MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_002505	TGG	2	6	132392	132397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237027
2503	NC_002505	GAT	2	6	132415	132420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237027
2504	NC_002505	AGC	2	6	132512	132517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237027
2505	NC_002505	ATTG	2	8	132561	132568	25 %	50 %	25 %	0 %	471237027
2506	NC_002505	GCA	2	6	132655	132660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_002505	GA	3	6	132678	132683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_002505	GAT	2	6	132714	132719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_002505	GACC	2	8	132727	132734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_002505	TCA	2	6	132848	132853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640170
2511	NC_002505	GTT	2	6	132905	132910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640170
2512	NC_002505	CCA	2	6	132935	132940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640170
2513	NC_002505	TGC	2	6	132950	132955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640170
2514	NC_002505	GTT	2	6	133194	133199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640170
2515	NC_002505	TG	3	6	133225	133230	0 %	50 %	50 %	0 %	15640170
2516	NC_002505	T	6	6	133275	133280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_002505	GAA	2	6	133326	133331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_002505	AATG	2	8	133512	133519	50 %	25 %	25 %	0 %	15640171
2519	NC_002505	GCTT	2	8	133619	133626	0 %	50 %	25 %	25 %	15640171
2520	NC_002505	GGC	2	6	133680	133685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640171
2521	NC_002505	A	6	6	133699	133704	100 %	0 %	0 %	0 %	15640171
2522	NC_002505	AAT	2	6	133717	133722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640171
2523	NC_002505	CCT	2	6	133764	133769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_002505	CGC	2	6	133780	133785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_002505	T	6	6	133858	133863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_002505	GCT	2	6	133923	133928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_002505	AG	3	6	133938	133943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_002505	AGG	2	6	133951	133956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_002505	GTT	2	6	133981	133986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640173
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2533	NC_002505	GAT	2	6	134146	134151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640173
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2535	NC_002505	AAG	2	6	134217	134222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640173
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2539	NC_002505	A	6	6	134349	134354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_002505	T	6	6	134370	134375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_002505	CAT	2	6	134399	134404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237028
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2543	NC_002505	A	7	7	134507	134513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_002505	A	6	6	134562	134567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_002505	TATT	2	8	134668	134675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_002505	T	6	6	134693	134698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_002505	TTGT	2	8	134700	134707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_002505	GTT	2	6	134714	134719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_002505	TTA	2	6	134737	134742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_002505	GTTT	2	8	134745	134752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_002505	ATT	2	6	134795	134800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_002505	TGT	2	6	134805	134810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_002505	GTTG	2	8	134900	134907	0 %	50 %	50 %	0 %	15640174
2554	NC_002505	T	6	6	134915	134920	0 %	100 %	0 %	0 %	15640174
2555	NC_002505	T	7	7	134923	134929	0 %	100 %	0 %	0 %	15640174
2556	NC_002505	GTT	3	9	134930	134938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640174
2557	NC_002505	GTTTTT	2	12	134947	134958	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15640174
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2559	NC_002505	T	7	7	134990	134996	0 %	100 %	0 %	0 %	15640174
2560	NC_002505	TTTTG	2	10	134998	135007	0 %	80 %	20 %	0 %	15640174
2561	NC_002505	TTTG	2	8	135019	135026	0 %	75 %	25 %	0 %	15640174
2562	NC_002505	TGT	2	6	135036	135041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640174
2563	NC_002505	TTGGT	2	10	135043	135052	0 %	60 %	40 %	0 %	15640174
2564	NC_002505	TGG	2	6	135053	135058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640174
2565	NC_002505	TA	3	6	135101	135106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_002505	GGC	2	6	135186	135191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_002505	AAGC	2	8	135283	135290	50 %	0 %	25 %	25 %	15640175
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2572	NC_002505	ATC	2	6	135425	135430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640175
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2580	NC_002505	CGG	2	6	135875	135880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_002505	T	7	7	135881	135887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_002505	CAT	2	6	135889	135894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640176
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2584	NC_002505	ATG	2	6	136040	136045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640176
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2590	NC_002505	ATC	2	6	136267	136272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640177
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2592	NC_002505	TTGG	2	8	136497	136504	0 %	50 %	50 %	0 %	15640177
2593	NC_002505	CTT	2	6	136577	136582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640177
2594	NC_002505	TTTC	2	8	136604	136611	0 %	75 %	0 %	25 %	15640177
2595	NC_002505	GTC	2	6	136621	136626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640177
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2597	NC_002505	T	7	7	136711	136717	0 %	100 %	0 %	0 %	15640177
2598	NC_002505	TGGC	2	8	136728	136735	0 %	25 %	50 %	25 %	15640177
2599	NC_002505	T	6	6	136752	136757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_002505	A	6	6	136824	136829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_002505	T	6	6	136878	136883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_002505	AAT	2	6	136898	136903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_002505	A	7	7	136959	136965	100 %	0 %	0 %	0 %	15640178
2604	NC_002505	TTG	2	6	136976	136981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640178
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2608	NC_002505	ACCG	2	8	137200	137207	25 %	0 %	25 %	50 %	15640178
2609	NC_002505	GC	3	6	137219	137224	0 %	0 %	50 %	50 %	15640178
2610	NC_002505	CTT	2	6	137269	137274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640178
2611	NC_002505	TGA	3	9	137299	137307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640178
2612	NC_002505	GAA	2	6	137324	137329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640178
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2621	NC_002505	GGGT	2	8	137541	137548	0 %	25 %	75 %	0 %	15640178
2622	NC_002505	GCAAG	2	10	137590	137599	40 %	0 %	40 %	20 %	15640178
2623	NC_002505	TGC	2	6	137632	137637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640178
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2628	NC_002505	CAAAA	2	10	137795	137804	80 %	0 %	0 %	20 %	15640178
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2746	NC_002505	GA	3	6	143458	143463	50 %	0 %	50 %	0 %	15640184
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2750	NC_002505	TCG	2	6	143685	143690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640184
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2752	NC_002505	A	6	6	143827	143832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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