MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 2162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021508	T	6	6	741310	741315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021508	CTT	2	6	743865	743870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021508	ACA	2	6	743884	743889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021508	TGC	2	6	743935	743940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_021508	GC	3	6	743939	743944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_021508	GC	3	6	746448	746453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_021508	TCC	2	6	746456	746461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_021508	C	6	6	748275	748280	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1509	NC_021508	CA	3	6	748307	748312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_021508	GGCAC	2	10	749516	749525	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_021508	GAA	2	6	749539	749544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021508	AAG	2	6	749571	749576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021508	CG	3	6	749643	749648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_021508	GC	3	6	749680	749685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_021508	CG	3	6	749695	749700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_021508	AGG	2	6	749725	749730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021508	GCT	2	6	750981	750986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021508	TAGG	2	8	751015	751022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021508	CG	4	8	751046	751053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_021508	GAG	2	6	752564	752569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021508	AAG	2	6	754276	754281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021508	CAT	2	6	756401	756406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021508	GGC	2	6	760196	760201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021508	ACC	2	6	761479	761484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_021508	CA	3	6	761487	761492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_021508	GCT	2	6	761545	761550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021508	CGG	2	6	761577	761582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021508	ACA	2	6	761598	761603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021508	TTC	2	6	761614	761619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1531	NC_021508	CCA	2	6	763107	763112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_021508	TCT	2	6	763126	763131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_021508	GAC	2	6	763151	763156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021508	ACC	2	6	763163	763168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_021508	TCC	2	6	763860	763865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_021508	CA	3	6	763874	763879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_021508	TGCA	2	8	763882	763889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1540	NC_021508	ACGCGC	2	12	766575	766586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_021508	GC	3	6	766589	766594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_021508	ACCCC	2	10	766597	766606	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1543	NC_021508	AGC	2	6	766607	766612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_021508	GACA	2	8	766774	766781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_021508	A	6	6	766798	766803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1548	NC_021508	GC	3	6	766929	766934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_021508	CA	3	6	767093	767098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_021508	GCG	2	6	767141	767146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_021508	C	9	9	767192	767200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1552	NC_021508	TCACC	2	10	767226	767235	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1553	NC_021508	ACCA	2	8	767241	767248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_021508	CA	3	6	767806	767811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_021508	C	6	6	767870	767875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1556	NC_021508	A	6	6	767883	767888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_021508	AAAC	2	8	768391	768398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_021508	CGCGC	2	10	768668	768677	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1561	NC_021508	C	6	6	768704	768709	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1562	NC_021508	TCC	2	6	772181	772186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_021508	GA	3	6	772187	772192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021508	ACC	2	6	772195	772200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_021508	CAC	2	6	772234	772239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_021508	AC	3	6	772238	772243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_021508	AGA	2	6	775015	775020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021508	AC	3	6	775058	775063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_021508	ACCG	2	8	775100	775107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_021508	CG	3	6	775106	775111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_021508	AG	3	6	775211	775216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021508	GAG	3	9	775214	775222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021508	A	6	6	776772	776777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1575	NC_021508	TAC	2	6	791559	791564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1580	NC_021508	TC	3	6	794855	794860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1582	NC_021508	T	6	6	795365	795370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_021508	GC	3	6	795415	795420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_021508	GA	3	6	798135	798140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_021508	CTCC	2	8	801272	801279	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1591	NC_021508	CG	3	6	801316	801321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_021508	GCA	2	6	801338	801343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_021508	CCT	2	6	803757	803762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_021508	GATG	2	8	803782	803789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021508	TTC	2	6	803827	803832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1597	NC_021508	TCA	2	6	803877	803882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_021508	TCG	2	6	806886	806891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_021508	AC	4	8	806905	806912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_021508	GAAA	3	12	807574	807585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021508	GAA	2	6	807590	807595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021508	GAA	2	6	807599	807604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021508	AAG	2	6	807621	807626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021508	CT	3	6	809378	809383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_021508	CTT	2	6	809439	809444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_021508	AGG	2	6	809465	809470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021508	C	6	6	809762	809767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1608	NC_021508	A	6	6	810454	810459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021508	ACGCAG	2	12	810481	810492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021508	ACGA	2	8	810539	810546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_021508	TGA	2	6	814313	814318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021508	TCTA	2	8	814373	814380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_021508	CAC	2	6	818103	818108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_021508	TG	3	6	818139	818144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021508	ACACGC	2	12	819316	819327	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_021508	GC	3	6	819326	819331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_021508	CT	3	6	821055	821060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_021508	TTC	2	6	821714	821719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_021508	AACC	2	8	821725	821732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_021508	AC	3	6	821753	821758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_021508	CAT	2	6	821769	821774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021508	A	7	7	823526	823532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021508	TTC	2	6	823583	823588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021508	GCAC	2	8	823611	823618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_021508	GT	3	6	827757	827762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021508	GCAGGG	2	12	827768	827779	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1627	NC_021508	AGCA	2	8	831714	831721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_021508	CGAG	2	8	831743	831750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_021508	GAC	2	6	831790	831795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_021508	G	6	6	831815	831820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021508	A	6	6	831828	831833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021508	GAA	2	6	831847	831852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021508	GC	3	6	831907	831912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_021508	AAG	2	6	831939	831944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021508	TG	3	6	831962	831967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021508	TGC	2	6	832017	832022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_021508	A	7	7	832023	832029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_021508	CG	4	8	832034	832041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1640	NC_021508	GC	3	6	833013	833018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1917	NC_021508	GCA	2	6	1013474	1013479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1920	NC_021508	CCG	2	6	1016803	1016808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1931	NC_021508	A	7	7	1025662	1025668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_021508	CA	3	6	1026208	1026213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1933	NC_021508	CCT	2	6	1026242	1026247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1943	NC_021508	TCC	2	6	1034184	1034189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1944	NC_021508	CTC	2	6	1034268	1034273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1949	NC_021508	AC	3	6	1036668	1036673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1951	NC_021508	TCTT	2	8	1038184	1038191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1952	NC_021508	GTG	2	6	1039555	1039560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_021508	CG	3	6	1039583	1039588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1954	NC_021508	A	6	6	1039598	1039603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_021508	CGC	2	6	1042630	1042635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1956	NC_021508	TGC	2	6	1042641	1042646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1957	NC_021508	CCTC	2	8	1043858	1043865	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1958	NC_021508	TCT	2	6	1043896	1043901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1959	NC_021508	ACT	2	6	1044813	1044818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1961	NC_021508	CG	4	8	1046090	1046097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1962	NC_021508	CCT	2	6	1046105	1046110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1964	NC_021508	CTTC	2	8	1049065	1049072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1977	NC_021508	CTT	2	6	1054184	1054189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1978	NC_021508	GC	3	6	1054190	1054195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1979	NC_021508	GCA	2	6	1054225	1054230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1980	NC_021508	AAC	2	6	1054266	1054271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1982	NC_021508	AGCG	2	8	1054347	1054354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1991	NC_021508	GCCTG	2	10	1054789	1054798	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2000	NC_021508	TTG	2	6	1055247	1055252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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