MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_002505	CAT	2	6	77620	77625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640111
1503	NC_002505	CAC	2	6	77697	77702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640111
1504	NC_002505	GTC	2	6	77704	77709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640111
1505	NC_002505	GCC	2	6	77802	77807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_002505	T	7	7	77840	77846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_002505	TGA	2	6	77864	77869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640112
1508	NC_002505	ATT	2	6	77890	77895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640112
1509	NC_002505	GCG	2	6	77905	77910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640112
1510	NC_002505	GCA	2	6	77923	77928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640112
1511	NC_002505	GGC	2	6	77931	77936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640112
1512	NC_002505	TGC	2	6	77957	77962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640112
1513	NC_002505	A	6	6	77974	77979	100 %	0 %	0 %	0 %	15640112
1514	NC_002505	GGT	2	6	78004	78009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640112
1515	NC_002505	CGG	2	6	78041	78046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640112
1516	NC_002505	ACT	2	6	78050	78055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640112
1517	NC_002505	AGC	2	6	78239	78244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640112
1518	NC_002505	ACC	2	6	78301	78306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640112
1519	NC_002505	TGG	2	6	78332	78337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640112
1520	NC_002505	CGG	2	6	78345	78350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640112
1521	NC_002505	GC	3	6	78516	78521	0 %	0 %	50 %	50 %	15640112
1522	NC_002505	AAG	2	6	78542	78547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640112
1523	NC_002505	TGC	2	6	78587	78592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640112
1524	NC_002505	ACC	2	6	78628	78633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640112
1525	NC_002505	GTT	2	6	78663	78668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640112
1526	NC_002505	AGT	2	6	78670	78675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640112
1527	NC_002505	AAG	2	6	78680	78685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640112
1528	NC_002505	TGG	2	6	78891	78896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640112
1529	NC_002505	GATG	2	8	78972	78979	25 %	25 %	50 %	0 %	15640112
1530	NC_002505	CTGG	2	8	78983	78990	0 %	25 %	50 %	25 %	15640112
1531	NC_002505	CGG	2	6	78993	78998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640112
1532	NC_002505	CTG	2	6	79098	79103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640113
1533	NC_002505	AAT	2	6	79119	79124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640113
1534	NC_002505	ATG	2	6	79168	79173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640113
1535	NC_002505	TGCG	2	8	79226	79233	0 %	25 %	50 %	25 %	15640113
1536	NC_002505	AACC	2	8	79315	79322	50 %	0 %	0 %	50 %	15640113
1537	NC_002505	GTG	2	6	79327	79332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640113
1538	NC_002505	CAG	2	6	79389	79394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640113
1539	NC_002505	CAG	2	6	79464	79469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640113
1540	NC_002505	CAG	2	6	79476	79481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640113
1541	NC_002505	CAC	3	9	79545	79553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640113
1542	NC_002505	GCC	2	6	79618	79623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640113
1543	NC_002505	AGC	2	6	79681	79686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640113
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1545	NC_002505	GTA	2	6	79746	79751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640113
1546	NC_002505	GCA	2	6	79801	79806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640113
1547	NC_002505	AAGCC	2	10	79925	79934	40 %	0 %	20 %	40 %	15640113
1548	NC_002505	CG	3	6	79944	79949	0 %	0 %	50 %	50 %	15640113
1549	NC_002505	TCAT	2	8	79954	79961	25 %	50 %	0 %	25 %	15640113
1550	NC_002505	CT	3	6	79969	79974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_002505	CAA	2	6	80014	80019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_002505	AGTG	2	8	80128	80135	25 %	25 %	50 %	0 %	15640114
1553	NC_002505	TGG	2	6	80162	80167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640114
1554	NC_002505	AGC	2	6	80172	80177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1555	NC_002505	CAA	2	6	80207	80212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640114
1556	NC_002505	AGC	2	6	80217	80222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1557	NC_002505	GCA	2	6	80239	80244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1558	NC_002505	CAG	2	6	80249	80254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1559	NC_002505	AGC	2	6	80262	80267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1560	NC_002505	GCA	2	6	80278	80283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1561	NC_002505	CAG	2	6	80405	80410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1562	NC_002505	GC	3	6	80434	80439	0 %	0 %	50 %	50 %	15640114
1563	NC_002505	AAG	2	6	80475	80480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640114
1564	NC_002505	TCA	2	6	80485	80490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640114
1565	NC_002505	GCA	2	6	80491	80496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1566	NC_002505	TGG	2	6	80499	80504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640114
