MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011374	TAAAT	2	10	1878	1887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011374	TTATT	3	15	1910	1924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011374	TATAA	2	10	7887	7896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011374	TTTTA	2	10	9099	9108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011374	AAAAT	2	10	28073	28082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011374	ACAAA	2	10	36537	36546	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011374	ATATT	2	10	37592	37601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011374	TTTTA	2	10	37680	37689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011374	TTATT	2	10	42511	42520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011374	AAATT	2	10	87098	87107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011374	AATAT	2	10	89257	89266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011374	TTATA	2	10	91626	91635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011374	ATATT	2	10	102598	102607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011374	TAAAA	2	10	102662	102671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011374	ATAGG	2	10	109389	109398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011374	TAAAA	2	10	112977	112986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011374	TAGAT	2	10	114175	114184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011374	CTAAA	2	10	114270	114279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011374	AAAAT	2	10	115052	115061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011374	TTTTA	2	10	119047	119056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011374	TATTT	2	10	120513	120522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011374	AATTA	2	10	124808	124817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011374	TGTTT	2	10	128041	128050	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011374	ATTTT	2	10	137014	137023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011374	TATTT	2	10	140766	140775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011374	TATAT	2	10	149166	149175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011374	TCGTG	2	10	150471	150480	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011374	GTGAA	2	10	151409	151418	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011374	GAAAA	2	10	151437	151446	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011374	GAATG	2	10	153636	153645	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011374	CTCAT	2	10	153741	153750	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011374	TAAAA	2	10	165706	165715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011374	TTTTA	2	10	191955	191964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011374	AAACC	2	10	192308	192317	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011374	TAAAA	2	10	218654	218663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011374	TTAAT	2	10	219604	219613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011374	TTATA	3	15	240194	240208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011374	TAAAT	2	10	240958	240967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011374	TAAAT	2	10	241200	241209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011374	TAATA	2	10	243359	243368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011374	TAATA	2	10	249663	249672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011374	AAAAT	2	10	255376	255385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011374	TAATT	2	10	282311	282320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011374	TAAAA	2	10	285276	285285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011374	AATAT	2	10	288457	288466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011374	ATTAT	2	10	298212	298221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011374	AAATA	2	10	305103	305112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011374	CAAAT	2	10	305684	305693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011374	TAAAA	2	10	313350	313359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011374	GTTTT	2	10	338180	338189	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011374	TAAAT	2	10	338503	338512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011374	TCGTG	2	10	342991	343000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011374	GTGAA	2	10	343930	343939	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011374	GAAAA	2	10	343958	343967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011374	GAATG	2	10	346157	346166	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011374	CTCAT	2	10	346262	346271	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011374	TTTAA	2	10	348061	348070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011374	TAATA	2	10	350042	350051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011374	AGCAT	2	10	353726	353735	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011374	AAATT	2	10	353906	353915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011374	AGAAC	2	10	353968	353977	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011374	ATTAT	2	10	357304	357313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011374	AAATG	2	10	363267	363276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011374	TATTT	2	10	374471	374480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011374	ATTAA	2	10	377078	377087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011374	TTTTA	2	10	381986	381995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011374	AAATT	2	10	384785	384794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011374	TTATT	2	10	390527	390536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011374	TAATA	2	10	390587	390596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011374	AGAAA	2	10	399507	399516	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011374	AATTA	2	10	399915	399924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011374	TATTT	2	10	420760	420769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011374	AAATT	2	10	420874	420883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011374	TCTAA	2	10	428576	428585	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011374	TAATT	2	10	428967	428976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011374	TTGAT	2	10	429012	429021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011374	ATATA	2	10	430626	430635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011374	TCTTA	2	10	430698	430707	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011374	TAAAC	2	10	430907	430916	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011374	TATTT	2	10	445126	445135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011374	TATGA	2	10	452025	452034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011374	AATTT	2	10	456873	456882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011374	ATTTT	2	10	460869	460878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011374	TAAAT	2	10	460879	460888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011374	ATTAA	2	10	470113	470122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011374	CATTA	2	10	470197	470206	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011374	TAGTT	2	10	493190	493199	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011374	ATGTT	2	10	494796	494805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011374	ATATT	2	10	503667	503676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011374	AAATA	2	10	523153	523162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011374	ATTGA	2	10	525515	525524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011374	ATTTT	2	10	529377	529386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011374	CAAAA	2	10	552228	552237	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011374	TTAAT	2	10	560794	560803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011374	ATTAT	2	10	560809	560818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011374	TAAAT	2	10	560881	560890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011374	CAATT	2	10	561825	561834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011374	AAACT	2	10	566660	566669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011374	ATTTT	2	10	567229	567238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011374	ATTTC	2	10	598689	598698	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011374	GTTTT	2	10	607325	607334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011374	TTATT	2	10	607371	607380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011374	TGTTT	2	10	607424	607433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011374	TAATT	2	10	610025	610034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011374	CTTAA	2	10	610610	610619	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011374	TTTAG	2	10	611804	611813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011374	TTTAA	2	10	612152	612161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011374	AAATT	2	10	613644	613653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011374	TAAAT	2	10	619951	619960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011374	ATTTT	2	10	620270	620279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011374	TTCAC	2	10	620882	620891	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_011374	ATTTA	2	10	620998	621007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011374	ATATA	2	10	621067	621076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011374	TAAAT	2	10	621100	621109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011374	TTTAA	2	10	621260	621269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011374	TGGTT	2	10	622091	622100	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011374	TAATT	2	10	623200	623209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011374	CTAAT	2	10	623348	623357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011374	AATTT	2	10	625314	625323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011374	AATTT	2	10	625388	625397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011374	TAAAA	2	10	642850	642859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011374	GCAAA	2	10	651360	651369	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011374	TTAAA	2	10	654266	654275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011374	AATTT	2	10	654372	654381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011374	CAAAC	2	10	657038	657047	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_011374	AAATA	2	10	677161	677170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011374	ATTTA	2	10	678944	678953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011374	TAAAT	2	10	679046	679055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011374	TTTAA	2	10	679197	679206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011374	ATTTT	2	10	679343	679352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011374	ATTTA	2	10	679545	679554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011374	TTAAT	2	10	679625	679634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011374	TAATT	2	10	680704	680713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011374	TTTGA	2	10	680815	680824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011374	TAAAT	2	10	681509	681518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011374	TCTTT	2	10	691624	691633	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011374	AAATT	2	10	695314	695323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011374	ACTTA	2	10	700513	700522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011374	TAAAA	2	10	701920	701929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011374	AAACA	2	10	705704	705713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011374	TTATA	2	10	707235	707244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011374	AATTC	2	10	722541	722550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011374	TAAAA	2	10	732583	732592	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011374	ATTTT	2	10	740504	740513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011374	ATTTT	2	10	744154	744163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011374	GTTTT	2	10	754102	754111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011374	TTAAA	2	10	770557	770566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011374	AGTTT	2	10	771905	771914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_011374	ATTAA	2	10	863755	863764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.