MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 63725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004603	A	6	6	250904	250909	100 %	0 %	0 %	0 %	28897011
5002	NC_004603	GCA	2	6	250922	250927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897011
5003	NC_004603	CAA	2	6	250953	250958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897011
5004	NC_004603	ATG	2	6	250976	250981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897011
5005	NC_004603	ATTG	2	8	250999	251006	25 %	50 %	25 %	0 %	28897011
5006	NC_004603	GAA	2	6	251018	251023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897011
5007	NC_004603	CTG	2	6	251147	251152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897011
5008	NC_004603	TGAT	2	8	251169	251176	25 %	50 %	25 %	0 %	28897011
5009	NC_004603	AT	3	6	251191	251196	50 %	50 %	0 %	0 %	28897011
5010	NC_004603	TGG	2	6	251250	251255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897011
5011	NC_004603	TGA	2	6	251257	251262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897011
5012	NC_004603	TGT	2	6	251272	251277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897011
5013	NC_004603	TG	3	6	251294	251299	0 %	50 %	50 %	0 %	28897011
5014	NC_004603	TTG	2	6	251361	251366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897011
5015	NC_004603	AAG	2	6	251373	251378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897011
5016	NC_004603	GAAACT	2	12	251384	251395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28897011
5017	NC_004603	GAT	2	6	251422	251427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897011
5018	NC_004603	TAT	2	6	251500	251505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28897011
5019	NC_004603	CAA	2	6	251600	251605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897011
5020	NC_004603	ACT	2	6	251691	251696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897011
5021	NC_004603	A	6	6	251714	251719	100 %	0 %	0 %	0 %	28897011
5022	NC_004603	GTT	2	6	251776	251781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897011
5023	NC_004603	TAAG	2	8	251884	251891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_004603	TAA	2	6	251931	251936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28897012
5025	NC_004603	TC	3	6	251965	251970	0 %	50 %	0 %	50 %	28897012
5026	NC_004603	T	7	7	251978	251984	0 %	100 %	0 %	0 %	28897012
5027	NC_004603	CTT	2	6	251986	251991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897012
5028	NC_004603	TC	3	6	251992	251997	0 %	50 %	0 %	50 %	28897012
5029	NC_004603	TTGG	2	8	252118	252125	0 %	50 %	50 %	0 %	28897012
5030	NC_004603	ACA	2	6	252199	252204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897012
5031	NC_004603	CAT	2	6	252205	252210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897012
5032	NC_004603	TTC	2	6	252211	252216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897012
5033	NC_004603	TTC	2	6	252250	252255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897012
5034	NC_004603	CGA	2	6	252280	252285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897012
5035	NC_004603	TCG	2	6	252297	252302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897012
5036	NC_004603	GTT	2	6	252389	252394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897012
5037	NC_004603	TTTTG	2	10	252399	252408	0 %	80 %	20 %	0 %	28897012
5038	NC_004603	CTT	2	6	252409	252414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897012
5039	NC_004603	T	6	6	252425	252430	0 %	100 %	0 %	0 %	28897012
5040	NC_004603	GTG	2	6	252466	252471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897012
5041	NC_004603	AGA	2	6	252491	252496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897012
5042	NC_004603	GTT	2	6	252520	252525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897012
5043	NC_004603	ACC	2	6	252584	252589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897012
5044	NC_004603	TTG	2	6	252657	252662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897012
5045	NC_004603	GGAC	2	8	252734	252741	25 %	0 %	50 %	25 %	28897012
5046	NC_004603	GAT	2	6	252761	252766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897012
5047	NC_004603	TTG	2	6	252863	252868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897012
5048	NC_004603	T	6	6	252890	252895	0 %	100 %	0 %	0 %	28897012
5049	NC_004603	TTG	2	6	252911	252916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897012
5050	NC_004603	TCT	2	6	252957	252962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897012
5051	NC_004603	CAG	2	6	253021	253026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897012
5052	NC_004603	ATG	2	6	253117	253122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897012
5053	NC_004603	TGC	2	6	253180	253185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897012
5054	NC_004603	CCA	2	6	253233	253238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897012
5055	NC_004603	CTC	2	6	253288	253293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_004603	GTTG	2	8	253350	253357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_004603	TGAG	2	8	253366	253373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_004603	TAG	2	6	253455	253460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_004603	CTC	2	6	253480	253485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_004603	CAAA	2	8	253514	253521	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_004603	ATG	2	6	253531	253536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_004603	TAA	2	6	253558	253563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_004603	GCT	2	6	253582	253587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897013
5064	NC_004603	GCT	2	6	253591	253596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897013
5065	NC_004603	TGC	2	6	253605	253610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897013
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5071	NC_004603	GAT	2	6	253845	253850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897013
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5073	NC_004603	GAT	3	9	254058	254066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897013
5074	NC_004603	TGT	2	6	254126	254131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897013
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5076	NC_004603	TGG	2	6	254214	254219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897013
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5078	NC_004603	TTGCT	2	10	254291	254300	0 %	60 %	20 %	20 %	28897013
