MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002506	TGA	2	6	52076	52081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002506	CAC	2	6	52166	52171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_002506	TG	3	6	52196	52201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_002506	CTC	2	6	52214	52219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_002506	TCTG	2	8	52229	52236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_002506	GCA	2	6	52262	52267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_002506	ACC	2	6	52303	52308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_002506	AAGC	2	8	52401	52408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_002506	TCG	2	6	52430	52435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_002506	TGG	2	6	52492	52497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_002506	ATG	2	6	52693	52698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_002506	TCC	2	6	52713	52718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_002506	GAC	2	6	52748	52753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002506	TGA	2	6	53114	53119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_002506	TGG	2	6	53122	53127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002506	ATG	2	6	53134	53139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002506	TTCAAT	2	12	53172	53183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1018	NC_002506	CAG	2	6	53257	53262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_002506	GGT	2	6	53270	53275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002506	AGC	2	6	53293	53298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_002506	CTCA	2	8	53321	53328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_002506	ATT	2	6	53331	53336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002506	ATC	2	6	53370	53375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_002506	AATC	2	8	53411	53418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_002506	TGA	2	6	53489	53494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_002506	CTT	2	6	53799	53804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_002506	GAG	2	6	53827	53832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002506	ATG	2	6	53855	53860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_002506	GCGT	2	8	53879	53886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_002506	ATT	2	6	53950	53955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002506	GAAA	2	8	53970	53977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002506	GAG	2	6	54058	54063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002506	GCT	2	6	54114	54119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002506	GATG	2	8	54201	54208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_002506	AAG	2	6	54476	54481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_002506	AGC	2	6	54539	54544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_002506	GATT	2	8	54557	54564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002506	ATC	2	6	54625	54630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_002506	GCC	2	6	54694	54699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_002506	CTG	2	6	54709	54714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_002506	CAA	2	6	54754	54759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_002506	A	6	6	54758	54763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002506	CGTT	2	8	54834	54841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_002506	C	6	6	54842	54847	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1045	NC_002506	GT	3	6	54855	54860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002506	GCC	2	6	54888	54893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_002506	GAGGTA	2	12	54939	54950	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15600818
1048	NC_002506	ATC	2	6	55068	55073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600818
1049	NC_002506	CAC	2	6	55136	55141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600818
1050	NC_002506	TACCT	2	10	55200	55209	20 %	40 %	0 %	40 %	15600818
1051	NC_002506	AG	3	6	55261	55266	50 %	0 %	50 %	0 %	15600818
1052	NC_002506	GACA	2	8	55341	55348	50 %	0 %	25 %	25 %	15600818
1053	NC_002506	GCAC	2	8	55396	55403	25 %	0 %	25 %	50 %	15600818
1054	NC_002506	CAC	2	6	55472	55477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600818
1055	NC_002506	GGC	2	6	55536	55541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600818
1056	NC_002506	CTT	2	6	55724	55729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600818
1057	NC_002506	GAACA	2	10	55785	55794	60 %	0 %	20 %	20 %	15600818
1058	NC_002506	TGGTT	2	10	55813	55822	0 %	60 %	40 %	0 %	15600818
1059	NC_002506	CCA	2	6	55835	55840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600818
1060	NC_002506	AGT	2	6	55869	55874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600818
1061	NC_002506	GGT	2	6	55907	55912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600818
1062	NC_002506	TCA	2	6	55919	55924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600818
1063	NC_002506	CGC	2	6	55952	55957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600818
1064	NC_002506	AC	3	6	56020	56025	50 %	0 %	0 %	50 %	15600818
1065	NC_002506	CAG	2	6	56046	56051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600818
1066	NC_002506	ATT	2	6	56059	56064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600818
1067	NC_002506	GA	4	8	56109	56116	50 %	0 %	50 %	0 %	15600819
1068	NC_002506	TCA	2	6	56160	56165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600819
1069	NC_002506	AATG	2	8	56314	56321	50 %	25 %	25 %	0 %	15600819
1070	NC_002506	AAT	2	6	56381	56386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600819
1071	NC_002506	CGA	2	6	56407	56412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600819
1072	NC_002506	AAT	2	6	56434	56439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600819
