MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 13673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019902	CTT	2	6	1078775	1078780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_019902	AG	3	6	1078796	1078801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019902	GGA	2	6	1078832	1078837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_019902	GC	3	6	1078866	1078871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_019902	AGCC	2	8	1078899	1078906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_019902	TC	3	6	1079070	1079075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_019902	GCG	2	6	1079257	1079262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_019902	ATCG	2	8	1079288	1079295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_019902	GGC	2	6	1079355	1079360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_019902	CAAA	2	8	1079484	1079491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_019902	TTC	2	6	1079505	1079510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_019902	AT	3	6	1079609	1079614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_019902	CTT	2	6	1079630	1079635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_019902	TA	3	6	1079705	1079710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_019902	CGA	2	6	1079859	1079864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_019902	GCAAGG	2	12	1081967	1081978	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4017	NC_019902	GCGA	2	8	1082552	1082559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_019902	GCC	2	6	1082614	1082619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_019902	GCG	2	6	1082629	1082634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_019902	CACTA	2	10	1082673	1082682	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4021	NC_019902	CG	3	6	1082689	1082694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_019902	TGC	2	6	1082695	1082700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_019902	TGA	2	6	1082790	1082795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_019902	TGAT	2	8	1082837	1082844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_019902	GTG	2	6	1082920	1082925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_019902	GTA	2	6	1082933	1082938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019902	GTC	2	6	1083010	1083015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_019902	T	7	7	1083081	1083087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_019902	ACT	2	6	1083111	1083116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_019902	GC	3	6	1083163	1083168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_019902	TGA	2	6	1083182	1083187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019902	AGG	2	6	1083404	1083409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_019902	GCG	2	6	1083552	1083557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_019902	GCGA	2	8	1083597	1083604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_019902	GCG	2	6	1083639	1083644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_019902	TGG	2	6	1083897	1083902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_019902	GC	3	6	1083987	1083992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_019902	AGA	2	6	1084056	1084061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_019902	CAC	2	6	1084209	1084214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_019902	GC	3	6	1084431	1084436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_019902	GCC	2	6	1084475	1084480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_019902	CCT	2	6	1085415	1085420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_019902	TTG	2	6	1085435	1085440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019902	TTG	2	6	1087493	1087498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019902	CTTC	2	8	1087520	1087527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_019902	CGT	2	6	1087556	1087561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_019902	TAG	2	6	1087563	1087568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4049	NC_019902	TGAA	2	8	1087722	1087729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4051	NC_019902	CCA	2	6	1087750	1087755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_019902	TCCA	2	8	1087835	1087842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_019902	AGG	2	6	1087928	1087933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_019902	GAG	2	6	1087983	1087988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019902	AAG	2	6	1088110	1088115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_019902	TCC	3	9	1088126	1088134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_019902	GCA	2	6	1088165	1088170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_019902	AGCG	2	8	1088207	1088214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_019902	TTG	2	6	1088229	1088234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_019902	GTGG	2	8	1088254	1088261	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_019902	CGG	2	6	1088284	1088289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_019902	TGG	2	6	1088554	1088559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_019902	GCT	2	6	1088563	1088568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_019902	TCG	2	6	1089770	1089775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_019902	TCA	2	6	1089845	1089850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_019902	GTT	2	6	1090545	1090550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_019902	AGCG	2	8	1090572	1090579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_019902	ATC	2	6	1090591	1090596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_019902	GTA	2	6	1090653	1090658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4071	NC_019902	CAGG	2	8	1090678	1090685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_019902	CGG	2	6	1090781	1090786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_019902	TGA	2	6	1090850	1090855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_019902	AT	4	8	1091191	1091198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019902	TA	3	6	1091204	1091209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019902	GTC	2	6	1091275	1091280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4079	NC_019902	GTC	2	6	1091536	1091541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4081	NC_019902	CT	3	6	1091616	1091621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_019902	ATG	2	6	1091675	1091680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019902	GGA	2	6	1091704	1091709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019902	GCT	2	6	1092386	1092391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_019902	GA	3	6	1092424	1092429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_019902	GGC	2	6	1092534	1092539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_019902	AGTGC	2	10	1093110	1093119	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4089	NC_019902	CACC	2	8	1093131	1093138	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4090	NC_019902	CGTT	2	8	1093223	1093230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_019902	ACGT	2	8	1093234	1093241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_019902	