1567	NC_002505	GCT	2	6	80524	80529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640114
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1569	NC_002505	CAC	2	6	80646	80651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640114
1570	NC_002505	AGC	2	6	80658	80663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
1571	NC_002505	A	6	6	80675	80680	100 %	0 %	0 %	0 %	15640114
1572	NC_002505	AAG	2	6	80775	80780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640114
1573	NC_002505	AGC	2	6	80817	80822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640114
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1575	NC_002505	AAAC	2	8	80965	80972	75 %	0 %	0 %	25 %	15640114
1576	NC_002505	ACTT	2	8	81066	81073	25 %	50 %	0 %	25 %	15640114
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1583	NC_002505	GC	3	6	81399	81404	0 %	0 %	50 %	50 %	15640114
1584	NC_002505	ATTG	2	8	81532	81539	25 %	50 %	25 %	0 %	15640114
1585	NC_002505	CAA	2	6	81548	81553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640114
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1588	NC_002505	AAT	2	6	81657	81662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_002505	CGTA	2	8	81732	81739	25 %	25 %	25 %	25 %	15640115
1590	NC_002505	CAT	2	6	81798	81803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640115
1591	NC_002505	GCG	2	6	81899	81904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640115
1592	NC_002505	GCG	2	6	82019	82024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640115
1593	NC_002505	GAA	2	6	82060	82065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640115
1594	NC_002505	TCTG	2	8	82109	82116	0 %	50 %	25 %	25 %	15640115
1595	NC_002505	CGG	2	6	82173	82178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640115
1596	NC_002505	ATG	2	6	82286	82291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640115
1597	NC_002505	GCTATC	2	12	82298	82309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15640115
1598	NC_002505	GCAT	2	8	82325	82332	25 %	25 %	25 %	25 %	15640115
1599	NC_002505	ATG	2	6	82357	82362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640115
1600	NC_002505	TTA	2	6	82389	82394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640115
1601	NC_002505	CGG	2	6	82404	82409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640115
1602	NC_002505	GCT	2	6	82446	82451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_002505	TTGC	2	8	82458	82465	0 %	50 %	25 %	25 %	15640116
1604	NC_002505	TCA	2	6	82522	82527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640116
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1607	NC_002505	AATC	2	8	82602	82609	50 %	25 %	0 %	25 %	15640116
1608	NC_002505	TCAG	2	8	82624	82631	25 %	25 %	25 %	25 %	15640116
1609	NC_002505	TGA	2	6	82642	82647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640116
1610	NC_002505	TTC	2	6	82696	82701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640116
1611	NC_002505	CAAG	2	8	82739	82746	50 %	0 %	25 %	25 %	15640116
1612	NC_002505	TGA	2	6	82798	82803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640116
1613	NC_002505	TGG	2	6	82855	82860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640116
1614	NC_002505	CA	3	6	82861	82866	50 %	0 %	0 %	50 %	15640116
1615	NC_002505	TCG	2	6	82891	82896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640116
1616	NC_002505	GC	3	6	82897	82902	0 %	0 %	50 %	50 %	15640116
1617	NC_002505	GCC	2	6	82970	82975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640116
1618	NC_002505	CAT	2	6	83153	83158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640117
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1620	NC_002505	GAT	2	6	83290	83295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640117
1621	NC_002505	CCG	2	6	83318	83323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640117
1622	NC_002505	CAAGC	2	10	83381	83390	40 %	0 %	20 %	40 %	15640117
1623	NC_002505	ATTG	2	8	83392	83399	25 %	50 %	25 %	0 %	15640117
1624	NC_002505	AAG	2	6	83400	83405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640117
1625	NC_002505	AC	3	6	83482	83487	50 %	0 %	0 %	50 %	15640117
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1627	NC_002505	GT	3	6	83886	83891	0 %	50 %	50 %	0 %	15640117
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1754	NC_002505	CGAA	2	8	90524	90531	50 %	0 %	25 %	25 %	15640124
1755	NC_002505	GATCA	2	10	90596	90605	40 %	20 %	20 %	20 %	15640124
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1757	NC_002505	T	6	6	90714	90719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1886	NC_002505	TTCGT	2	10	97648	97657	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1887	NC_002505	GCA	2	6	97714	97719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1888	NC_002505	GTT	2	6	97721	97726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1889	NC_002505	GCG	2	6	97920	97925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1993	NC_002505	ACAGC	2	10	104508	104517	40 %	0 %	20 %	40 %	15640140
1994	NC_002505	GGTAAG	2	12	104542	104553	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15640140
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1997	NC_002505	TTGA	2	8	104653	104660	25 %	50 %	25 %	0 %	15640140
1998	NC_002505	CGAAAT	2	12	104691	104702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15640140
1999	NC_002505	TGA	2	6	104744	104749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640140
2000	NC_002505	CGA	2	6	104751	104756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640140

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