MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 13673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019902	TCC	2	6	115279	115284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_019902	CGG	2	6	115375	115380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_019902	GC	3	6	115397	115402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_019902	TCG	2	6	115459	115464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_019902	TCGG	2	8	115495	115502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_019902	AGG	2	6	115530	115535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019902	TG	3	6	115613	115618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019902	TAGCCA	2	12	115679	115690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_019902	GT	3	6	115719	115724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019902	GT	3	6	115757	115762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019902	GGAG	2	8	115770	115777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019902	GGT	2	6	115782	115787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019902	GAA	2	6	115847	115852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019902	CGC	2	6	115868	115873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_019902	GTT	2	6	115911	115916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019902	AGG	2	6	115917	115922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019902	TGG	2	6	115943	115948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019902	GCC	2	6	115983	115988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_019902	TGG	2	6	115997	116002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_019902	GGTC	2	8	116004	116011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_019902	CCT	2	6	117495	117500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_019902	AGG	2	6	117507	117512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019902	GGC	2	6	117525	117530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_019902	GTG	2	6	117550	117555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019902	GTC	2	6	118687	118692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019902	GCGGAC	2	12	118746	118757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_019902	GCA	2	6	118764	118769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_019902	ATC	2	6	118784	118789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_019902	CCG	2	6	118816	118821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_019902	GC	3	6	118967	118972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_019902	TGA	2	6	119050	119055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019902	CGG	2	6	119788	119793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_019902	G	7	7	119814	119820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019902	CGG	2	6	120739	120744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_019902	GCCG	2	8	121547	121554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_019902	AAG	2	6	121560	121565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019902	CGG	2	6	121589	121594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_019902	G	6	6	124281	124286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019902	C	6	6	124487	124492	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
540	NC_019902	ATG	2	6	124556	124561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019902	ACA	2	6	124574	124579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_019902	CGGC	2	8	124938	124945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_019902	CGC	2	6	124982	124987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_019902	TGC	2	6	125004	125009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_019902	TCC	2	6	125061	125066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_019902	TGG	2	6	125124	125129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_019902	GC	4	8	125155	125162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_019902	CGC	2	6	134471	134476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_019902	GGT	2	6	134488	134493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019902	GTGG	2	8	135016	135023	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019902	CGGT	2	8	135044	135051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_019902	CGA	2	6	135136	135141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_019902	GGCG	2	8	135166	135173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
554	NC_019902	TCC	2	6	135177	135182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_019902	CGAA	2	8	135196	135203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_019902	TCC	2	6	135913	135918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_019902	TCG	2	6	135925	135930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_019902	G	6	6	135987	135992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019902	CGGG	2	8	135997	136004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
560	NC_019902	CGGC	2	8	136010	136017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_019902	CG	3	6	136057	136062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_019902	GGT	2	6	136110	136115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019902	TTC	2	6	136136	136141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_019902	CGC	2	6	136199	136204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_019902	G	6	6	136667	136672	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019902	CGG	2	6	137071	137076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_019902	CCG	2	6	137149	137154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_019902	TCG	2	6	137183	137188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_019902	GTT	2	6	137275	137280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019902	ACC	2	6	137285	137290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_019902	GCG	2	6	137302	137307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_019902	GCCG	2	8	137343	137350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_019902	C	6	6	137416	137421	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
574	NC_019902	GTG	2	6	137429	137434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019902	GAG	2	6	137450	137455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_019902	TGA	2	6	137482	137487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_019902	G	6	6	140432	140437	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