GAC	2	6	1093838	1093843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4094	NC_019902	GC	3	6	1093936	1093941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_019902	TGCCG	2	10	1093942	1093951	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4096	NC_019902	TGC	2	6	1093960	1093965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4098	NC_019902	CTG	2	6	1094076	1094081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_019902	CGT	2	6	1094155	1094160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_019902	CTTG	2	8	1094228	1094235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_019902	ACG	2	6	1094265	1094270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_019902	CGC	2	6	1094279	1094284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_019902	CCT	2	6	1094308	1094313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_019902	GC	3	6	1094360	1094365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_019902	GCA	2	6	1094400	1094405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_019902	CGC	2	6	1094420	1094425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_019902	TAC	2	6	1094484	1094489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_019902	TGGC	2	8	1094521	1094528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_019902	TACG	2	8	1094643	1094650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_019902	GAA	2	6	1094654	1094659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019902	GGC	2	6	1094662	1094667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_019902	CGC	2	6	1094704	1094709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_019902	TGG	2	6	1094836	1094841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_019902	AG	3	6	1094845	1094850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_019902	GAAC	2	8	1094978	1094985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_019902	CAA	2	6	1095071	1095076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019902	CG	3	6	1095102	1095107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_019902	TGA	2	6	1095177	1095182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019902	CCCG	2	8	1095246	1095253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4120	NC_019902	A	6	6	1095268	1095273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_019902	CTA	2	6	1095431	1095436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_019902	GTATC	2	10	1095504	1095513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4123	NC_019902	GCG	2	6	1095596	1095601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_019902	TGC	2	6	1095678	1095683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_019902	CGT	2	6	1095686	1095691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_019902	GCC	2	6	1095762	1095767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_019902	GCT	2	6	1095779	1095784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_019902	GC	3	6	1095794	1095799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_019902	GGA	2	6	1095848	1095853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019902	CAG	2	6	1095855	1095860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_019902	TGC	2	6	1095868	1095873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_019902	GGT	2	6	1096895	1096900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_019902	TTC	2	6	1097155	1097160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_019902	GTT	2	6	1097218	1097223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_019902	GC	3	6	1097358	1097363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4139	NC_019902	GGA	3	9	1097371	1097379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_019902	GC	3	6	1097573	1097578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4143	NC_019902	GGC	2	6	1097589	1097594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4148	NC_019902	CGG	2	6	1097769	1097774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4150	NC_019902	GTGC	2	8	1099669	1099676	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4173	NC_019902	TTG	2	6	1107055	1107060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4189	NC_019902	GGC	2	6	1111848	1111853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4193	NC_019902	CG	3	6	1111954	1111959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4246	NC_019902	GAC	2	6	1124818	1124823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4250	NC_019902	GCG	2	6	1126088	1126093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4253	NC_019902	AACGA	2	10	1127470	1127479	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4255	NC_019902	TCC	2	6	1127628	1127633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4256	NC_019902	CGC	2	6	1127637	1127642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_019902	TGCGC	2	10	1127692	1127701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4258	NC_019902	GAC	2	6	1127729	1127734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_019902	CGC	2	6	1127735	1127740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4260	NC_019902	GAG	2	6	1127761	1127766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_019902	GCG	2	6	1128694	1128699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_019902	G	6	6	1129482	1129487	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_019902	TGCAC	2	10	1129536	1129545	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4264	NC_019902	CGG	3	9	1129546	1129554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_019902	GGCCG	2	10	1129561	1129570	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4266	NC_019902	ACC	2	6	1129635	1129640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4269	NC_019902	CCGAC	2	10	1131691	1131700	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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4295	NC_019902	AGCGG	2	10	1151779	1151788	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4296	NC_019902	GCC	2	6	1153594	1153599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4302	NC_019902	GAG	2	6	1153916	1153921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4377	NC_019902	TCG	2	6	1172653	1172658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4379	NC_019902	CGA	2	6	1172720	1172725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4381	NC_019902	TCG	3	9	1172776	1172784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4382	NC_019902	CCCG	2	8	1172834	1172841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4383	NC_019902	G	6	6	1172880	1172885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_019902	CG	3	6	1172906	1172911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4385	NC_019902	AGAT	2	8	1172921	1172928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_019902	TGGT	2	8	1175011	1175018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_019902	CG	3	6	1175667	1175672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4388	NC_019902	CCT	2	6	1175677	1175682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4389	NC_019902	CCGT	2	8	1175762	1175769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4390	NC_019902	TGG	2	6	1175780	1175785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_019902	TGG	2	6	1175818	1175823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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