MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021179	GAA	2	6	10248	10253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021179	GTG	2	6	10292	10297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021179	AGT	2	6	10326	10331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021179	GAT	2	6	12432	12437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021179	TAT	2	6	13849	13854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021179	GTG	2	6	13908	13913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021179	GGC	2	6	24332	24337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021179	CAA	3	9	24579	24587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021179	ACC	2	6	24607	24612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021179	CCA	2	6	24942	24947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021179	AGC	2	6	25004	25009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021179	AGA	2	6	25424	25429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021179	TGA	2	6	28898	28903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021179	CTC	2	6	29028	29033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021179	AGG	2	6	29055	29060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021179	CTC	2	6	32948	32953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021179	TAT	2	6	38196	38201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021179	TGA	2	6	38211	38216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021179	CCT	2	6	45568	45573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021179	ACA	2	6	45585	45590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021179	TCT	2	6	52579	52584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021179	AGA	2	6	54508	54513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021179	GTG	2	6	55749	55754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021179	GGA	2	6	58810	58815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021179	CAT	2	6	59491	59496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021179	TTG	2	6	59539	59544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021179	CCT	3	9	62811	62819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021179	GTA	2	6	62835	62840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021179	GCG	2	6	62868	62873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021179	GGA	2	6	67576	67581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021179	TCC	2	6	67618	67623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021179	CCT	2	6	69665	69670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021179	AAC	2	6	69738	69743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021179	TCT	2	6	70707	70712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021179	TTC	2	6	73845	73850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021179	AGT	2	6	78623	78628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021179	GTC	2	6	79054	79059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021179	TCT	3	9	82352	82360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021179	GCA	2	6	84248	84253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021179	TTG	2	6	94395	94400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021179	ACC	2	6	94712	94717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021179	TCG	2	6	98687	98692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021179	CTT	2	6	99869	99874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021179	GTA	2	6	102761	102766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021179	AAT	2	6	102769	102774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021179	TTC	2	6	105854	105859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021179	CTG	2	6	106353	106358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021179	AGC	2	6	106704	106709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021179	CCG	2	6	108143	108148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021179	CGT	2	6	113767	113772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021179	GGA	2	6	113852	113857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021179	TGC	2	6	115757	115762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021179	GAG	2	6	122256	122261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021179	TCC	2	6	123668	123673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021179	TCC	2	6	124659	124664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021179	GCT	2	6	124781	124786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021179	TCC	2	6	124960	124965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021179	AGA	2	6	125025	125030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021179	GAG	2	6	125078	125083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021179	CCT	2	6	129758	129763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021179	CCT	2	6	132722	132727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021179	TAC	2	6	132817	132822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021179	TAA	2	6	132843	132848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021179	CTC	2	6	136710	136715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021179	AGA	2	6	136748	136753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021179	GCA	2	6	139668	139673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021179	GGA	2	6	140896	140901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021179	GGT	2	6	140910	140915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021179	CCG	2	6	140938	140943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021179	CGC	2	6	142887	142892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021179	TGC	2	6	142909	142914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021179	GTT	2	6	143069	143074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021179	TGA	2	6	143087	143092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021179	TCG	2	6	148319	148324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021179	AGC	2	6	149002	149007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021179	GTT	2	6	150591	150596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021179	GCT	2	6	150691	150696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021179	GTT	2	6	151781	151786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021179	GCT	2	6	152319	152324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021179	CTC	2	6	154149	154154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021179	CGG	2	6	154318	154323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021179	AGG	2	6	154328	154333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021179	CCG	2	6	157594	157599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021179	GAC	2	6	157842	157847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021179	CCT	2	6	157875	157880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021179	CTG	2	6	159435	159440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021179	TGC	2	6	166957	166962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021179	TGG	2	6	168983	168988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021179	CGC	2	6	169007	169012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021179	GCG	2	6	169049	169054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021179	CCA	2	6	169117	169122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021179	CCG	2	6	169123	169128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021179	AGG	2	6	169209	169214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021179	GTT	2	6	169259	169264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021179	TGG	3	9	169298	169306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021179	ATT	2	6	169413	169418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021179	CAC	2	6	169478	169483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_021179	ATC	2	6	169512	169517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021179	GAT	2	6	169688	169693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021179	ATT	2	6	170054	170059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021179	ACC	2	6	170236	170241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021179	TTC	2	6	170297	170302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021179	AAG	2	6	179372	179377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021179	TAT	2	6	182461	182466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021179	GCT	2	6	185553	185558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021179	CTT	2	6	185579	185584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021179	TTG	2	6	190092	190097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021179	TCG	2	6	191015	191020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021179	TTA	2	6	204203	204208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021179	TCA	2	6	204272	204277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021179	CCT	2	6	204415	204420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021179	CCG	2	6	204444	204449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021179	GAG	2	6	204471	204476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021179	GCG	2	6	205678	205683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021179	AGG	2	6	212329	212334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021179	GAG	2	6	216188	216193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021179	AGG	2	6	216703	216708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021179	GGT	2	6	218666	218671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021179	GGT	2	6	218912	218917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021179	GCG	2	6	219011	219016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021179	GAA	2	6	219068	219073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021179	AGC	2	6	223283	223288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021179	GTT	2	6	230247	230252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021179	AGG	2	6	230272	230277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021179	GTG	2	6	231041	231046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021179	AAT	2	6	231206	231211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021179	TTG	2	6	231463	231468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021179	GCA	2	6	231565	231570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021179	CGA	2	6	231657	231662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021179	TGA	2	6	231691	231696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021179	CAG	2	6	231734	231739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021179	GTT	2	6	231765	231770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021179	ATT	2	6	231775	231780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021179	CTG	2	6	231858	231863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021179	GAA	2	6	231926	231931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021179	GAT	2	6	231960	231965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021179	GAT	2	6	232175	232180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021179	TGC	2	6	232262	232267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_021179	GGA	2	6	232388	232393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_021179	CGG	2	6	235012	235017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021179	AAG	2	6	235141	235146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_021179	GAG	2	6	235752	235757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021179	GTG	2	6	238409	238414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_021179	CTT	2	6	623363	623368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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