579	NC_019902	CTGC	2	8	140440	140447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_019902	GCA	2	6	140486	140491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_019902	GCC	2	6	140497	140502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_019902	CCG	2	6	140508	140513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_019902	GCG	2	6	140546	140551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_019902	CTG	2	6	140554	140559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_019902	TTC	2	6	140576	140581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_019902	GCT	2	6	140597	140602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_019902	GCG	2	6	140615	140620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_019902	GCG	2	6	142448	142453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_019902	GCC	2	6	142458	142463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_019902	CGC	2	6	142491	142496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_019902	GCT	2	6	142560	142565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_019902	CCT	2	6	142578	142583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_019902	TCC	2	6	143834	143839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_019902	AG	3	6	143858	143863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_019902	GC	3	6	144923	144928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_019902	TG	3	6	145023	145028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019902	GA	3	6	145079	145084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019902	TGC	2	6	145092	145097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_019902	GTC	2	6	145114	145119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_019902	CGA	2	6	145160	145165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_019902	GCG	2	6	145169	145174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_019902	CACC	2	8	145187	145194	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
605	NC_019902	GCCT	2	8	145199	145206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
606	NC_019902	CGTTC	2	10	145210	145219	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
607	NC_019902	ATC	2	6	145228	145233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_019902	CGC	2	6	145725	145730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_019902	TGC	2	6	145771	145776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_019902	CG	3	6	145782	145787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_019902	GGTTC	2	10	145813	145822	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
613	NC_019902	GC	4	8	145853	145860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_019902	CGC	2	6	145906	145911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_019902	GGGGC	2	10	145927	145936	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
616	NC_019902	GGT	2	6	146686	146691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_019902	TGC	2	6	146730	146735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_019902	AGC	2	6	147740	147745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_019902	GCG	2	6	147789	147794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_019902	TGC	2	6	150219	150224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_019902	GCC	2	6	150225	150230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_019902	GGC	2	6	150286	150291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_019902	GGGC	2	8	150325	150332	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
624	NC_019902	GCG	2	6	150383	150388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_019902	GCG	2	6	150405	150410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_019902	TGG	2	6	150411	150416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019902	GCTG	2	8	150454	150461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_019902	CGT	2	6	150519	150524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_019902	G	6	6	150687	150692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
630	NC_019902	GAC	2	6	152333	152338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_019902	AGG	3	9	152378	152386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019902	TCCG	2	8	152920	152927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_019902	GC	3	6	152935	152940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_019902	GCG	2	6	152962	152967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_019902	CG	3	6	152966	152971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_019902	CGG	2	6	153013	153018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_019902	CGA	2	6	153062	153067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_019902	ACG	2	6	153092	153097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_019902	ATC	2	6	153107	153112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_019902	GGC	2	6	153144	153149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_019902	CTA	2	6	153165	153170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_019902	CCG	2	6	153175	153180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_019902	CGG	2	6	153188	153193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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646	NC_019902	ACC	2	6	153237	153242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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652	NC_019902	GTCG	2	8	155109	155116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
653	NC_019902	GC	3	6	155144	155149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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771	NC_019902	C	14	14	182781	182794	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
772	NC_019902	CT	3	6	182870	182875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
773	NC_019902	CCG	2	6	184184	184189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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775	NC_019902	GC	3	6	184241	184246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
776	NC_019902	GC	3	6	184251	184256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
777	NC_019902	GC	3	6	184273	184278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
778	NC_019902	G	6	6	184279	184284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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912	NC_019902	CGC	2	6	242623	242628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
913	NC_019902	TTA	2	6	242636	242641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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943	NC_019902	GC	3	6	261837	261842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
944	NC_019902	GGA	2	6	261860	261865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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948	NC_019902	CGG	2	6	266896	266901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
949	NC_019902	CGTG	2	8	266916	266923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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954	NC_019902	TCG	2	6	270549	270554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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957	NC_019902	GCCG	2	8	272647	272654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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959	NC_019902	GGA	2	6	272762	272767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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961	NC_019902	TCA	2	6	272847	272852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
962	NC_019902	GC	3	6	272939	272944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
963	NC_019902	GTT	2	6	273016	273021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
964	NC_019902	GGT	2	6	273038	273043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
965	NC_019902	CTTG	2	8	273124	273131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
966	NC_019902	TGT	2	6	273162	273167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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975	NC_019902	CGG	2	6	281446	281451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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977	NC_019902	CG	3	6	281493	281498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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