MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002506	ATT	2	6	659739	659744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_002506	AAC	2	6	659764	659769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161582042
12503	NC_002506	TCA	2	6	659777	659782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
12504	NC_002506	GCCGTT	2	12	659809	659820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
12505	NC_002506	ATC	2	6	659896	659901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
12506	NC_002506	CAT	2	6	659919	659924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
12507	NC_002506	AAT	2	6	659977	659982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161582042
12508	NC_002506	CTTTGC	2	12	659997	660008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161582042
12509	NC_002506	TGGCA	2	10	660009	660018	20 %	20 %	40 %	20 %	161582042
12510	NC_002506	GA	5	10	660037	660046	50 %	0 %	50 %	0 %	161582042
12511	NC_002506	TGG	2	6	660126	660131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582042
12512	NC_002506	GATT	2	8	660135	660142	25 %	50 %	25 %	0 %	161582042
12513	NC_002506	T	6	6	660153	660158	0 %	100 %	0 %	0 %	161582042
12514	NC_002506	AGT	2	6	660295	660300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582042
12515	NC_002506	GGT	2	6	660346	660351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582042
12516	NC_002506	ATC	2	6	660394	660399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
12517	NC_002506	ACCG	2	8	660400	660407	25 %	0 %	25 %	50 %	161582042
12518	NC_002506	CA	3	6	660438	660443	50 %	0 %	0 %	50 %	161582042
12519	NC_002506	GCG	2	6	660468	660473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582042
12520	NC_002506	TCA	2	6	660488	660493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
12521	NC_002506	ATG	2	6	660560	660565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582042
12522	NC_002506	CTG	2	6	660598	660603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
12523	NC_002506	CCA	2	6	660669	660674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161582042
12524	NC_002506	T	6	6	660691	660696	0 %	100 %	0 %	0 %	161582042
12525	NC_002506	GCT	2	6	660726	660731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
12526	NC_002506	TCA	2	6	660779	660784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
12527	NC_002506	CAAT	2	8	660872	660879	50 %	25 %	0 %	25 %	161582042
12528	NC_002506	T	6	6	661019	661024	0 %	100 %	0 %	0 %	161582042
12529	NC_002506	CAA	2	6	661069	661074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161582042
12530	NC_002506	AATA	2	8	661106	661113	75 %	25 %	0 %	0 %	161582042
12531	NC_002506	CG	3	6	661119	661124	0 %	0 %	50 %	50 %	161582042
12532	NC_002506	CAGT	2	8	661125	661132	25 %	25 %	25 %	25 %	161582042
12533	NC_002506	CAG	2	6	661186	661191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582042
12534	NC_002506	TGC	2	6	661202	661207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
12535	NC_002506	GCG	2	6	661218	661223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582042
12536	NC_002506	CG	3	6	661258	661263	0 %	0 %	50 %	50 %	161582042
12537	NC_002506	TTA	2	6	661283	661288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161582042
12538	NC_002506	AGC	2	6	661316	661321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582042
12539	NC_002506	GGA	2	6	661429	661434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161582042
12540	NC_002506	TGC	2	6	661478	661483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
12541	NC_002506	A	6	6	661633	661638	100 %	0 %	0 %	0 %	161582042
12542	NC_002506	TTC	2	6	661708	661713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161582042
12543	NC_002506	ACCA	2	8	661733	661740	50 %	0 %	0 %	50 %	161582042
12544	NC_002506	A	6	6	661780	661785	100 %	0 %	0 %	0 %	161582042
12545	NC_002506	CAA	2	6	661922	661927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_002506	TGA	2	6	661996	662001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_002506	TGC	2	6	662005	662010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
12548	NC_002506	GTG	2	6	662098	662103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601474
12549	NC_002506	TAT	2	6	662116	662121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601474
12550	NC_002506	CAT	2	6	662214	662219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601474
12551	NC_002506	TAC	2	6	662464	662469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601474
12552	NC_002506	ACA	2	6	662514	662519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601474
12553	NC_002506	ATT	2	6	662552	662557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601474
12554	NC_002506	CGC	2	6	662637	662642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601474
12555	NC_002506	ACGA	2	8	662759	662766	50 %	0 %	25 %	25 %	15601474
12556	NC_002506	CAA	2	6	662974	662979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601474
12557	NC_002506	GA	3	6	662980	662985	50 %	0 %	50 %	0 %	15601474
12558	NC_002506	TATT	2	8	663019	663026	25 %	75 %	0 %	0 %	15601474
12559	NC_002506	GAA	2	6	663091	663096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601474
12560	NC_002506	GCA	2	6	663131	663136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601474
12561	NC_002506	TGCGC	2	10	663189	663198	0 %	20 %	40 %	40 %	15601474
12562	NC_002506	ATC	2	6	663229	663234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601474
12563	NC_002506	CAC	2	6	663273	663278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601474