5079	NC_004603	GAC	2	6	254333	254338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897013
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5081	NC_004603	AAT	2	6	254412	254417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_004603	TC	4	8	254457	254464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_004603	GTT	2	6	254479	254484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_004603	TAC	2	6	254572	254577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5086	NC_004603	TGT	2	6	254593	254598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_004603	AG	3	6	254702	254707	50 %	0 %	50 %	0 %	28897014
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5090	NC_004603	GTT	2	6	254979	254984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_004603	TTG	2	6	254991	254996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_004603	TTC	2	6	254998	255003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_004603	TTCT	2	8	255033	255040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_004603	ATCG	2	8	255098	255105	25 %	25 %	25 %	25 %	28897015
5095	NC_004603	TAC	2	6	255134	255139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897015
5096	NC_004603	GTT	2	6	255175	255180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897015
5097	NC_004603	TTG	2	6	255215	255220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897015
5098	NC_004603	TCTA	2	8	255278	255285	25 %	50 %	0 %	25 %	28897015
5099	NC_004603	TCGCA	2	10	255319	255328	20 %	20 %	20 %	40 %	28897015
5100	NC_004603	TTGA	2	8	255416	255423	25 %	50 %	25 %	0 %	28897015
5101	NC_004603	T	6	6	255430	255435	0 %	100 %	0 %	0 %	28897015
5102	NC_004603	AATA	2	8	255455	255462	75 %	25 %	0 %	0 %	28897015
5103	NC_004603	TTCA	2	8	255624	255631	25 %	50 %	0 %	25 %	28897016
5104	NC_004603	ACG	2	6	255637	255642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897016
5105	NC_004603	TGA	2	6	255649	255654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897016
5106	NC_004603	TCA	2	6	255811	255816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897016
5107	NC_004603	TTGCG	2	10	255831	255840	0 %	40 %	40 %	20 %	28897016
5108	NC_004603	TAC	2	6	255897	255902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_004603	AG	4	8	255960	255967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_004603	GTCGT	2	10	256047	256056	0 %	40 %	40 %	20 %	28897017
5111	NC_004603	AC	3	6	256075	256080	50 %	0 %	0 %	50 %	28897017
5112	NC_004603	GGC	2	6	256115	256120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897017
5113	NC_004603	CTT	2	6	256192	256197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897017
5114	NC_004603	GACTTT	2	12	256433	256444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28897017
5115	NC_004603	TCT	2	6	256473	256478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897017
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5117	NC_004603	GTT	2	6	256534	256539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897017
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5119	NC_004603	CAAAAA	2	12	256688	256699	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5120	NC_004603	TGT	2	6	256845	256850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897018
5121	NC_004603	GAC	2	6	256917	256922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897018
5122	NC_004603	GC	3	6	256932	256937	0 %	0 %	50 %	50 %	28897018
5123	NC_004603	GAC	2	6	256956	256961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897018
5124	NC_004603	TTC	2	6	256980	256985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897018
5125	NC_004603	CTG	2	6	257000	257005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897018
5126	NC_004603	TCT	2	6	257023	257028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897018
5127	NC_004603	GGC	2	6	257060	257065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897018
5128	NC_004603	CATG	2	8	257066	257073	25 %	25 %	25 %	25 %	28897018
5129	NC_004603	ACC	2	6	257107	257112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897018
5130	NC_004603	CAT	2	6	257246	257251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897018
5131	NC_004603	TGA	2	6	257273	257278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897018
5132	NC_004603	GC	3	6	257306	257311	0 %	0 %	50 %	50 %	28897018
5133	NC_004603	TTTC	2	8	257330	257337	0 %	75 %	0 %	25 %	28897018
5134	NC_004603	GATC	2	8	257351	257358	25 %	25 %	25 %	25 %	28897018
5135	NC_004603	CAA	2	6	257378	257383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897018
5136	NC_004603	TTGA	2	8	257459	257466	25 %	50 %	25 %	0 %	28897018
5137	NC_004603	CAT	2	6	257564	257569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897018
5138	NC_004603	TTCACC	2	12	257574	257585	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	28897018
5139	NC_004603	CAC	2	6	257597	257602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897018
5140	NC_004603	CAG	2	6	257642	257647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897018
5141	NC_004603	CAC	2	6	257669	257674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897018
5142	NC_004603	GCA	2	6	257701	257706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897018
5143	NC_004603	ATG	2	6	257749	257754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897018
5144	NC_004603	GCG	2	6	257788	257793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_004603	T	6	6	257960	257965	0 %	100 %	0 %	0 %	28897019
5146	NC_004603	ATG	2	6	257972	257977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897019
5147	NC_004603	AGTG	2	8	257993	258000	25 %	25 %	50 %	0 %	28897019
5148	NC_004603	TA	3	6	258032	258037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_004603	TAGG	2	8	258083	258090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_004603	AAC	2	6	258115	258120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897020
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5154	NC_004603	GCAC	2	8	258278	258285	25 %	0 %	25 %	50 %	28897020
5155	NC_004603	ACT	2	6	258308	258313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897020
5156	NC_004603	AAT	2	6	258334	258339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28897020
5157	NC_004603	CTT	2	6	258344	258349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5158	NC_004603	AGC	2	6	258402	258407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5159	NC_004603	ATC	2	6	258458	258463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897021
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5164	NC_004603	TCT	2	6	258645	258650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897021
