MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 13673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_019902	GAA	2	6	2303230	2303235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_019902	CCG	2	6	2303306	2303311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_019902	TCG	2	6	2303366	2303371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_019902	CGG	2	6	2303452	2303457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_019902	CGCC	2	8	2303466	2303473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8006	NC_019902	TG	3	6	2303514	2303519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_019902	CAG	2	6	2303614	2303619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_019902	CCA	2	6	2303721	2303726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_019902	AGC	2	6	2303747	2303752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_019902	CCG	2	6	2303763	2303768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_019902	GCC	2	6	2303797	2303802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_019902	TGA	2	6	2303909	2303914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_019902	GCC	2	6	2303936	2303941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_019902	CCG	2	6	2303943	2303948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_019902	CAC	2	6	2303991	2303996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_019902	CGG	2	6	2304193	2304198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_019902	CAG	2	6	2304331	2304336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_019902	GCA	2	6	2304342	2304347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_019902	TCC	2	6	2304383	2304388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_019902	CCAC	2	8	2304534	2304541	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8021	NC_019902	GCG	2	6	2304558	2304563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_019902	CGA	2	6	2304633	2304638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_019902	GC	3	6	2304640	2304645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_019902	TCGC	2	8	2304683	2304690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_019902	ACC	2	6	2304692	2304697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_019902	CG	3	6	2304734	2304739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8027	NC_019902	GAA	2	6	2304778	2304783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_019902	GCG	2	6	2304797	2304802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_019902	GGT	2	6	2304837	2304842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_019902	ACG	2	6	2304888	2304893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_019902	CG	4	8	2304895	2304902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_019902	GC	3	6	2304927	2304932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_019902	GTG	2	6	2304949	2304954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_019902	TGCG	2	8	2304986	2304993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_019902	TCGGC	2	10	2305116	2305125	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8036	NC_019902	CGG	2	6	2305126	2305131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_019902	CAG	2	6	2305150	2305155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_019902	GGTC	2	8	2305203	2305210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8039	NC_019902	GCC	2	6	2305215	2305220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_019902	AGCC	2	8	2305244	2305251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_019902	CAC	2	6	2305276	2305281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_019902	GCG	2	6	2305293	2305298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_019902	GTC	2	6	2305315	2305320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_019902	TCG	2	6	2305421	2305426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_019902	TCG	2	6	2305431	2305436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_019902	AGG	2	6	2305478	2305483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_019902	CCA	2	6	2305542	2305547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_019902	GTGC	2	8	2305572	2305579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8049	NC_019902	CG	3	6	2305597	2305602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_019902	GCG	2	6	2305727	2305732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_019902	GCC	2	6	2305750	2305755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_019902	GGT	2	6	2305768	2305773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_019902	CTC	2	6	2305813	2305818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_019902	TCC	2	6	2305832	2305837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_019902	CAC	2	6	2305840	2305845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_019902	GCATCG	2	12	2305847	2305858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_019902	CCG	2	6	2305905	2305910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_019902	GCA	2	6	2305962	2305967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_019902	GGC	2	6	2305980	2305985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_019902	TCG	2	6	2306036	2306041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_019902	ACG	2	6	2306042	2306047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_019902	GCA	3	9	2306103	2306111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_019902	CGG	2	6	2306149	2306154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_019902	TCA	2	6	2306199	2306204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_019902	CCCG	2	8	2306253	2306260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8066	NC_019902	GCC	2	6	2306315	2306320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_019902	CCGGTT	2	12	2306423	2306434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8069	NC_019902	CCCAAG	2	12	2306570	2306581	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_019902	GAG	2	6	2306614	2306619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_019902	TCG	2	6	2306621	2306626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8073	NC_019902	GTC	2	6	2306641	2306646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8075	NC_019902	CTCG	2	8	2306713	2306720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_019902	CGA	2	6	2306721	2306726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8087	NC_019902	CGG	2	6	2310520	2310525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_019902	CCGG	2	8	2310537	2310544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8095	NC_019902	C	6	6	2311916	2311921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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8098	NC_019902	CTTCGG	2	12	2312661	2312672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8101	NC_019902	CCT	2	6	2312808	2312813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_019902	CGA	2	6	2313039	2313044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8104	NC_019902	G	6	6	2313206	2313211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_019902	CCT	2	6	2314379	2314384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_019902	CGC	2	6	2314432	2314437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_019902	CAA	2	6	2314447	2314452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_019902	TTC	2	6	2314488	2314493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8111	NC_019902	CG	3	6	2314746	2314751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_019902	CGA	2	6	2314761	2314766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_019902	CCT	2	6	2314769	2314774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_019902	CGAA	2	8	2314788	2314795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_019902	ACC	2	6	2314829	2314834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_019902	ATC	2	6	2314872	2314877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8118	NC_019902	ACC	2	6	2314909	2314914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_019902	AT	3	6	2314950	2314955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_019902	CAAC	2	8	2314976	2314983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_019902	TCCC	2	8	2315030	2315037	