MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NS_000191	GGTTT	2	10	819	828	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NS_000191	TCTTT	2	10	3202	3211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NS_000191	GTGTT	2	10	3472	3481	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NS_000191	GGTTT	2	10	3625	3634	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NS_000191	GGTTT	2	10	3691	3700	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NS_000191	GGTTT	2	10	3713	3722	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NS_000191	GATGT	2	10	6587	6596	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NS_000191	TCTTT	2	10	7179	7188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NS_000191	ATATA	2	10	8021	8030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NS_000191	CCCCT	2	10	12223	12232	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NS_000191	TATTT	2	10	15706	15715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NS_000191	ATTAT	2	10	17841	17850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NS_000191	TGGAA	2	10	18176	18185	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NS_000191	TACTT	2	10	18286	18295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NS_000191	AAATA	2	10	18592	18601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NS_000191	GAGTA	2	10	23945	23954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NS_000191	CAAAT	2	10	25977	25986	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NS_000191	AATAT	2	10	27047	27056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NS_000191	TATGA	2	10	27546	27555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NS_000191	TCAAA	2	10	31960	31969	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NS_000191	ATTTT	2	10	34914	34923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NS_000191	ATTTA	2	10	34954	34963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NS_000191	TTTTC	2	10	38707	38716	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NS_000191	TTCCT	2	10	39521	39530	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NS_000191	TTGAT	2	10	39791	39800	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NS_000191	TCTGT	2	10	40215	40224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NS_000191	AAATT	2	10	40333	40342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NS_000191	GCTTT	2	10	40821	40830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NS_000191	TATCG	2	10	42346	42355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NS_000191	CAATT	2	10	43446	43455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NS_000191	TCTCA	2	10	47133	47142	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NS_000191	TAAAA	2	10	47764	47773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NS_000191	TTTTA	2	10	47851	47860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NS_000191	TGTAT	2	10	53123	53132	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NS_000191	ATTTA	2	10	53144	53153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NS_000191	ATATA	2	10	53534	53543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NS_000191	GCTTA	2	10	54334	54343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NS_000191	AAAAT	2	10	58691	58700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NS_000191	ATTTT	2	10	64651	64660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NS_000191	AAAAC	2	10	66785	66794	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NS_000191	TGTTC	2	10	72211	72220	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NS_000191	CTTTA	2	10	80700	80709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NS_000191	TAAAT	2	10	87369	87378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NS_000191	AGTAA	2	10	87387	87396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NS_000191	TCAAT	2	10	87804	87813	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NS_000191	GTTAA	2	10	92467	92476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NS_000191	GAGAA	2	10	95572	95581	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NS_000191	TAAAT	2	10	97142	97151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NS_000191	TAATA	2	10	97474	97483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NS_000191	AAAAT	2	10	100864	100873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NS_000191	TACTA	2	10	107034	107043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NS_000191	AAATA	2	10	112452	112461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NS_000191	AATAA	2	10	112609	112618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NS_000191	AGTAA	2	10	112632	112641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NS_000191	ATTTT	2	10	113860	113869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NS_000191	GCTGA	2	10	113987	113996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NS_000191	GTTTT	2	10	118233	118242	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NS_000191	TTGAC	2	10	118860	118869	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NS_000191	ATATT	2	10	127949	127958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NS_000191	GACTT	2	10	127992	128001	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NS_000191	TCGTG	2	10	129321	129330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NS_000191	CATCC	2	10	132993	133002	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NS_000191	ATTTT	2	10	133752	133761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NS_000191	TTATT	2	10	144288	144297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NS_000191	TTAAT	2	10	149993	150002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NS_000191	TAAAA	2	10	151496	151505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NS_000191	TGAAA	2	10	155444	155453	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NS_000191	AGAAA	2	10	155892	155901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NS_000191	ATAAA	2	10	158517	158526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NS_000191	GGGAA	2	10	163044	163053	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NS_000191	ATAGG	2	10	163772	163781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NS_000191	AAATA	2	10	163788	163797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NS_000191	CATGC	2	10	169123	169132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NS_000191	AATGC	2	10	169382	169391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NS_000191	TTTGA	2	10	178912	178921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NS_000191	