MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002505	TAAG	2	8	261888	261895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_002505	ATT	2	6	261993	261998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_002505	CAA	2	6	262002	262007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_002505	T	6	6	262058	262063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_002505	ATT	2	6	262072	262077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_002505	GTA	2	6	262088	262093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_002505	TAA	2	6	262104	262109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640284
5008	NC_002505	A	6	6	262108	262113	100 %	0 %	0 %	0 %	15640284
5009	NC_002505	ATTA	2	8	262126	262133	50 %	50 %	0 %	0 %	15640284
5010	NC_002505	TTAG	2	8	262312	262319	25 %	50 %	25 %	0 %	15640284
5011	NC_002505	ATC	2	6	262327	262332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640285
5012	NC_002505	GAC	2	6	262374	262379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640285
5013	NC_002505	AGC	2	6	262405	262410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640285
5014	NC_002505	AGC	2	6	262447	262452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640285
5015	NC_002505	AGA	2	6	262507	262512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640285
5016	NC_002505	AAG	2	6	262580	262585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640285
5017	NC_002505	A	7	7	262618	262624	100 %	0 %	0 %	0 %	15640285
5018	NC_002505	CT	3	6	262632	262637	0 %	50 %	0 %	50 %	15640285
5019	NC_002505	AGT	2	6	262732	262737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640286
5020	NC_002505	TTAA	2	8	262765	262772	50 %	50 %	0 %	0 %	15640286
5021	NC_002505	CGC	2	6	262815	262820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640286
5022	NC_002505	CAA	2	6	262898	262903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640286
5023	NC_002505	GTC	2	6	263000	263005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640286
5024	NC_002505	CTT	2	6	263337	263342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640286
5025	NC_002505	CAA	2	6	263401	263406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640286
5026	NC_002505	GGT	2	6	263464	263469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640286
5027	NC_002505	GCT	2	6	263643	263648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_002505	AAT	2	6	263730	263735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_002505	TCA	2	6	263750	263755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_002505	ATA	2	6	263815	263820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_002505	TCA	2	6	263826	263831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_002505	A	7	7	263842	263848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_002505	AGT	2	6	263901	263906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_002505	AT	3	6	263911	263916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_002505	CTA	2	6	263920	263925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_002505	ATATT	2	10	264017	264026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_002505	TGA	2	6	264074	264079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_002505	ATA	2	6	264090	264095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_002505	ATC	2	6	264137	264142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_002505	TAA	2	6	264161	264166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_002505	AAT	2	6	264216	264221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_002505	AT	3	6	264225	264230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_002505	AAC	2	6	264427	264432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237032
5044	NC_002505	ACT	2	6	264484	264489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237032
5045	NC_002505	AAT	2	6	264490	264495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471237032
5046	NC_002505	CTA	2	6	264621	264626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237032
5047	NC_002505	TGC	2	6	264724	264729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237032
5048	NC_002505	GTA	2	6	264754	264759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237032
5049	NC_002505	CAA	2	6	264771	264776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237032
5050	NC_002505	A	6	6	264782	264787	100 %	0 %	0 %	0 %	471237032
5051	NC_002505	TTA	2	6	264812	264817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471237032
5052	NC_002505	GGATA	2	10	264834	264843	40 %	20 %	40 %	0 %	471237032
5053	NC_002505	TCA	2	6	264851	264856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237032
5054	NC_002505	ATT	2	6	264869	264874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471237032
5055	NC_002505	TG	4	8	264910	264917	0 %	50 %	50 %	0 %	471237032
5056	NC_002505	A	6	6	264959	264964	100 %	0 %	0 %	0 %	471237032
5057	NC_002505	AAT	2	6	265009	265014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471237032
5058	NC_002505	AG	3	6	265060	265065	50 %	0 %	50 %	0 %	471237032
5059	NC_002505	TAATGG	2	12	265088	265099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237032
5060	NC_002505	T	7	7	265180	265186	0 %	100 %	0 %	0 %	471237032
5061	NC_002505	ATT	2	6	265193	265198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471237032
5062	NC_002505	AAT	2	6	265212	265217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471237032
