MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 2070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021490	GGT	2	6	228755	228760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021490	GC	3	6	228788	228793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_021490	TTG	2	6	228811	228816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021490	T	6	6	230207	230212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021490	TG	3	6	230258	230263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021490	AGTG	2	8	230281	230288	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021490	AGG	2	6	230317	230322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021490	GTG	2	6	231086	231091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021490	TG	4	8	231134	231141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021490	GC	3	6	231157	231162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_021490	GGGA	2	8	231192	231199	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021490	AAT	2	6	231251	231256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021490	GAAC	2	8	231281	231288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_021490	TTG	2	6	231508	231513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021490	AC	3	6	231570	231575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_021490	GCA	2	6	231610	231615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021490	CGA	2	6	231702	231707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021490	GGGA	2	8	231719	231726	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021490	TGA	2	6	231736	231741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021490	CAG	2	6	231779	231784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021490	GTT	2	6	231810	231815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021490	ATT	2	6	231820	231825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021490	CTG	2	6	231903	231908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021490	GAA	2	6	231971	231976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021490	GAT	2	6	232005	232010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021490	CA	3	6	232066	232071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_021490	GAT	2	6	232220	232225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021490	TGC	2	6	232307	232312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_021490	GTC	2	6	232319	232324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021490	GTG	2	6	232393	232398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021490	GGA	2	6	232433	232438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021490	TCA	2	6	232458	232463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021490	AC	3	6	232484	232489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_021490	AC	3	6	232653	232658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021490	AGGG	2	8	232713	232720	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021490	AGG	2	6	232744	232749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021490	CCT	2	6	232796	232801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_021490	GCATG	2	10	232822	232831	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
539	NC_021490	TC	3	6	232892	232897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_021490	CCCTT	2	10	232898	232907	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
541	NC_021490	AAGG	2	8	232953	232960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021490	TAT	2	6	232991	232996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021490	TTTGT	2	10	233009	233018	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021490	GGT	2	6	233036	233041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021490	GGGTG	2	10	233063	233072	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021490	ATA	2	6	233092	233097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021490	GAG	2	6	233181	233186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021490	TGAA	2	8	233257	233264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021490	AGGG	2	8	233266	233273	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021490	TGAAC	2	10	233289	233298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
551	NC_021490	AG	3	6	233327	233332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021490	AGT	2	6	233341	233346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021490	GCGA	2	8	233348	233355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_021490	GGA	2	6	233360	233365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021490	CG	3	6	233399	233404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_021490	GGTG	2	8	233416	233423	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021490	AAT	2	6	233425	233430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021490	AG	3	6	233467	233472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021490	CTG	2	6	233505	233510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021490	CGG	2	6	233527	233532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021490	CAA	2	6	233676	233681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021490	GGT	2	6	233700	233705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021490	GCA	2	6	233745	233750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021490	GTG	2	6	233804	233809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021490	CGT	2	6	233817	233822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021490	GGA	2	6	233881	233886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021490	A	6	6	233904	233909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021490	AAAC	2	8	233944	233951	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_021490	TGCG	2	8	234102	234109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_021490	AGG	2	6	234207	234212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021490	AGC	2	6	234223	234228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021490	TGA	2	6	234363	234368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021490	GAG	2	6	234381	234386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021490	AG	3	6	234403	234408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021490	AGG	2	6	234432	234437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021490	TTCC	2	8	234444	234451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_021490	CGT	2	6	234663	234668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021490	GTGCGA	2	12	234679	234690	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_021490	AGGTT	2	10	234748	234757	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021490	AGGT	2	8	234785	234792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021490	GA	3	6	234816	234821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021490	AC	3	6	234848	234853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_021490	GGT	2	6	234965	234970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021490	AGAGG	2	10	234997	235006	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021490	TTGAA	2	10	235026	235035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021490	CGG	2	6	235047	235052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021490	AAG	2	6	235176	235181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021490	GTA	2	6	235258	235263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021490	ACC	2	6	235319	235324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_021490	CCT	2	6	235407	235412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_021490	AGG	2	6	235483	235488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021490	GAG	2	6	235787	235792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021490	TAA	2	6	236028	236033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021490	ATT	2	6	236052	236057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021490	TCCTTC	2	12	236060	236071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_021490	TGG	2	6	236111	236116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021490	GAT	2	6	236169	236174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021490	GTAG	2	8	236194	236201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021490	CTC	2	6	236923	236928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_021490	TGCA	2	8	236946	236953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_021490	AGA	2	6	237739	237744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021490	AC	3	6	237767	237772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_021490	CTG	2	6	241394	241399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021490	GTA	2	6	241420	241425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021490	GA	3	6	241458	241463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021490	GT	3	6	242148	242153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021490	GT	3	6	242216	242221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021490	GAGGG	2	10	242250	242259	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021490	CTG	3	9	242270	242278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021490	CTGT	2	8	242281	242288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_021490	CTTT	2	8	242920	242927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_021490	TG	3	6	242977	242982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021490	GGCC	2	8	243005	243012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_021490	GGC	2	6	243018	243023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021490	CTGT	2	8	243034	243041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_021490	GAG	2	6	243133	243138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021490	GGT	2	6	243140	243145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021490	GTC	2	6	243320	243325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021490	TCCT	2	8	243430	243437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_021490	TCT	2	6	244216	244221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021490	TGCC	2	8	244254	244261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_021490	TGT	2	6	244287	244292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021490	T	6	6	244292	244297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021490	GTT	2	6	245984	245989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021490	T	8	8	246486	246493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021490	CGT	2	6	246508	246513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021490	TG	3	6	246514	246519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021490	TG	3	6	246664	246669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021490	TCGGT	2	10	246711	246720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
630	NC_021490	G	6	6	246730	246735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021490	TG	3	6	254587	254592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021490	T	7	7	254617	254623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021490	GAG	2	6	255028	255033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021490	T	8	8	259025	259032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021490	GTTTGT	2	12	259109	259120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021490	AGG	2	6	259126	259131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021490	GTG	2	6	260929	260934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021490	GCA	2	6	262063	262068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_021490	GT	3	6	262090	262095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021490	CT	3	6	262100	262105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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914	NC_021490	GAG	2	6	351433	351438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
915	NC_021490	CAC	2	6	353041	353046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
916	NC_021490	CG	3	6	353054	353059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
917	NC_021490	TCT	2	6	353103	353108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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951	NC_021490	GGAT	2	8	373531	373538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
952	NC_021490	GTG	2	6	373607	373612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
953	NC_021490	GCG	2	6	373633	373638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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993	NC_021490	CG	3	6	385471	385476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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