5165	NC_004603	TCT	2	6	258705	258710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897021
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5171	NC_004603	GTATT	2	10	258942	258951	20 %	60 %	20 %	0 %	28897021
5172	NC_004603	CAATG	2	10	259011	259020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5173	NC_004603	T	6	6	259028	259033	0 %	100 %	0 %	0 %	28897022
5174	NC_004603	TTG	2	6	259061	259066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897022
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5176	NC_004603	GCA	2	6	259109	259114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897022
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5182	NC_004603	ACGG	2	8	259305	259312	25 %	0 %	50 %	25 %	28897022
5183	NC_004603	TGT	2	6	259358	259363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897022
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5190	NC_004603	AAT	2	6	260053	260058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5191	NC_004603	ATCTTC	2	12	260155	260166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28897023
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5206	NC_004603	TTC	2	6	260884	260889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897023
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5212	NC_004603	AGT	2	6	261059	261064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897023
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5229	NC_004603	GCT	2	6	261643	261648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897024
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5231	NC_004603	AATCA	2	10	261678	261687	60 %	20 %	0 %	20 %	28897024
5232	NC_004603	TGA	3	9	261719	261727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897024
5233	NC_004603	GA	3	6	261726	261731	50 %	0 %	50 %	0 %	28897024
5234	NC_004603	AGCA	2	8	261750	261757	50 %	0 %	25 %	25 %	28897024
5235	NC_004603	GCT	2	6	261814	261819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897024
5236	NC_004603	AGCA	2	8	261906	261913	50 %	0 %	25 %	25 %	28897024
5237	NC_004603	TTG	2	6	261919	261924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897024
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5239	NC_004603	GC	3	6	261942	261947	0 %	0 %	50 %	50 %	28897024
5240	NC_004603	GAC	2	6	261999	262004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897024
5241	NC_004603	ATT	2	6	262054	262059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_004603	TGA	2	6	262139	262144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_004603	A	6	6	262166	262171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_004603	TTTC	2	8	262213	262220	0 %	75 %	0 %	25 %	28897025
5245	NC_004603	CG	3	6	262244	262249	0 %	0 %	50 %	50 %	28897025
5246	NC_004603	ACA	2	6	262305	262310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897025
5247	NC_004603	CTT	2	6	262327	262332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897025
5248	NC_004603	TTC	2	6	262382	262387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897025
5249	NC_004603	CGA	2	6	262459	262464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897025
5250	NC_004603	GGT	3	9	262515	262523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897025
5251	NC_004603	GTT	2	6	262567	262572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897025
5252	NC_004603	GGT	2	6	262581	262586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897025
5253	NC_004603	TAA	2	6	262607	262612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28897025
5254	NC_004603	CAAG	2	8	262639	262646	50 %	0 %	25 %	25 %	28897025
5255	NC_004603	GTT	2	6	262687	262692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897025
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5257	NC_004603	T	6	6	262704	262709	0 %	100 %	0 %	0 %	28897025
5258	NC_004603	TCA	2	6	262763	262768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_004603	TTC	2	6	262773	262778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_004603	AGA	2	6	262851	262856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_004603	GCGCT	2	10	262944	262953	0 %	20 %	40 %	40 %	28897026
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5264	NC_004603	AGT	2	6	263015	263020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897026
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5281	NC_004603	TCA	2	6	264225	264230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5282	NC_004603	T	6	6	264309	264314	0 %	100 %	0 %	0 %	28897027
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5289	NC_004603	CTA	2	6	264772	264777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897027
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5315	NC_004603	TA	3	6	266483	266488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5317	NC_004603	TTA	2	6	266511	266516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5320	NC_004603	A	6	6	266599	266604	100 %	0 %	0 %	0 %	28897028
5321	NC_004603	TGGT	2	8	266675	266682	0 %	50 %	50 %	0 %	28897028
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5331	NC_004603	GAG	2	6	267183	267188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5332	NC_004603	CTTC	2	8	267193	267200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5333	NC_004603	TTC	2	6	267261	267266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5334	NC_004603	AATC	2	8	267365	267372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5336	NC_004603	TTGT	2	8	267409	267416	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5337	NC_004603	CGTATC	2	12	267457	267468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897030
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5346	NC_004603	ACT	2	6	268463	268468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897032
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5363	NC_004603	AGT	2	6	269324	269329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5371	NC_004603	CGTA	2	8	269843	269850	25 %	25 %	25 %	25 %	28897034
5372	NC_004603	TTCT	2	8	269885	269892	0 %	75 %	0 %	25 %	28897034
5373	NC_004603	CAA	2	6	269903	269908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897034
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5498	NC_004603	TTG	2	6	276899	276904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897051
5499	NC_004603	A	6	6	276946	276951	100 %	0 %	0 %	0 %	28897051
5500	NC_004603	CGT	2	6	276967	276972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897051

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