5063	NC_002505	AAG	3	9	265218	265226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237032
5064	NC_002505	TA	3	6	265341	265346	50 %	50 %	0 %	0 %	471237032
5065	NC_002505	TTC	2	6	265496	265501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640289
5066	NC_002505	TC	3	6	265543	265548	0 %	50 %	0 %	50 %	15640289
5067	NC_002505	TCA	2	6	265617	265622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640289
5068	NC_002505	CTT	2	6	265623	265628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640289
5069	NC_002505	CGA	2	6	265681	265686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640289
5070	NC_002505	T	6	6	265841	265846	0 %	100 %	0 %	0 %	15640289
5071	NC_002505	GTA	2	6	265939	265944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640289
5072	NC_002505	GCTT	2	8	265960	265967	0 %	50 %	25 %	25 %	15640289
5073	NC_002505	T	6	6	266022	266027	0 %	100 %	0 %	0 %	15640289
5074	NC_002505	TTG	2	6	266076	266081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640289
5075	NC_002505	GCA	2	6	266133	266138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640289
5076	NC_002505	TGA	2	6	266157	266162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640289
5077	NC_002505	T	6	6	266174	266179	0 %	100 %	0 %	0 %	15640289
5078	NC_002505	TGC	2	6	266210	266215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640289
5079	NC_002505	T	7	7	266403	266409	0 %	100 %	0 %	0 %	15640289
5080	NC_002505	GCA	2	6	266499	266504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640289
5081	NC_002505	GA	3	6	266548	266553	50 %	0 %	50 %	0 %	15640289
5082	NC_002505	ATT	2	6	266591	266596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640289
5083	NC_002505	ACT	2	6	266651	266656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640289
5084	NC_002505	ATC	3	9	266702	266710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640289
5085	NC_002505	AAG	2	6	266712	266717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640289
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5087	NC_002505	TAA	2	6	266817	266822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640289
5088	NC_002505	ATAA	2	8	266885	266892	75 %	25 %	0 %	0 %	15640289
5089	NC_002505	GAAA	2	8	266920	266927	75 %	0 %	25 %	0 %	15640289
5090	NC_002505	ATG	2	6	266958	266963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640289
5091	NC_002505	GCAG	2	8	266988	266995	25 %	0 %	50 %	25 %	15640289
5092	NC_002505	CAT	2	6	266996	267001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640289
5093	NC_002505	ATAC	2	8	267020	267027	50 %	25 %	0 %	25 %	15640289
5094	NC_002505	AG	3	6	267046	267051	50 %	0 %	50 %	0 %	15640289
5095	NC_002505	TCA	2	6	267067	267072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640289
5096	NC_002505	GCA	2	6	267132	267137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640289
5097	NC_002505	CAT	2	6	267163	267168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640289
5098	NC_002505	ATG	2	6	267191	267196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640289
5099	NC_002505	AGC	2	6	267241	267246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_002505	CCAAC	2	10	267262	267271	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5101	NC_002505	ATG	2	6	267344	267349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_002505	CAA	2	6	267511	267516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640291
5103	NC_002505	GA	3	6	267568	267573	50 %	0 %	50 %	0 %	15640291
5104	NC_002505	AAGC	2	8	267697	267704	50 %	0 %	25 %	25 %	15640291
5105	NC_002505	CTG	2	6	267710	267715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640291
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5108	NC_002505	TTA	2	6	267853	267858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640291
5109	NC_002505	GCA	2	6	267865	267870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640291
5110	NC_002505	ATG	2	6	267946	267951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640291
5111	NC_002505	TTG	2	6	268047	268052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640291
5112	NC_002505	T	7	7	268079	268085	0 %	100 %	0 %	0 %	15640291
5113	NC_002505	ACG	2	6	268100	268105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640291
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5117	NC_002505	GC	3	6	268318	268323	0 %	0 %	50 %	50 %	15640291
5118	NC_002505	ATC	2	6	268347	268352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640291
5119	NC_002505	ATTTT	2	10	268386	268395	20 %	80 %	0 %	0 %	15640292
5120	NC_002505	TGT	2	6	268410	268415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640292
5121	NC_002505	ATTG	2	8	268432	268439	25 %	50 %	25 %	0 %	15640292
5122	NC_002505	TG	3	6	268438	268443	0 %	50 %	50 %	0 %	15640292
5123	NC_002505	A	6	6	268543	268548	100 %	0 %	0 %	0 %	15640292
5124	NC_002505	TGGT	2	8	268572	268579	0 %	50 %	50 %	0 %	15640292
5125	NC_002505	CTT	2	6	268581	268586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640292
5126	NC_002505	TGA	2	6	268627	268632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640292
5127	NC_002505	CTTG	2	8	268689	268696	0 %	50 %	25 %	25 %	15640292
5128	NC_002505	CAA	2	6	268703	268708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640292
5129	NC_002505	GAT	2	6	268831	268836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640292
5130	NC_002505	A	6	6	268852	268857	100 %	0 %	0 %	0 %	15640292
5131	NC_002505	TGG	2	6	269049	269054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_002505	ACA	2	6	269110	269115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640293
