MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 12619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019897	TCGC	2	8	336601	336608	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_019897	GGCCG	2	10	336627	336636	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1003	NC_019897	GCG	2	6	336668	336673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_019897	GGC	2	6	336693	336698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_019897	GCT	3	9	336699	336707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_019897	GCT	2	6	336729	336734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_019897	GGC	2	6	336788	336793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019897	CCT	2	6	336800	336805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_019897	GCCG	2	8	336822	336829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_019897	CGTTC	2	10	336849	336858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1011	NC_019897	GACG	2	8	336886	336893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_019897	GAT	2	6	336928	336933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019897	GGC	2	6	336950	336955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_019897	TTG	2	6	337012	337017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019897	AT	3	6	337038	337043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019897	CGC	2	6	337053	337058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_019897	CGG	2	6	337064	337069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_019897	AAC	2	6	337097	337102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_019897	GGC	2	6	337216	337221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_019897	CGG	2	6	337256	337261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_019897	GCG	2	6	337292	337297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_019897	CCA	2	6	337468	337473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_019897	CGA	2	6	337477	337482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_019897	GCA	2	6	337551	337556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019897	CGC	2	6	337598	337603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_019897	GTGA	2	8	337604	337611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019897	GAA	2	6	337647	337652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019897	GAA	2	6	337693	337698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019897	CAG	2	6	337719	337724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_019897	ATT	2	6	337760	337765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019897	GC	4	8	337775	337782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_019897	GGA	2	6	337910	337915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019897	GGC	2	6	337930	337935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019897	GAA	2	6	338174	338179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019897	GGT	2	6	338250	338255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019897	GTC	2	6	338264	338269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019897	TCGTG	2	10	338273	338282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_019897	GGA	2	6	338377	338382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019897	ATC	2	6	338401	338406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019897	AC	3	6	338428	338433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_019897	AC	3	6	338597	338602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_019897	CAC	2	6	338612	338617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_019897	AGCC	2	8	338697	338704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_019897	GAT	2	6	338720	338725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019897	CCT	2	6	338776	338781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_019897	AAG	2	6	338815	338820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019897	TGA	2	6	338897	338902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019897	CG	3	6	339034	339039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_019897	GC	3	6	339054	339059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_019897	GGT	2	6	339121	339126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019897	AAC	2	6	339151	339156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_019897	GCCT	2	8	339195	339202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_019897	AGG	2	6	339210	339215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019897	TCC	2	6	339228	339233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_019897	CCA	2	6	339240	339245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_019897	GGC	2	6	339287	339292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_019897	GAT	2	6	339304	339309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019897	GAG	2	6	339335	339340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019897	TGC	2	6	339405	339410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019897	GGA	2	6	339448	339453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019897	AAGC	2	8	339516	339523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_019897	CCGG	2	8	339554	339561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_019897	ACA	2	6	339653	339658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019897	GCG	2	6	339675	339680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_019897	GGA	2	6	339690	339695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019897	GGCC	2	8	339783	339790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_019897	AGG	2	6	339793	339798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019897	GCAG	2	8	339877	339884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_019897	AAG	2	6	340001	340006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019897	TTGCGT	2	12	340080	340091	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1071	NC_019897	TGC	2	6	340425	340430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_019897	ATC	2	6	340485	340490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019897	AGC	2	6	340565	340570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019897	CGC	2	6	340642	340647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_019897	TGG	2	6	340726	340731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019897	CCG	2	6	340789	340794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_019897	ACA	2	6	340877	340882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019897	ACC	2	6	340898	340903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_019897	CTG	2	6	340953	340958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_019897	GTCC	2	8	340964	340971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_019897	AGC	2	6	340973	340978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_019897	GGGA	2	8	341028	341035	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019897	GTA	2	6	341041	341046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019897	GC	3	6	341145	341150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_019897	GAA	2	6	341152	341157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019897	CGG	2	6	341391	341396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_019897	GA	3	6	341489	341494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019897	ACC	2	6	341662	341667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_019897	GGT	2	6	341885	341890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019897	CGT	2	6	342080	342085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_019897	GAG	2	6	342129	342134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019897	GTT	2	6	342183	342188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019897	ACGG	2	8	342218	342225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_019897	C	6	6	342256	342261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1095	NC_019897	AC	3	6	342458	342463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_019897	T	7	7	342629	342635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_019897	T	9	9	342728	342736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019897	AGC	2	6	342752	342757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_019897	CTGC	2	8	343016	343023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_019897	AT	3	6	343092	343097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019897	TTG	3	9	343098	343106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019897	GCA	2	6	343136	343141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019897	CGT	2	6	343209	343214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_019897	TC	3	6	343292	343297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_019897	T	6	6	343430	343435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019897	TGT	2	6	343466	343471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019897	ATG	2	6	343472	343477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019897	GA	3	6	343478	343483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019897	TGC	2	6	343501	343506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_019897	GCG	2	6	343511	343516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_019897	AGG	2	6	343535	343540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019897	CGGC	2	8	346357	346364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_019897	GAAG	2	8	347072	347079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019897	T	8	8	347742	347749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019897	GGA	2	6	347758	347763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019897	CGTTA	2	10	347768	347777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_019897	CGAA	2	8	349974	349981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_019897	GGC	2	6	351466	351471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019897	GAAA	2	8	351542	351549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019897	TGC	3	9	351598	351606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019897	CGTCAT	2	12	351611	351622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019897	GCG	3	9	351654	351662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019897	GGCG	2	8	351664	351671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_019897	CGG	2	6	351705	351710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_019897	GGAA	2	8	351748	351755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019897	GCACAT	2	12	351895	351906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019897	ACGA	2	8	351953	351960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_019897	TGT	2	6	353815	353820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019897	TAA	2	6	353828	353833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019897	AAAAT	2	10	353847	353856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019897	A	6	6	353872	353877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019897	AAG	2	6	353883	353888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019897	CCCT	2	8	353996	354003	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1135	NC_019897	TTC	2	6	354106	354111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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