MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 DNA

Total Repeats: 566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020419	AGACAA	2	12	949	960	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020419	ATAAAA	2	12	1339	1350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485004
3	NC_020419	TAAAAA	2	12	2950	2961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020419	GATAAT	2	12	3001	3012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020419	ACGACA	2	12	6487	6498	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485006
6	NC_020419	AAGATA	2	12	6723	6734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020419	TTCAAC	2	12	6960	6971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020419	GGCGTA	2	12	10041	10052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189485008
9	NC_020419	AAAAGA	2	12	10424	10435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485008
10	NC_020419	TAAAAG	2	12	12640	12651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020419	TTTCAG	2	12	13565	13576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485009
12	NC_020419	CAAAAG	2	12	16451	16462	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485010
13	NC_020419	TGTTGA	2	12	18719	18730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020419	TTTGTA	2	12	21151	21162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485011
15	NC_020419	CTTTAA	2	12	22164	22175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485011
16	NC_020419	TTTTAA	2	12	22396	22407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485011
17	NC_020419	CAATAC	2	12	23812	23823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020419	TAGAAA	2	12	27158	27169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020419	ATGGGT	2	12	27330	27341	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020419	GTTTTT	2	12	28390	28401	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189485015
21	NC_020419	GAAAAA	2	12	33931	33942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485019
22	NC_020419	CTATAC	2	12	36558	36569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020419	TGTTTT	2	12	36633	36644	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020419	AACTAT	2	12	36874	36885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020419	TATTTT	2	12	38122	38133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020419	TTAATG	2	12	38830	38841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020419	ATTTTA	2	12	40668	40679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020419	TTTTAA	2	12	42834	42845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485020
29	NC_020419	AAATAA	2	12	47822	47833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020419	GATAAA	2	12	53491	53502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020419	TATATG	2	12	54350	54361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020419	GCTTAT	2	12	54918	54929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485030
33	NC_020419	ATAAAA	2	12	55383	55394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485030
34	NC_020419	TTTAAA	2	12	61187	61198	50 %	50 %	0 %	0 %	189485036
35	NC_020419	GAAGCA	2	12	61984	61995	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189485037
36	NC_020419	ATAAAT	2	12	64044	64055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020419	GCGTTA	2	12	64464	64475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020419	GATAAA	2	12	64750	64761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020419	ATGAAA	2	12	65553	65564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020419	ACTTTA	2	12	66024	66035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020419	TTTCAG	2	12	66678	66689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020419	TGAAAT	2	12	67095	67106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020419	AAAATA	2	12	70328	70339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485039
44	NC_020419	AAGACA	2	12	74175	74186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485040
45	NC_020419	GAAGCT	2	12	75245	75256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485041
46	NC_020419	GTTCCT	2	12	75452	75463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189485041
47	NC_020419	AAAAGC	2	12	77358	77369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485042
48	NC_020419	TTTTCT	2	12	79028	79039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020419	CTTGTT	2	12	79787	79798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189485043
50	NC_020419	CATAAG	2	12	81389	81400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485044
51	NC_020419	TTATAT	2	12	82115	82126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485044
52	NC_020419	TGCCGC	2	12	82247	82258	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189485044
53	NC_020419	CCCAAG	2	12	86457	86468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189485045
54	NC_020419	TCTACT	2	12	87094	87105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020419	TAAAAC	2	12	90105	90116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020419	AATTTT	2	12	90124	90135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485047
57	NC_020419	TTTAAA	2	12	90959	90970	50 %	50 %	0 %	0 %	189485047
58	NC_020419	TTAGAG	2	12	98025	98036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485055
59	NC_020419	ATATTG	2	12	99517	99528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485057
60	NC_020419	AAATAA	2	12	102532	102543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485059
61	NC_020419	AGACAT	2	12	104677	104688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485059
62	NC_020419	TAAAAA	2	12	106024	106035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485060
63	NC_020419	ATATTG	2	12	107154	107165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485062
64	NC_020419	AGGCAT	2	12	108074	108085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485063
65	NC_020419	GTTTTA	2	12	108663	108674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485063
66	NC_020419	TATGAA	2	12	109423	109434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485064
67	NC_020419	AAGAAT	2	12	112021	112032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020419	AAAACA	2	12	112579	112590	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020419	TAAAAA	2	12	113019	113030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020419	TCAATA	2	12	115345	115356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485066
71	NC_020419	ATTTTT	2	12	118474	118485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020419	CTTTTT	2	12	118816	118827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020419	TTTTAT	2	12	122120	122131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485071
