MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 DNA

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020419	AGACAA	2	12	949	960	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020419	TAAAAA	2	12	2950	2961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020419	GATAAT	2	12	3001	3012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020419	AAGATA	2	12	6723	6734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020419	TTCAAC	2	12	6960	6971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020419	TAAAAG	2	12	12640	12651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020419	TGTTGA	2	12	18719	18730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020419	CAATAC	2	12	23812	23823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020419	TAGAAA	2	12	27158	27169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020419	ATGGGT	2	12	27330	27341	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020419	CTATAC	2	12	36558	36569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020419	TGTTTT	2	12	36633	36644	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020419	AACTAT	2	12	36874	36885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020419	TATTTT	2	12	38122	38133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020419	TTAATG	2	12	38830	38841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020419	ATTTTA	2	12	40668	40679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020419	AAATAA	2	12	47822	47833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020419	GATAAA	2	12	53491	53502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020419	TATATG	2	12	54350	54361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020419	ATAAAT	2	12	64044	64055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020419	GCGTTA	2	12	64464	64475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020419	GATAAA	2	12	64750	64761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020419	ATGAAA	2	12	65553	65564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020419	ACTTTA	2	12	66024	66035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020419	TTTCAG	2	12	66678	66689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020419	TGAAAT	2	12	67095	67106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020419	TTTTCT	2	12	79028	79039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020419	TCTACT	2	12	87094	87105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020419	TAAAAC	2	12	90105	90116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020419	AAGAAT	2	12	112021	112032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020419	AAAACA	2	12	112579	112590	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020419	TAAAAA	2	12	113019	113030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020419	ATTTTT	2	12	118474	118485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020419	CTTTTT	2	12	118816	118827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020419	ATTTTT	2	12	126466	126477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020419	TTATGT	2	12	128031	128042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020419	GGGAGA	2	12	128909	128920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020419	TAGAAG	2	12	130428	130439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020419	TGGAAG	2	12	133306	133317	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020419	TTATAC	2	12	133792	133803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020419	AATTCT	2	12	173919	173930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020419	ACAAAA	2	12	189104	189115	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020419	TAATAT	2	12	195776	195787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020419	ATTTTT	2	12	198049	198060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020419	TTGATA	2	12	213391	213402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020419	GAAGAG	2	12	226525	226536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020419	GGCTTT	2	12	236662	236673	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020419	AAAAGA	2	12	238690	238701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020419	CCAAAA	2	12	239407	239418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020419	TAGCAT	2	12	244933	244944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020419	TAAAAC	2	12	248330	248341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020419	TAGAAA	2	12	271813	271824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020419	AAAGAT	2	12	283397	283408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020419	TTTTAC	2	12	290166	290177	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020419	ATTGAA	2	12	295787	295798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020419	TATACT	2	12	306300	306311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020419	CAGTAG	2	12	337275	337286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020419	AATTGA	2	12	337772	337783	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020419	ATAGTT	2	12	344480	344491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020419	TGAAAG	2	12	351003	351014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020419	TATGAA	2	12	356324	356335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020419	ATTGTG	2	12	369783	369794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020419	AAAATA	2	12	374762	374773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020419	ATTTGT	2	12	377016	377027	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020419	GGAAAA	2	12	377308	377319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020419	CAGGTA	2	12	377869	377880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020419	CAGGTA	2	12	391621	391632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020419	TAAAAA	2	12	403821	403832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020419	TTAATC	2	12	409451	409462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020419	AAAAAT	2	12	412003	412014	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020419	AAAAAT	2	12	412780	412791	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020419	ATTCAA	2	12	413490	413501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020419	AAAGCA	2	12	413612	413623	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020419	TATTGA	2	12	414980	414991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020419	GAAGGC	2	12	418433	418444	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020419	GTATAG	2	12	421691	421702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020419	AAAACA	2	12	426332	426343	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020419	CGTTTA	2	12	428037	428048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020419	AAAAGT	2	12	428245	428256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020419	TTTACG	2	12	428593	428604	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020419	TGTTTT	2	12	428796	428807	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020419	AGATAA	2	12	432194	432205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020419	GAAAAA	2	12	432360	432371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020419	GATACT	2	12	436363	436374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020419	TGGTTT	2	12	438259	438270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020419	TGGACT	2	12	441857	441868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020419	ATTTAA	2	12	448216	448227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020419	TATTTT	2	12	454195	454206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020419	CGATAA	2	12	454235	454246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020419	TTCGGC	2	12	454939	454950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020419	AAGTGT	2	12	458001	458012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020419	AGAAAA	2	12	458094	458105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020419	TGCTGG	2	12	458304	458315	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020419	TCTTTC	2	12	460309	460320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020419	AGCTTA	2	12	467582	467593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020419	AAAATA	2	12	467686	467697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020419	GATAAA	2	12	468304	468315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020419	AAAATA	2	12	469964	469975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020419	TAGTAT	2	12	478572	478583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020419	ATTGAC	2	12	479683	479694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020419	CAGACT	2	12	484105	484116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020419	AATAAA	2	12	486817	486828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020419	AGAATA	2	12	499441	499452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020419	ACGAGT	2	12	503932	503943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020419	AATAAA	2	12	510042	510053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020419	CAAATA	2	12	512703	512714	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020419	AATTTT	2	12	517422	517433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020419	CTTATG	2	12	518072	518083	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020419	ATGAAT	2	12	523694	523705	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020419	AAAGTC	2	12	528832	528843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020419	AGAAAC	2	12	530171	530182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020419	CAGACA	2	12	535732	535743	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020419	TTCTAT	2	12	538851	538862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020419	GATTTC	2	12	547838	547849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020419	TGAAAG	2	12	557898	557909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020419	ATAGAA	2	12	574559	574570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020419	TTAACT	2	12	584800	584811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020419	GATATA	2	12	588510	588521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020419	AAATGC	2	12	588692	588703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020419	TTATGA	2	12	589980	589991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020419	TTATAT	2	12	593826	593837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020419	ATACAA	2	12	608716	608727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020419	ATTTTA	2	12	609035	609046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020419	ATAAAA	2	12	624120	624131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020419	GTGCCT	2	12	625487	625498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020419	AAAAGG	2	12	626467	626478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020419	TAAAAT	2	12	646975	646986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020419	TGAAAT	2	12	647367	647378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020419	TATTGC	2	12	651347	651358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020419	TTTTAA	2	12	653230	653241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020419	ATTTAT	2	12	658544	658555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020419	ATTATA	2	12	658573	658584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020419	TAATTT	2	12	658696	658707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.