MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Sulfuricurvum sp. RIFRC-1

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020505	TGAA	2	8	1391	1398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020505	AAAG	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020505	TCTT	2	8	12916	12923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020505	ATGG	2	8	14746	14753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020505	TAAA	2	8	15610	15617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020505	TCAT	2	8	25089	25096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020505	GATA	2	8	39843	39850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020505	ACAA	2	8	49698	49705	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020505	CAAT	2	8	59654	59661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020505	TTTC	2	8	60336	60343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020505	TTGA	2	8	61660	61667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020505	GGCA	2	8	68531	68538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020505	TCGT	2	8	68799	68806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020505	AGGG	2	8	73783	73790	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020505	CTTC	2	8	81086	81093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020505	AGAA	2	8	88655	88662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020505	AAAT	2	8	93880	93887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020505	ATTT	3	12	95819	95830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020505	TGAA	2	8	103185	103192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020505	ATCA	2	8	107326	107333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020505	GATT	2	8	110126	110133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020505	GGGT	2	8	110544	110551	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020505	CACT	2	8	129038	129045	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020505	GAGG	2	8	132415	132422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020505	AACT	2	8	136594	136601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020505	TGAT	2	8	155159	155166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020505	CTTC	2	8	156985	156992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020505	GAAA	2	8	167795	167802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020505	GGAT	2	8	170560	170567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020505	TAAA	2	8	170718	170725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020505	AAAT	2	8	171280	171287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020505	ATTT	2	8	178908	178915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020505	TTTA	2	8	178969	178976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020505	ATTT	2	8	187549	187556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020505	AGTT	2	8	210557	210564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020505	GTTT	2	8	217324	217331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020505	ATTA	2	8	240226	240233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020505	ATTT	2	8	245957	245964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020505	GTAT	2	8	248492	248499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020505	TTGG	3	12	249673	249684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020505	GTTA	2	8	288964	288971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020505	TTTG	2	8	290798	290805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020505	CGCC	2	8	297902	297909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_020505	CCAC	2	8	305586	305593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_020505	TCTT	2	8	306036	306043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020505	AGTG	2	8	310569	310576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020505	ACTT	2	8	317441	317448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020505	ATAA	2	8	346561	346568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020505	TTTC	2	8	348462	348469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020505	ATTA	2	8	359917	359924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020505	CAAT	2	8	371318	371325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020505	TTTC	2	8	377177	377184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020505	ATTT	2	8	377259	377266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020505	TCTT	2	8	381093	381100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020505	TGCT	2	8	386541	386548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020505	TTTA	2	8	398976	398983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020505	TTCA	2	8	399020	399027	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020505	GAAA	2	8	436130	436137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020505	AGTA	2	8	450603	450610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020505	CAAT	2	8	466050	466057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020505	ATTT	2	8	467401	467408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020505	TTTG	2	8	474171	474178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020505	ATTC	2	8	489469	489476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020505	AATT	2	8	514650	514657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020505	TTTG	2	8	517056	517063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020505	TAAA	2	8	523292	523299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020505	TAAG	2	8	550297	550304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020505	AAAG	2	8	564452	564459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020505	ATTT	2	8	565562	565569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020505	ATTT	2	8	566165	566172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020505	TTTC	2	8	576995	577002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020505	GAAT	2	8	577081	577088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020505	ATGT	2	8	577152	577159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020505	CATT	2	8	578696	578703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020505	ATTG	2	8	583415	583422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020505	GTTT	2	8	585803	585810	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020505	AAAG	2	8	616793	616800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020505	TTAT	2	8	620799	620806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020505	ATAA	2	8	622293	622300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020505	CGAA	2	8	625531	625538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020505	GGTA	2	8	625541	625548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020505	ATTT	2	8	641279	641286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020505	GGCT	2	8	642814	642821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020505	TTGC	2	8	644632	644639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020505	GACA	2	8	644735	644742	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020505	GGTG	2	8	645130	645137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020505	GGTG	2	8	645340	645347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020505	AATC	2	8	645352	645359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020505	AAAG	2	8	645475	645482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020505	GGTG	2	8	646023	646030	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020505	TCCC	2	8	646167	646174	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_020505	GACT	2	8	646744	646751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020505	AGAC	2	8	646755	646762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020505	TACG	2	8	647127	647134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020505	AATA	2	8	656606	656613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020505	GATG	2	8	657527	657534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020505	ATAA	2	8	671466	671473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020505	ATTT	2	8	671507	671514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020505	ATTT	2	8	702649	702656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020505	TGAA	2	8	718487	718494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020505	TTTC	2	8	738066	738073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020505	TGGA	2	8	752893	752900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020505	ATTT	2	8	761357	761364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020505	ATTT	2	8	761390	761397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020505	TCTG	2	8	774316	774323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020505	TATT	2	8	778933	778940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020505	CATA	2	8	786693	786700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020505	TTGG	2	8	793377	793384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020505	TTGG	2	8	794773	794780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020505	ATTC	2	8	797052	797059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020505	GTAA	2	8	800890	800897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020505	AGCA	2	8	804068	804075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020505	GAAA	2	8	804087	804094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020505	GAAA	2	8	805256	805263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020505	TAAA	2	8	814379	814386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020505	ACTT	2	8	815751	815758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020505	ACTA	2	8	843457	843464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020505	TTCA	2	8	854940	854947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020505	GTAA	2	8	855016	855023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020505	TCCG	2	8	858004	858011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020505	AAAT	2	8	860405	860412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020505	CATT	2	8	860498	860505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020505	TGGA	2	8	862471	862478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020505	TTGA	2	8	862538	862545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020505	CGGT	2	8	870159	870166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020505	AGGG	2	8	878748	878755	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020505	ATTA	2	8	880783	880790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020505	ATTG	2	8	882317	882324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020505	GTTT	2	8	882405	882412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020505	TTGA	2	8	885163	885170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020505	AAAG	2	8	889647	889654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020505	ATGC	2	8	893747	893754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020505	TAAT	2	8	895037	895044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020505	CTAT	2	8	896088	896095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020505	GAAG	2	8	896357	896364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020505	TAAT	2	8	911390	911397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020505	CAAA	2	8	928086	928093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020505	GGAT	2	8	928591	928598	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020505	GAAA	2	8	931881	931888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020505	TTAA	2	8	942482	942489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020505	TCGT	2	8	950383	950390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020505	GAAA	2	8	959539	959546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020505	TATG	2	8	967313	967320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020505	GTAT	2	8	967327	967334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020505	ATCA	2	8	986305	986312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020505	CGTA	2	8	990508	990515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020505	TTCG	2	8	991947	991954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020505	TTAA	2	8	994708	994715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020505	TAAA	2	8	997047	997054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020505	TTTA	2	8	999558	999565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020505	TAAT	2	8	999566	999573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.