12564	NC_002506	TGTT	2	8	663281	663288	0 %	75 %	25 %	0 %	15601474
12565	NC_002506	GCCA	2	8	663290	663297	25 %	0 %	25 %	50 %	15601474
12566	NC_002506	CGC	2	6	663303	663308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601474
12567	NC_002506	CG	3	6	663327	663332	0 %	0 %	50 %	50 %	15601474
12568	NC_002506	CTT	2	6	663381	663386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601474
12569	NC_002506	AG	3	6	663396	663401	50 %	0 %	50 %	0 %	15601474
12570	NC_002506	TCT	2	6	663419	663424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601474
12571	NC_002506	T	6	6	663436	663441	0 %	100 %	0 %	0 %	15601474
12572	NC_002506	CAA	2	6	663453	663458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601474
12573	NC_002506	TGTTT	2	10	663497	663506	0 %	80 %	20 %	0 %	15601474
12574	NC_002506	GGT	2	6	663531	663536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601474
12575	NC_002506	GTG	2	6	663589	663594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601474
12576	NC_002506	A	6	6	663703	663708	100 %	0 %	0 %	0 %	15601474
12577	NC_002506	GCG	2	6	663732	663737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601474
12578	NC_002506	GCG	2	6	663811	663816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601474
12579	NC_002506	GCT	2	6	663855	663860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
12580	NC_002506	GAT	2	6	663901	663906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601474
12581	NC_002506	TGC	2	6	663965	663970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
12582	NC_002506	GAT	2	6	664060	664065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601474
12583	NC_002506	GC	3	6	664075	664080	0 %	0 %	50 %	50 %	15601474
12584	NC_002506	TGC	2	6	664115	664120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
12585	NC_002506	TGG	2	6	664323	664328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601475
12586	NC_002506	GTA	2	6	664436	664441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601475
12587	NC_002506	TCA	2	6	664460	664465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601475
12588	NC_002506	TGA	2	6	664482	664487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601475
12589	NC_002506	TCA	2	6	664494	664499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601475
12590	NC_002506	CA	3	6	664592	664597	50 %	0 %	0 %	50 %	15601475
12591	NC_002506	CTG	2	6	664655	664660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601475
12592	NC_002506	TTC	2	6	664720	664725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601475
12593	NC_002506	TGC	2	6	664766	664771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601475
12594	NC_002506	ATT	2	6	664912	664917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601475
12595	NC_002506	T	6	6	664962	664967	0 %	100 %	0 %	0 %	15601475
12596	NC_002506	ATG	2	6	665135	665140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601475
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12598	NC_002506	CCG	3	9	665252	665260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601476
12599	NC_002506	AGT	2	6	665279	665284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601476
12600	NC_002506	CTT	2	6	665360	665365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601476
12601	NC_002506	TAAA	2	8	665441	665448	75 %	25 %	0 %	0 %	15601476
12602	NC_002506	CCA	2	6	665522	665527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601476
12603	NC_002506	TCG	2	6	665542	665547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601476
12604	NC_002506	TCT	2	6	665596	665601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601476
12605	NC_002506	GA	3	6	665650	665655	50 %	0 %	50 %	0 %	15601476
12606	NC_002506	TTCA	2	8	665704	665711	25 %	50 %	0 %	25 %	15601476
12607	NC_002506	TTA	2	6	665770	665775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_002506	TGC	2	6	665789	665794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_002506	TGT	2	6	665804	665809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_002506	T	7	7	665831	665837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_002506	CAG	2	6	665868	665873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_002506	CAA	2	6	665949	665954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_002506	GCA	2	6	666039	666044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	533112012
12614	NC_002506	GC	3	6	666048	666053	0 %	0 %	50 %	50 %	533112012
12615	NC_002506	ATCG	2	8	666067	666074	25 %	25 %	25 %	25 %	533112012
12616	NC_002506	GAA	2	6	666109	666114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	533112012
12617	NC_002506	GCGAT	2	10	666119	666128	20 %	20 %	40 %	20 %	533112012
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12619	NC_002506	ATG	2	6	666258	666263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601478
12620	NC_002506	CG	4	8	666272	666279	0 %	0 %	50 %	50 %	15601478
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12994	NC_002506	ATT	2	6	685938	685943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12995	NC_002506	GC	3	6	685974	685979	0 %	0 %	50 %	50 %	15601496
12996	NC_002506	CTT	2	6	685990	685995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601496
12997	NC_002506	CTT	2	6	686011	686016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601496
12998	NC_002506	GCC	2	6	686076	686081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601496
12999	NC_002506	GAT	2	6	686104	686109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601496
13000	NC_002506	CG	3	6	686137	686142	0 %	0 %	50 %	50 %	15601496

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