74	NC_020419	ATTTTT	2	12	126466	126477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020419	TTATGT	2	12	128031	128042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020419	GGGAGA	2	12	128909	128920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020419	TAGAAG	2	12	130428	130439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020419	TGGAAG	2	12	133306	133317	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020419	TTATAC	2	12	133792	133803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020419	GGGGCT	2	12	135095	135106	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189485076
81	NC_020419	GCAAAA	2	12	138072	138083	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485077
82	NC_020419	GAAAAA	2	12	138195	138206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485077
83	NC_020419	GCTAAA	2	12	138543	138554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485077
84	NC_020419	TATTTC	2	12	141646	141657	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485078
85	NC_020419	CAAAAA	2	12	141708	141719	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485078
86	NC_020419	TTAAAG	2	12	143403	143414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485078
87	NC_020419	CCGGTT	2	12	146676	146687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485082
88	NC_020419	GAGAGT	2	12	148282	148293	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189485083
89	NC_020419	AAGCAA	2	12	152782	152793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485090
90	NC_020419	AGTAAA	2	12	154759	154770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485094
91	NC_020419	AAATTG	2	12	156853	156864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485099
92	NC_020419	GTTTTA	2	12	160261	160272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485104
93	NC_020419	AGATAT	2	12	161698	161709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485106
94	NC_020419	GACCCG	2	12	164079	164090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189485110
95	NC_020419	GAAAAA	2	12	164332	164343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485111
96	NC_020419	TTTAAA	2	12	165202	165213	50 %	50 %	0 %	0 %	189485112
97	NC_020419	AATTCT	2	12	173919	173930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020419	AAAATA	2	12	178993	179004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485123
99	NC_020419	TGCGAC	2	12	180092	180103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485124
100	NC_020419	CAAAAA	2	12	184052	184063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485127
101	NC_020419	AAAAAT	2	12	185139	185150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485128
102	NC_020419	ACAAAA	2	12	189104	189115	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020419	TTTTAA	2	12	190559	190570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485130
104	NC_020419	TAAAAA	2	12	191950	191961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485130
105	NC_020419	TCCCTA	2	12	192329	192340	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485130
106	NC_020419	TAATAT	2	12	195776	195787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020419	CTTTTT	2	12	197679	197690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485133
108	NC_020419	ATTTTT	2	12	198049	198060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020419	TTACGT	2	12	199112	199123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485134
110	NC_020419	CTTTTT	2	12	201953	201964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485136
111	NC_020419	TTTTTC	2	12	203191	203202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485137
112	NC_020419	AATTTC	2	12	207664	207675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485138
113	NC_020419	TATTTT	2	12	209061	209072	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485139
114	NC_020419	TCAAAT	2	12	210794	210805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485139
115	NC_020419	AAAGAT	2	12	211656	211667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485139
116	NC_020419	GTTTTC	2	12	211975	211986	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189485140
117	NC_020419	TTGATA	2	12	213391	213402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020419	TAATTT	2	12	215826	215837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485142
119	NC_020419	TAAATT	2	12	217268	217279	50 %	50 %	0 %	0 %	189485143
120	NC_020419	TGCTAT	2	12	217807	217818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485144
121	NC_020419	TGCAGC	2	12	219479	219490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485146
122	NC_020419	TTAACA	2	12	221072	221083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485147
123	NC_020419	GAAGAG	2	12	226525	226536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020419	ATTAGG	2	12	229404	229415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485153
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243	NC_020419	AAAAGT	2	12	428245	428256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_020419	TGTTTT	2	12	428796	428807	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_020419	TACCAA	2	12	651517	651528	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189485451
363	NC_020419	TTTTAA	2	12	653230	653241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
364	NC_020419	ATTTAT	2	12	658544	658555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
365	NC_020419	ATTATA	2	12	658573	658584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
366	NC_020419	TAATTT	2	12	658696	658707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
367	NC_020419	TCATTT	2	12	659137	659148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485455
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370	NC_020419	TCATAA	2	12	665788	665799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
371	NC_020419	TTTGAT	2	12	666122	666133	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485460
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381	NC_020419	TTTTCT	2	12	687694	687705	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
382	NC_020419	TTGCAA	2	12	689135	689146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
383	NC_020419	ATTTTT	2	12	691268	691279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_020419	TATTTG	2	12	695191	695202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485482
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391	NC_020419	ATAAGA	2	12	715742	715753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485493
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398	NC_020419	GCTGGA	2	12	732041	732052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189485504
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401	NC_020419	TTTTAT	2	12	739090	739101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_020419	TCATAT	2	12	742387	742398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485511
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462	NC_020419	CTTTAA	2	12	896961	896972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485613
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470	NC_020419	ATTTGT	2	12	918125	918136	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485626
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