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8122	NC_019902	CGATT	2	10	2315045	2315054	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8123	NC_019902	CAA	2	6	2315101	2315106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_019902	CGCC	2	8	2315127	2315134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8125	NC_019902	CA	3	6	2315136	2315141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_019902	ACG	2	6	2315149	2315154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_019902	CAA	2	6	2315442	2315447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_019902	GCA	2	6	2315494	2315499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_019902	A	6	6	2315499	2315504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_019902	ATC	2	6	2315628	2315633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8132	NC_019902	AAC	2	6	2315725	2315730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_019902	GCG	2	6	2315774	2315779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8134	NC_019902	CTCG	2	8	2315889	2315896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8135	NC_019902	TA	3	6	2315912	2315917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8137	NC_019902	TA	3	6	2316114	2316119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8138	NC_019902	CAAC	2	8	2316168	2316175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8143	NC_019902	TTC	2	6	2316330	2316335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8162	NC_019902	GC	3	6	2317091	2317096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8163	NC_019902	G	7	7	2317115	2317121	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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8243	NC_019902	ACGCG	2	10	2335142	2335151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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8247	NC_019902	GGT	2	6	2335390	2335395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8249	NC_019902	TCT	2	6	2335582	2335587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8250	NC_019902	GAT	2	6	2335674	2335679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8252	NC_019902	CCG	2	6	2335739	2335744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8253	NC_019902	GT	4	8	2336475	2336482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8254	NC_019902	CGG	2	6	2336592	2336597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8255	NC_019902	CCGT	2	8	2336643	2336650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8256	NC_019902	ACG	2	6	2336670	2336675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8257	NC_019902	C	6	6	2336713	2336718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8258	NC_019902	CGG	2	6	2336734	2336739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8259	NC_019902	CG	3	6	2336805	2336810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8260	NC_019902	AGAGGC	2	12	2336866	2336877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8261	NC_019902	GCT	2	6	2336883	2336888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8262	NC_019902	GAA	2	6	2336900	2336905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8263	NC_019902	CGGG	2	8	2336911	2336918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8264	NC_019902	GAG	2	6	2337023	2337028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8265	NC_019902	TCG	2	6	2337029	2337034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8266	NC_019902	CG	3	6	2337059	2337064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8267	NC_019902	GCA	2	6	2337081	2337086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8268	NC_019902	CG	4	8	2337088	2337095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8269	NC_019902	TCCG	2	8	2338481	2338488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8270	NC_019902	TCC	2	6	2338489	2338494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8275	NC_019902	CCGG	2	8	2338829	2338836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8276	NC_019902	GGC	2	6	2338849	2338854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8282	NC_019902	CGGCCG	2	12	2339367	2339378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8283	NC_019902	CA	3	6	2339394	2339399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8284	NC_019902	CG	3	6	2339400	2339405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8285	NC_019902	C	7	7	2339423	2339429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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8292	NC_019902	GCG	3	9	2340077	2340085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8293	NC_019902	TCG	2	6	2340097	2340102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8294	NC_019902	CAG	2	6	2340137	2340142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8301	NC_019902	GC	3	6	2340678	2340683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8302	NC_019902	GCA	2	6	2340811	2340816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8307	NC_019902	CGGGG	2	10	2341029	2341038	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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8320	NC_019902	TCG	2	6	2342748	2342753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8329	NC_019902	GGA	2	6	2343273	2343278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8332	NC_019902	GGTC	2	8	2343340	2343347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8336	NC_019902	ACC	2	6	2343522	2343527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8341	NC_019902	CGG	2	6	2343913	2343918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8344	NC_019902	CACG	2	8	2344084	2344091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8347	NC_019902	GC	4	8	2344238	2344245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8351	NC_019902	CGC	2	6	2344453	2344458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8362	NC_019902	GATG	2	8	2350282	2350289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8372	NC_019902	GCA	2	6	2353069	2353074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8373	NC_019902	GAAC	2	8	2353162	2353169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8374	NC_019902	CAG	2	6	2353179	2353184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8375	NC_019902	GTC	2	6	2353953	2353958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8377	NC_019902	CT	3	6	2354014	2354019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8378	NC_019902	ATG	2	6	2355661	2355666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8381	NC_019902	CATC	2	8	2355760	2355767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8382	NC_019902	GAT	2	6	2355774	2355779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8383	NC_019902	GCT	2	6	2355799	2355804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8384	NC_019902	GCTC	2	8	2355806	2355813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8385	NC_019902	CG	3	6	2355899	2355904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8386	NC_019902	TC	3	6	2355908	2355913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8387	NC_019902	CCAC	2	8	2355932	2355939	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8388	NC_019902	CCTT	2	8	2355975	2355982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8389	NC_019902	TCGC	2	8	2356000	2356007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8390	NC_019902	CGCC	2	8	2356113	2356120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8391	NC_019902	AGC	2	6	2356256	2356261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8392	NC_019902	TCA	2	6	2356286	2356291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8393	NC_019902	CCG	2	6	2356328	2356333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8394	NC_019902	CAA	2	6	2356374	2356379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8395	NC_019902	ACC	3	9	2356457	2356465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8396	NC_019902	AT	3	6	2356629	2356634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8397	NC_019902	CAA	2	6	2356821	2356826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8398	NC_019902	GGT	2	6	2356839	2356844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8424	NC_019902	GC	3	6	2360703	2360708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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