MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002506	AGC	2	6	286799	286804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601036
5502	NC_002506	AGAC	2	8	286882	286889	50 %	0 %	25 %	25 %	15601036
5503	NC_002506	TAG	2	6	286940	286945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
5504	NC_002506	TTAA	2	8	286962	286969	50 %	50 %	0 %	0 %	15601036
5505	NC_002506	T	7	7	287074	287080	0 %	100 %	0 %	0 %	15601037
5506	NC_002506	TCGT	2	8	287109	287116	0 %	50 %	25 %	25 %	15601037
5507	NC_002506	ATC	3	9	287165	287173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601037
5508	NC_002506	ACT	2	6	287188	287193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601037
5509	NC_002506	TGA	2	6	287238	287243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
5510	NC_002506	CTCG	2	8	287288	287295	0 %	25 %	25 %	50 %	15601037
5511	NC_002506	GAT	2	6	287352	287357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
5512	NC_002506	GGC	2	6	287397	287402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601037
5513	NC_002506	TGG	2	6	287417	287422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601037
5514	NC_002506	G	6	6	287485	287490	0 %	0 %	100 %	0 %	15601037
5515	NC_002506	ACT	2	6	287603	287608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601037
5516	NC_002506	GCT	2	6	287628	287633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601037
5517	NC_002506	TTGA	2	8	287695	287702	25 %	50 %	25 %	0 %	15601037
5518	NC_002506	GCT	2	6	287723	287728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601037
5519	NC_002506	CAT	2	6	287754	287759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601037
5520	NC_002506	GAT	2	6	287794	287799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
5521	NC_002506	CGT	2	6	287851	287856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601037
5522	NC_002506	TGC	2	6	287946	287951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601037
5523	NC_002506	TGA	2	6	288065	288070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
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5526	NC_002506	GCAGT	2	10	288182	288191	20 %	20 %	40 %	20 %	15601037
5527	NC_002506	GCC	2	6	288202	288207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601037
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5529	NC_002506	TGCG	2	8	288284	288291	0 %	25 %	50 %	25 %	15601037
5530	NC_002506	C	6	6	288366	288371	0 %	0 %	0 %	100 %	15601037
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5532	NC_002506	TGA	2	6	288590	288595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
5533	NC_002506	TTC	2	6	288658	288663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_002506	TGAC	2	8	288665	288672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_002506	GTG	2	6	288682	288687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_002506	TGCT	2	8	288787	288794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_002506	CGT	2	6	288899	288904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601038
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5541	NC_002506	GCA	2	6	289280	289285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601038
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5549	NC_002506	A	6	6	289785	289790	100 %	0 %	0 %	0 %	15601038
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5554	NC_002506	TGGT	2	8	289976	289983	0 %	50 %	50 %	0 %	15601038
5555	NC_002506	GAT	2	6	290065	290070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5557	NC_002506	CAA	2	6	290142	290147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_002506	CGA	2	6	290148	290153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5564	NC_002506	CT	3	6	290559	290564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5596	NC_002506	ACG	2	6	292256	292261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5603	NC_002506	TGA	2	6	292679	292684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601043
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5605	NC_002506	TCT	2	6	292742	292747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_002506	CAC	2	6	292788	292793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5610	NC_002506	CAAT	2	8	293139	293146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5613	NC_002506	GAT	2	6	293317	293322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5615	NC_002506	TGG	2	6	293421	293426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_002506	CAT	2	6	294069	294074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5626	NC_002506	ATC	2	6	294191	294196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5758	NC_002506	AAC	2	6	300885	300890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601047
5759	NC_002506	TGA	2	6	300963	300968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601047
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5761	NC_002506	TTG	2	6	301010	301015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601047
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5766	NC_002506	A	6	6	301211	301216	100 %	0 %	0 %	0 %	15601047
5767	NC_002506	AAG	2	6	301277	301282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601047
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5773	NC_002506	GAA	2	6	301497	301502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601047
5774	NC_002506	ATT	2	6	301593	301598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601047
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5782	NC_002506	AGCG	2	8	302057	302064	25 %	0 %	50 %	25 %	15601048
5783	NC_002506	TGA	2	6	302073	302078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601048
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5786	NC_002506	CTCA	2	8	302234	302241	25 %	25 %	0 %	50 %	15601048
5787	NC_002506	ACT	2	6	302252	302257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601048
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5790	NC_002506	CGA	2	6	302356	302361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601048
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5792	NC_002506	CAT	2	6	302509	302514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601048
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5831	NC_002506	T	6	6	305274	305279	0 %	100 %	0 %	0 %	15601051
5832	NC_002506	GTA	2	6	305287	305292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601051
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5847	NC_002506	GAA	2	6	306176	306181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601052
5848	NC_002506	AAG	2	6	306234	306239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5849	NC_002506	ATTG	2	8	306303	306310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5850	NC_002506	T	6	6	306441	306446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5851	NC_002506	CA	3	6	306447	306452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5852	NC_002506	ATA	2	6	306485	306490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5853	NC_002506	TAT	2	6	306497	306502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601053
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5870	NC_002506	AAG	2	6	307366	307371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601053
5871	NC_002506	TGA	2	6	307384	307389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601053
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5874	NC_002506	TGCGTG	2	12	307615	307626	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15601053
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5878	NC_002506	CGTG	2	8	307920	307927	0 %	25 %	50 %	25 %	15601053
5879	NC_002506	TGA	2	6	308017	308022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601053
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5882	NC_002506	TTGG	2	8	308099	308106	0 %	50 %	50 %	0 %	15601053
5883	NC_002506	TGT	3	9	308120	308128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601053
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5997	NC_002506	GCG	2	6	313710	313715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5998	NC_002506	ATC	2	6	313735	313740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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