MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021508	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021508	G	6	6	8819	8824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021508	T	6	6	9669	9674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021508	A	7	7	10331	10337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021508	A	6	6	10352	10357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021508	T	6	6	12435	12440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021508	G	7	7	12477	12483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021508	T	7	7	13929	13935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021508	G	6	6	24743	24748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021508	A	6	6	24823	24828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021508	G	6	6	24870	24875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021508	A	6	6	25008	25013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021508	G	6	6	29055	29060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021508	C	10	10	34074	34083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_021508	T	9	9	38243	38251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021508	T	6	6	42892	42897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021508	A	6	6	55535	55540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021508	A	6	6	57925	57930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021508	T	6	6	59479	59484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021508	T	10	10	64080	64089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021508	G	7	7	71775	71781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021508	T	6	6	72338	72343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021508	G	9	9	72679	72687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021508	T	6	6	73397	73402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021508	C	6	6	73841	73846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_021508	T	6	6	78576	78581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021508	T	6	6	78597	78602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021508	T	6	6	90649	90654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021508	T	6	6	91101	91106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021508	G	6	6	91157	91162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021508	A	6	6	93055	93060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021508	C	10	10	94721	94730	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_021508	A	6	6	111764	111769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021508	T	6	6	113747	113752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021508	G	6	6	121980	121985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021508	A	6	6	122150	122155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021508	A	6	6	122210	122215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021508	C	9	9	122230	122238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_021508	T	6	6	132833	132838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021508	C	8	8	136737	136744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_021508	C	11	11	140949	140959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_021508	A	6	6	142975	142980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021508	C	10	10	148350	148359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_021508	C	9	9	154190	154198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_021508	A	6	6	169727	169732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021508	T	8	8	170150	170157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021508	T	6	6	170296	170301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021508	T	7	7	182519	182525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021508	T	6	6	191220	191225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021508	G	6	6	192131	192136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021508	T	6	6	195572	195577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021508	A	6	6	196456	196461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021508	G	8	8	208627	208634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021508	A	6	6	219146	219151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021508	T	6	6	230249	230254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021508	A	6	6	233946	233951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021508	T	6	6	244334	244339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021508	T	8	8	246528	246535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021508	G	6	6	246772	246777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021508	T	7	7	254659	254665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021508	T	8	8	259067	259074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021508	G	7	7	275796	275802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021508	G	6	6	275807	275812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021508	T	6	6	275857	275862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021508	T	7	7	276887	276893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021508	C	6	6	278069	278074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_021508	A	6	6	282391	282396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021508	A	7	7	287264	287270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021508	T	6	6	299140	299145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021508	T	6	6	304970	304975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021508	T	6	6	305857	305862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021508	G	6	6	312317	312322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021508	T	6	6	323915	323920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021508	T	6	6	326757	326762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021508	T	7	7	326772	326778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021508	G	7	7	326795	326801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021508	T	6	6	328040	328045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021508	G	11	11	329162	329172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021508	C	9	9	333561	333569	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_021508	G	6	6	336005	336010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021508	T	6	6	341063	341068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021508	G	6	6	373195	373200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021508	G	10	10	373247	373256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021508	G	9	9	373982	373990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021508	T	6	6	383797	383802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021508	T	6	6	402025	402030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021508	T	7	7	402503	402509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021508	A	7	7	406375	406381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_021508	C	9	9	409141	409149	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_021508	T	6	6	422950	422955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021508	T	6	6	422963	422968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021508	T	8	8	422992	422999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021508	T	6	6	448956	448961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021508	T	6	6	453738	453743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021508	T	6	6	477931	477936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021508	C	6	6	484843	484848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_021508	C	6	6	484863	484868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_021508	G	6	6	491363	491368	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021508	G	6	6	492548	492553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021508	C	10	10	510923	510932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_021508	C	6	6	511032	511037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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107	NC_021508	A	6	6	546572	546577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021508	A	7	7	550364	550370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021508	T	6	6	562037	562042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021508	T	6	6	562763	562768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021508	T	6	6	563160	563165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021508	A	6	6	568808	568813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021508	T	6	6	569548	569553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021508	A	6	6	576627	576632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021508	A	7	7	580454	580460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021508	T	6	6	583054	583059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021508	A	7	7	600332	600338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021508	T	7	7	635241	635247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021508	T	6	6	642481	642486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021508	A	6	6	644056	644061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021508	T	8	8	644094	644101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_021508	C	9	9	674399	674407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_021508	C	11	11	676714	676724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_021508	A	6	6	688345	688350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021508	A	6	6	698248	698253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_021508	A	6	6	725708	725713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021508	A	6	6	735606	735611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_021508	T	6	6	741310	741315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_021508	A	6	6	766798	766803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021508	C	9	9	767192	767200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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137	NC_021508	A	6	6	767883	767888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_021508	A	6	6	776772	776777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_021508	A	6	6	831828	831833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021508	A	7	7	832023	832029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021508	A	6	6	849866	849871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021508	A	7	7	853528	853534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021508	A	6	6	862154	862159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021508	A	8	8	864676	864683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021508	C	6	6	872303	872308	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
153	NC_021508	T	6	6	881972	881977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021508	T	8	8	882029	882036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.