MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018020	CGATTC	2	12	8894	8905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018020	ATGAAA	2	12	61863	61874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018020	AATCTG	2	12	85011	85022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018020	GAAAAC	2	12	115110	115121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018020	CGTTTT	2	12	115162	115173	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018020	CCCCAA	2	12	201950	201961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018020	TAATGA	2	12	415331	415342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018020	TGCGGT	2	12	418316	418327	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018020	TTTAAG	2	12	503494	503505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018020	GTCATG	2	12	554063	554074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018020	GGCTGA	2	12	683059	683070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018020	TTGGGA	2	12	1276719	1276730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018020	ATCCAA	2	12	1356513	1356524	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018020	ACAATA	2	12	1372142	1372153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018020	GAAAAA	2	12	1436449	1436460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018020	TGCACC	2	12	1439542	1439553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018020	ATGATA	2	12	1584645	1584656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018020	TTCGGC	2	12	1611135	1611146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018020	CGCAAA	2	12	1640811	1640822	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018020	ACTCGC	2	12	1692375	1692386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018020	TATAAT	2	12	1724936	1724947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018020	GCAAAT	2	12	1836149	1836160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018020	ATTTCG	2	12	1871360	1871371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018020	ATCTTC	2	12	2063029	2063040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018020	AATGAT	2	12	2193268	2193279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018020	GGCCGC	2	12	2200786	2200797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018020	GGTGGC	2	12	2319404	2319415	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018020	CGCGAC	2	12	2368116	2368127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018020	GCAAAA	2	12	2391147	2391158	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018020	GCAATC	2	12	2414304	2414315	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018020	TCAAAA	2	12	2635885	2635896	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018020	TATCAA	2	12	2688972	2688983	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018020	GGCGCC	2	12	2696107	2696118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018020	ACCCGT	2	12	2701951	2701962	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018020	TTCTGA	2	12	2945900	2945911	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018020	TCAAAA	2	12	3014931	3014942	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018020	GCCCGC	2	12	3198680	3198691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018020	TTCATC	2	12	3204181	3204192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018020	ACCAGC	2	12	3295025	3295036	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018020	CTTAGG	2	12	3495152	3495163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018020	ATTTTT	2	12	3515401	3515412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018020	CTTAGG	2	12	3520108	3520119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018020	AAAGAG	2	12	3584221	3584232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018020	TGCGCC	2	12	3588636	3588647	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018020	GTGCGG	2	12	3663287	3663298	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018020	GAAACG	2	12	3670537	3670548	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018020	TGGTTT	2	12	3684517	3684528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018020	GGCAAT	2	12	3761987	3761998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018020	CTGAAA	2	12	3844386	3844397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018020	CAAAGC	2	12	3871749	3871760	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018020	GAGGCG	2	12	3987557	3987568	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018020	GAAAAA	2	12	3988823	3988834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018020	CGCCTG	2	12	4006751	4006762	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018020	CAAAAG	2	12	4108045	4108056	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018020	AAAGCC	2	12	4254579	4254590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.