MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17

Total Repeats: 9613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NS_000191	A	7	7	1111317	1111323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NS_000191	CTA	2	6	1111337	1111342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NS_000191	TAA	3	9	1111363	1111371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9504	NS_000191	T	6	6	1111373	1111378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9505	NS_000191	CAC	2	6	1111387	1111392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9506	NS_000191	A	6	6	1111442	1111447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9507	NS_000191	ATAA	2	8	1111481	1111488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9508	NS_000191	A	6	6	1111501	1111506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9509	NS_000191	A	7	7	1111527	1111533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9510	NS_000191	AACA	2	8	1111562	1111569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9511	NS_000191	AACG	2	8	1111579	1111586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9512	NS_000191	A	7	7	1111615	1111621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NS_000191	AAT	2	6	1111625	1111630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9514	NS_000191	T	8	8	1111680	1111687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9515	NS_000191	TTATA	2	10	1111695	1111704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9516	NS_000191	ATT	2	6	1111705	1111710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NS_000191	AAAT	2	8	1111712	1111719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9518	NS_000191	AT	3	6	1111718	1111723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9519	NS_000191	CTC	2	6	1111761	1111766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9520	NS_000191	TTTA	2	8	1111771	1111778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9521	NS_000191	CTC	2	6	1111782	1111787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9522	NS_000191	AGTC	2	8	1111802	1111809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9523	NS_000191	CAGG	2	8	1111865	1111872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9524	NS_000191	T	8	8	1111940	1111947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9525	NS_000191	TAC	2	6	1111950	1111955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9526	NS_000191	G	7	7	1111983	1111989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9527	NS_000191	TAA	2	6	1112006	1112011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9528	NS_000191	AAC	2	6	1112044	1112049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9529	NS_000191	T	7	7	1112117	1112123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9530	NS_000191	TAA	2	6	1112945	1112950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9531	NS_000191	GATA	2	8	1112966	1112973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9532	NS_000191	GACA	2	8	1112997	1113004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9533	NS_000191	CGC	2	6	1113007	1113012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9534	NS_000191	A	7	7	1113028	1113034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9535	NS_000191	CTTTT	2	10	1116892	1116901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9536	NS_000191	TCT	2	6	1116970	1116975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9537	NS_000191	AT	3	6	1116985	1116990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9538	NS_000191	TTTTA	2	10	1117067	1117076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9539	NS_000191	T	7	7	1117080	1117086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9540	NS_000191	TCG	2	6	1117162	1117167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NS_000191	GCA	2	6	1117250	1117255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NS_000191	TAT	2	6	1117268	1117273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9543	NS_000191	GCC	2	6	1117288	1117293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9544	NS_000191	T	8	8	1117304	1117311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9545	NS_000191	G	8	8	1117312	1117319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9546	NS_000191	TGCC	2	8	1117353	1117360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9547	NS_000191	CAT	2	6	1117414	1117419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9548	NS_000191	CAC	2	6	1117518	1117523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9549	NS_000191	TTA	2	6	1117542	1117547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9550	NS_000191	CTT	2	6	1117575	1117580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9551	NS_000191	CAT	2	6	1117587	1117592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9552	NS_000191	AT	4	8	1117591	1117598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NS_000191	TTA	2	6	1117658	1117663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9554	NS_000191	TG	3	6	1117692	1117697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9555	NS_000191	TCC	2	6	1117721	1117726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9556	NS_000191	CT	3	6	1117815	1117820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9557	NS_000191	TCTCT	2	10	1117830	1117839	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9558	NS_000191	CTT	2	6	1117843	1117848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NS_000191	TCC	2	6	1118206	1118211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NS_000191	GTGA	2	8	1118324	1118331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9561	NS_000191	TTG	2	6	1118332	1118337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9562	NS_000191	CAAT	2	8	1118452	1118459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9563	NS_000191	TTTCA	2	10	1118475	1118484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9564	NS_000191	ATTT	2	8	1118505	1118512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NS_000191	TA	3	6	1118548	1118553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9566	NS_000191	ATA	2	6	1118572	1118577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9567	NS_000191	ATTT	2	8	1118589	1118596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9568	NS_000191	CAAAAA	2	12	1118602	1118613	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9569	NS_000191	CAA	2	6	1118628	1118633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NS_000191	CAA	2	6	1118693	1118698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9571	NS_000191	CGAA	2	8	1118709	1118716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9572	NS_000191	A	6	6	1118719	1118724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9573	NS_000191	AC	3	6	1118733	1118738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9574	NS_000191	CTT	2	6	1118780	1118785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9575	NS_000191	TCG	2	6	1118792	1118797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NS_000191	GTT	3	9	1118821	1118829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9577	NS_000191	ACA	2	6	1118862	1118867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9578	NS_000191	A	6	6	1118867	1118872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9579	NS_000191	TAA	2	6	1118877	1118882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9580	NS_000191	T	6	6	1118884	1118889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9581	NS_000191	CAA	2	6	1118908	1118913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9582	NS_000191	CT	3	6	1118944	1118949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9583	NS_000191	CAAGA	2	10	1118983	1118992	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9584	NS_000191	A	6	6	1119006	1119011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9585	NS_000191	TA	3	6	1119151	1119156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9586	NS_000191	T	6	6	1119690	1119695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9587	NS_000191	CAG	2	6	1119703	1119708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9588	NS_000191	A	6	6	1119771	1119776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9589	NS_000191	GAA	2	6	1119791	1119796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9590	NS_000191	AGTAT	2	10	1121471	1121480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9591	NS_000191	A	6	6	1121503	1121508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9592	NS_000191	CGA	2	6	1121609	1121614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9593	NS_000191	TTG	2	6	1121688	1121693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9594	NS_000191	T	6	6	1121743	1121748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9595	NS_000191	TTCA	2	8	1121783	1121790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9596	NS_000191	GAA	2	6	1121853	1121858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9597	NS_000191	TGC	2	6	1121919	1121924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9598	NS_000191	ATTT	2	8	1121930	1121937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9599	NS_000191	CAG	2	6	1121940	1121945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9600	NS_000191	GCT	2	6	1122010	1122015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9601	NS_000191	TAT	3	9	1122022	1122030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9602	NS_000191	GCT	2	6	1122034	1122039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9603	NS_000191	A	6	6	1122064	1122069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NS_000191	ACTA	2	8	1122088	1122095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9605	NS_000191	TTGC	2	8	1122117	1122124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9606	NS_000191	AGA	2	6	1122132	1122137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9607	NS_000191	GAACAC	2	12	1122145	1122156	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9608	NS_000191	TC	3	6	1122227	1122232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9609	NS_000191	ACCG	2	8	1122282	1122289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9610	NS_000191	AGAA	2	8	1123721	1123728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9611	NS_000191	TCTGA	2	10	1124956	1124965	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9612	NS_000191	ATT	2	6	1125803	1125808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9613	NS_000191	TTG	2	6	1125814	1125819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.