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5163	NC_002505	CAAG	2	8	270380	270387	50 %	0 %	25 %	25 %	15640293
5164	NC_002505	TCC	2	6	270469	270474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5165	NC_002505	ATCA	2	8	270509	270516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5166	NC_002505	TCCC	2	8	270534	270541	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5167	NC_002505	TCC	2	6	270635	270640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5168	NC_002505	C	6	6	270639	270644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5193	NC_002505	GC	3	6	271953	271958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5194	NC_002505	TAC	2	6	271961	271966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5228	NC_002505	CTGT	2	8	273623	273630	0 %	50 %	25 %	25 %	471237033
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5240	NC_002505	AGT	2	6	274320	274325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_002505	TTG	2	6	274352	274357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_002505	AGT	2	6	274372	274377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_002505	TAGG	2	8	274415	274422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_002505	T	7	7	274483	274489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_002505	AT	3	6	274501	274506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_002505	T	6	6	274529	274534	0 %	100 %	0 %	0 %	15640298
5249	NC_002505	GTT	2	6	274591	274596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640298
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5372	NC_002505	ATC	2	6	280914	280919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640305
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5376	NC_002505	GAA	2	6	281036	281041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640305
5377	NC_002505	CGG	2	6	281086	281091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640305
5378	NC_002505	GCCGAT	2	12	281141	281152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15640305
5379	NC_002505	CAG	2	6	281211	281216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640305
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5382	NC_002505	CCA	2	6	281319	281324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640305
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5398	NC_002505	CTT	2	6	281857	281862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640305
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5404	NC_002505	GCA	2	6	282063	282068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640305
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5466	NC_002505	CTT	2	6	285031	285036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5467	NC_002505	GC	3	6	285073	285078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5468	NC_002505	TC	3	6	285086	285091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5469	NC_002505	CTGA	2	8	285101	285108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5470	NC_002505	CTATGT	2	12	285133	285144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5471	NC_002505	GATG	2	8	285242	285249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5472	NC_002505	T	6	6	285306	285311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5473	NC_002505	CCTC	2	8	285321	285328	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5474	NC_002505	TC	3	6	285387	285392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5475	NC_002505	T	6	6	285407	285412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5476	NC_002505	TGG	2	6	285442	285447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5477	NC_002505	TCA	2	6	285485	285490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5479	NC_002505	T	7	7	285524	285530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5480	NC_002505	TCA	2	6	285651	285656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640309
5481	NC_002505	A	8	8	285662	285669	100 %	0 %	0 %	0 %	15640309
5482	NC_002505	GTG	2	6	285693	285698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640309
5483	NC_002505	ATG	2	6	285708	285713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640309
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5486	NC_002505	TTG	2	6	285790	285795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640309
5487	NC_002505	TAC	2	6	285915	285920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640309
5488	NC_002505	GCGATT	2	12	285945	285956	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15640309
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5491	NC_002505	CTTG	2	8	286058	286065	0 %	50 %	25 %	25 %	15640309
5492	NC_002505	TTGGT	2	10	286096	286105	0 %	60 %	40 %	0 %	15640309
5493	NC_002505	TTGG	2	8	286141	286148	0 %	50 %	50 %	0 %	15640309
5494	NC_002505	GC	3	6	286162	286167	0 %	0 %	50 %	50 %	15640309
5495	NC_002505	TCTG	2	8	286234	286241	0 %	50 %	25 %	25 %	15640309
5496	NC_002505	TTC	2	6	286274	286279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640309
5497	NC_002505	GGC	2	6	286403	286408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640309
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5499	NC_002505	A	6	6	286608	286613	100 %	0 %	0 %	0 %	15640309
5500	NC_002505	CTG	2	6	286617	286622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640309

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