MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002505	AC	3	6	49448	49453	50 %	0 %	0 %	50 %	15640083
1002	NC_002505	CTC	2	6	49464	49469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640084
1003	NC_002505	TCA	2	6	49532	49537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640084
1004	NC_002505	GAT	2	6	49557	49562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640084
1005	NC_002505	CAGA	2	8	49670	49677	50 %	0 %	25 %	25 %	15640084
1006	NC_002505	GCG	2	6	49723	49728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640084
1007	NC_002505	GCC	2	6	49752	49757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640084
1008	NC_002505	GAT	2	6	49767	49772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640084
1009	NC_002505	GAG	2	6	49823	49828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640084
1010	NC_002505	CTG	2	6	49886	49891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640084
1011	NC_002505	ATA	2	6	49930	49935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640084
1012	NC_002505	TTAT	2	8	49964	49971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_002505	CAAG	2	8	49976	49983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_002505	GCG	2	6	49991	49996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002505	T	7	7	50010	50016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002505	TGA	2	6	50044	50049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002505	GAA	2	6	50050	50055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_002505	TGG	2	6	50111	50116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640086
1019	NC_002505	ACA	2	6	50124	50129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640086
1020	NC_002505	TGCGC	2	10	50139	50148	0 %	20 %	40 %	40 %	15640086
1021	NC_002505	GTTTG	2	10	50184	50193	0 %	60 %	40 %	0 %	15640086
1022	NC_002505	TGC	2	6	50222	50227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640086
1023	NC_002505	AGC	2	6	50243	50248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640086
1024	NC_002505	GCTA	2	8	50281	50288	25 %	25 %	25 %	25 %	15640086
1025	NC_002505	GCCA	2	8	50385	50392	25 %	0 %	25 %	50 %	15640086
1026	NC_002505	CGTG	2	8	50439	50446	0 %	25 %	50 %	25 %	15640086
1027	NC_002505	ATC	2	6	50453	50458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640086
1028	NC_002505	CAA	2	6	50545	50550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640086
1029	NC_002505	GTA	2	6	50587	50592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640086
1030	NC_002505	GA	3	6	50681	50686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002505	AAGAT	2	10	50741	50750	60 %	20 %	20 %	0 %	15640087
1032	NC_002505	CAA	2	6	50755	50760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640087
1033	NC_002505	GTG	3	9	50831	50839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640087
1034	NC_002505	TGCC	2	8	50918	50925	0 %	25 %	25 %	50 %	15640087
1035	NC_002505	CGC	2	6	50959	50964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640087
1036	NC_002505	T	6	6	51040	51045	0 %	100 %	0 %	0 %	15640087
1037	NC_002505	TGG	2	6	51076	51081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640087
1038	NC_002505	TGG	3	9	51084	51092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640087
1039	NC_002505	TTG	2	6	51119	51124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640087
1040	NC_002505	CGG	2	6	51255	51260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640087
1041	NC_002505	T	6	6	51265	51270	0 %	100 %	0 %	0 %	15640087
1042	NC_002505	GAT	2	6	51271	51276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640087
1043	NC_002505	AATG	2	8	51280	51287	50 %	25 %	25 %	0 %	15640087
1044	NC_002505	TCG	2	6	51414	51419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640087
1045	NC_002505	AATC	2	8	51494	51501	50 %	25 %	0 %	25 %	15640087
1046	NC_002505	CAG	2	6	51761	51766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640088
1047	NC_002505	GTGC	2	8	51787	51794	0 %	25 %	50 %	25 %	15640088
1048	NC_002505	GGC	2	6	51814	51819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640088
1049	NC_002505	T	7	7	51826	51832	0 %	100 %	0 %	0 %	15640088
1050	NC_002505	AGG	2	6	51876	51881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640088
1051	NC_002505	GC	4	8	51910	51917	0 %	0 %	50 %	50 %	15640088
1052	NC_002505	A	6	6	51943	51948	100 %	0 %	0 %	0 %	15640088
1053	NC_002505	GAT	2	6	51953	51958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640088
1054	NC_002505	ACA	2	6	51975	51980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640088
1055	NC_002505	GCA	2	6	52015	52020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640088
1056	NC_002505	CGA	2	6	52038	52043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640088
1057	NC_002505	TTG	2	6	52046	52051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640088
1058	NC_002505	TGG	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640088
1059	NC_002505	GCG	2	6	52067	52072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640088
1060	NC_002505	TTA	2	6	52091	52096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640088
1061	NC_002505	CAG	2	6	52100	52105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640088
1062	NC_002505	ATG	2	6	52221	52226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640088
1063	NC_002505	ATC	2	6	52229	52234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640088
1064	NC_002505	ATG	2	6	52316	52321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640088
1065	NC_002505	ACA	2	6	52360	52365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640088
1066	NC_002505	GC	3	6	52371	52376	0 %	0 %	50 %	50 %	15640088
1067	NC_002505	CGAT	2	8	52380	52387	25 %	25 %	25 %	25 %	15640088
1068	NC_002505	TGT	2	6	52557	52562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640089
1069	NC_002505	T	6	6	52564	52569	0 %	100 %	0 %	0 %	15640089
1070	NC_002505	TGA	2	6	52661	52666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640089
1071	NC_002505	AGTG	2	8	52675	52682	25 %	25 %	50 %	0 %	15640089
1072	NC_002505	CT	3	6	52737	52742	0 %	50 %	0 %	50 %	15640089
1073	NC_002505	TGCT	2	8	52862	52869	0 %	50 %	25 %	25 %	15640090
1074	NC_002505	CAT	2	6	52948	52953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640090
1075	NC_002505	CGA	2	6	52993	52998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640090
1076	NC_002505	GCA	2	6	53026	53031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640090
1077	NC_002505	CAT	2	6	53053	53058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640090
1078	NC_002505	TGC	2	6	53177	53182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640090
1079	NC_002505	TCG	2	6	53205	53210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640090
1080	NC_002505	AGCAC	2	10	53232	53241	40 %	0 %	20 %	40 %	15640090
1081	NC_002505	TCA	2	6	53305	53310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640090