AGAGA	2	10	181803	181812	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NS_000191	GTTTT	2	10	184366	184375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NS_000191	ATTGT	2	10	185634	185643	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NS_000191	ATAAC	2	10	186042	186051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NS_000191	TGATT	2	10	189459	189468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NS_000191	AACCT	2	10	195388	195397	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NS_000191	TTTTC	2	10	198179	198188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NS_000191	TAAAA	2	10	203779	203788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NS_000191	AATTA	2	10	204267	204276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NS_000191	TCTTT	2	10	208583	208592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NS_000191	CAAAA	2	10	212930	212939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NS_000191	TAAAA	2	10	213171	213180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NS_000191	TATAT	2	10	213315	213324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NS_000191	TTAGT	2	10	216995	217004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NS_000191	CTTTA	2	10	224297	224306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NS_000191	AGAAA	2	10	225262	225271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NS_000191	ATGTT	2	10	225401	225410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NS_000191	GAAAT	2	10	228447	228456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NS_000191	AATAG	2	10	228842	228851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NS_000191	TGAAT	2	10	228941	228950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NS_000191	TTTCT	2	10	230359	230368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NS_000191	AAAAG	2	10	230436	230445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NS_000191	TTTTG	2	10	236875	236884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NS_000191	TAAAA	2	10	236988	236997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NS_000191	GGGAT	2	10	239021	239030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NS_000191	TGTTT	2	10	248933	248942	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NS_000191	TGCGG	2	10	258867	258876	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NS_000191	AAAGA	2	10	259366	259375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NS_000191	TTCCA	2	10	267922	267931	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NS_000191	AAAGA	2	10	270584	270593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NS_000191	TAAAA	2	10	271395	271404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NS_000191	TGATA	2	10	281070	281079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NS_000191	ATAAA	2	10	281262	281271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NS_000191	CGCAG	2	10	284326	284335	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NS_000191	AATTC	2	10	286425	286434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NS_000191	TTTTG	2	10	288163	288172	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NS_000191	ATACT	2	10	291466	291475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NS_000191	TATAA	2	10	293158	293167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NS_000191	TAAAA	2	10	296350	296359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NS_000191	CTTTT	2	10	303825	303834	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NS_000191	AAATC	2	10	334082	334091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NS_000191	CTGGT	2	10	335230	335239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NS_000191	AAATT	2	10	336986	336995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NS_000191	TTCTT	2	10	338727	338736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NS_000191	TATAA	2	10	343589	343598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NS_000191	AGTTT	2	10	343690	343699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NS_000191	TTGTT	2	10	347200	347209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NS_000191	AAGGG	2	10	349649	349658	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NS_000191	TTTTA	2	10	357452	357461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NS_000191	TTGAT	2	10	366950	366959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NS_000191	ATATG	2	10	367840	367849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NS_000191	GTTAG	2	10	368461	368470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NS_000191	AAGAA	2	10	368580	368589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NS_000191	GGATT	2	10	369139	369148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NS_000191	TTCTT	2	10	374776	374785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NS_000191	AAAAC	2	10	375921	375930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NS_000191	AAAAT	2	10	376695	376704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NS_000191	AAACA	2	10	376726	376735	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NS_000191	TAACC	2	10	377245	377254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NS_000191	ATTAA	2	10	377447	377456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NS_000191	TGTTT	2	10	385418	385427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NS_000191	GTGTT	2	10	388667	388676	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NS_000191	ATTTT	2	10	391216	391225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NS_000191	AAAAT	2	10	391436	391445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NS_000191	AAAGT	2	10	392958	392967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NS_000191	ATTTT	2	10	404608	404617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NS_000191	TAAAT	2	10	405656	405665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NS_000191	AAGAG	2	10	406848	406857	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NS_000191	TTTGT	2	10	407587	407596	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NS_000191	TAAAC	2	10	407999	408008	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NS_000191	GGTTC	2	10	411315	411324	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NS_000191	ATAAA	2	10	411378	411387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NS_000191	AATTT	2	10	412202	412211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NS_000191	TTTTA	2	10	413227	413236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.