1073	NC_002506	ATA	2	6	56516	56521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_002506	ATA	2	6	56542	56547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_002506	TGC	2	6	56573	56578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_002506	AC	4	8	56591	56598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_002506	ACGT	2	8	56652	56659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_002506	GCAT	2	8	56771	56778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_002506	AGG	2	6	56844	56849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_002506	CAC	2	6	56850	56855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_002506	TCA	2	6	56927	56932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_002506	GCA	3	9	56988	56996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_002506	CCAA	2	8	57015	57022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_002506	CGG	2	6	57023	57028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_002506	TTC	2	6	57086	57091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_002506	GGT	2	6	57100	57105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_002506	GGC	2	6	57171	57176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_002506	TCA	2	6	57216	57221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_002506	CTTT	2	8	57243	57250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_002506	CA	3	6	57288	57293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_002506	GAAT	2	8	57335	57342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_002506	CAG	2	6	57370	57375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_002506	TGG	2	6	57378	57383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002506	AG	3	6	57406	57411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002506	TCA	2	6	57494	57499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_002506	TTG	2	6	57519	57524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_002506	GCTTG	2	10	57533	57542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_002506	CAG	2	6	57564	57569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_002506	TCA	2	6	57595	57600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_002506	T	6	6	57722	57727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_002506	GTA	2	6	57729	57734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002506	TCA	2	6	57805	57810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_002506	CATGC	2	10	57813	57822	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1104	NC_002506	CTCA	2	8	57894	57901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_002506	GCG	2	6	57961	57966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_002506	CGG	2	6	58006	58011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_002506	TGA	2	6	58022	58027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002506	GGT	2	6	58053	58058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_002506	CTT	2	6	58133	58138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_002506	GCA	2	6	58230	58235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1111	NC_002506	GCA	2	6	58322	58327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1112	NC_002506	GCT	2	6	58363	58368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1113	NC_002506	AGTG	2	8	58400	58407	25 %	25 %	50 %	0 %	15600822
1114	NC_002506	CA	3	6	58421	58426	50 %	0 %	0 %	50 %	15600822
1115	NC_002506	GAC	2	6	58456	58461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1116	NC_002506	T	6	6	58477	58482	0 %	100 %	0 %	0 %	15600822
1117	NC_002506	CCA	2	6	58513	58518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600822
1118	NC_002506	GA	3	6	58541	58546	50 %	0 %	50 %	0 %	15600822
1119	NC_002506	GC	3	6	58597	58602	0 %	0 %	50 %	50 %	15600822
1120	NC_002506	GCT	2	6	58605	58610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1121	NC_002506	GCA	2	6	58668	58673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1122	NC_002506	TCA	2	6	58674	58679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600822
1123	NC_002506	T	6	6	58696	58701	0 %	100 %	0 %	0 %	15600822
1124	NC_002506	GCC	2	6	58715	58720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600822
1125	NC_002506	TCT	2	6	58736	58741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600822
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1129	NC_002506	GCA	2	6	58854	58859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1130	NC_002506	ATT	2	6	58909	58914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600822
1131	NC_002506	CTT	2	6	58947	58952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600822
1132	NC_002506	AGCC	2	8	58984	58991	25 %	0 %	25 %	50 %	15600822
1133	NC_002506	TGT	2	6	59031	59036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600822
1134	NC_002506	GCA	2	6	59040	59045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1135	NC_002506	CAAT	2	8	59141	59148	50 %	25 %	0 %	25 %	15600822
1136	NC_002506	GTGG	2	8	59182	59189	0 %	25 %	75 %	0 %	15600822
1137	NC_002506	CTCAAT	2	12	59248	59259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600822
1138	NC_002506	TTG	2	6	59308	59313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600822
1139	NC_002506	GTA	2	6	59320	59325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600822
1140	NC_002506	ATG	2	6	59341	59346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600822
1141	NC_002506	CAGG	2	8	59370	59377	25 %	0 %	50 %	25 %	15600822
1142	NC_002506	GCT	2	6	59589	59594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1143	NC_002506	AAG	2	6	59608	59613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600822
1144	NC_002506	GTC	2	6	59638	59643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600822
1145	NC_002506	A	6	6	59716	59721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_002506	ATA	2	6	59746	59751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_002506	TGC	2	6	59817	59822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193273
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1150	NC_002506	ACG	2	6	59933	59938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193273
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1156	NC_002506	CGC	2	6	60230	60235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193273
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1169	NC_002506	TAA	2	6	61305	61310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_002506	GTCA	2	8	65311	65318	25 %	25 %	25 %	25 %	15600828
1254	NC_002506	CCG	2	6	65352	65357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600828
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