MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002505	ATG	2	6	286635	286640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640309
5502	NC_002505	TTC	2	6	286665	286670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640309
5503	NC_002505	CTG	2	6	286728	286733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640309
5504	NC_002505	TGC	2	6	286738	286743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640309
5505	NC_002505	TGG	2	6	286843	286848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640309
5506	NC_002505	GCTG	2	8	286850	286857	0 %	25 %	50 %	25 %	15640309
5507	NC_002505	TCA	2	6	286888	286893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640309
5508	NC_002505	ATT	2	6	286902	286907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640309
5509	NC_002505	A	6	6	286923	286928	100 %	0 %	0 %	0 %	15640309
5510	NC_002505	CAA	2	6	286962	286967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640309
5511	NC_002505	AG	3	6	287061	287066	50 %	0 %	50 %	0 %	15640310
5512	NC_002505	T	6	6	287071	287076	0 %	100 %	0 %	0 %	15640310
5513	NC_002505	GT	3	6	287126	287131	0 %	50 %	50 %	0 %	15640310
5514	NC_002505	AGA	2	6	287139	287144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640310
5515	NC_002505	TGCA	2	8	287159	287166	25 %	25 %	25 %	25 %	15640310
5516	NC_002505	ACG	2	6	287186	287191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5517	NC_002505	GAT	2	6	287226	287231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640310
5518	NC_002505	GCG	2	6	287252	287257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640310
5519	NC_002505	TG	3	6	287291	287296	0 %	50 %	50 %	0 %	15640310
5520	NC_002505	TTC	2	6	287398	287403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640310
5521	NC_002505	CGA	2	6	287424	287429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5522	NC_002505	ATCA	2	8	287443	287450	50 %	25 %	0 %	25 %	15640310
5523	NC_002505	AGA	2	6	287514	287519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640310
5524	NC_002505	GCA	2	6	287585	287590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5525	NC_002505	CA	3	6	287681	287686	50 %	0 %	0 %	50 %	15640310
5526	NC_002505	AAG	2	6	287687	287692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640310
5527	NC_002505	CG	3	6	287706	287711	0 %	0 %	50 %	50 %	15640310
5528	NC_002505	CTT	2	6	287729	287734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640310
5529	NC_002505	TCG	2	6	287771	287776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5530	NC_002505	TGG	2	6	287810	287815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640310
5531	NC_002505	ATG	3	9	287848	287856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640310
5532	NC_002505	TGG	2	6	287910	287915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640310
5533	NC_002505	CTG	2	6	288025	288030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5534	NC_002505	ACA	2	6	288032	288037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640310
5535	NC_002505	CTG	2	6	288196	288201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5536	NC_002505	GCG	2	6	288202	288207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640310
5537	NC_002505	GAT	2	6	288222	288227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640310
5538	NC_002505	ATG	2	6	288274	288279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640310
5539	NC_002505	ACCTCA	2	12	288283	288294	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15640310
5540	NC_002505	ATG	2	6	288337	288342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640310
5541	NC_002505	TTC	2	6	288442	288447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640310
5542	NC_002505	TG	3	6	288450	288455	0 %	50 %	50 %	0 %	15640310
5543	NC_002505	ACC	2	6	288475	288480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640310
5544	NC_002505	TGA	2	6	288531	288536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640310
5545	NC_002505	CTG	2	6	288571	288576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5546	NC_002505	TGA	2	6	288648	288653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640310
5547	NC_002505	CTG	2	6	288691	288696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5548	NC_002505	TGC	2	6	288740	288745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5549	NC_002505	TGC	2	6	288800	288805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5550	NC_002505	TGC	2	6	288929	288934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640310
5551	NC_002505	TGGCA	2	10	288959	288968	20 %	20 %	40 %	20 %	15640310
5552	NC_002505	TGG	2	6	289013	289018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640310
5553	NC_002505	TCC	2	6	289050	289055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640310
5554	NC_002505	GACA	2	8	289089	289096	50 %	0 %	25 %	25 %	15640310
5555	NC_002505	GC	3	6	289142	289147	0 %	0 %	50 %	50 %	15640310
5556	NC_002505	AG	4	8	289283	289290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_002505	CT	4	8	289299	289306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_002505	T	6	6	289306	289311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_002505	CGT	2	6	289335	289340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_002505	GGC	2	6	289411	289416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640311
5561	NC_002505	GTGCT	2	10	289448	289457	0 %	40 %	40 %	20 %	15640311
5562	NC_002505	TCG	2	6	289487	289492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640311
5563	NC_002505	GTTG	2	8	289530	289537	0 %	50 %	50 %	0 %	15640311
5564	NC_002505	CTG	2	6	289582	289587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640311
5565	NC_002505	TGC	2	6	289622	289627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640311
5566	NC_002505	T	6	6	289663	289668	0 %	100 %	0 %	0 %	15640311
5567	NC_002505	CGC	2	6	289783	289788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640311
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5570	NC_002505	TGGC	2	8	289970	289977	0 %	25 %	50 %	25 %	15640311
5571	NC_002505	CGC	2	6	289996	290001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640311
5572	NC_002505	CTT	2	6	290031	290036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640311
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5574	NC_002505	TGC	2	6	290340	290345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640311
5575	NC_002505	CAAT	2	8	290367	290374	50 %	25 %	0 %	25 %	15640311
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5580	NC_002505	CAT	2	6	290688	290693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640311
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5582	NC_002505	AGT	2	6	290810	290815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640311
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5587	NC_002505	GTG	2	6	291091	291096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_002505	CAG	2	6	291133	291138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_002505	GC	3	6	291149	291154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_002505	TG	3	6	291206	291211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_002505	CGA	2	6	291228	291233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_002505	CCG	2	6	291381	291386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640312
5594	NC_002505	GCCA	2	8	291405	291412	25 %	0 %	25 %	50 %	15640312
5595	NC_002505	TGG	2	6	291534	291539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640312
5596	NC_002505	CG	3	6	291540	291545	0 %	0 %	50 %	50 %	15640312
5597	NC_002505	TGT	2	6	291575	291580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640312
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5599	NC_002505	CTGA	2	8	291665	291672	25 %	25 %	25 %	25 %	15640312
5600	NC_002505	TCAG	2	8	291683	291690	25 %	25 %	25 %	25 %	15640312
5601	NC_002505	GT	3	6	291716	291721	0 %	50 %	50 %	0 %	15640312
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5605	NC_002505	GGC	2	6	291822	291827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640312
5606	NC_002505	TTG	2	6	291839	291844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640312
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5608	NC_002505	TG	3	6	292006	292011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_002505	CTG	2	6	292012	292017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_002505	GTA	2	6	292029	292034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_002505	TGG	2	6	292130	292135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_002505	GTTG	2	8	292248	292255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_002505	GCC	2	6	292314	292319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_002505	GCT	2	6	292353	292358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_002505	AAT	2	6	292395	292400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_002505	CGG	2	6	292429	292434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_002505	GGT	2	6	292538	292543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_002505	CCA	3	9	292576	292584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_002505	TCT	2	6	292687	292692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_002505	GTG	2	6	292714	292719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_002505	ATC	2	6	292728	292733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_002505	CAATC	2	10	292754	292763	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5623	NC_002505	TTCGGT	2	12	292992	293003	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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5625	NC_002505	TTG	2	6	293034	293039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5874	NC_002505	TTCGT	2	10	307134	307143	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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