205916	205921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_004603	ACA	2	6	206030	206035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896969
4113	NC_004603	GCT	2	6	206144	206149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896969
4114	NC_004603	GCGT	2	8	206192	206199	0 %	25 %	50 %	25 %	28896969
4115	NC_004603	GAT	2	6	206212	206217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896969
4116	NC_004603	ATTG	2	8	206230	206237	25 %	50 %	25 %	0 %	28896969
4117	NC_004603	GTG	2	6	206291	206296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896969
4118	NC_004603	ACA	2	6	206434	206439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896970
4119	NC_004603	CAG	2	6	206445	206450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896970
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4122	NC_004603	ACT	2	6	206577	206582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896970
4123	NC_004603	GGC	2	6	206634	206639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896970
4124	NC_004603	AGTT	2	8	206650	206657	25 %	50 %	25 %	0 %	28896970
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4372	NC_004603	TGGT	2	8	219922	219929	0 %	50 %	50 %	0 %	28896983
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4375	NC_004603	ATGT	2	8	220028	220035	25 %	50 %	25 %	0 %	28896983
4376	NC_004603	TC	3	6	220041	220046	0 %	50 %	0 %	50 %	28896983
4377	NC_004603	T	6	6	220049	220054	0 %	100 %	0 %	0 %	28896983
4378	NC_004603	GTT	2	6	220123	220128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896983
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4382	NC_004603	CT	3	6	220409	220414	0 %	50 %	0 %	50 %	28896983
4383	NC_004603	AAT	2	6	220418	220423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896983
4384	NC_004603	TGC	2	6	220432	220437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896983
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4394	NC_004603	T	6	6	220913	220918	0 %	100 %	0 %	0 %	28896984
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4399	NC_004603	TGGC	2	8	221012	221019	0 %	25 %	50 %	25 %	28896984
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4403	NC_004603	T	7	7	221113	221119	0 %	100 %	0 %	0 %	28896984
4404	NC_004603	ACG	2	6	221179	221184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896984
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4406	NC_004603	TAT	2	6	221270	221275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896985
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4408	NC_004603	ACG	2	6	221307	221312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896985
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