1082	NC_002505	GGTA	2	8	53333	53340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_002505	TAG	2	6	53341	53346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_002505	A	6	6	53410	53415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_002505	A	6	6	53548	53553	100 %	0 %	0 %	0 %	15640091
1086	NC_002505	ACA	2	6	53563	53568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640091
1087	NC_002505	GCC	2	6	53587	53592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640091
1088	NC_002505	TCT	2	6	53593	53598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640091
1089	NC_002505	AGA	2	6	53613	53618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640091
1090	NC_002505	CAAT	2	8	53640	53647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_002505	TG	3	6	53649	53654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_002505	TGA	2	6	53664	53669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_002505	TTAA	2	8	53754	53761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002505	A	6	6	53806	53811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002505	GGC	2	6	53853	53858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_002505	GCA	2	6	53884	53889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_002505	GCG	2	6	53917	53922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_002505	CGA	2	6	54092	54097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_002505	GAT	2	6	54117	54122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_002505	GCA	2	6	54166	54171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_002505	GAA	2	6	54225	54230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002505	GGT	2	6	54268	54273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_002505	AGA	2	6	54308	54313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_002505	CAG	2	6	54334	54339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_002505	GGT	2	6	54399	54404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_002505	G	6	6	54481	54486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_002505	GGC	2	6	54545	54550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_002505	GAA	2	6	54788	54793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_002505	TGC	2	6	54864	54869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_002505	GTC	2	6	54876	54881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_002505	TGG	2	6	54954	54959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_002505	GGA	2	6	54990	54995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002505	GAC	2	6	55003	55008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_002505	TCA	2	6	55015	55020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_002505	AC	3	6	55041	55046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_002505	CGT	2	6	55109	55114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_002505	AC	3	6	55210	55215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_002505	AAG	2	6	55246	55251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_002505	GGA	2	6	55270	55275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_002505	CCT	2	6	55351	55356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_002505	TGA	2	6	55373	55378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_002505	CA	3	6	55384	55389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_002505	GATT	2	8	55390	55397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_002505	GCATG	2	10	55450	55459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_002505	CCA	2	6	55491	55496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_002505	TCA	2	6	55536	55541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_002505	ACA	2	6	55580	55585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_002505	TTG	2	6	55591	55596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_002505	CAA	2	6	55634	55639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_002505	GTT	2	6	55745	55750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_002505	GAG	2	6	55993	55998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_002505	GTA	2	6	56020	56025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002505	GCG	2	6	56026	56031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_002505	G	6	6	56178	56183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_002505	TCC	2	6	56188	56193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_002505	CTGA	2	8	56208	56215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_002505	GTAC	2	8	56292	56299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_002505	GTG	2	6	56319	56324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_002505	GGA	2	6	56496	56501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_002505	TAC	2	6	56619	56624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_002505	AGTA	2	8	56694	56701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_002505	AC	3	6	56713	56718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_002505	CGTC	2	8	56731	56738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1144	NC_002505	AAC	2	6	56750	56755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1147	NC_002505	AAAG	2	8	56853	56860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_002505	AGTCG	2	10	56875	56884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1149	NC_002505	CCT	2	6	57055	57060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1155	NC_002505	GA	3	6	57417	57422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_002505	TTA	2	6	57544	57549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1165	NC_002505	GGT	2	6	58160	58165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_002505	CGG	2	6	58247	58252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_002505	CGT	2	6	58355	58360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1196	NC_002505	TTA	2	6	59967	59972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_002505	GATT	2	8	64349	64356	25 %	50 %	25 %	0 %	15640097
1266	NC_002505	CGA	2	6	64367	64372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640097
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1270	NC_002505	GCA	2	6	64684	64689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640097
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1288	NC_002505	TGA	2	6	66004	66009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640098
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1291	NC_002505	ACG	2	6	66280	66285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1292	NC_002505	TTTTC	2	10	66287	66296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1293	NC_002505	CCAG	2	8	66313	66320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1294	NC_002505	TTG	2	6	66349	66354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640099
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1372	NC_002505	ACC	2	6	71484	71489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1382	NC_002505	ATT	2	6	71852	71857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640104
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