MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 2162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021508	CGTG	2	8	223259	223266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_021508	TTTC	2	8	223270	223277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_021508	GT	3	6	223280	223285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021508	TTC	2	6	223335	223340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021508	AGC	2	6	223370	223375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021508	TG	3	6	228667	228672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021508	CT	3	6	228753	228758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_021508	GC	3	6	228763	228768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_021508	GCT	2	6	228780	228785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021508	GGT	2	6	228797	228802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021508	GC	3	6	228830	228835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_021508	TTG	2	6	228853	228858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021508	T	6	6	230249	230254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021508	TG	3	6	230300	230305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021508	AGTG	2	8	230323	230330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021508	AGG	2	6	230359	230364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021508	GTG	2	6	231128	231133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021508	TG	4	8	231176	231183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021508	GC	3	6	231199	231204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_021508	GGGA	2	8	231234	231241	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021508	AAT	2	6	231293	231298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021508	GAAC	2	8	231323	231330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_021508	TTG	2	6	231550	231555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021508	AC	3	6	231612	231617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_021508	GCA	2	6	231652	231657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021508	CGA	2	6	231744	231749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_021508	GGGA	2	8	231761	231768	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021508	TGA	2	6	231778	231783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021508	CAG	2	6	231821	231826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021508	GTT	2	6	231852	231857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021508	ATT	2	6	231862	231867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021508	CTG	2	6	231945	231950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021508	GAA	2	6	232013	232018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021508	GAT	2	6	232047	232052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021508	CA	3	6	232108	232113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_021508	GAT	2	6	232262	232267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021508	TGC	2	6	232349	232354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021508	GTC	2	6	232361	232366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021508	GTG	2	6	232435	232440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021508	GGA	2	6	232475	232480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021508	TCA	2	6	232500	232505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021508	AC	3	6	232526	232531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_021508	AC	3	6	232695	232700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_021508	AGGG	2	8	232755	232762	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021508	AGG	2	6	232786	232791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021508	CCT	2	6	232838	232843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_021508	GCATG	2	10	232864	232873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
548	NC_021508	TC	3	6	232934	232939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_021508	CCCTT	2	10	232940	232949	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
550	NC_021508	AAGG	2	8	232995	233002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021508	TAT	2	6	233033	233038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021508	TTTGT	2	10	233051	233060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021508	GGT	2	6	233078	233083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021508	GGGTG	2	10	233105	233114	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021508	ATA	2	6	233134	233139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021508	GAG	2	6	233223	233228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021508	TGAA	2	8	233299	233306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021508	AGGG	2	8	233308	233315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021508	TGAAC	2	10	233331	233340	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
560	NC_021508	AG	3	6	233369	233374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021508	AGT	2	6	233383	233388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021508	GCGA	2	8	233390	233397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_021508	GGA	2	6	233402	233407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021508	CG	3	6	233441	233446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_021508	GGTG	2	8	233458	233465	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021508	AAT	2	6	233467	233472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021508	AG	3	6	233509	233514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021508	CTG	2	6	233547	233552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021508	CGG	2	6	233569	233574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021508	CAA	2	6	233718	233723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021508	GGT	2	6	233742	233747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021508	GCA	2	6	233787	233792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021508	GTG	2	6	233846	233851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021508	CGT	2	6	233859	233864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021508	GGA	2	6	233923	233928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021508	A	6	6	233946	233951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021508	AAAC	2	8	233986	233993	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_021508	TGCG	2	8	234144	234151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
579	NC_021508	AGG	2	6	234249	234254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021508	AGC	2	6	234265	234270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021508	TGA	2	6	234405	234410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021508	GAG	2	6	234423	234428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021508	AG	3	6	234445	234450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021508	AGG	2	6	234474	234479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021508	TTCC	2	8	234486	234493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_021508	CGT	2	6	234705	234710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021508	GTGCGA	2	12	234721	234732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
588	NC_021508	AGGTT	2	10	234790	234799	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021508	AGGT	2	8	234827	234834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021508	GA	3	6	234858	234863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021508	AC	3	6	234890	234895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_021508	GGT	2	6	235007	235012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021508	AGAGG	2	10	235039	235048	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021508	TTGAA	2	10	235068	235077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021508	CGG	2	6	235089	235094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021508	AAG	2	6	235218	235223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021508	GTA	2	6	235300	235305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021508	ACC	2	6	235361	235366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_021508	CCT	2	6	235449	235454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_021508	AGG	2	6	235525	235530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021508	GAG	2	6	235829	235834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021508	TAA	2	6	236070	236075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021508	ATT	2	6	236094	236099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021508	TCCTTC	2	12	236102	236113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_021508	TGG	2	6	236153	236158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021508	GAT	2	6	236211	236216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021508	GTAG	2	8	236236	236243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021508	CTC	2	6	236965	236970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_021508	TGCA	2	8	236988	236995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_021508	AGA	2	6	237781	237786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021508	AC	3	6	237809	237814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_021508	CTG	2	6	241436	241441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021508	GTA	2	6	241462	241467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021508	GA	3	6	241500	241505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021508	GT	3	6	242190	242195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021508	GT	3	6	242258	242263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021508	GAGGG	2	10	242292	242301	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021508	CTG	3	9	242312	242320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021508	CTGT	2	8	242323	242330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_021508	CTTT	2	8	242962	242969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_021508	TG	3	6	243019	243024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021508	GGCC	2	8	243047	243054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_021508	GGC	2	6	243060	243065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021508	CTGT	2	8	243076	243083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_021508	GAG	2	6	243175	243180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021508	GGT	2	6	243182	243187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021508	GTC	2	6	243362	243367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021508	TCCT	2	8	243472	243479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_021508	TCT	2	6	244258	244263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021508	TGCC	2	8	244296	244303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_021508	TGT	2	6	244329	244334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021508	T	6	6	244334	244339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021508	GTT	2	6	246026	246031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021508	T	8	8	246528	246535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021508	CGT	2	6	246550	246555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021508	TG	3	6	246556	246561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021508	TG	3	6	246706	246711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021508	TCGGT	2	10	246753	246762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
639	NC_021508	G	6	6	246772	246777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021508	TG	3	6	254629	254634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_021508	GTG	2	6	282291	282296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
780	NC_021508	CGT	2	6	282304	282309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_021508	GGA	2	6	282368	282373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
782	NC_021508	A	6	6	282391	282396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
783	NC_021508	AAAC	2	8	282431	282438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
784	NC_021508	TGCG	2	8	282589	282596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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792	NC_021508	CGT	2	6	283150	283155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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912	NC_021508	CCA	2	6	348073	348078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
913	NC_021508	CCT	2	6	348636	348641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
914	NC_021508	ACG	2	6	351390	351395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
915	NC_021508	GCG	2	6	351408	351413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
916	NC_021508	CG	3	6	351412	351417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
917	NC_021508	GAG	2	6	351472	351477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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